Simulação computacional do comportamento fractal

em colônias de bactérias

Vanessa Fernandes, Lucas Barbiere – IFRJ Paracambi – Licenciatura em Matemática

Cassia Isac, Thiago Leal – IFRJ Paracambi
vanessa.fernandes.silva@hotmail.com, lkz.israel@gmail.com, {cassia.goncalves, thiago.leal}@ifrj.edu.br

Introdução Metodologia
Serão feitas simulações computacionais com o intuito de observar o desenvolvimento
Diversas são as manifestações de padrões fractais na Natureza. As estruturas que
de uma colônia de bactérias, utilizando o método DLA. Este descreve processos onde
exibem esse comportamento têm em sua fractalidade uma solução evolucionária para
partículas estão em movimento browniano. As partículas consideradas, que neste contexto
perpetuar a vida.
representam as bactérias, serão aqui mencionadas como agentes.
Dentre outros exemplos, é possível mencionar também o desenvolvimento de
Os agentes submetidos ao movimento browniano, em algum ponto de sua trajetória,
colônias de determinadas bactérias, como a E. coli [5] ou a Salmonella typhimurium [4],
chocam-se com a partícula central, agregando-se à esta. Além disso, a simulação busca
cujas fronteiras projetam vilosidades, apresentando um padrão fractal. Nestes casos,
analisar os parâmetros do modelo descrito em [2], observando o consequente efeito destes
portanto, a dimensão fractal pode ser um interessante parâmetro para descrever o formato
na morfologia do aglomerado de agentes.
que emerge da fronteira dessas colônias [1].
O modelo tomado como base, e descrito em [2], considera a relação entre parâmetros
Alguns estímulos químicos ou físicos, externos à colônia, como a quantidade de
e variáveis em um formato adimensional, como:
nutrientes ou a rigidez do meio, influenciam na nutrição e mobilidade dos organismos,
∂Y Y
=D ∇ 2 Y B na presença de agentes i
constituindo análises interessantes e que se refletem na organização da colônia. Com isso, a ∂τ Y+A
∂Y na ausência de agentes i
modelagem computacional propicia a realização de experimentos virtuais e o efeito dessas =D ∇ 2 Y
∂τ
Ou ainda, ao analisar a variação de massa dos agentes:
alterações no meio sobre os organismos. d Xi Y
=C (1+ X i ) para X i =0
dτ Y +A
d Xi Y 1
=C (1+ X i ) E para 0< X i <1 i=1,... , N
dτ Y+A √ 1+ X i

(I) (II)
(III)
Figura 1: (I) Colônia de L. monocytogenes incubada por 7 semanas;(II) Colônias de P.
mirabilis incubadas por 18 horas; (III) Colônias de Salmonella spp. S. anatum incubadas
por 2 (A) e 4 (B) semanas e (C) duas colônias de S. typhimurium incubadas por 3 semanas.
Objetivo
Este trabalho tem como objetivo simular computacionalmente o crescimento de uma
colônia de bactéria, através do modelo descrito por [2], baseado no método Diffusion-
Limited Aggregation (DLA). Tem-se a finalidade de observar o comportamento desta
X+ = 0; X N +1=0 para X- = 1.
Sendo:
• A: cinética de absorção de nutrientes pelos agentes,
• B: parâmetro associado ao esgotamento da camada de nutriente;
• C: absorção dos nutrientes pelos agentes;
• D: coeficiente de difusão de nutrientes na camada de nutrição;
• E: contribuição da massa que depende da energia cinética; e
• τ : tempo
Este trabalho é tema de um projeto de Iniciação Científica, que encontra-se em estágio
inicial de desenvolvimento.
Bibliografia
1.D. J. Barry, “Quantifying the branching frequency of virtual filamentous microbes using
fractal analysis,” Biotechnology and Bioengineering 110 (2003) 437– 447.
2.Y. Huang, I. Krumanocker, and M. –O. Coppens, “Fractal self-organization of bacteria-
inspired agents,” Fractal 20 (2012) 179-195.
3.S. E. Morandé, “Dimensões Fractais Aplicadas ao Estudo de Bactérias.” (2013).
4.T. Matsuyama and M. Matsushita, “Self-similar colony morphogenesis by gram-negative
rods as the experimental model of fractal growth by a cell population”, Appll. Environ.
Microbiol., vol. 58, 1227–1232, (1992).
5.S. Lambert, S.Moustier, P. Dussouillez,M. Barakat, J. Bottero, J. L. Petit, and P. Ginestet,
“Analysis of the structure of very large bacterial aggregates by small-angle multiple
light scattering and confocal image analysis,” Journal of Colloid and Interface Science
262 (2003) 384–390.

bactéria em função de diversos fatores que alteram as configurações do padrão exibido pela Agradecimentos
fronteira da colônia. Agradecemos ao Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Rio de
Janeiro, campus Paracambi, pelo aposte financeiro.