03/08/2012

Mineração de Dados em
Objetivo do Curso
Biologia Molecular
Sobre o curso
Fornecer ao aluno os principais conceitos
de Mineração de Dados, enfatizando
as técnicas mais utilizadas para aplicações
práticas em Biologia Molecular

André C. P. L. F. de Carvalho
Monitora: Valéria Carvalho
03/08/2012 André de Carvalho - ICMC/USP 2

Tópicos do Curso Final do curso

Entender os principais passos da descoberta de
Descoberta de conhecimento em conj. de dados conhecimento de conjuntos de dados biológicos
Data Warehouse e OLAP Ser capaz de sumarizar estatisticamente um
Análise e preparação dos dados conjunto de dados biológicos
Pré-processamento dos dados Compreender o processo de preparação dos dados
Mineração de dados Ser capaz de produzir e analisar modelos
Preditiva
utilizando técnicas de mineração de dados
Descritiva
Ferramentas
Ler e compreender artigos científicos sobre
mineração de dados em biologia molecular
Aplicações em Biologia Molecular

03/08/2012 André de Carvalho - ICMC/USP 3 03/08/2012 André de Carvalho - ICMC/USP 4

Exercícios Material didático

Por em prática o que for visto durante o Conteúdo dos capítulos cobertos nos
curso livros indicados
Preparação de dados Ou outros livros de MD, que cubram os
Implementação tópicos visto
Realização de experimentos Os slides do curso têm tudo, menos o
Análise de resultados essencial
Bem escrito

5 6

1
 03/08/2012

Projeto Etiqueta de aulas

Utilizar MD para resolver problema real
Dados públicos
Detalhes a serem definidos depois
Chegar no horário da aula
Pedir licença para entrar e sair da sala
Usar palavras “mágicas” por favor, com licença,
obrigado (a) e desculpe
Não conversar durante a aula
Levantar o braço para fazer perguntas e comentários
Não ler outro material durante a aula
Desligar celular durante a aula
Colocar lixo no lixo
Não copiar de colega ou site material a ser avaliado

7 03/08/2012 André de Carvalho - ICMC/USP 8

Avaliação Datas
Provas: Prova 1: 11/10
Duas provas normais Prova 2: 22/11
Provas curtas, uma após cada duas aulas Projeto: 6/12
Chamada oral
Alunos podem ser perguntados em aula,
valendo nota
Trabalhos:
Um por laboratório e um projeto final
03/08/2012 André de Carvalho - ICMC/USP 9 03/08/2012 André de Carvalho - ICMC/USP 10

Cálculo da Média Recuperação

Sejam Só terão direito à recuperação os alunos
MC = Média Chamada com 3.0 ≤ MF ≤ 5.0 e freqüência
MP = Média Aritmética das Provas superior a 70%
NT = Nota Trabalho Observação:
MF = Média Final
Será dada a nota 0.0 (zero) para cópia
Se MP ≥ 5 e NT ≥ 5 → MF = (4MP + 3MC + parcial de programa ou prova, sendo o
3MT ) /10 ou (6MP + 4NT) / 10 problema levado para a coordenação do
Se MP < 5 ou NT < 5 → MF = menor valor curso
entre MP, MC e NT

03/08/2012 André de Carvalho - ICMC/USP 11 03/08/2012 André de Carvalho - ICMC/USP 12

2
 03/08/2012

Livros para o Curso Pacotes e Conjuntos de Dados

K. Faceli, A. Lorena, J. Gama, J. e A. de Carvalho: WEKA
Inteligência Artificial: Uma Abordagem de
Aprendizado de Máquina, Editora LTC, 2011 http://directory.google.com/Top/Computers/Artific
ial_Intelligence/Machine_Learning
I. H. Witten e E. Frank, Data Mining: Practical
Machine Learning Tools and Techniques with Java R
Implementations. Morgan Kauffman, 2011 (terceira http://lancet.mit.edu/ga
edição)
J. Han e M. Kamber, Data Mining: Concepts and Machine Learning Data Repository UC Irvine
Techniques, 2nd edition, Morgan Kaufmann, 2006 http://www.ics.uci.edu/~mlearn/ML/Repository.ht
V. Kumar, M. Steinbache P. Tan, Introduction to Data ml
Mining, Pearson / Addison-Wesley, 2006

03/08/2012 André de Carvalho - ICMC/USP 13 03/08/2012 André de Carvalho - ICMC/USP 14

Perguntas

03/08/2012 André de Carvalho - ICMC/USP 15