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  • Biofísica Molecular

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    Biofísica Molecular

    ● Éxons ○ Ex: estudo de simulações


    ○ Região do DNA que forma de fármacos
    o RNA mensageiro ■ Como vai atuar no
    ● Estudo da sequência dos organismo?
    aminoácidos das proteínas sem ● Depende da
    sequenciar as proteínas estrutura
    das
    Bioinformática moléculas
    ● NCBI
    ○ Banco de dados genômicos Visualização das moléculas
    ■ Ajuda no ● Difração de raio X
    entendimento do ○ Possível quando há uma
    genoma de diversos estrutura sólida produzida
    organismos vivos por aquelas moléculas
    ○ Sequência de nucleotídeos ■ Não é possível em
    de DNA e RNAm nos dão todas, porque
    informações sobre a algumas não
    sequência da proteína possuem estrutura
    sólida
    Estudo de estrutura e funcionamento ○ Emite raio-x, com
    das moléculas comprimento de onda bem
    ● Composição da molécula pequeno
    ○ Estabilidade dos átomos ■ Sofre desvio
    ○ Forças atuantes (difração)
    ○ Ângulos das ligações ● Formação de
    químicas um padrão
    ○ Tipo de aminoácido ○ Choque das ondas dos
    ● A depender da composição, maior átomos com as ondas que
    é a probabilidade da proteína virar estão na substâncias
    uma hélice; folha; etc ■ Ocorre a difração
    ○ Ex: aa 22 a 45, há uma ○ Modelagem computacional
    sequência que permite a consegue fazer um mapa
    formação de alfa hélices da eletrodensidade do
    elétron escolhido
    Modelagem computacional
    ● Sequências de aminoácidos
    ○ Hidrofílicos/hidrofóbicos
    Eletroforese Espectrometria de massa
    ● Separação de moléculas ● Identificação de proteínas
    ○ DNA e proteínas ○ Equipamento que
    ● Gel de agarose bombardeia elétrons para
    ○ Migração das moléculas produzir íons
    para o polo positivo ■ Atravessam um
    campo magnético
    fazendo trajetórias
    diferentes
    ● Depende
    das massas
    ○ O campo separa os íons
    ■ A massa e a carga
    dos íons é medida
    pela sua posição no
    espectro
    ○ Identifica os elementos
    daquela amostra
    ● Migração
    ○ Moléculas menores A espectroscopia é um método que usa a
    ■ Passam até o final radiação eletromagnética para identificar
    do gel substâncias e suas concentrações
    ○ Moléculas médias
    ■ Ficam no meio do Espectrofotômetro
    gel ● Quantificação de proteínas
    ○ Moléculas maiores ● Muito útil, porém é preciso usar
    ■ Ficam na parte uma grande quantidade da
    superior do gel amostra
    ○ Quando não é possível, é
    ● Eletroforese bidimensional utilizado o nanodrop
    ○ Mais eficiente
    ■ Proteína fica retida Nanodrop
    no seu ponto ● No lugar das cubetas com grande
    isoelétrico quantidade de amostras, apenas
    ● pH em que a um microlitro é utilizado
    carga líquida ○ Mais viável
    da proteína
    é igual a 0
    ○ “Dupla separação” das
    proteínas
    Microscopia no computador para avaliar
    ● Microscópio de força atômica o resultado obtido
    ○ Revelam as variações ● Não usa radiação eletromagnética
    topográficas de uma ○ Menos invasiva
    amostra (“relevo”) ● Resultado em picos
    ■ Não revela imagem ○ Localização dos átomos
    ○ É possível observar a estudados na molécula
    constituição de moléculas ○ Blindagem das nuvens
    ○ Funciona a partir das forças eletrônicas que os
    intermoleculares hidrogênios fazem em volta
    ■ Interação da ponta do átomo
    da agulha com a
    amostra forma a
    topografia

    Ressonância magnética
    ● Estimula e detecta a mudança na
    direção do eixo de rotação dos
    prótons encontrados na água dos
    tecidos vivos
    ○ Essas moléculas são
    captadas pelo aparelho de
    ressonância e reproduzidas

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