Microbiologia ambiental

Profa Renata Manfrinato

 Microbiologia ambiental
• Ciências ambientais X ecologia microbiana.
-Estuda os microrganismos e suas funções e os
efeitos provocados pela presença e atividade
desses no meio ambiente.
-Com os avanços da biologia molecular
aumentou-se a habilidade de detectar e
identificar microrganismos e suas atividades no
ambiente.
 Microbiologia ambiental
Ecologia microbiana
• Estudo das interações entre populações de
microrganismos e entre estas populações e outros
organismos de outros níveis tróficos. É o estudo da
estrutura e da função do ecossistema. A estrutura é a
composição da comunidade biológica, a quantidade e a
distribuição dos componentes abióticos e a faixa
gradiente das condições ambientais. Já a função envolve
processos relacionados com o fluxo de energia, a
ciclagem de nutrientes e a regulação mútua dos
organismos no ambiente.
 População microbiana
• Os ecossistemas são formados pelas comunidades
biológicas e pelos componentes abióticos. Cada
ecossistema apresenta uma diversidade de
microrganismos distribuídos em duas categorias:
• 1 – Autóctones ou indígenas, que são os
microrganismos residentes e naturais daquele
ambiente.
• 2- Alóctones ou não indígenas, que são os
microrganismos transitórios.
• O ecossistema pode ser ocupado por microrganismos
especializados metabolicamente e que são restritos a
um ambiente distinto.
 Nicho ecológico
O nicho corresponde ao papel funcional do
microrganismo na comunidade e suas
características de adaptação às condições
ambientais. Cada espécie apresenta
requerimentos nutricionais particulares,
propriedades cinéticas e potenciais bioquímicos.
As características do microrganismo são
determinantes da habilidade ou não de realizar
uma função particular no ambiente
 Microbiologia Ambiental
• Os microrganismos buscam sobreviver
executando metabolismo, e
consequentemente, crescimento. A grande
diversidade de habitats fez com que os
microrganismos estivessem sob diferentes
pressões seletivas o que resultou na seleção
de grande variedade metabólica, fisiológica e
molecular.
 Microbiologia ambiental
Diversidade biológica:
• 5 milhões de microrganismos – estimativa
• 100.000 identificados por marcadores
(metagenômica)
• Mais de 10.000 espécies de bactérias.
• Estima-se que existam 1,5 milhões de
espécies de fungos, porém são conhecidas cerca
de 69.000.
 Microbiologia ambiental
Microrganismos e o ambiente:
• Microrganismos estão em todos os lugares.
• Dentro e sobre o corpo de animais. • Nos objetos
que tocamos, usamos, comemos e bebemos.
• Superfícies imersas – biofilmes.
• Plantas.
• No interior da terra.
• Extraterrestres?
 Biofilmes
Biofilme microbiano é um complexo
ecossistema microbiano, altamente dinâmico
que atua de maneira coordenada, aderidas as
superfícies bióticas e/ou abióticas (sésseis) ou
suspensas em solução (planctônicas), cujas
células podem ou não estar envolvidas por uma
matriz de exopolímeros (polissacarídeos,
proteínas, lipídeos), podendo ser formada a
partir de uma única ou de múltiplas espécies
 Biofilmes
• Os biofilmes possibilitam a criação de microambientes e nichos na
ausência de um ambiente físico estruturado e propiciam melhor
condição de sobrevivência nos ambientes naturais. Protegem
contra flutuações de pH, radiação ultravioleta, concentração de
sais, desidratação, predadores, fagocitose, biocidas e
antimicrobianos. Aumentam a possibilidade de trocas de material
genético entre seus componentes e facilitam o estabelecimento de
microconsórcios, possibilitando a utilização de substratos de difícil
degradação. Também aumentam a quantidade de nutrientes
disponíveis, através da deposição e concentração desses na matriz
polimérica.
• Biofilmes têm sido extensivamente estudados pelo seu papel no
ciclo de nutrientes e controle de poluentes em ambientes
aquáticos, além dos efeitos benéficos ou prejudiciais à saúde
humana.
 Biofilmes
• É importante ressaltar que biofilmes
microbianos são produzidos por culturas
puras de bactérias e por consórcios de
microrganismos, que podem incluir fungos,
protozoários e algas.
 Biofilmes
Os biofilmes mais comuns na natureza são
heterogêneos, compostos por duas ou mais
espécies, podendo os produtos do metabolismo
de uma espécie auxiliar o crescimento das
outras e a adesão de uma dada espécie fornecer
ligantes que promovem a ligação de outras.
Inversamente, a competição pelos nutrientes e
a acumulação de metabólitos tóxicos produzidos
pelas espécies colonizadoras poderão limitar a
diversidade de espécies num biofilme
 Biofilmes
Alcaligenes, Bacillus, Enterobacter,
Flavobacterium, Pseudomonas e Staphylococcus
são gêneros de bactérias frequentemente
encontrados em biofilmes.
 Biofilmes
A formação do biofilme é afetada pelas
características da superfície, pela cobertura
polimérica da água, pela presença de materiais
particulados, pela qualidade e concentração de
nutrientes do meio circundante e pelas
características da bactéria e do fluido, se
houver.
Formação de biofilmes
 Formação de Biofilmes
•1- Formação de filme condicionado – adsorção de substâncias orgânicas a uma
superfície sólida e colonização inicial por um único tipo bacteriano.
•2- Associação transiente do microrganismo com a superfície ou com outros
microrganismos. Produção de EPS (proteínas, carboidratos e polissacarídeos) e
biosurfactantes. Apêndices externos, como adesinas e pillus tipo III, facilitam a
associação.
•3- Associação estável – adesão firme dos microrganismos à superfície. Redução da
motilidade desses através da inibição do gene da flagelina. Síntese de
exopolissacarídeos e desenvolvimento de camadas compostas por diferentes
microrganismos.
•4- Maturação – formação e estruturação de microcolônias. Formação de poros
intersticiais e canais. Síntese de mais exopolissacarídeos. Ocorrem interações
metabólicas e genéticas entre os microrganismos.
•5- Dispersão: expansiva- ocorre a liberação de células do interior das colônias após a
morte celular, ou pela degradação da matriz por liases e a restauração da motilidade
dos microrganismos.
 Biofilmes
Biofilmes microbianos possuem a característica
de realizar a biodegradação, realizando a
biocorrosão de superfícies metálicas e em
especial encanamentos e a biodegradação de
rochas, pedras e construções.
 Biofilmes
Os biofilmes podem ser classificados, quanto sua origem, de
duas maneiras: naturais ou sintéticos. Os naturais são
formados a partir da aglomeração de microrganismos que
estão dispostos em uma superfície coberta por água e unidos
devido à secreção de uma substância viscosa, como exemplo
o limbo. Quando estas superfícies estão em contato direto
com a água e expostas à radiação solar, acarretam aos
microrganismos características que os classificam como
fototróficos ou fotossintetizante, ou seja, organismos capazes
de converter luz em ATP, energia eletromagnética (luz) em
ATP necessário para seu desenvolvimento. Já os sintéticos,
são feitos a partir de polissacarídeos, como por exemplo,
amido e pectina; Ou proteínas, como glúten e gelatina.