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Aminoácidos protéicos:
- propriedades gerais
- classificação
- ionização e carácter anfotérico
Proteína (polímero)
Aminoácido 1 Aminoácido 2
(monômero)
aminoácido
COO
um dipeptídeo
+
H3N — C — H
A ligação peptídica ocorre entre o grupo
R
-carboxila de um aminoácido e o grupo
Fórmula geral de um aminoácido: -amino de outro aminoácido.
os grupos amino e carboxila estão
no carbono Até 100 aminoácidos (10 kDa) peptídeo
R – a cadeia lateral R diferencia os Mais de 100 aminoácidos proteína
aminoácidos entre si
Para entender a complexidade estrutural de uma proteína é necessário
primeiro compreender as propriedades de seus aminoácidos constituintes.
COO
+
H3N — C— H Aminoácidos proteicos são L- - aminoácidos
R
Um polarímetro
Isomeria óptica: os acúcares naturais são de série D
* Glicose:
• 6 Carbonos quirais
• 16 isômeros possíveis
• Carbono 5 define a
D- Gliceraldeído
configuração D- ou L-
• 1 carbono quiral
D-glicose
• a manose é
As letras D- e L- indicam apenas
um isômero da
a configuração espacial de um
glicose no C2.
isômero, e não a sua atividade
óptica.
• a galactose é
Existem compostos D que são
um isômero da
levógiros (-) e compostos L que
glicose no C4.
são dextrógiros (+).
Ex: D (-) frutose
L (+) arginina D-manose D-galactose
Aminoácidos protéicos são determinados geneticamente: código genético
amino carboxila
Serina Treonina
(Ser – S) (Thr – T)
Ácido Aspártico Ácido Glutâmico
(Asp – D) (Glu – E)
Histidina
Lisina
Arginina (His – H)
(Lys – K) Aminoácidos “especiais”
(Arg – R)
Além disso:
Jogue o “Amino Acid Game” para aprender a reconhecer a estrutura dos aminoácidos.
- 3-hidroxi-prolina
- 4 hidroxi-prolina
(colágeno)
- 3-metil-histidina (actina)
Proteínas são moléculas tridimensionais.
grupo heme
grupo heme
Heme
Fe2+ + O2 (Fe3+)2O3
X
polar
Fe2+ + O2 Fe2+.O2
O O2 liga-se ao átomo de Fe do heme. apolar
proteína
água
Mioglobina da baleia cachalote
As cadeias laterais de aminoácidos
polares podem fazer pontes de H entre si e com moléculas de água
do meio, solubilizando proteínas.
(+) (+)
(=)
(+)
A água é um dipolo
permanente, devido
à diferença de (=) (+)
eletronegatividade
de seus átomos. Ponte de H formada
entre duas moléculas
de água
H H H H H
O H H O O
H H O H O H O O H
H
O H H H
H
H H H O H
O H H O H O H O
H O O H
H
H O
-
H H
O H H O
H
H H H + O
H
H
H H O H Moléculas de água H O H O
O H H
interagindo no gelo. O H
O O H
O H H
H H Na água líquida, a H
H H O H
O H rede de interações O
O H
H H O H
é menos H H
H
Camada de solvatação de organizada.
um composto aniônico Camada de solvatação de
um composto catiônico
Aminoácidos
polares
Corte
transversal da
membrana
interna da
mitocôndria
Aminoácidos
apolares
Calma ! Você saberá responder a essas questões até o final dessa disciplina.
.
aminoácido
x4
• da ligação peptídica
• das cadeias laterais dos aminoácidos
determinam como o esqueleto covalente de uma proteína vai
se enovelar
determinam os tipos de forças, covalentes e não covalentes,
que irão estabilizar a estrutura tridimensional de uma proteína.
Meio alcalino
carga (-)
Pense
antes de
dar o
próximo
click !
v1
Desprotonação (1) HA H+ + A- Protonação (2)
v2
R - COOH R - COO + H+
Considerando-se o pK médio de 2,0, no equilíbrio dessa reação, teremos:
[ R – COO ] [H +]
Keq = ~ 10 -2 = 1 .
R - NH3+ R - NH2 + H+
Considerando-se o pK médio de 9,0, no equilíbrio dessa reação, teremos:
A afinidade por prótons do grupo amino (pk ~ 9) é 107 vezes maior do que a do
grupo carboxila (pK ~2).
carga
0 -1
H+ 0
-
-COOH - COO
+H+ - H+
H+
+
-NH3 - NH2
+1
+1 0
Meio ácido
Aminoácidos, peptídeos e proteínas são bons tampões
[ H+ ] . [A-]
pH = pK + log
[ HA ]
Quando -
[ H ]. [ A ] = [ HA ]
+
{
[ HA ]
zero
Traduzindo:
• quando o pH do meio é igual ao pK do grupo ionizável, este está 50% dissociado
HO O HO O O O
C 50% O O
C C 50% +
-H+ -H O O -H+ -H+ C -1
HC-H CH2 +1 C CH2
+H+ +H+
+H+ +H+ CH2
+ +
NH3 +
NH3 CH2 NH 3
O + O O
+O NH2
+1 NH +
C 50%
3 C
50% Aumentando mais o
Em pH < 2,34, todos CHos 2 Diminuindo a [H+] do meio,CH -1
a -COOH
2 pH,Em
até pH > 109,6, (pK
o valor
grupos ionizáveis da glicina Em pH 5,97 ocorre o ponto predomina a forma
do NH3+), haverá 50%
começa a desprotonar. No pH 2,34,
estão protonados. A molécula
NH3 + isoéletrico da glicina. 100% das
NH2
metade das –COOH desprotonaram, dede glicina com
moléculas de
apresenta carga +1. moléculas estão
gerando com carga
a glicina zero. zero.
com carga carga
glicina com -1.
carga -1.
Como o pH do meio afeta a carga de aminoácidos com cadeias laterais ionizáveis ?
HO O
Como exemplo, veremos a
C pK -COOH = 2.18
ionização da Lisina: pI = 8.85 + 10.53 = 9.69
H C- NH3
+ pK - = 8.95
2
pK R- (ponto isoelétrico)
(CH2)4
NH3+
pH 2 .18 pH 8.95 pH 10.53
pH < 2 pK -COOH pH 3 - 8 pK -NH3+ pH 9.69 pK R- NH3+ pH > 11
HO O O O O O O O O O
O O O O
C C C C C C
C
-NH3+ -NH3+ -NH3+ -NH2 -NH2 -NH2
-NH2
H+ H+ H+ H+ H+ H+
NH3+ NH3+ NH3+ NH3+ NH3+ NH2
NH2
(+2) 50% (+1) (+1) 50% (zero) 100% (zero) 50% (-1) (-1)
todos os 50% (+2) 50% (+1) 50% (zero) todos os
predomínio ponto
grupos grupos
carga +1 isoelétrico
protonados desprotonados
predomínio predomínio
carga +2 carga -1
Exercício:
As distâncias interatômicas na
ligação peptídica são menores que
as de uma ligação amida comum.
um dipeptídeo O O
C C
A ligação peptídica ocorre entre o grupo N N
-carboxila de um aminoácido e o grupo H H
-amino de outro aminoácido.
Esse fato evidencia ressonância eletrônica,
com uma nuvem de elétrons oscilando entre o
C e o N. Isso atribue à ligação simples C – N
um carácter parcial (50%) de dupla ligação
Como resultado da ressonância da ligação peptídica, ela é mais rígida
que uma ligação simples, colocando todos os átomos participantes no
mesmo plano espacial.
Observe no gráfico
Posteriormente, comqueanasdeterminação
regiões
A B C D indicadas pelosdos
experimental círculos vermelhos,
ângulos em que
e (pontos no
Ramachandram
gráfico) em diversaspreviu que não
proteínas, seria
a sua teoria
possível existir estruturas estáveis, até hoje
foi comprovada.
não se descobriu nenhuma proteína.
Nas regiões de A a F ocorrem algumas
formas
Veja notridimensionais
próximo slidetípicas
o quedeacontece
proteínas,
como veremos na próxima aula.
com a ligação peptídica nessas regiões.
2 1 A B C
Colágeno
D E tripla hélice
3 F
4
E F -hélice -hélice
(esquerda) (direita) Anel
Ângulos de rotação da cadeia polipeptítica em torno de um carbono alfa
Aminoácidos protéicos:
- propriedades gerais
- classificação
- isomeria óptica
- ionização
- comportamento ácido-base e tamponamento