O que é a Bioquímica?

❑ Estudo da base molecular da VIDA

❑ Estudo das reações químicas que ocorrem

nos organismos vivos:

▪ Degradação dos nutrientes dos alimentos que

lhes fornecem energia

▪Transformação ou biossíntese para formação de

compostos necessários às células

1
Objetivos da Bioquímica:

❑ Determinar como conjuntos de

moléculas inanimadas que constituem
os seres vivos interagem entre si para
manter e perpetuar a VIDA, somente por
leis químicas que governam o universo
não vivo.

2
 Bioquímica I
❑ Estudo da estrutura, propriedades e
funções da Biomoléculas

❑ Compreensão e interpretação dos

aspectos ou domínios particulares do
metabolismo

3
 A lógica molecular dos organismos vivos

• Organismos vivos • Matéria inanimada

1. Elevada organização, 1. Estruturas pouco

células complexas, organizadas, misturas de
variedade de espécies compostos químicos
relativamente simples
2. Retiram, transformam e
usam energia do meio 2. Não usam energia de
ambiente (nutrientes e luz forma sistemática e
solar), para manutenção dinâmica para
de estruturas e realização manutenção de estrutura
de trabalho e produção de trabalho

3. Capacidade de auto- 3. Estrutura estática

replicação
4
 Biomoléculas
• Ácidos nucleicos*: armazenamento e transmissão da
informação genética
• Proteínas*:
- Produtos e efetuadores da acção genética
- Atividade catalítica
- Função estrutural
• Polissacáridos*:
- Armazenamento de energia (ex. amido)
- Elementos estruturais (ex. celulose)
• Lípidos:
- Armazenamento de combustível muito rico em energia
- Componentes estruturais

* Macromoléculas 5
Hierarquia molecular

6
 A Bioquímica explica as diversas formas de
vida em termos químicos unificadores

Se os organismos
vivos são compostos
de moléculas
intrinsecamente
inanimadas, como é
que essas moléculas
conferem uma
considerável
combinação de
características a que
chamamos VIDA?

7
• Por que razão os organismos vivos
parecem ser mais do que a soma dos seus
componentes inanimados?

8
•Abiogénese •Biogénese

- teorias que consideravam - todos os organismos vivos

possível o surgimento de Vida a
surgem a partir de outros
partir de matéria inanimada,
organismos vivos e nunca por
fosse qual fosse o agente
geração espontânea.
catalisador dessa transformação.

•Criacionismo •Experiências de Redi

•Geração Espontânea •Experiências de Pasteur

9
• Está definitivamente
provado que, nas
condições actuais, a Vida
surge sempre de outra
Vida, preexistente.

• Mas, como surgiu a Vida

pela primeira vez ?

10
 Origem do Universo
• 15 a 20 biliões de anos “BIG BANG”

Formação de He e H

Arrefecimento gradual do Universo

Sol
Nebulosas

• 4,5 biliões de anos

Planetas TERRA

11
A ausência de uma camada de ozono perfeitamente
formada provocava num verdadeiro "bombardeamento"
da superfície terrestre por radiações ultravioleta de alta
intensidade

Radiações cósmicas
Reações termonucleares TERRA

• Formação de elementos no estado gasoso (muito estáveis)

C, O, N, P, S

• Formação de compostos simples (P e T determinado)

CO, CO2, H2S, NH3, CH4, N2, H2, H2O 12

 ORIGEM PRÉ-BIÓTICA DOS
COMPOSTOS ORGÂNICOS
De onde teriam vindo as
moléculas que originaram
os primeiros seres vivos?

1 – Reações entre as
moléculas dos gases
atmosféricos.
2 – “Semeadas” dos cometas
e meteoritos.

13
 TEORIA DA EVOLUÇÃO QUÍMICA
OU MOLECULAR
Postulada por: A vida é resultado de uma
evolução a partir de
compostos inorgânicos
Huxley (1825-1895) que se combinaram
Haldane (1892-1964) originando moléculas
orgânicas simples e
Oparin (1894-1980) depois moléculas
orgânicas mais complexas
até o surgimento de
estruturas com
capacidade de se auto-
duplicar e apresentar
atividades metabólicas. 14
• 1) Evolução química
Moléculas simples reagem para formar polímeros orgânicos
complexos

• 2) Auto-organização
Os polímeros organizam-se e formam entidades não vivas
(coacervados ou microsferas) que, posteriormente adquirem
a capacidade de se auto-replicarem (transição de grupos de
moléculas reativas sem vida para sistemas vivos)

• 3) Evolução biológica
As células primitivas originaram sistemas metabólicos mais
complexos com capacidade de formar organismos
multicelulares e de se reproduzir. 15
https://www.youtube.com/watch?v=mRzxTzKIsp8

16
 Modelo evolutivo de Oparin (1924) e Haldane (1929)

Teoria baseada no princípio de que as condições

existentes na Terra primitiva eram diferentes das de hoje.

❑ Interações químicas em atmosfera redutora* (sem

O2) sob o efeito de radiações cósmicas e descargas
eléctricas das tempestades, deram origem a pequenas
moléculas à base de carbono*.

❑ Após arrastamento pelas chuvas até aos mares

primitivos, estes reagiram entre si, originando moléculas
mais complexas
Moléculas orgânicas capazes de se duplicar 17
* Há teorias que contestam que a atmosfera era redutora
Moléculas à base de carbono*

❑ Por que razão as substâncias orgânicas (compostos de carbono)

constituem cerca de 90% dos compostos químicos existentes?

❑ Grande versatilidade comparada com outros elementos

❑ Capacidade de formar virtualmente um nº infinito de compostos
devido à sua capacidade para estabelecer 4 ligações covalentes
altamente estáveis (simples, duplas e triplas)

18
Experiência de Miller e Urey (1953) : Formação abiótica de
compostos orgânicos sob condições semelhantes à atmosfera
primitiva (confirmou experimentalmente a Hipótese de Oparin e
Haldane)

19
A formação de aminoácidos (alanina, ácido aspártico e
glutamato) e ácidos orgânicos simples (fórmico,
acético, propiónico, láctico e succínico) usuais nos
seres vivos, a partir de uma mistura de gases,
redutora, com composição semelhante à da
atmosfera primitiva, foi realizada experimentalmente,
em 1953, por Harold Urey e Stanley Miller, recorrendo
a descargas eléctricas como fonte de energia.

Com esta experiência, demonstrou-se ser possível a

síntese de moléculas orgânicas por via não biótica e
consolidou-se a hipótese chave de Oparin e Haldane.

20
 Experiências de FOX (1957)- origem das
macromoléculas em meio não aquoso

Baseando-se nas experiências de Miller, Sidney Fox, aqueceu

uma mistura seca de aminoácidos. Fox partiu da suposição de
que os compostos orgânicos caídos com as chuvas formavam
massas secas sobre as rochas quentes, após a evaporação da
água.

No final de sua experiência

constatou a presença de
proteinóides (moléculas de
natureza proteica constituídas
por poucos aminoácidos), numa
evidência de que os aminoácidos
se teriam unido através de
ligações peptídicas, numa
síntese por desidratação.

21
• Dado que a concentração de monómeros nos
oceanos primitivos deveria ser baixa e que as reações
de polimerização são reações de desidratação, estas
não seriam fáceis de obter em condições naturais.

• Assim, foi proposto que as polimerizações teriam

ocorrido apenas em condições especiais*, que
aumentavam artificialmente a concentração de
monómeros e catalisavam as reações.

• * Argilas ou microcavidades minerais tipo favo de abelha com

propriedades organofílicas e catalíticas.

• Argilas organofílicas são argilas que contém moléculas orgânicas intercaladas entre as camadas
estruturais inorgânicas, mudando a natureza hidrofílica para hidrofóbica. 22
Ácidos nucleicos ou Proteínas:
Quais se formaram primeiro?

O ovo ou a galinha:
Qual se formou primeiro? 23
 Ácidos nucleicos ou Proteínas:
Quais se formaram primeiro?
Factos a favor das Proteínas

▪ Os aa (aminoácidos) associam-se em proteinóides em

condições próximas das existentes inicialmente na terra

▪ A sequência destes aa não é bem determinada, embora

também não seja puramente casual e alguns proteinóides
tenham ação catalítica (microsferas)

▪ O processo de tradução na síntese de proteínas depende da

presença de DNA, mas este para se duplicar precisa de
determinadas proteínas

▪ A síntese laboratorial de ácidos protonucleicos é mais difícil

que a de proteinóides, apesar de a organização de um ácido
nucleico ser mais simples (no entanto já foi descrita por Powner et al a
síntese de ribonucleótidos de pirimidina…)
24
 Ácidos nucleicos ou Proteínas:
Quais se formaram primeiro?
Factos a favor dos Ácidos nucleicos

▪ Responsáveis pela síntese de proteínas

▪ A sequência dos aa numa proteína (e a atividade biológica)

é determinada pela sequência de nucleótidos

▪ A organização espacial das cadeias de ácidos nucleicos é

muito menos complexa do que a das proteínas (4 tipos de
nucleótidos vs 20 aa)

▪ Verificou-se o RNA catalisa algumas reacções de síntese

de proteínas RNA Catalisador ou RNA Auto-replicativo

25
• 1) Hipótese dos “Genes primeiro”- O mundo do RNA

• Acredita-se hoje que a primeira molécula

“informacional” tenha sido o RNA, e não o DNA. Foi
feita a descoberta de que certos “pedaços” de RNA têm
uma atividade catalítica: permitem a produção, a partir
de um molde de RNA e de nucleótidos, de outras
moléculas de RNA idênticas ao molde!

• O RNA com atividade “enzimática” designa-se ribozima.

Isso permite explicar o eventual surgimento e duplicação
dos ácidos nucleicos, mesmo na ausência das
sofisticadas polimerases (proteínas) que atuam hoje.

https://www.youtube.com/watch?v=K1xnYFCZ9Yg 26
27
• Montagem espontânea de moléculas de fosfolípidos
existentes na “sopa” pré-biótica que englobou uma
mistura de RNA auto-replicativo e outras moléculas

• RNA em sistema fechado Selecção natural do

RNA de acordo com a sua capacidade de produção
de proteínas mais avançadas

• As bactérias são os seres vivos que mais

semelhanças apresentam com os 1ºs organismos

28
 2) Hipótese do “Metabolismo primeiro”

• É uma alternativa à hipótese de “genes primeiro” e sugere que redes

auto-sustentáveis de reações metabólicas podem ter sido o primeiro
tipo de vida simples (ANTES dos Ácidos Nucleicos)

• Essas redes podem ter -se formado próximo a respiradouros hidrotermais

submarinos que forneceram um suprimento contínuo de precursores
químicos, e podem ter sido auto-sustentáveis e persistentes
(satisfazendo os critérios básicos da vida).

• Vias inicialmente simples podem ter produzido moléculas que atuaram

como catalisadoras para a formação de moléculas mais complexas.

• Eventualmente, as redes metabólicas podem ter sido capazes de construir

moléculas grandes como as proteínas e ácidos nucleicos.

https://www.youtube.com/watch?v=yTxZXkp-6sI 29
• Vida evoluiu em ambientes submarinos
anaeróbios e de alta temperatura similares
aos sistemas hidrotermais.

• Essa hipótese é suportada pela observação

de estruturas consideradas vestígios de
proto células, em rochas formadas por
processos hidrotermais há 3,5 – 3,8
bilhões de anos atrás.
•
• Os primeiros organismos na Terra seriam,
assim, hipertermófilos anaeróbios.

• Habitats em fontes hidrotermais

provavelmente ofereceriam, também, um
ambiente estável e relativamente isolado
dos efeitos catastróficos dos impactos de
meteoros.
30
Microcavidades minerais (rochosas) no fundo dos oceanos ricas
em Fe, Ni, e S, promotoras de síntese química

Biopolímeros confinados às microcavidades de Fe-S atingem

concentrações elevadas

Pré-célula desprovida de membrana, mas separada do meio

exterior por um compartimento de natureza inorgânica.

Emergência das linhagens Procariotas nos confinamentos

inorgânicos- desenvolvimento de membranas
- éteres isoprénicos nas Archaeobacteria e
- ésteres de ácidos gordos nas Eubacteria
31
 Nova teoria?

• Em algum ponto no início da evolução, a vida tornou-se celular. Supondo que essa
etapa fosse necessária para a origem da vida, haveria necessariamente uma fonte pré-
existente de compostos anfiílicos capazes de se agrupar em compartimentos
membranosos.

• É possível fazer suposições sobre as propriedades de tais compostos e as condições

mais favoráveis à sua automontagem em estruturas membranares.

• As membranas provavelmente incorporavam misturas de derivados de

hidrocarbonetos entre 10 e 20 carbonos de comprimento com grupos carboxilato
ou hidroxilo. Esses compostos podem ser sintetizados por reações químicas e quase
certamente pequenas quantidades estavam presentes no ambiente pré-biótico.

• A montagem da membrana ocorre mais facilmente em soluções de baixa força iônica

com teor mínimo de sal e catiõess divalentes, o que sugere que a vida celular
começou em piscinas de água doce associadas a ilhas vulcânicas, em vez de
fontes hidrotermais submarinas. 32
Figure 2. Structures, components, and abiotic synthetic pathways of bio-
macromolecules operating three fundamental functions of life:
replication, compartmentalization, and metabolism.
33
Figure 15. Overview of the chemical evolution of life. 34
 Perspectivas atuais: teoria evolucionista ou da
geração espontânea gradual pótese h
Consiste, basicamente, em admitir que, de forma espontânea e
gradual, em condições ambientais diferentes das que
actualmente existem, entidades moleculares se terão
combinado, dando primeiro origem:

• a novas moléculas, que classificamos de orgânicas (porque

intervêm na constituição dos organismos e só por eles são hoje
sintetizadas na natureza), e depois

• a moléculas mais complexas por justaposição das primeiras (os

polímeros).

• Finalmente, estruturas moleculares complexas e constituindo

entidades isoladas do meio, com capacidades metabólicas e de
reprodução, sujeitas às leis da evolução (diversidade-selecção-
evolução), terão estado na origem das primeiras células vivas.
35
 ORIGEM DOS SISTEMAS ISOLADOS

Os processos químicos que

caracterizam a vida ocorrem sempre
no interior das células.

Estas são delimitadas por uma fina

membrana que caracteriza o ponto
inicial do surgimento da vida

36
 1) Hipótese Heterotrófica
Os primeiros seres vivos era incapazes de
sintetizar seu próprio alimento.

Nutriam-se de matéria orgânica (coacervados,

aminoácidos, glúcidos) e realizavam
fermentação.

A disponibilidade de alimento e a forma como

o obtinham permitiram reproduzir-se
rapidamente e proliferar

O meio começou a receber um grande teor

de dióxido de carbono e o alimento a ficar
escasso, resultando numa verdadeira
crise energética para estes primeiros
seres vivos.

37
 A fotossíntese surge devido a uma crise
energética com o objetivo de proporcionar a
síntese de alimento tendo como consequência
a libertação de O2.
Aparecimento dos primeiros seres
fotossintéticos simples (cianobactérias)
e autotróficos.

CO2+H2O→C6H12O6+O2

A libertação de O2 vai promover o aparecimento

de respiração celular aerobia nos
heterotróficos, muito mais eficiente em termos
energéticos.
38
 2) Hipótese Autotrófica

A célula primitiva obtinha a sua

própria energia (ATP) a partir de
matéria inorgânica, por
quimiossíntese.
(por ex bactérias nitrificantes).

Hoje pode ser observado, por ex, em

algumas bactérias que vivem em
ambientes extremos (ausência de
luz, altas temperaturas).

Esta energia era depois utilizada na

síntese de substâncias orgânicas
(CH2O).

39
Resumo

40
 CONSEQUÊNCIA DA LIBERTAÇÃO
DO O2

• Foi considerado o holocausto do O2.

• Foi responsável pela síntese de uma grande
quantidade de radicais livres.
• Inicialmente reagia com iões de Ferro
formando oxido de ferro.
• Tornou o meio aeróbio após esgotar os
depósitos de iões de ferro.

41
O oxigénio atmosférico e o curso da evolução
25

20

15

10

0
0 0,5 1 1,5 2 2,5 3 3,5 4 4,5 5
T e m po ( biliõe s de a no s )

Eucariotas Células 1ª Libertação 1ª Células vivas

eucarióticas Formação da Terra
Multicelulares de Oxigénio
fotossintéticas
(plantas, fungos, 1ª Células
Respiração Formação de
animais) Algas verdes ou fotossintéticas
aeróbia oceanos e 42
vermelhas
endossimbiontes (bactérias) (cianobactérias) continentes
 O2 ATMOSFÉRICO E O CURSO DA
EVOLUÇÃO
A relação entre a mudança dos níveis de oxigénio atmosférico é um
dos principais estágios que ocorreu na evolução dos organismos
na Terra.

As evidências geológicas sugerem que houve mais de um bilião de

anos de intervalo entre o aparecimento das cianobactérias e o
período em que grandes concentrações de O2 começaram a
acumular-se na atmosfera. Esse intervalo tão grande deveu-se,
sobretudo, à grande quantidade de ferro solúvel existente nos
oceanos, que reagia com o O2 libertado para enormes depósitos
de óxido de ferro.
43
 IMPORTANTE
1 - O oxigénio molecular é tóxico para os organismos que não disponham
de mecanismos enzimáticos protectores (catalase ou peroxidase, por
exemplo) capazes de reduzir os subprodutos altamente nocivos do
metabolismo oxidativo (peróxido e superóxido de hidrogénio).

2 - Os dados geofísicos indicam que o oxigénio molecular surgiu

gradualmente na atmosfera há cerca de 2000 M.a.

3 - O oxigénio teve um papel fundamental no desenvolvimento e

complexidade das estruturas biológicas, como se pode constatar pelos
exemplos seguintes:

• capacidade de divisão celular depende da formação do complexo

actina-miosina, impossível sem oxigénio;
• síntese de esteróis, ácidos gordos e colagénio é impossível sem
oxigénio;
• metabolismo aeróbio fornece 15 vezes mais energia que o anaeróbio;
• camada de ozono permitiu a vida em terra.

44
A célula eucariótica dquiriu a capacidade de realizar a respiração e a
fotossíntese depois da simbiose realizada com células procarióticas aeróbias e
45
fotossintéticas (Lynn Margulis)
Evolução dos Eucariotas através da Endossimbiose

46
 Bibliografia
Referências de estudo:

• Quintas et al, “Bioquímica-Organização molecular da vida”, Ed. Lidel, 2008.

Capítulo 1, Origem molecular da vida, pg.3-14.

• Voet e Voet ”Biochemistry”, Ed. Wiley, 3ª edição, 2004. Capítulo 1, 1-5-The

origin of life, pg.28-34.

• Artigo fornecido “Hipóteses sobre a origem da vida”

• O que é Evolução Química?

https://www.youtube.com/watch?v=mRzxTzKIsp8

• Qual é a hipótese do mundo do RNA?

https://www.youtube.com/watch?v=K1xnYFCZ9Yg

• What Is The Metabolism-First Hypothesis For The Origin Of life?

https://www.youtube.com/watch?v=yTxZXkp-6sI
47