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O coronavírus 2 da síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV-2) é um vigilância genômica e vacinação desempenham um papel importante na
coronavírus beta que pertence à família Coronaviridae. O SARS CoV-2 é um prevenção da disseminação, identificação precoce de variantes, prevenção de
vírus envelopado em forma esférica. O ácido ribonucleico (RNA) é orientado mutações e replicação viral, respectivamente.
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Figura 1. Genoma do SARS-CoV-2. SARS-CoV-2: coronavírus 2 da síndrome respiratória aguda grave; N: nucleocapsídeo; M:
membrana; S: espiga; E: envelope; RdRp: RNA polimerase dependente de RNA; ORF: quadro de leitura aberto.
pacientes receberam temporariamente o nome 2019-nCoV [8]. vírus da gripe. Em janeiro de 2020, as sequências do genoma do SARS-
Uma vez determinado que o vírus está relacionado ao SARS-CoV, foi CoV-2 foram disponibilizadas no GISAID [14]. Nextstrain cura e analisa a
designado o nome SARS-CoV-2 pelo Coronavirus Research Group (CSG) do genética do SARS-CoV-2 e é um esforço colaborativo de pesquisadores entre
Comitê Internacional para a classificação de vírus em 11 de fevereiro de Seattle, EUA e Basel, Suíça [12].
2020 [9].
A interagência do governo dos EUA dividiu as variantes do SARS-CoV-2
em três classes. Com base nas evidências científicas, o status da variante
Genética e patogênese
pode às vezes ser escalado ou desescalado e, portanto, o Centro de Controle
e Prevenção de Doenças (CDC) atualizará as cepas variantes nas diferentes
O SARS-CoV-2 é um vírus envelopado de forma esférica [1]. classes (Tabela 2) [15]. De acordo com o relatório de 21 de abril de 2021, as
Possui quatro proteínas estruturais e 16 proteínas não estruturais. classes são: variante de interesse, variante de preocupação e variante de
As proteínas estruturais são a proteína do nucleocapsídeo (N), a membrana alta consequência.
(M), a proteína S e a proteína do envelope (E). O RNA é orientado na direção
5'-3', o que o torna um vírus de RNA de sentido positivo, e o RNA pode ser
lido diretamente como um RNA mensageiro (mRNA, Fig. 1). A RNA replicase
Variante de interesse
é codificada na extremidade terminal 5'. A proteína não estrutural 14 (nsp14)
tem atividade de revisão que permite que a taxa de mutações permaneça
baixa. A proteína S causa a ligação do vírus à célula hospedeira no receptor Esta classe inclui variantes com marcadores específicos que estão
da enzima conversora de angiotensina 2 (ACE2), que está presente na associados a alterações na ligação ao receptor, neutralização de anticorpos
membrana da célula hospedeira. diminuída desenvolvida contra infecção ou vacinação anterior, eficácia
diminuída de tratamentos, impacto diagnóstico potencial ou aumento previsto
Os receptores ACE2 são encontrados em abundância nas células alveolares. na transmissibilidade da gravidade da doença. Esta classe também requer
A ligação causa a fusão da membrana lipídica viral com a membrana celular maior vigilância da sequência, maior caracterização laboratorial e análise
do hospedeiro, internalizando assim o vírus. A maquinaria do hospedeiro epidemiológica para verificar a transmissibilidade e gravidade da doença, o
traduz o RNA viral e leva à produção da replicase e proteínas estruturais do risco de reinfecção e proteção contra vacinação. As variantes atuais incluídas
vírus. na variante de interesse dos EUA são B.1.526, B.1.525 e P.2. Todas essas
A replicase é clivada em proteínas não estruturais das quais a RNA variantes compartilham uma mutação comum D614G; e as evidências
polimerase dependente de RNA (RdRp) é uma delas. A replicação viral e a mostram que as variantes com essa mutação espalham a doença mais
amplificação são realizadas e a montagem dos vírions é realizada no retículo rapidamente do que as variantes sem ela. No final de janeiro, início de
endoplasmático da célula hospedeira e no aparelho de Golgi. Durante o fevereiro de 2020, a cepa então circulante foi substituída pela cepa portadora
processo de replicação, podem ocorrer erros no genoma levando a mutações da mutação D614G. O códon 614 substitui o ácido aspártico por glicina no
que dão origem a variantes. Os virions são finalmente liberados para fora da aminoácido neste sítio da proteína S [16].
célula por exocitose [10, 11].
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S:N501 RDB Pode aumentar a ligação de ACE2. Testes em indivíduos Reino Unido (20I/501Y.V1)
vacinados com Pfizer BioNTech e Moderna sugerem
redução na neutralização.
Brasil (20J/501Y.V3)
S:E484 RDB Pode aumentar a ligação de ACE2. África do Sul (20H/501Y.V2)
Brasil (20J/501Y.V3)
Brasil (20B/S.484K)
S:H69- Domínio N-terminal de pico Pode alterar o reconhecimento por anticorpos. Reino Unido (20I/501Y.V1)/B.1.1.7
S:Q677 Perto de ambos fora do bolsão do edifício furin; Hipoteticamente pensado para influenciar a 20G (clado 20C-EUA)
importante para a clivagem S1/S2 clivagem S1/S2.
S:Y453F RDB Pode aumentar a ligação de ACE2. Variante “mink” do cluster 5 vista
em visons na Holanda
Brasil (20J/501Y.V3)
S:Y144- Domínio N-terminal de pico Associado ao escape de anticorpos. Reino Unido (20I/501Y.V1), 20A/S:484K
S:H655 Brasil (20J/501Y.V3)
S:P681 Perto do local de clivagem da furina Pode reduzir o reconhecimento de anticorpos. Reino Unido (20I/501Y.V1)
Brasil (20J/501Y.V3)
ORF1a:S3675 É uma deleção de três aminoácidos em 20C/S:484K e 20A/S:484K
ORF1a nas posições 3675-5677.
RDB: domínio de ligação ao receptor; ACE2: enzima conversora de angiotensina 2; ORF: quadro de leitura aberto.
Semelhante à variante de classe de interesse, as variantes nesta classe também Variante do Reino Unido (B.1.1.7 ou 20I/501Y.V1)
compartilham uma mutação comum D614G, que se espalha rapidamente do que
as variantes sem a mutação.
B.1.1.7, também conhecido como VOC202012/01, foi detectado em setembro
de 2020 no Reino Unido. Possui 23 mutações em comparação com a cepa
Variante de alta consequência original encontrada em Wuhan, China. Oito dessas mutações foram encontradas
na proteína S. Suas mutações notáveis são N501Y, deleção 69/70 e P681H. A
mutação N501Y parece permitir que a proteína S se ligue mais firmemente ao
Esta classe inclui variantes que apresentam evidências de que as medidas
receptor ACE2 [18].
preventivas e médicas têm uma eficácia significativamente menor em comparação
com as variantes circulantes anteriormente. É 40-80% mais transmissível [19]. De acordo com o relatório de Davies et
Não há variantes nesta classe [17]. al, quase 5.000 das 17.452 mortes por COVID-19 durante os meses de setembro
a fevereiro foram devido a essa variante. Eles também estimaram que a
mortalidade foi aproximadamente 55% maior quando comparada a outras
As variantes COVID-19
variantes [20].
Da mesma forma, os relatórios científicos de janeiro de 2021 indicaram que
A seguir estão as diferentes variantes identificadas em diferentes países. Destas, houve um aumento na taxa de morte com essa variante [21]. Em 1º de abril de
as três variantes importantes que rapidamente se tornaram dominantes são 2021, havia 12.505 casos relatados em 51 jurisdições [22]. Foi identificado em
B.1.1.7, B.1.351 e P.1. 82 países [23].
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Variante de alta
sinais e sintomas Variante original Variante de interesse Variante de interesse
consequência
Sintomas
OMS: Organização Mundial da Saúde; CDC: Centro de Controle e Prevenção de Doenças; EUA: Autorização de Uso de Emergência.
Variante sul-africana (B.1.351 ou 20H/501Y.V2) A variante P.1 também conhecida como B.1.1.28.1 foi detectada pela
primeira vez no norte do Brasil na cidade de Manaus, no estado do
A variante B.1.351, também conhecida como 501Y.V2, foi identificada Amazonas, em dezembro de 2020. Em janeiro de 2021, foi identificada
pela primeira vez em outubro de 2020 na Baía de Nelson Mandela, na nos arredores de Tóquio no aeroporto de Haneda entre quatro viajantes
África do Sul. Em dezembro de 2020, também foi detectado na Zâmbia. do Brasil durante a triagem de rotina de passageiros em amostras
Em 1º de abril de 2021, havia 323 casos relatados em 31 jurisdições analisadas no Instituto Nacional de Doenças Infecciosas (NIID) no
nos EUA. Existem 23 mutações com 17 alterações de aminoácidos, Japão. Em 1º de abril de 2021, havia 224 casos relatados em 22
mas as mutações notáveis nesta variante são K417N, E484K e N501Y jurisdições nos EUA [22]. Possui 35 mutações com 17 alterações de
na proteína S. Sugere-se ter maior transmissibilidade e mais comumente aminoácidos. Suas mutações notáveis são K417T, E484K e N501Y
visto em jovens sem doenças subjacentes [22]. [22]. Em um estudo de Naveca et al, verificou-se que esta variante é
2,2 vezes mais transmissível que levou a alguns casos de reinfecção
A mutação E484K nesta variante medeia o escape de anticorpos que se recuperaram de COVID-19, e quase tem uma taxa de infecção
é a principal razão para a redução da sensibilidade às vacinas [25]. As semelhante nos mais jovens (18 - 59 anos). ) e pacientes mais velhos
vacinas de mRNA (Pfizer e Moderna) foram autorizadas nos EUA antes (> 60 anos) [28, 29]. B.1.351 e P.1 consistem em mutações semelhantes
da identificação dessa cepa no país [26]. De acordo com os estudos de ligação ao receptor e, portanto, supõe-se que a eficácia da vacina
mais recentes, essas duas vacinas produziram anticorpos neutralizantes contra a cepa P.1 seja semelhante à B.1.351. Como os estudos
mais baixos do que as cepas anteriores. Novavax, Janssen e Astra- demonstraram eficácia reduzida da vacina contra B.1.351, é provável
Zeneca conduziram ensaios na África do Sul com cepas mutantes que a eficácia contra a cepa P.1 seja reduzida [30]. A Sinovac Biotech
B.1.351 dominantes. Esses estudos demonstraram a menor eficácia da iniciou os ensaios clínicos que demonstraram que a vacina CoronoVac
vacina em comparação com as outras variantes em que essa cepa não é 50% eficaz na prevenção da infecção com a variante P.1 no Brasil
foi [31].
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Variante brasileira (B.1.1.28) também resistente à vacinação. De acordo com o Laboratório de Virologia do
Conselho Indiano de Pesquisa Médica, descobriu-se que a vacina COVAXIN da
Bharat Biotech neutraliza efetivamente a infecção e é 78% eficaz contra a
A variante brasileira B.1.1.28 foi inicialmente encontrada no estado do Rio de
variante mutante dupla [37-39].
Janeiro no Brasil, e é a linhagem P2. Ao contrário da variante P.1, a variante
B.1.1.28 tem apenas uma mutação E484K notável na proteína S [32]. A eficácia
terapêutica e vacinal ainda não foi relatada. Semelhante às variantes B.1.351 e Variante mutante triplo (B.1.618)
P.1, a vacina pode ser ineficaz contra esta variante [33].
20A.EU1/S:A222V
Variante da área da baía de São Francisco dos EUA (B.1.427 e B.1.429)
Essas variantes foram identificadas pela primeira vez na Califórnia em fevereiro A variante 20A.EU1 tem mutações de domínio não terminal (NTD) que não
de 2021. As mutações notáveis em B.1.427 são L452R e D614G; enquanto as desempenham um papel direto na ligação ao receptor ou fusão de membrana.
mutações em B.1.429 são S131, W152C, L452R e D614G. Ambas as variantes Esta variante foi inicialmente identificada em 20 de junho de 2020 na Espanha,
têm 20% de aumento do risco de transmissibilidade e redução da eficácia mas rapidamente se espalhou pela Europa e muitos países [42].
terapêutica [15]. Foi identificado no ano passado nos EUA e na Europa. É uma
variante com uma mutação na proteína S. Em janeiro de 2021, aumentou
rapidamente como causa de casos em vários condados da Califórnia [35]. 20A.EU2
20A/S:98F
Variante mutante dupla (B.1.617)
A variante 20A/S:98F tem a mutação S:98F que foi encontrada
Esta variante é detectada pela primeira vez na Índia. Como duas mutações são predominantemente na Bélgica e Holanda [12].
vistas no mesmo vírus, essa variante é chamada de variante “duplo mutante”.
Houve um aumento significativo nos casos de COVID-19 na Índia. O primeiro
20C/S:80Y
caso nos EUA foi identificado em São Francisco em 5 de abril de 2021. As
mutações notáveis são E484Q e L452R. Essas variantes apresentam risco
aumentado de transmissão e A variante 20C/S:80Y teve 18 mutações de nucleotídeos, possivelmente
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relacionados à edição semelhante ao complexo de edição de apolipoproteína reduzida eficácia da vacina contra B.1.351, é provável que a eficácia contra a
B (APOBEC) dentro do hospedeiro que são encontrados em pelo menos 10 cepa P. 1 seja reduzida [47]. A Sinovac Biotech iniciou os ensaios clínicos que
países na Europa [12]. demonstraram que a vacina Cor onoVac é 50% eficaz na prevenção da
infecção com a variante P.1 no Brasil [47]. B.1.526 e B.1.525 têm uma redução
na eficácia da vacina [15]. Mais estudos são necessários para estudar a
20B/S:626S
eficácia das vacinas atualmente aprovadas contra a variante dupla mutante
[40, 47]. De acordo com o Laboratório de Virologia do Conselho Indiano de
A variante 20B/S:626S tem a mutação S:626S. Esta variante é encontrada em Pesquisa Médica, descobriu-se que a vacina COVAXIN da Bharat Biotech
15 países da Europa, sendo predominantemente vista na Noruega, Dinamarca neutraliza efetivamente a infecção e é 78% eficaz contra a variante mutante
e Reino Unido [12]. dupla [39-41].
20B/S:1122L
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de medidas de precaução, incluindo mascaramento, higiene das mãos, Neufeldt CJ, Cerikan B, Stanifer ML, et al. Estrutura e replicação do
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