Estudos em Geociências

Webinar “Pandemics and COVID-19:

Is There a Role for Medical Geologists?”

Doutoramento em Geociências

Fernando Massora Pedro

201210034

Abril

2021
 Estudos em Geociências

Webinar “Pandemics and COVID-19:

Is There a Role for Medical Geologists?”

Doutoramento em Geociências

Fernando Massora Pedro

201210034

up201210034@edu.fc.up.pt

Trabalho a ser apresentado na Unidade Curricular Estudos em Geociências, do

programa Doutoral em Geociências da Faculdade de Ciências da Universidade do
Porto em Coordenação com Universidade do Aveiro

Abril

2021
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Pandemias e COVID-19: Existe um papel para os médicos geólogos?

O webinar teve lugar no dia 18 de março, pelas 14:00, foi moderado por Dr. José
Centeno, o primeiro palestrante Dr. Robert Finkelman, University of Texas in Dallas
apresentou o tema “Pandemics and COVID-19: A Role for Medical Geology” ele começou
com uma pergunta, alguns podem perguntar: há um papel da geologia médica e do
geólogo na pandemia viral? A resposta curta para esta pergunta é um SIM não
qualificado, argumentou ainda dizendo que podemos usar nosso conhecimento de SIG
para ajudar a mapear o movimento e a rápida propagação das pandemias e revelar sua
relação com inúmeros outros parâmetros existentes que podem estar interligados, por
outro lado podemos prevenir pandemias ajudando a entender melhor as relações entre
geologia, ecologia e as doenças, uma investigação dos centros de controle e prevenção
de doenças dos EUA e as autoridades de saúde de Uganda descobriram que, após uma
operação de mineração tentar exterminar os morcegos de uma caverna em Uganda, os
morcegos restantes apresentaram maior nível de infeção do vírus Marburgo levando ao
surto mais grave de Marburg em 2012. Estimando por excesso a mortalidade durante 1
ano associado à pandêmica COVID-19 agrupado por idades, mostrou que houve mais
morte por esta doença para pessoas acima dos 70 anos (13,7%), seguido de doenças
cardiovascular (2-3%) e diabetes (2%) uma amostra de um corte populacional, a morte
por COVID-19 (22/05/2020) a nível mundial, estava representada pela Bélgica, Espanha
e Itália, sendo os países com maior número de mortes, num outro gráfico mostrou
pessoas acima dos 60 anos tem maior risco de infeção e morte por essa pandemia com
maior enfoque para mulheres na mesma faixa etária. Falou também de potenciais
problemas de saúde causados pela inalação de poeira, por um lado tem a alta carga de
poeira nas alças reduz a capacidade de troca oxigênio, alta carga de poeira no pulmão
torna as pessoas suscetíveis a doenças respiratórias, como tuberculose, alguns minerais
como amianto, orionte e quartzo podem causar cancro, alguns minerais podem ser
hospedeiros de patógenos humanos, partículas vítreas e alguns minerais podem se
dissolver nos fluidos do pulmão e do estômago, liberando elementos potencialmente
prejudiciais ao organismo humano, minerais aciculares e de vidro podem ser irritantes
nas passagens nasais e esofágicas, nas saliências e estômago, resultando em cancro, a
doença do pulmão negro provocado pela inalação de carvão mineral, desde 1990 mais
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de 20.000 mineiros morreram por essa doença, outras mais de 500.000 contraíram a
doença, dentre muitas outras doenças que pode ser causadas pela inalação ou consumo
de diversas substancias de origem mineral temos a fluorite, lesões de pele de arsênico,
provocado pelo arsénio, nefropatia endêmica dos Balcãs / síndrome da água de lenhite,
provocado pela a água subterrânea que se infiltra através da camada de carvão. Virando
o foco na COVID-19, menos recursos estão disponíveis para lidar com questões de
geologia médica, exacerbando esses problemas e tornando mais pessoas suscetíveis ao
vírus, embora todos os esforços devam ser feitos para erradicar o COVID-19, não deve
ser feito à custa do tratamento de questões de geologia médica, para nós pode ser tarde
demais para prever o impacto e os efeitos da COVID-19, mas não é tarde demais para
mitigar os impactos da próxima pandemia, com isso devemos começar a analisar com
muita atenção, como a geologia medica pode ser útil. Os cientistas dizem que é
altamente provável que, sem uma intervenção inteligente, outro novo vírus possa vir a
saltar de animal para hospedeiro humano e encontre condições de se espalhar como um
incêndio, e poderá vir a provocar desastres maiores que das pandemias atualmente já
existentes, isso poderá ser de qualquer natureza. Então o que nós podemos fazer? Seja
COVID-19 ou outra pandemia viral, qualquer que seja, devemos tentar minimizar o
problema que afeta os idosos. Como? Temos que continuar as nossas pesquisas, educar
o público sobre diversos tipos de transmissão ou passagem de doenças, as comunidades
médicas e de saúde pública e os tomadores de decisão em todos os níveis, devem ter a
missão de tomara dianteira, enfatizar a vulnerabilidade do idoso, apontamos que seus
pais estão em risco agora, eles estarão em risco em alguns anos, seus filhos estarão em
risco em algumas décadas. Temos que salientar que a geologia médica e geólogos
médicos podem ajudar a proteger a saúde de todos os idosos, incluindo a minimização
dos impactos de pandemias!

O segundo palestrante foi o Dr. Prosun Bhattacharya, KYH Royal Institute of Technology,
Stockholm, Sweden, apresentou o tema “SARS-Cov_2 genetic materials in wastewater:
opportuniteies and challenges for monitoring the pandemic and water security” começou
destacando série de pontos, tais como o surto atual de COVID-19 devido ao SARS-Cov-2
da China, que afetou severamente a humanidade, interrompendo as interações humanas
normais e a economia global, provocando uma enorme catástrofe á todos níveis. A
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eliminação persistente de RNA viral de SARS-Cov-2 nas fezes humanas nos oferece a
possibilidade de rastrear a prevalência e as tendências da doença em comunidades
referentes à epidemiologia baseada em águas residuais (WBE) e tem havido um impulso
global de compreensão as ondas da pandemia SARS-Cov-2 através da vigilância de
águas residuais. Evidenciou-se que a adoção de práticas WBE sem dúvida ajudará na
contenção e desenvolvimento de estratégias de mitigação apropriadas contra a
propensão do atual surto viral SARS-Cov-2 através da dependência de fontes de água
potável baseadas em lençóis freáticos. É sabido com muita clareza que, a síndrome
respiratória aguda grave coronavírus 2 (SARS-Cov-2) foi identificada como a causa da
pandemia contínua de pneumonia severa conhecida como COVID-19, a Organização
Mundial da Saúde (OMS) declarou a situação desse surto de epidemia a pandemia, á 11
de março de 2020. O primeiro diagnostico clinico em hospital de COVID-19 na UE foi
anunciado á 24 de janeiro de 2020 e os casos clínicos continuaram aumentando
dramaticamente em países de todos os continentes, de realçar que, os números
atualmente relatados baseiam-se principalmente em pacientes que foram clinicamente
testados, exclui nesse caso aquele que por diversos motivos, não chegam as unidades
sanitárias, ou mesmo por vezes chegam em avançado estado, que pouco tempo depois
perdem a vida sem se saber a verdadeira causa que pode ser o SARS-Cov-2.
Especialmente em países em via de desenvolvimento, onde pode notar-se a falta de
unidades sanitárias, por outro lado temos a questão da natureza assintomática do
COVID-19 entre várias partes populacionais levou a consideráveis incertezas na
estimativa do número real de pacientes e a um cenário realista de propagação do
COVID-19, as estimativas são apenas para pacientes com COVID-19 com sintomas
graves que são testados em laboratórios do hospital, os números relatados subestimam o
número real de pacientes com COVID-19. Algo que ainda carece da nossa atenção, as
águas residuais, que são uma matriz complexa, contêm uma ampla gama de marcadores
químicos e biológicos da atividade humana, as mais recentes investigações detetaram os
elementos SARS-Cov-2 em águas residuais em várias regiões na Holanda e Austrália, e
esta é uma fonte potencial de informação sobre a prevalência de infeções nas
comunidades onde existe uma propagação deste vírus, a análise dos resíduos oferece
uma alternativa econômica para testar um grande número de indivíduos aleatórios na
população. Na Holanda, o material genético do novo coronavírus SARS-Cov-2 foi
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detetado pela primeira vez á 5 de março de 2020 em uma estação de tratamento de

águas residuais na cidade de Amersfoort, cerca de 50 km a sudeste de Amesterdão,
antes da deteção de quaisquer casos clínicos, foi possível notar que, infeção com SARS-
Cov-2 é acompanhada por eliminação persistente de RNA viral nas fezes humanas o que
teria provocado a possível contaminação em aguas residuais, a fragmentação do RNA
viral varia amplamente entre os pacientes infetados com a COVID-19 - 27% á 89% em
densidades de 0,8 a 7,5 log10 cópias do gene por grama o coronavírus SARS-Cov-2 é
frequentemente excretado nas fezes de uma pessoa infetada, embora não seja provável
que o esgoto se torne uma importante via de transmissão, a prevalência crescente do
patógeno nas comunidades aumentará na medida em que flui para os sistemas de
esgoto.

O vírus SARS-Cov-2 em águas residuais pode ter duração de longo prazo da

fragmentação do material genético SARS-Cov-2, cerca de 3 semanas na expetoração, 4
semanas nas fezes. Os sintomas gastrointestinais não estão associados à positividade
do RNA viral da amostra fecal; a gravidade da doença não está associada à duração
prolongada nem à positividade do RNA viral, vírus vivos foram isolados em amostras de
fezes de indivíduos afetados, nota-se viromas nas fezes geralmente não infeciosos, nas
tentativas de isolar o vírus de amostras de RT PCR positivas coletadas em pacientes que
estão se recuperando. É preciso ter em conta a estrutura chave do SARS-Cov-2 e
constituição genética e componentes, geneticamente SARS-Cov-2 compreende 13-15
(12 funcionais) estruturas de leitura aberta (ORFs), genes S, E, M e N, RdRp, uma replica
é essencial para a replicação do genoma viral. Os métodos para análise SARS-Cov-2 em
amostras ambientais de água, temos a identificação de SARS-Cov-2 em laboratórios
inclui isolamento viral e deteção de ácido nucleico viral. Os ensaios da reação em cadeia
da polimerase da transcriptase reversa (RT-PCR) visando pequenas regiões dos
genomas do SARS-Cov-2 são desenvolvidos rotineiramente e aplicados em testes
clínicos e amostras de águas residuais, temos a recuperação de vírus de águas
residuais: método mais comum empregado precipitação PGE para concentrar vírus de
matrizes de água; temos a deteção e quantificação de vírus: estimativas precisas da
concentração viral em águas não tratadas por meio de ensaios de reação em cadeia da
polimerase quantitativa da transcrição reversa (RT-qPCR) sejam ajustados usando a
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eficiência de recuperação de uma combinação particular de vírus e método de

concentração. A sobrevivência SARS-Cov-2 em águas residuais a epidemiologia
baseada em águas residuais: colaboração global para maximizar as contribuições na luta
contra o COVID-19, já foram confirmados casos de SARS-Cov-2 RNA em águas
residuais nos municípios da Holanda, Austrália, Japão, Índia, Itália, Espanha, Suécia,
Bangladesh e Estados Unidos, a maioria desses descobertas também foram os primeiros
casos oficialmente diagnosticados clinicamente nestes países, essas descobertas podem
atuar como um conceito comprovado para informações potenciais, embora ocultas, sobre
prevalência de infeções por SARS-Cov-2 e oferecer uma alternativa econômica para
rastrear um grande número de indivíduos randómicos na população. O risco de
derramamento de águas residuais em países em desenvolvimento nota-se que cerca de
20% das pessoas ainda defecam ao ar livre no centro e sul da Ásia e nas regiões da
África subsahariana e, por outro lado, na região africana subsahariana, apenas 20% da
população total melhorou as instalações de saneamento higiênico, como resultado, a
transferência de fezes humanas gerou águas residuais de fontes não higiénicas para
locais de distribuição não planeados que são, na maioria dos casos, fontes de água de
superfície, representam uma ameaça potencial de contaminação, é igualmente essencial
para países que são altamente dependentes da extração de água subterrânea para fins
de consumo, sem processo de purificação apropriado e, portanto, sujeitos a diferentes
tipos de contaminação, neste contexto particular, é imperativo olhar para a possível
presença de viromas em diferentes literaturas no passado sobre a presença de vírus. A
sobrevivência de vírus em águas residuais e subterrâneas, por outro lado, adsorção e
persistência são os dois principais elementos que afetam o destino e o transporte dos
vírus no meio ambiente, a sobrevivência dos vírus é tipicamente avaliada pelo tempo de
redução: T90, T99 ou T99,99, que é o tempo requerido para os vírus reduzirem em 90%,
99% ou 99,99% respetivamente, sob diferentes condições ambientais embora a literatura
sobre o transporte de SARS-Cov-2 na superfície e no meio subterrâneo não esteja
disponível, vários fatores, incluindo fatores específicos do solo, específicos do vírus e
ambientais podem influenciar o transporte do vírus no ambiente, nisso as características
que regem a migração de vírus em sistemas de superfície e subsuperfície incluem
temperatura, taxa de adsorção, agregação de vírus, teor de humidade, pH, concentração
de sais, propriedades do solo, matéria orgânica, estirpes do vírus e condições hidráulicas.
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As recomendações críticas da vigilância SARS-Cov-2 em águas residuais, conforme

anunciado em 11 de novembro de 2020, a comissão pretende propor o estabelecimento
de uma Autoridade de Resposta e Emergência de Saúde (HERA) que fortalecerá a
preparação do sindicato e a capacidade de resposta para novas e emergentes ameaças
à saúde humana na fronteira com a Croácia. A missão do HERA é capacitar a união e
seus estados membros a implantar rapidamente as mais avançadas medidas médicas e
outras medidas em caso de emergência de saúde pública, cobrindo toda a cadeia de
valor, desde a conceção até a distribuição e uso, em 17 de fevereiro de 2021, a comissão
adotou um plano europeu de preparação para a bio-defesa HERA incubador, que
apresenta uma proposta de ação imediata para preparar a Europa contra a ameaça
crescente das variantes do SARS-Cov-2. A experiência dos estados membros nesta área
mostrou que a vigilância do SARS-Cov-2 e suas variantes nas águas residuais pode
fornecer uma fonte de informação económica, rápida e confiável sobre a disseminação
do SARS-Cov-2 na população e que pode constituem uma parte valiosa de uma
vigilância genómica e epidemiológica aumentada.

No final deixou umas recomendações críticas sobre a mitigação do risco da pandemia

SARS-Cov-2, primeiro é necessário fazer um monitoramento de águas residuais tendo
em consideração uma abordagem complementar e independente para estratégias de
vigilância e teste COVID-19. Há 30 de novembro de 2020, a Organização Mundial da
Saúde (OMS) organizou uma consulta a especialistas sobre as necessidades de saúde
pública relacionadas à vigilância de SARS-Cov-2 em águas residuais, concluiu que a
vigilância de SARS-Cov-2 em águas residuais pode fornecer importantes complementos
e informações independentes para autoridades de saúde pública, especificamente, a
vigilância de águas residuais pode ser usada para fins preventivos ou de alerta precoce,
uma vez que a deteção de vírus em águas residuais deve ser tomada como um sinal de
possível (re) emergência da pandemia, da mesma forma, os resultados indicativos da
ausência do vírus nas águas residuárias podem indicar que a zona populacional
contribuinte pode ser considerada de menor risco. Os estados membros devem
estabelecer sistemas eficazes de vigilância de águas residuais garantindo que os dados
relevantes sejam prontamente fornecidos às autoridades de saúde competentes, os
estados membros são fortemente encorajados a implementar o mais rápido possível e o
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mais tardar á 1 de outubro de 2021 um sistema nacional de vigilância de águas residuais

direcionado à coleta de dados SARS-Cov-2 e suas variantes em águas residuais.

Recomendação crítica sobre amostragem e métodos analíticos, para garantir que a

amostragem e os métodos são comparáveis e confiáveis, os estados membros devem
garantir que: As amostras são coletadas ao longo de um período de 24 horas, usando um
amostrador composto de fluxo ou tempo e durante os períodos de seca sempre que
possível ou corrigido para a influência de eventos meteorológicos através da
normalização usando fluxo de águas residuais de 24 horas durante o tempo de
amostragem e tamanho da população o esgoto para calcular cargas de vírus per capita
por dia; as análises são realizadas em laboratórios que operam métodos apropriados de
RT-PCR sob condições de gerenciamento de qualidade padrão; ,s deteções de variantes
SARS-Cov-2 baseadas em métodos de sequenciação de genes devidamente
documentados; a participação regular dos laboratórios em ensaios de proficiência
adequados, organizados por provedores credenciados e uso, quando disponível, de
material de referência (certificado); Observação de padrões de qualidade específicos,
conforme recomendado.

Por outro lado, deixou recomendações críticas sobre a dimensão internacional, dizendo
que, os estados membros são fortemente encorajados a: compartilhar as melhores
práticas a nível internacional, promovendo maior harmonização na vigilância de SARS-
Cov-2 em águas residuais; assistência a países terceiros com acesso limitado a outras
fontes de informação para rastrear a circulação da presença do vírus na sua população
através da monitorização de águas residuais; fomentar a cooperação permanente em
estreita coordenação com a OMS, mas também com outros parceiros avançados que
implementaram seus próprios sistemas de vigilância para garantir que os métodos de
amostragem e análise sejam comparáveis e confiáveis, os estados membros devem
garantir isso. A vigilância SARS-Cov-2 no meio ambiente, duração de longo prazo da
excreção de SARS-Cov-2 nas fezes: cerca de 3 semanas na expetoração, 4 semanas
nas amostras de fezes. Os sintomas gastrointestinais não estão associados à
positividade do RNA viral da amostra fecal; a gravidade da doença não foi associada com
duração prolongada nem positividade para RNA viral. Os vírus vivos foram isolados em
amostra de indivíduo afetado. Os viromas nas fezes geralmente não são infeciosos, mas
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tentativas de isolar o vírus de amostras de RT PCR positivas coletadas em pacientes que

estão se recuperando deve ser feita.

Esse webinar teve uma participação de 34 pessoas e teve uma duração de

aproximadamente uma hora e vinte e cinco minutos, depois da apresentação dos
palestrantes ouve um momento para debates, onde foram apresentadas questões e
prontamente respondidas pelos palestrantes.