[1] P. V’kovski, A. Kratzel, S. Steiner, H. Stalder, V.

Thiel, Coronavirus biology

and replication, implications for SARS-CoV-2, Nat. Rev. Microbiol. 19,2021 155–170

V’KOVSKI, P. et al. Coronavirus biology and replication, implications for

SARS-CoV-2. Natura Reviews Microbiology, v. 19, n. 1, p. 155-170, 2021.
Disponível em <https://www.nature.com/articles/s41579-020-00468-6>. Acessado
em: 09 de jul. de 2022.

BIOLOGIA E REPLICAÇÃO DO CORONAVÍRUS: IMPLICAÇÕES PARA O

SARS-COV-2

HISTÓRIA
Citar de modo geral os coronavirus...
Dentro da ordem de Nidovirales e da subordem de Coronavirineae encontra-
se a família Coronaviridae . Este último é ainda especificado na subfamília
de Orthocoronavirinae , que consiste em quatro
gêneros: alphacoronavirus, betacoronavirus, gammacoronavirus e deltacoronavirus.
Os alfacoronavírus e betacoronavírus infectam exclusivamente espécies de
mamíferos, os gamacoronavírus e os deltacoronavírus têm uma gama mais ampla
de hospedeiros que inclui espécies de aves. As infecções por coronavírus em
humanos e animais resultam principalmente em doenças respiratórias e entéricas.

Em 1966 e 1967, foram descobertos os primeiros coronavírus humanos,

HCoV-229E e HCoV-OC43.
O surgimento zoonótico do coronavírus da síndrome respiratória aguda grave
(SARS-CoV) e a subsequente epidemia de SARS em 2002-2003 causaram 8.000
casos documentados de SARS, 10% dos quais com consequências
letais 183 , 184. Como a transmissão de humano para humano ocorreu
principalmente após o início dos sintomas, medidas drásticas de saúde pública,
incluindo restrições de viagem e isolamento de pacientes infectados, conseguiram
conter a disseminação internacional para foyers limitados de infecções. 
183. ZHONG, N.S. et al. Epidemiology and cause of severe acute
respiratory syndrome (SARS) in Guangdong, People’s Republic of China, in
February, 2003. The Lancet, v. 362, n. 9393, p. 1353-1358,  2003. Disponível em
< https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0140673603146302>.
Acessado em: 02 de ago. 2022.

Desde novembro de 2002, um agente infeccioso causou surtos de

pneumonia atípica na província de Guangdong, no sul da China. A maioria
dos casos ocorreu na China continental e em Hong Kong.
Mas, no final de fevereiro de 2003, a doença havia se espalhado para
regiões e países vizinhos. Surtos de SARS ocorreram no Sudeste Asiático,
América do Norte e Europa, e deram origem à primeira pandemia do século
XXI.
Investigações epidemiológicas sugerem que a SARS provavelmente
surgiu pela primeira vez em cidades satélites de Guangzhou, circulando por
pelo me‐ nos 2 meses antes de causar um grande surto na própria
Guangzhou.
Achados epidemiológicos sugerem que a SARS estava se espalhando
em um padrão in‐ comum. A pandemia começou com apenas alguns casos
agrupados principalmente em famílias e profissionais de saúde hospitalares
em cidades ao redor de Guangzhou.

184. KSIAZEK t. G. et al. A novel coronavirus associated with severe

acute respiratory syndrome. New England Journal of Medicine, v. 15, n. 348, p.
1953-1966, 2020. Disponível em < https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12690092/>.
Acessado em 07 de ago. 2022.

No final de 2002, casos de doenças respiratórias com risco de vida

sem causa identificável foram relatados na Província de Guangdong, China;
eles foram seguidos por relatos do Vietnã, Canadá e Hong Kong de doenças
respiratórias febris graves que se espalharam para membros da família e
profissionais de saúde.
Muitos casos podem ser ligados através de cadeias de transmissão a
um profissional de saúde da província de Guangdong, China, que visitou
Hong Kong, onde foi hospitalizado com SARS e morreu.
Vietnã, Cingapura, Tailândia, Hong Kong, Canadá, Taiwan e Estados
Unidos

O surgimento de um segundo coronavírus de origem zoonótica altamente

patogênico, MERS-CoV, resultou em mais de 2.500 casos humanos de MERS
desde 2012, associados a lesões pulmonares induzidas por vírus e manifestações
clínicas graves (taxa de letalidade de 36%) 188 . O MERS-CoV também se originou
de morcegos e estabeleceu um reservatório animal em camelos dromedários.

188. Zaki AM, van Boheemen S, Bestebroer TM, Osterhaus AD,

Fouchier RA. Isolation of a novel coronavirus from a man with pneumonia in
Saudi Arabia. N. Engl. J. Med. 2012;367:1814–1820
ZAKI, A. M. et al. Isolation of a novel coronavirus from a man with
pneumonia in Saudi Arabia. New England Journal of Medicine, v. 8, n. 367, p.
1814-1820, 2012. Disponível em
<https://www.nejm.org/doi/10.1056/NEJMoa1211721?url_ver=Z39.88-
2003&rfr_id=ori:rid:crossref.org&rfr_dat=cr_pub%20%200www.ncbi.nlm.nih.gov >.
Acessado em 07 de ago. 2022.
Os coronavírus são vírus de RNA de sentido positivo, fita simples e
envelopados que são fenotipicamente e genotipicamente diversos. 1 Os
coronavírus são comuns em morcegos em todo o mundo, mas também
podem ser encontrados em muitas outras espécies, incluindo pássaros,
gatos, cães, porcos, camundongos, cavalos, baleias e humanos. Podem
causar doenças respiratórias, entéricas, hepáticas ou neurológicas, com
gravidade variável em várias espécies animais.
A diversidade de coronavírus é facilitada pela infidelidade da RNA
polimerase dependente de RNA, a alta frequência de recombinação de RNA e
os genomas extraordinariamente grandes para vírus de RNA. Esses fatores
não apenas levaram à diversidade de coronavírus conhecidos, mas também
facilitaram o surgimento de vírus com novas características que permitem
que o organismo se adapte a novos hospedeiros e nichos ecológicos, às
vezes causando eventos zoonóticos.

Recentemente, o SARS-CoV-2 patogênico se espalhou rapidamente na

população humana após um provável transbordamento de morcegos ou de um
hospedeiro intermediário ainda não identificado. Em outubro de 2020, mais de 40
milhões de casos de COVID-19 foram declarados em mais de 200 países, causando
mais de 1 milhão de mortes ( COVID-19 Dashboard ). 

O SARS-CoV-2
Curiosamente, o SARS-CoV-2 compartilhou 79,6% de identidade de
nucleotídeos com o SARS-CoV e relações estreitas com os coronavírus
relacionados à síndrome respiratória aguda grave (SARSr-CoVs) ZC45 e ZXC21
de Rhinolophus sinicus, enquanto RaTG13 de Rhinolophus affinis mostrou a maior
similaridade de nucleotídeo de 96,2% .
A identidade da sequência diferiu muito na comparação de genes e domínios
individuais, indicando eventos de recombinação frequentes em hospedeiros
reservatórios naturais. Isso é exemplificado comparando a identidade do nucleotídeo
do SARS-CoV-2 com o coronavírus de morcego, o gene spike, um dos principais
determinantes da transmissão zoonótica para humanos, mostrou menor semelhança
de sequência com o SARS-CoV-2, levantando assim a questão da origem do SARS-
CoV-2. O SARS-CoV-2 ou um precursor imediato não foi encontrado, deixando o
papel dos morcegos no surgimento do SARS-CoV-2 evasivo. Além disso, a
separação ambiental de morcegos e humanos pode favorecer a existência de um
hospedeiro intermediário, responsável pela adaptação e transmissão do SARS-CoV-
2 para a população humana,197 . O exemplo do pangolim CoV MP789, que
compartilhou cinco aminoácidos essenciais para a ligação de ACE2 no S com
SARS-CoV-2 destaca a existência de uma variedade de betacoronavírus não
identificados em animais da vida selvagem e seus papéis como possíveis
hospedeiros intermediários.

O SARS-CoV-2 tem como alvo os tecidos do trato respiratório superior e

inferior e a transmissão eficiente de humano para humano ocorre mesmo antes do
início dos sintomas . As manifestações clínicas variam desde infecções
assintomáticas ou leves até inflamação pulmonar aguda e pneumonia,
principalmente em idosos e pacientes com comorbidades.
Ao infectar células epiteliais brônquicas, pneumócitos e células do trato
respiratório superior em humanos, as infecções por SARS-CoV, MERS-CoV e
SARS-CoV-2 podem evoluir para patologias respiratórias graves e com risco de vida
e lesões pulmonares para as quais não há tratamento profilático ou terapêutico
específico foi aprovado até hoje. As etapas iniciais da infecção por coronavírus
envolvem a ligação específica da proteína spike (S) de coronavírus aos receptores
de entrada celular. A expressão e a distribuição tecidual dos receptores de entrada
influenciam consequentemente o tropismo e a patogenicidade virais. Durante o ciclo
de vida intracelular (Fig. 1), os coronavírus expressam e replicam seu RNA
genômico para produzir cópias completas que são incorporadas em partículas virais
recém-produzidas.
Os coronavírus possuem genomas de RNA notavelmente grandes. Na
extremidade 5', o RNA genômico apresenta dois grandes quadros de leitura aberta
(ORFs; ORF1a e ORF1b) que ocupam dois terços do genoma capeado e
poliadenilado. ORF1a e ORF1b codificam 15–16 proteínas não estruturais (nsp), das
quais 15 compõem o complexo de replicação e transcrição viral (RTC) que inclui,
entre outras, enzimas de processamento e modificação de RNA e uma função de
revisão de RNA necessária para manter a integridade do genoma de coronavírus
>30 kb. ORFs que codificam proteínas estruturais e ORFs intercalados que
codificam proteínas acessórias são transcritos do terço 3' do genoma para formar
um conjunto aninhado de mRNAs subgenômicos (sg mRNAs). As proteínas
acessórias de coronavírus são conjuntos altamente variáveis de proteínas
específicas de vírus que exibem conservação limitada mesmo dentro de espécies
individuais, mas acredita-se que contribuam principalmente para modular as
respostas do hospedeiro à infecção e são determinantes da patogenicidade viral. No
entanto, as funções moleculares de muitas proteínas acessórias permanecem
amplamente desconhecidas devido à falta de homologias com proteínas acessórias
de outros coronavírus ou com outras proteínas conhecidas.
O vírus do coronavírus consiste em proteínas estruturais, ou seja, spike (S),
envelope (E), membrana (M), nucleocapsídeo (N) e, para alguns betacoronavírus,
hemaglutinina-esterase (não mostrada). O genoma de RNA fita simples de sentido
positivo (+ssRNA) é encapsidado por N, enquanto M e E asseguram sua
incorporação na partícula viral durante o processo de montagem. Os trímeros S se
projetam do envelope viral derivado do hospedeiro e fornecem especificidade para
os receptores de entrada celular. 
As proteínas S de coronavírus são glicoproteínas de fusão homotriméricas de
classe I que são divididas em duas partes funcionalmente distintas (S1 e S2)
(Fig. 2). O S1 exposto à superfície contém o domínio de ligação ao receptor (RBD)
que envolve especificamente o receptor da célula hospedeira, determinando assim o
tropismo e a patogenicidade da célula do vírus. O domínio S2 transmembranar
contém regiões de repetição heptada e o peptídeo de fusão, que medeiam a fusão
de membranas virais e celulares após extensos rearranjos conformacionais.
A afinidade de ligação da proteína S e ACE2 está correlacionada com a
gravidade da doença em infecções por SARS-CoV. A afinidade do SARS-CoV-2
RBD com o ACE2 mostrou ser semelhante ou mais forte do que a do SARS-CoV
RBD. No entanto, a afinidade de ligação de toda a proteína SARS-CoV-2 S ao ACE2
parece ser igual ou inferior à do SARS-CoV, sugerindo um RBD menos exposto
Além da ligação ao receptor, a clivagem proteolítica das proteínas S do
coronavírus por proteases derivadas de células hospedeiras é essencial para
permitir a fusão. O SARS-CoV demonstrou usar a serina protease de superfície
celular TMPRSS2 para iniciação e entrada. O  TMPRSS2 é expresso no trato
respiratório humano e, portanto, contribui fortemente para a disseminação e a
patogênese do SARS-CoV. Notavelmente, a entrada do SARS-CoV-2 depende
principalmente do TMPRSS2.
Ciclo de vida viral
As partículas de coronavírus se ligam a fatores de ligação celular e interações
S específicas com os receptores celulares, (como a enzima conversora de
angiotensina 2 (ACE2), juntamente com fatores do hospedeiro (como a serina
protease da superfície celular TMPRSS2), promovem a captação e a fusão viral no
membrana celular ou endossomal. 
A importância da ligação ao receptor mediado pela proteína S do coronavírus
e os rearranjos conformacionais coordenados temporalmente resultam na fusão da
membrana tornam esse processo um alvo principal das respostas antivirais inatas e
adaptativas. Além disso as proteínas S do coronavírus são fortemente glicosiladas, o
que promove a evasão imune ao proteger os epítopos dos anticorpos neutralizantes.
Após a entrada, a liberação e descamação do RNA genômico de entrada o
submete à tradução imediata de dois grandes quadros de leitura aberta, ORF1a e
ORF1b. As poliproteínas pp1a e pp1ab resultantes são co-traducionalmente e pós-
traducionalmente processadas nas proteínas não estruturais individuais (nsps) que
formam o complexo de replicação e transcrição viral. Concordante com a expressão
de nsps, a biogênese de organelas de replicação viral consistindo em vesículas de
membrana dupla perinucleares (DMVs) características, membranas convolutas
(CMs) e pequenas esférulas de membrana dupla (DMSs) abertas criam um
microambiente protetor para replicação de RNA genômico viral e transcrição de
mRNAs subgenômicos (mRNAs sg) compreendendo o conjunto aninhado
característico de mRNAs de coronavírus. As proteínas estruturais traduzidas
translocam para as membranas do retículo endoplasmático (ER) e transitam através
do compartimento intermediário ER-para-Golgi (ERGIC), onde a interação com o
RNA genômico recém-produzido e N-encapsidado resulta em brotamento no lúmen
dos compartimentos vesiculares secretores. Finalmente, os vírions são secretados
da célula infectada por exocitose. As principais etapas inibidas por compostos que
estão sendo validados e que representam alvos antivirais atraentes estão
destacadas em vermelho. Uma sequência 3' poliA; tampa, estrutura de tampa
5'; dsRNA, RNA de fita dupla; L, sequência líder; RdRP.
 JUSTIFICATIVA
Os coronavírus (CoVs) são uma família altamente diversificada de vírus de
RNA de fita simples de sentido positivo envelopados. Eles infectam humanos, outros
mamíferos e espécies de aves, incluindo gado e animais de companhia, e, portanto,
não são apenas um desafio para a saúde pública, mas também uma preocupação
veterinária e econômica. 
Apesar das anteriores emergências de saúde pública causadas pelos surtos
de SARS-CoV e MERS-CoV e do impacto da pandemia de SARS-CoV-2 em curso
na sociedade e na saúde humana, as estratégias de intervenção para combater as
infecções por coronavírus estão apenas em seus estágios iniciais e aguardam
comprovação de eficácia clínica. Seu desenvolvimento depende intimamente da
compreensão aprofundada dos mecanismos básicos das funções dos genes do
coronavírus, bem como das interações moleculares com os fatores do
hospedeiro. Desde a descoberta do primeiro coronavírus (vírus da bronquite
infecciosa aviária) na década de 1930 e a descoberta dos primeiros coronavírus
humanos (HCoV-229E e HCoV-OC43) na década de 1960, o campo de pesquisa do
coronavírus fez progressos substanciais na compreensão dos princípios básicos da
replicação e patogênese do coronavírus. Esse avanço foi acelerado após o
surgimento do SARS-CoV em 2002 e do MERS-CoV em 2012 e ampliou nossa
visão sobre os coronavírus como patógenos zoonóticosque podem afetar
gravemente a saúde humana. Além disso, a velocidade sem precedentes e o
progresso técnico da pesquisa de coronavírus, que se tornou evidente em poucos
meses após o aparecimento do SARS-CoV-2 no final de 2019, levou a uma
compreensão cada vez maior desse patógeno emergente e de sua doença
associada.
A alta homologia genômica e estrutural entre as proteínas S de SARS-CoV e
SARS-CoV-2 (76% de identidade de aminoácidos) apoiou a identificação de ACE2
como o receptor de superfície celular para SARS-CoV-2. Notavelmente, os resíduos
essenciais de contato do SARS-CoV que interagem com o ACE2 foram altamente
conservados no SARS-CoV-2, bem como em membros da espécie Coronavírus
relacionado à síndrome respiratória aguda grave que usa ACE2 ou possui
propriedades de cadeia lateral de aminoácidos semelhantes . Esses dados foram
corroborados pela resolução atômica da interface entre a proteína SARS-CoV-2 S e
ACE2. Por outro lado, o coronavírus relacionado à síndrome respiratória aguda
grave do morcegoA sequência RaTG13 S (93,1% de identidade nucleotídica com
SARS-CoV-2) mostra a conservação de apenas um dos seis aminoácidos
diretamente envolvidos na ligação de ACE2, embora, com base em toda a
sequência genômica, RaTG13 seja o parente mais próximo de SARS-CoV -2
conhecidos até o momento (96,2%). Esses dados sugerem que, assim como durante
a evolução do SARS-CoV, eventos frequentes de recombinação entre coronavírus
relacionados à síndrome respiratória aguda grave que coexistem em morcegos
provavelmente favoreceram o surgimento do SARS-CoV-2.
De fato, os pontos de interrupção de recombinação previstos dividem o gene
S em três partes. A parte central da proteína S (aminoácidos 1.030-1.651,
abrangendo o RBD) é mais semelhante ao SARS-CoV e aos coronavírus
relacionados à síndrome respiratória aguda grave de morcego WIV1 e RsSHC014,
todos os quais usam ACE2 humano como um receptor de entrada celular 23. No
entanto, as partes amino-terminal e carboxi-terminal da proteína SARS-CoV-2 S
(aminoácidos 1-1.029 e 1.651-3.804, respectivamente) estão mais intimamente
relacionadas aos coronavírus relacionados à síndrome respiratória aguda grave
ZC45 e ZXC21. Essas observações destacam a importância da recombinação
como um mecanismo geral que contribui para a diversidade de coronavírus e,
portanto, pode impulsionar o surgimento de futuros coronavírus humanos
patogênicos de reservatórios de morcegos. Isso enfatiza a necessidade de
vigilância para determinar a amplitude da diversidade de coronavírus
relacionados à síndrome respiratória aguda grave, avaliar com que frequência
os eventos de recombinação ocorrem no campo e entender quais variantes de
vírus têm potencial para infectar humanos.

Uma característica peculiar da proteína SARS-CoV-2 S é a aquisição de um

sítio de clivagem polibásico (PRRAR) no limite S1-S2, que permite a clivagem
eficiente pelo protótipo da pró-proteína convertase furina. A clivagem resulta em
infecção aprimorada e foi proposta como um evento-chave na evolução do SARS-
CoV-2, pois a clivagem eficiente da proteína S é necessária para uma infecção bem-
sucedida e é um determinante principal na superação das barreiras das
espécies. Esse pré-processamento da proteína SARS-CoV-2 S pela furina pode
contribuir para o tropismo celular expandido e potencial zoonótico e pode aumentar
a transmissibilidade 16, 46 . Existem vários casos de aquisições de sítios de clivagem
semelhantes a furina que ocorreram independentemente durante a evolução do
coronavírus e sítios de clivagem semelhantes estão presentes em outros
coronavírus humanos. Esses eventos de inserção independentes destacam o
potencial zoonótico dos coronavírus relacionados à síndrome respiratória
aguda grave do morcego e podem aumentar a possibilidade de futuros surtos.

MATERIAIS E MÉTODOS
Sistema de estudo: Rato
Oportunidade: Crítico para o desenvolvimento de medicamentos e
vacinas; camundongos transgênicos ACE2 humanos exibem perda de peso e
replicação de vírus nos pulmões após infecção por SARS-CoV e SARS-CoV-
2; sintomas representativos de patogenicidade viral leve 159 , 160
Limitação: Ligação limitada de SARS-CoV-2 ao ACE2 de
camundongo; camundongos ACE2 transgênicos ainda não prontamente
disponíveis; camundongos transgênicos ACE2 humanos mostram danos em órgãos
extrapulmonares após infecção por SARS-CoV (não observado em pacientes
humanos com SARS) 161

REFERÊNCIAS ADICIONAIS INTERESSANTES

183. Zhong NS, et al. Epidemiology and cause of severe acute
respiratory syndrome (SARS) in Guangdong, People’s Republic of China, in
February, 2003. Lancet. 2003;362:1353–1358.
184. Ksiazek TG, et al. A novel coronavirus associated with severe acute
respiratory syndrome. N. Engl. J. Med. 2003;348:1953–1966
188. Zaki AM, van Boheemen S, Bestebroer TM, Osterhaus AD, Fouchier
RA. Isolation of a novel coronavirus from a man with pneumonia in Saudi
Arabia. N. Engl. J. Med. 2012;367:1814–1820