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Eletroporação de células biológicas

isoladas através de micropipetas:


Estudos numéricos dos efeitos elétricos
e mecânicos na membrana celular

Jânio Anselmo
Orientadora: Daniela Ota Hisayasu Suzuki, Dra. .

Universidade Federal de Santa Catarina – UFSC


Instituto de Engenharia Biomédica – IEB
janio.anselmo@ieb.ufsc.br

25 de julho de 2023

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Objetivos

1 Objetivos

2 Fundamentação teórica

3 Definição do modelo matemático

4 Estudo do microeletrodo EFC

5 Estudo da deformação mecânica

6 Conclusões e trabalhos futuros


Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC
Objetivos
Objetivo Geral

Contribuir com os estudos do fenômeno da eletroporação em


células isoladas utilizando microeletrodo estirado repleto de
eletrólito (EFC);
Estudar modelos matemáticos que permitam expressar o
comportamento da condutividade da membrana celular,
quando a mesma é exposta em campos elétricos não-uniformes
e deformações mecânicas em sua estrutura celular.

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Objetivos
Objetivo Geral

Contribuir com os estudos do fenômeno da eletroporação em


células isoladas utilizando microeletrodo estirado repleto de
eletrólito (EFC);
Estudar modelos matemáticos que permitam expressar o
comportamento da condutividade da membrana celular,
quando a mesma é exposta em campos elétricos não-uniformes
e deformações mecânicas em sua estrutura celular.

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Objetivos
Objetivos Especı́ficos

1 Adaptação de modelo matemático de [Glaser et al. 1988] e


[Ramos 2005]. Através deste, estudar numericamente as
variações elétricas e estruturais da célula;
2 Estudo das variações elétricas e geométricas do microeletrodo
EFC. Verificar a influência da reatância capacitiva na
condutividade da membrana celular e desenvolver um
algoritmo de suavização desta;
3 Estudo numérico do modelo matemático da deformação
mecânica. Investigar a impedância da fenda(750, 0 kΩ [Bae e
Butler 2006]) e as caracterı́sticas fı́sico-mecânicas da
membrana celular durante a eletroporação.

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Objetivos
Objetivos Especı́ficos

1 Adaptação de modelo matemático de [Glaser et al. 1988] e


[Ramos 2005]. Através deste, estudar numericamente as
variações elétricas e estruturais da célula;
2 Estudo das variações elétricas e geométricas do microeletrodo
EFC. Verificar a influência da reatância capacitiva na
condutividade da membrana celular e desenvolver um
algoritmo de suavização desta;
3 Estudo numérico do modelo matemático da deformação
mecânica. Investigar a impedância da fenda(750, 0 kΩ [Bae e
Butler 2006]) e as caracterı́sticas fı́sico-mecânicas da
membrana celular durante a eletroporação.

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Objetivos
Objetivos Especı́ficos

1 Adaptação de modelo matemático de [Glaser et al. 1988] e


[Ramos 2005]. Através deste, estudar numericamente as
variações elétricas e estruturais da célula;
2 Estudo das variações elétricas e geométricas do microeletrodo
EFC. Verificar a influência da reatância capacitiva na
condutividade da membrana celular e desenvolver um
algoritmo de suavização desta;
3 Estudo numérico do modelo matemático da deformação
mecânica. Investigar a impedância da fenda(750, 0 kΩ [Bae e
Butler 2006]) e as caracterı́sticas fı́sico-mecânicas da
membrana celular durante a eletroporação.

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Fundamentação teórica

1 Objetivos

2 Fundamentação teórica

3 Definição do modelo matemático

4 Estudo do microeletrodo EFC

5 Estudo da deformação mecânica

6 Conclusões e trabalhos futuros


Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC
Fundamentação teórica
Eletroporação – Formação de Poros

Poro hidrofı́lico,
permitindo a passagem
de moléculas;
Ruptura da membrana,
Eletroporação
irreversı́vel.

Adaptado de [Pavlin et al. 2008]

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Fundamentação teórica
Capilar estirado distante da membrana

Distância de alguns
micrômetros;
Potencial aplicado: 100
à 2, 0 kV;
Registrar informação
dos transientes dos
poros;
Campo elétrico
não-uniforme.

Adaptado de [Chiea 2013]

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Fundamentação teórica
Capilar estirado tocando a membrana celular

Eletroporação somente
sob região do EFC;
Potencial aplicado na
ordem de dezenas de
volts;
Dependente da
impedância da fenda;
Posicionar o eletrodo
sem perfurar;
Necessidade de células
aderentes.
Adaptado de [Chiea 2013]

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Definição do modelo matemático

1 Objetivos

2 Fundamentação teórica

3 Definição do modelo matemático

4 Estudo do microeletrodo EFC

5 Estudo da deformação mecânica

6 Conclusões e trabalhos futuros


Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC
Definição do modelo matemático
Modelo matemático da condutividade da membrana celular

Adaptação do modelo matemático apresentado por [Glaser et al.


1988] e [Ramos 2005]:
Potencial Transmembrana

 2
 Vm 
 
∆σm Vpp
= Ke e (1)
∆t

Vm Crı́tico Constante de Equilı́brio

Ke obtido para Vm (σm = 0) entre 1,8 e 3,3 V;


Resultados experimentais e teóricos da suspensão de célula.

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Definição do modelo matemático
Validação do modelo matemático da condutividade da membrana celular

Campo elétrico efetivo:

1 + p/2
Ef = E0
1 + (3p/4Nπ)1/3

Erro máximo das curvas:


inferior à 15%.

Adaptado de [Zudans et al. 2007]

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Definição do modelo matemático
Materiais e métodos

Potencial Elétrico em Va :
Equação de Poisson:

∂V
Vtotal + (Ltotal − l) = Va
∂z
−∇ · (σm ∇ V ) = 0

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Definição do modelo matemático
Materiais e métodos

Potencial Elétrico em Va :
Equação de Poisson:

∂V
Vtotal + (Ltotal − l) = Va
∂z
−∇ · (σm ∇ V ) = 0

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Definição do modelo matemático
Resultados – Comparação com resultados da literatura [Zudans et al. 2007]*

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Definição do modelo matemático
Resultados – Influência da distância do EFC

−5 rcélula=10,0 µm, V=500 V


x 10
1.8
d=8,0 µm
1.6 d=4,0 µm
d=2,0 µm
d=1,0 µm
1.4 d=0,5 µm

1.2
σm, S/m

0.8

0.6

0.4

0.2
0 15 30 45 60 75 90
Ângulo, θ°

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Definição do modelo matemático
Resultados – Influência da distribuição do campo elétrico – 500 à 4000 V

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Definição do modelo matemático
Resultados – Influência do raio celular - σm

−5 dpipeta=0,5 µm, V=500 V


x 10
5
r=1,0 µm
4.5 r=5,0 µm
r=10,0 µm
4 r=20,0 µm
r=30,0 µm
3.5

3
σm, S/m

2.5

1.5

0.5

0
0 5 10 15 20 25 30
Ângulo, θ°

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Definição do modelo matemático
Resultados – Influência do meio extracelular - σm

−5 rcelula=10,0 µm, dµpipeta=0,5 µm, V=500 V


x 10
2

1.8

1.6

1.4
σo=0,01 S/m
σm, S/m

1.2 σo=0,50 S/m


σo=1,50 S/m
1

0.8

0.6

0.4
0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 1
σi, S/m

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Estudo do microeletrodo EFC

1 Objetivos

2 Fundamentação teórica

3 Definição do modelo matemático

4 Estudo do microeletrodo EFC

5 Estudo da deformação mecânica

6 Conclusões e trabalhos futuros


Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC
Estudo do microeletrodo EFC
Materiais e métodos

Potencial Elétrico em Va :
Equação de Poisson:

∂V
Vtotal + (Ltotal − l) = Va
∂z
−∇ · (σm ∇ V ) = 0

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Estudo do microeletrodo EFC
Materiais e métodos

Potencial Elétrico em Va :
Equação de Poisson:

∂V
Vtotal + (Ltotal − l) = Va
∂z
−∇ · (σm ∇ V ) = 0

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Estudo do microeletrodo EFC
Resultados – Comparação com dados experimentais [Chiea 2013]

dponta = 10,0 µm
9

5
−X, R (MΩ)

−1
0 1 2 3 4 5
10 10 10 10 10 10
Frequência, Hz

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Estudo do microeletrodo EFC
O novo prisma da eletroporação

Pulsos de nanossegundos (ns):


Eletroporação das organelas
[Entre (1) – (11)];
Estimulação de fluxo de
cálcio (Ca2+ );
1 Nucléolo, 2 Núcleo celular, 3 Ribossomos,
4 Vesı́culas, 5 Retı́culo endoplasmático rugoso Alterações no potencial de
(RER), 6 Complexo de Golgi, 7 Microtúbulos, 8
Retı́culo endoplasmático liso (REL), 9 Mitocôndrias,
membrana.
10 Vacúolo, 11 Citoplasma, 12 Lisossomas, 13
Centrı́olos, 14 Membrana plasmática.

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Estudo do microeletrodo EFC
Resultados – Potencial transmenbrana x Vin (t) de 1, 0 ms

dpipeta=4,0 µm, V=500 V

Pulsoin
Pulsoout

200
400

Amplitude, mV
Amplitude, V

200

0 0
−1 −0.5 0 0.5 1 1.5 2
Tempo, ms

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Estudo do microeletrodo EFC
Resultados – Potencial transmenbrana x Vin (t) de 10, 0 µs

dpipeta=4,0 µm, V=500 V


100
Pulsoin
500
Pulsoout

80
400

Amplitude, mV
60
Amplitude, V

300

40
200

100 20

0 0
−10 −5 0 5 10 15 20 25
Tempo, µs

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Estudo do microeletrodo EFC
Resultados – Potencial transmenbrana x Vin (t) de 100, 0 ns

dpipeta=4,0 µm, V=500 V

Pulsoin
500
Pulsoout
50

Amplitude, mV
Amplitude, V

0 0
−200 0 200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 1800
Tempo, ns

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Estudo do microeletrodo EFC
Circuito elétrico total

C2
R1 A
Rin
Ce

Vin
+88.8 C1 R2
AC Volts Cin Re

R3
PBS (Extracelular)
Rpbs

R4
Rf

R5
Rm

C3
Cm
Vm
+88.8
Volts

Adaptado de [Chiea 2013]


Intracelular

R6
Ri

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Estudo do microeletrodo EFC
Circuito elétrico equivalente

R1
A
Rin

Vin
+88.8 R2 C1
AC Volts Req Ceq

Figura 1: Circuito elétrico equivalente

Adaptado de [Chiea 2013]

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Estudo do microeletrodo EFC
Equação final do Vinc (t)

 h i
Rin Ceq
 Vin (t) +1 : 0< t < ti

 tc
Vinc (t) = Vin (t) h i : ti < t < (tf − ti )
 −Vin (t) Rin Ceq

: (tf − ti ) < t < tf

tc

ti é o tempo de duração do impulso;


tc é o tempo desejado para Ceq atingir a plena carga;
tf é o tempo final do pulso Vin ;
Fora do intervalo mencionado, Vinc (t) = 0.

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Estudo do microeletrodo EFC
Resultados – Potencial transmenbrana com Vinc (t) de 10, 0 µs

dpipeta=4,0 µm, Vinc(t)


1000
Pulsoin
ti = 0,1 µs Pulsoout
→← 200

Amplitude, mV
Amplitude, V

100
0

ti = 0,1 µs
→←

0
−5 0 5 10 15
Tempo, µs

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Estudo do microeletrodo EFC
Resultados – Potencial transmenbrana com Vinc (t) de 100, 0 ns

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Estudo da deformação mecânica

1 Objetivos

2 Fundamentação teórica

3 Definição do modelo matemático

4 Estudo do microeletrodo EFC

5 Estudo da deformação mecânica

6 Conclusões e trabalhos futuros


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Estudo da deformação mecânica
Materiais e métodos

Equação de movimento:
Equação de deformação-deslocamento:
Equação constitutiva:

F = −∇ · σ
1 
∇ us + (∇ us )2

ϵ=
2
σ=C :ϵ

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Estudo da deformação mecânica
Resultados – Comparação com dados experimentais [Chiea 2013]

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Estudo da deformação mecânica
Resultados – Distribuição de tensões mecânicas de Von Mises

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Estudo da deformação mecânica
Resultados – Tensão transmembrana da célula

rcélula=10,0 µm, V=20 V


0.5
Toque na membrana
0.4 Deformação da membrana

0.3
+Vpp1
0.2 +Vpp2

0.1
Vm, V

−0.1

−0.2 −Vpp2
−Vpp1
−0.3

−0.4
15 30 45 60 75 90
Ângulo, θ°

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Estudo da deformação mecânica
Resultados – Pressão exercida pelo EFC na membrana

6 rcélula=10,0 µm, V=20 V


x 10
1
Toque na membrana
0.8 Deformação da membrana

0.6

0.4
Pressão, N/m2

0.2

−0.2

−0.4

−0.6

−0.8

−1
20 22 24 26 28 30 32 34 36 38 40
Ângulo, θ°

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Estudo da deformação mecânica
Resultados – Distribuição do campo elétrico e leitura da corrente elétrica

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Conclusões e trabalhos futuros

1 Objetivos

2 Fundamentação teórica

3 Definição do modelo matemático

4 Estudo do microeletrodo EFC

5 Estudo da deformação mecânica

6 Conclusões e trabalhos futuros


Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC
Conclusões e trabalhos futuros
Conclusões

O capı́tulo módulo I apresenta uma baliza para definições dos


parâmetros necessários na efetivação da eletroporação;
As aplicações de pulsos de curta duração em EFC’s precisam
ser revistas ou compensadas, conforme módulo II;
O módulo III demostra o forte impacto da deformação da
membrana celular na eletroporação.

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Conclusões e trabalhos futuros
Conclusões

O capı́tulo módulo I apresenta uma baliza para definições dos


parâmetros necessários na efetivação da eletroporação;
As aplicações de pulsos de curta duração em EFC’s precisam
ser revistas ou compensadas, conforme módulo II;
O módulo III demostra o forte impacto da deformação da
membrana celular na eletroporação.

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Conclusões e trabalhos futuros
Conclusões

O capı́tulo módulo I apresenta uma baliza para definições dos


parâmetros necessários na efetivação da eletroporação;
As aplicações de pulsos de curta duração em EFC’s precisam
ser revistas ou compensadas, conforme módulo II;
O módulo III demostra o forte impacto da deformação da
membrana celular na eletroporação.

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Conclusões e trabalhos futuros
Trabalhos futuros

Definição de um modelo matemático que descreva de forma


dinâmica, em função de Vm , o número de poros gerados e a
sua respectiva evolução temporal;
Aplicação e estudos numéricos de novos modelos matemáticos
para análise do comportamento fı́sico-mecânico da membrana
celular;
Experimentos de introdução de marcadores ou genes
analisando a viabilidade celular.

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Conclusões e trabalhos futuros
Trabalhos futuros

Definição de um modelo matemático que descreva de forma


dinâmica, em função de Vm , o número de poros gerados e a
sua respectiva evolução temporal;
Aplicação e estudos numéricos de novos modelos matemáticos
para análise do comportamento fı́sico-mecânico da membrana
celular;
Experimentos de introdução de marcadores ou genes
analisando a viabilidade celular.

Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC


Conclusões e trabalhos futuros
Trabalhos futuros

Definição de um modelo matemático que descreva de forma


dinâmica, em função de Vm , o número de poros gerados e a
sua respectiva evolução temporal;
Aplicação e estudos numéricos de novos modelos matemáticos
para análise do comportamento fı́sico-mecânico da membrana
celular;
Experimentos de introdução de marcadores ou genes
analisando a viabilidade celular.

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Produções Acadêmicas
Banca de TCC & Eventos – Participação I

[1] D. d. S. de Medeiros, E. M. L. Merlin, M. Moecke e J. Anselmo.


“Participação em banca de Ana Paula Rosa Negri: Detecção
de crises epilépticas baseada em sinais de eletroencefalograma
utilizando a transformada Wavelet”. Em: Trabalho de Conclu-
são de Curso (Graduação em Sistemas de Telecomunicações) -
Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Santa
Catarina (2014).
Revisor de artigos pela AMIA (American Medical Informatics Association);
V e VI Minicurso de Engenharia Biomédica na Prática;
SEPEX 2012.

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Produções Acadêmicas
Artigos – Participação I

[2] A. De Castro, C. F. Fronza e J. Anselmo. “Computational ap-


proach of the homeostatic turnover of memory B cells”. Em:
Embrapa Informática Agropecuária-Artigo em periódico inde-
xado (ALICE) (2014).
[3] C. F. Fronza, J. Anselmo, J. L. B. Marques, G. B. Pintarelli e A.
De Castro. “A Blower-Like Approach to Predict the Effective-
ness of Vaccines in a TB Dynamic”. Em: Embrapa Informática
Agropecuária-Artigo em periódico indexado (ALICE) (2014).
[4] C. F. Fronza, J. Anselmo, J. L. B. Marques, G. B. Pintarelli
e A. De Castro. “In Silico System For Early Diagnosis Of Di-
abetes Mellitus Complications By Using Dynamic Pupillome-
try And Heart Rate Variability”. Em: International Symposium
on Mathematical and Computational Biology, Poznan, Poland
(2014).
Aluno: Jânio Anselmo Dissertação de Mestrado – IEB-UFSC
Produções Acadêmicas
Artigos – Contribuições da Dissertação I

[5] J. Anselmo, L. C. Ramos, J. L. Marques, F. R. M. B. Silva


e D. O. Suzuki. “Membrane Conductance Analysis on Single-
cell Electroporation with Electrolyte-filled Capillary”. Em: IEEE
Transaction on Dielectrics and Electrial Isulation - Submitted
article (2014).
[6] J. Anselmo, D. O. Suzuki e J. L. Marques.“Estudos Numéricos
dos Influentes Parâmetros da Eletroporação Através de Micro-
capilares Estirados”. Em: XXIV Congresso Brasileiro de Enge-
nharia Biomédica - Uberlândia/MG (2014), pp. 1341–1344.
[7] D. O. Suzuki, J. Anselmo, K. D. de Oliveira, J. O. Freytag,
M. M. Rangel, J. L. Marques e A. Ramos.“Numerical Model of
Dog Mast Cell Tumor Treated by Electrochemotherapy”. Em:
Artificial Organs (2014).

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