Nucleotídeos e ácidos

nucléicos
Prof. Cleverson Diniz Teixeira de Freitas
Biodiversidade: Material Genético

2
O DNA está contido no interior de cada célula

Eucariótica Procariótica

Animal Vegetal

3
O DNA armazena a informação genética

Injeção

Bactéria virulenta viva Rato morre

Etreptococcus pneumoniae

Experimento de Avery-MacLeod-McCarty.
Bactéria não virulenta viva Rato vive
 Calor

Bactéria
Virulenta
Bactéria Rato Vive
Viva
Virulenta morta
pelo calor
 Bactéria virulenta morta
pelo calor

Bactéria não
virulenta viva
Mistura de
Rato Morre
bactérias
 Bactéria não virulenta viva

DNA Isolado da bactéria

virulenta

Bactéria não
virulenta viva
Bactéria
virulenta viva Rato Morre

Transformação: processo de transferência de DNA de uma bactéria para outra.

Primeiros estudos com o DNA

Um segundo experimento...

Hershey e Chase (1952) – Bacteriófagos T2

Capa protéica tinha

enxofre, mas não fósforo

DNA continha fósforo,

mas não enxofre

S32 P31
 Nucleotídeos
Base Nitrogenada

Fosfato

Pentose
Compostos ancestrais das bases
nitrogenadas

Pirimidina Purina
 DNA

Adenina Guanina Timina Citosina

 RNA

Adenina Citosina Uracila Citosina

 DNA x RNA

Adenina (DNA) Adenina (RNA)

DNA= Ácido Desoxirribonucléico (Pentose-Desoxirribose)

RNA= Ácido Ribonucléico (Pentose-Ribose)
Ácidos Nucléicos: Estrutura Química

1 único anel de 6 átomos

Nucleotídeo Pirimidinas

Base
nitrogenada

Grupo
fosfato Citosina Uracila Timina
Açucar de 5 (C) (U) (T) DNA
carbonos
RNA
Purinas

Ribose Desoxirribose

Adenina Guanina
(A) (G)

2 anéis fundidos de 5 e 6 átomos

Algumas bases minoritárias que
ocorrem nos ácidos nucléicos
RNA/DNA
 pH 7.0
Por isso o DNA é uma ácido

Como essas cargas são neutralizadas?

Possuem caráter hidrofóbico

 Descrição de um oligonucleotídeo

Posição 5’ Posição 3’

Direção 5’3’
 Algumas propriedades das bases
nitrogenadas

• Purinas e pirimidina são compostos fracamente básicos;

• A ressonância envolvendo muitos átomos no anel

confere um caráter de dupla ligação;

• São relativamente hidrofóbicas e pouco solúveis em

água em pH fisiológico;

• As interações hidrofóbicas entre as bases (interações de

empilhamento) são as principais forças que mantêm a
estrutura do DNA;

• Efeito hipocrômico.
Nucleotídeos absorvem LUZ
Padrão de pontes de hidrogênio entre as bases
nitrogenadas

Timina
Adenina

Citosina
Guanina
Ácidos Nucléicos: Estrutura Molecular

Erwin Chargaff Pareamento das bases

açucar açucar
açucar açucar

Duas pontes de hidrogênio Três pontes de hidrogênio

A=T e C=G logo A+G = T+C

Concentração de purinas sempre igual à concentração de pirimidinas

Ácidos Nucléicos: Estrutura Molecular

A=T e C=G
Proporção de A+T/C+G variava amplamente nos DNA de espécies diferentes
Ácidos Nucléicos: Estrutura Molecular

Rosalind Franklin Maurice Wilkins

Padrões de difração de raios X

DNA é helicoidal (hélice), bifilamentar

Molécula
cristalizada 3,4 Å
Feixe raio X

34 Å
Raios
difratados

Filme

Possui 2 periodicidades : Primária : a cada 3,4 Å

Secundária : a cada 34 Å
Ácidos Nucléicos: Estrutura Molecular

“Molecular Structure of Nucleic Acids: A struture

James Watson for Deoxyribose Nucleic Acid”. Nature, 1953.

Francis Crick

Dupla hélice
Dupla hélice do DNA (Watson e Crick, 1953).
Formas Tridimensionais do DNA:

Tipos de DNA 12 pb
10 pb por giro
por giro

DNA B: proposta por Watson e Crick,

forma mais abundante em condições 11 pb
fisiológicas, gira para a direita, 10 pb por por giro

volta.

DNA A: curta e larga, giro direita, 11

pb por volta (ambiente desidratados).

DNA Z: gira para a esquerda, 4,56

nm por volta, regiões ricas em C e G
(presentes em alguns genes inativos).

Não alteram a informação da seq.

de bases, mas podem facilitar ou
dificultar a interação com proteínas
A dupla hélice é mantida unida por dois
conjuntos de forças: pontes de
hidrogênio e as interações de
empilhamento.
As fitas do DNA são Anti-Paralelas

• As fitas são complementares, contudo

são diferentes na composição e na
sequencia de bases;

• Pontes de hidrogênio são importantes

para a especificidade das fitas e as
interações de empilhamento estabilizam a
dupla hélice.
Replicação Semiconservativa do DNA
 Estruturas não-usuais de certas seqüências de DNA

Seqüências no DNA com

palíndromo simetria: repetidas e
invertidas

grampo

giões envolvidas em processos regulatórios

o de reconhecimento de enzimas de restrição
cruciforme
O DNA de tripla hélice
Tripla Hélice
Ácidos Nucléicos: RNA

Estrutura do RNA fita simples

 Fita simples
 Mais reativo do que o DNA (OH),
instável
 Não apresenta estrutura
secundária regular
 Várias estruturas são possíveis
 Pareamento de bases:

G≡C
A=U
DNA e RNA estão sujeitos a hidrólise
lenta da ligação fosfodiéster

Em meio alcalino
Ácidos Nucléicos: RNA

Estruturas secundárias da molécula RNA

Grampo
Fita simples Alça interna
Saliência
Ácidos Nucléicos: RNA

Tipos de RNA

RNA mensageiro (mRNA) – molde para a síntese protéica – 1 a 5%

do RNA total da célula

RNA transportador (tRNA) – leva aminoácidos para o ribossomo –

10-15% RNA total

RNA ribossômico (rRNA) – principal componente dos ribossomos

– 75% do RNA total

Micro RNA (miRNA) ou RNAs de interferência (iRNA) - regulatórios

Principais tipos e funções das moléculas de RNA
Ácidos Nucléicos: DNA x RNA
Propriedades químicas dos ácidos nucléicos

Desnaturação e renaturação
DNA dupla hélice

Denaturação Reassociação (annealing)

DNA parcialmente
denaturado

Separação das Associação das fitas por

fitas pareamento de bases

↑80o ou ▲pH (< 3,0 ou > 10,0)

Formamida, DMSO

Fitas de DNA separadas estruturam-

Ruptura das pontes de H
se casualmente em espirais
 Propriedades químicas dos ácidos nucléicos

emperatura desnaturação
Temperatura de melting (Tm)
emperatura de dissociação

Metade das moléculas de DNA estão

denaturadas

Varia de acordo com o tamanho e a

composição das moléculas :

 Quanto maior a molécula

 Quanto maior o conteúdo GC

Temperaturas mais elevadas

Propriedades químicas dos ácidos nucléicos

Hibridização: ácidos nucléicos de origem diferentes podem se associar

O anelamento ou
hibridação: ocorre
normalmente a 25 oC
abaixo da Tm
Amostra 1 Amostra 2

- Amplitude de hibridação: similaridade

dos ácidos nucléicos de duas fontes
diferentes
Dúplex híbrido
- Correlações evolutivas
- Localizar genes
Os nucleotídeos podem sofrer transformações não
enzimáticas

Desaminação Depurinação
Os nucleotídeos podem sofrer transformações não
enzimáticas
Generalidades

Os nucleotídeos possuem vários papéis no metabolismo celular :

 “Moeda” energética (carregadores de energia) – ATP, GTP

 Medeia resposta da célula a hormônios e outros estímulos

celulares (mensageiros químicos) – AMP cíclico, GTP cíclico

 Cofatores de enzimas – FAD, NAD

 Constituem o DNA e o RNA, os repositórios da informação

genética
 ATP (Energia) NAD (CoFator)

AMPc (Mensageiro secundário)