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Universidade Federal de Pelotas

CDTec - Graduação em Biotecnologia


Disciplina de Biologia Molecular

A Estrutura dos Ácidos


Nucléicos

Priscila M. M. de Leon
Dra., Médica Veterinária
Profa, PNDP Biotecnologia/UFPel
Ácidos Nucleicos
• São macromoléculas presentes em todos os organismos vivos;
• Através deles as células recebem informação sobre qual proteína
sintetizar – CÓDIGO GENÉTICO:
exata sequencia de aminoácidos → estrutura → função proteica
 Informação localizada nos cromossomos das células;

– Tipos:
• Ácido Desoxirribonucleico (DNA)
• Ácido Ribonucleico (RNA)
Ambos são polímeros lineares de nucleotídeos
(4 diferentes) unidos por ligações fosfodiéster
Estrutura dos Ácidos Nucléicos

• DNA – Ácido Desoxirribonucléico

• RNA – Ácido Ribonucléico


• mRNA – RNA mensageiro
• tRNA – RNA transportador
• rRNA – RNA ribossômico
 hnRNA - RNA nuclear heterogêneo

 snRNA - small nuclear RNA

 Polímeros lineares compostos por 4 diferentes tipos de nucleotídeos.


História
Em 1928, Frederick Griffith realizou experimentos que forneceram evidências
que a informação genética está contida em uma molécula específica

• 1869 - Friedrich Miescher


– Substância ácida no núcleo = ácido nucléico
• 1944 - Avery, MacLeod e McCarty
– Sugeriram a função do DNA
• 1949 – Chargaff
– composição das bases do DNA (A=T, C=G; relação AT/CG variável)
• 1952 – Hershey e Chase
– Comprovou a função do DNA
• 1953 - Watson e Crick
– Propuseram a estrutura de hélice dupla do DNA – baseado em dados de
difração de raios X
A Estrutura dos Ácidos Nucléicos

Polímeros lineares de monômeros de nucleotídeos


A Aestrutura
Estrutura dos
dos Nucleotídeos
Ácidos Nucleicos
PENTOSES:

Púrica ou
DNA
Pirimidica

C1 – base nitrogenada
C5 – grupo fosfato

RNA
≠ Hidroxila no C2
A Aestrutura
Estrutura dos
dos Nucleotídeos
Ácidos Nucleicos
Legenda
O nucleotídeo é
composto por: Grupo fosfato
açúcar
grupo fosfato Açúcar
base nitrogenada
C; T U Bases
G; A nitrogenadas

Nucleosídeo

Nucleotídeo
BASES NITTROGENADAS

Base nitrogenada: composto cíclico contendo nitrogênio (grupamento funcional


Purinas – possuem anel duplo / Pirimidinas – possuem anel simples
No DNA emparelham-se com as respectivas bases complementares (≠ tamanho)
A Aestrutura
Estrutura dos
dos Nucleotídeos
Ácidos Nucleicos

 Ligação 1 – Ligação Fosfodiéster


Fosfato + C5 da pentose
 Ligação 2 – Ligação Glicosídica
Base Nitrogenada + C1 da pentose
A Aestrutura
Estrutura dos
dos Nucleotídeos
Ácidos Nucleicos

1º nucleotídeo: grupamento
fosfato em C5

Último nucleotídeo:
grupamento grupamento
hidroxílico em C3

Próximo nucleotídeo é
adicionado na extremidade
3’-OH
Ligação fosfodiéster A Estrutura
estrutura dos Ácidos
Ácidos Nucleicos
Nucléicos

O grupo hidroxila do carbono-3 da pentose do primeiro nucleotídeo se liga ao grupo


fosfato ligado a hidroxila do carbono-5 da pentose do segundo nucleotídeo através de
uma ligação fosfodiéster.
Polaridade
A estrutura das
dos fitas de
Ácidos
fitas de DNA
Nucleicos
DNA
5’ Grupo fosfato
T

Direcionalidade
A

Os nucleotídeos são
covalentemente ligados em uma
cadeia polinucleotídica
G

5’TAGC3’

3’ Grupo OH na pentose
1 Table 1. Primers used in qRT-PCR reaction for equine oocytes.

Fragment Efficiency Coorelation


Gene Acession Number Sequence TM
size (%) (R2)
F 5’ GAGACCCCCAGTGCCATCAA 3’
Bcl-2 Eq XM_001499714.1 57ºC 146 bp 99.9% 0.97
R 5’ GGGATGTCAGGTCGCTGAAT 3’
F 5’ TTTGCTTCAGGGTTTCATCC 3’
BaxEq XM_001489207.1 60ºC 162 bp 100% 0.94
R 5’ ATCCTCTGCAGCTCCATGTT 3’
F 5’ AAAGGATGCCCATGCTACAGAGGA 3’
p53 Eq XM_001918153.1 63ºC 82 bp 90.5% 0.98
R 5’ AGTAGACTGGCCCTTCTTGGTCTT 3’
F 5’ TTCATCCACTGTCCCACTGA 3’
SurvivinEq XM_001915400.1 57ºC 98 bp 70.5% 0.98
R 5’ GTTCCTCTATGGGGTCGTCA 3’
F 5’ GCC GTA ACT TCT GTG CTG TG 3’
GAPDH NM_001163856.1 61ºC 150 bp 84.0% 0.98
R 5’ AAT GAA GGG GTC ATT GAT GG 3’
2
1953 - Watson e Crick
Elucidaram a estrutura do DNA
Ácidos nucléicos
Fitas antiparalelas

Anéis aromáticos- hidrofóbicos


GRUPO CETO C=O
GRUPO AMINO C-NH2
Ponte de Hidrogênio adicional
Nitrogênios dos anéis aromáticos

Ligação
fosfodiéster

Representação (5’ 3’) Pareamento Uniformidade de tamanho

Purinas = Pirimidinas Complementaridade


A+G = C+T
Estrutura do DNA
Propriedades do DNA

 Complementariedade – entre bases nitrogenadas


 Antiparalelismo – direcionalidade a cadeias
 Desnaturação - pontes de hidrogênio rompem
 Renaturação (ou hibridização ou anelamento) –
reestabelecimento das pontes de hidrogênio entre as
cadeias
Desnaturação
X
Renaturação
Desnaturação e Renaturação
Supertorção
• Enrolamento da hélice dupla sobre si mesmo

• Conformação predominante do DNA na célula

• Fundamental para o empacotamento do DNA nos genomas

• Envolvido na replicação, transcrição e na recombinação

• Característica de quase todos os DNAs circulares e lineares

• Importante para a sua funcionalidade


Cadeia Polinucleotídica – Estrutura Primária
Dupla Hélice – Estrutura Secundária
Supertorção – Estrutura Terceária

Supertorcida / Superenrolada / Super Helicoidal


Supertorção
• Extremidades ligadas covalentemente
• Supertorcida, superenrolada, superhelicoidal
– Superenrolamento negativo
– Superenrolamento positivo
• Relaxada

topoisomerase Totalmente
Totalmente
supertorcido
relaxado
Superenrolamento negativo: gerado pelo desenrolamento da dupla hélice
Plectonêmico: encontrado no DNA em solução
Toroidal: DNA enrolado em proteínas como as histonas, que formam os
nucleossomos.
Tipos de superenrolamento

DNA

Histonas
Efeitos do Superenrolamento

• Eletroforese em gel de agarose

• Microscopia eletrônica

• Velocidade de sedimentação
Enzimas que introduzem ou removem
Topoisomerases superenrolamentos no DNA

Fundamentais para:
• Transcrição
• Replicação
• Recombinação
• Remodelamento da cromatina

Sistema complexo de enzimas – Topoisomerases


Células Eucarióticas e Procarióticas
Manutenção da homeostasia do superenrolamento do DNA

Promovem a quebra transitória das Ligações Fosfodiéster na fita de DNA


Enzimas que introduzem ou removem
Topoisomerases superenrolamentos no DNA
Tipos de DNA
Composição de bases, meio em que se encontram ou sua ligação com proteínas
Se diferenciam pela sua espessura, número de pares de base por volta da hélice e a exposição das
bases ao meio externo
• DNA B
– É a forma mais abundante na célula
(fisiológico)
– É a forma clássica do DNA
– A dupla hélice gira para a direita
– Volta completa a cada 10,4 pb

• DNA A
– Condições de umidade muito baixa
– Forma mais “compacta; curta”
– Encontrado nos híbridos DNA:RNA
(transcrição)
– RNA:RNA (genoma de vírus)

• DNA Z
– Forma mais “estreita”
– Sequências GC repetidas
– A dupla hélice gira para a esquerda
– Altas concentrações de cátions
– Volta completa a cada 12 pb
A Dupla Hélice

O B-DNA é o predominante em condições fisiológicas


Outras estruturas do DNA

Moléculas de DNA de fita simples – vírus e bacteriófagos


Estruturas cruciformes – regiões simétricas
Junções de Holliday – 4 fitas de DNA - recombinação
DIFERENÇAS
Diferença ENTRE DNAe ERNA
entre DNA RNA

DNA RNA
•Bases Nitrogenadas
– Adenina – Adenina
– Guanina Purinas – Guanina
– Citosina – Citosina
Pirimidinas
– Timina – Uracila
•Açúcar
Desoxirribose Ribose

•Fita dupla •Fita simples


DIFERENÇAS ENTRE DNA E RNA
Estrutura do RNA

 mRNA: transfere a informação genética aos


ribossomos (1 a 5 % do RNA total) tRNA

 rRNA: componente dos ribossomos – síntese de


proteínas (75 % do RNA total)
 tRNA: transporta os aa até os ribossomos para a
síntese de proteínas (10 a 15 % do total)

rRNA
 snRNAs: RNAs nucleares pequenos Manutenção básica
 scRNAs: RNAs citoplasmáticos pequenos do metabolismo da
 snoRNAs: RNAs nucleolares pequenos célula

RNAs não codificadores curtos:


• miRNAs: microRNAs
• siRNAs: RNAs de interferência Envolvidos na
• piRNAs regulação da
expressão dos genes
RNAs não codificadores longos: funções
regulatórias ainda não elucidadas
Dogma Central da Biologia Molecular

REPLICAÇÃO
DNA DNA

TRASNCRIÇÃO REVERSA TRANSCRIÇÃO

RNA

TRADUÇÃO

PROTEÍNA

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