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A separação dos enantiômeros por métodos convencionais não é possível, uma vez
que as suas propriedades físicas dificultam tais processos, por isso é importante utilizar
métodos especiais como eletroforese capilar, cromatografia gasosa, cromatografia em camada
delgada e a cromatografia com fluido supercrítico.
Os enantiômeros podem ser separados por dois métodos: direto e indireto. O método
direto consiste pela diferença de estabilidade dos complexos diastereoisométricos formados e
a fase quiral. Já no método indireto a separação dos enantiômeros utiliza um reagente quiral e
enantioméricamente puro, formando um par de diastereoisômeros, que podem ser separados
por fases estacionárias aquirais.