Responda as questes:

1. O que so marcadores moleculares?

So segmentos particulares de DNA que representa as diferenas em nvel de
genoma. Pode ou no estar associado com a expresso de uma caracterstica fenotpica.
So estveis, detectados em todos os tecidos. So independentes da fase de crescimento,
diferenciao, desenvolvimento e necessrio que no sejam influenciados por efeitos
ambientais, pleiotrpicos e epistticos. Eles dependem de mtodos de isolamento de DNA
e do desenvolvimento de tcnicas modernas de biologia molecular. Foram criados diversos
mtodos de deteco de polimorfismo gentico diretamente do DNA. Portanto, eles
descrevem o padro molecular de um gentipo e apresentam a capacidade de detectar
variao superando a expresso do fentipo e a influncia do ambiente sobre o gentipo.

2. Quais as principais
microssatlites?

diferenas entre

os

marcadores

isoenzimticos

As isoenzimas so um grupo de mltiplas formas moleculares de uma enzima,

resultante de variaes allicas dos genes codificadores. A obteno de marcadores
isoenzimticos envolve a preparao da amostra do tecido, a separao por eletroforese
dos polimorfismos em gis de poliacrilamida ou de amido e a visualizao dos
polimorfismos por meio de corantes enzimticos especficos. As principais vantagens
dessa tcnica so o baixo custo, a facilidade e a rapidez da metodologia, bem como a
obteno de marcadores genticos co-dominantes, ou seja, marcadores que permitem a
diferenciao dos locos em homozigose dos locos em heterozigose. As desvantagens so
o baixo nmero dos sistemas enzimticos polimrficos e a influncia das condies
ambientais e dos tecidos vegetais nas atividades enzimticas.
Enquanto que os microssatlites so unidades muito curtas (2 a 5 pb) repetidas em
tandem, ou seja, uma aps a outra. Os marcadores microssatlites so conhecidos
tambm como SSR (Simple Sequence Repeats). A obteno dos marcadores envolve a
amplificao dos microssatlites via PCR, utilizando-se primers especficos (geralmente de
20 a 25 pb) para as regies do DNA que flanqueiam os microssatlites. Nesse sentido,
para

se

conseguir

marcadores

desenvolvimento

dos

primers

desenvolvimento

requer

microssatlites,
especficos

construo

de

para

necessrio,
espcie

bibliotecas

primeiramente

em

estudo.

genmicas,

Esse

seleo

sequenciamento dos clones positivos e desenho dos primers. Tais primers, em alguns
casos, podem ser utilizados para obteno de marcadores microssatlites em espcies
geneticamente relacionadas. Uma vez desenvolvidos os primers especficos, as etapas de
obteno so parecidas com as utilizadas para marcadores RAPD: extrao e amplificao
via PCR do DNA, eletroforese em gis de poliacrilamida ou agarose e visualizao do
polimorfismo por auto-radiografia, colorao com prata ou fluorescncia (gis de
poliacrilamida) ou por colorao com brometo de etdio sob luz ultravioleta (gis de

agarose). As principais vantagens deste mtodo so a co-dominncia dos marcadores, o

alto nvel de polimorfismo que pode ser detectado, a alta reprodutibilidade das marcas e a
possibilidade de deteco de vrios microssatlites (multiplex) no mesmo gel facilitando a
operacionalizao das anlises, principalmente, quando necessria a anlise de grande
nmero de acessos. As principais desvantagens so o alto custo requerido no
desenvolvimento de primers especficos, quando eles no esto disponveis para a
espcie a ser estudada e o fato das bandas inespecficas ou gis de baixa resoluo
poderem dificultar a acurada avaliao dos polimorfismos.

3. Existe alguma relao entre o tamanho e a complexidade de um genoma?

Explique.
No h uma relao clara entre o tamanho do genoma e a complexidade gentica.
No entanto, entre os diferentes filos h a necessidade de um aumento mnimo do genoma,
o que pode ser refletido em um aumento da complexidade anatmica e fisiolgica. O
tamanho do genoma das bactrias de fato, aproximadamente proporcional ao nmero de
genes que ele contm. J em eucariotos, parece no existir uma relao entre o tamanho
do genoma e o nmero de genes dos organismos. Como exemplo, podemos citar o
homem que o organismo mais complexo da lista de genomas, e, o seu tamanho
genmico inferior ao do arroz, apresentando um maior nmero de protenas descritas do
que as sintetizadas pelo arroz.