Genes & Proteínas: estudos em larga escala – 2023

Prof. Francis M. F. Nunes

1A - Informar as sequências dos primers Forward (F) e Reverse (R), orientando ambos de 5’ para 3’
(da esquerda para a direita). Os primers devem ser pensados informados com base nas regiões que
estão em negrito e sublinhadas na sequência abaixo (portanto cada primer deve conter tamanho = 20
nucleotídeos) que foi extraída do NCBI-GenBank.

>sequência_do_GenBank
GGCGAACCTATCTAAAGTCAATATTAAACGATCGATTATTTTAATGAACAGCGAATGG
AATGAACGACGTAAACATTAAACGCTAGCATTTGCCCGTATGTCTGATACACTGTGTG

1B – Com base na fórmula (2 x nº A+T) + (4 x nº G+C), qual a temperatura de anelamento de cada

um dos primers?

2 – Verdadeiro (V) ou Falso (F)?

( ) O genoma é, conceitualmente, um lote haploide.

( ) O espermatozoide possui um genoma completo.
( ) O CAP equivale ao TSS de um RNA.
( ) A 3’UTR começa após o códon de parada e se estende até antes de iniciar a cauda poli A.
( ) Um mRNA com CDS de 300 nucleotídeos codifica uma proteína de 100 aminoácidos.
( ) Regiões genômicas não codificadoras são consideradas genes se forem transcritas e
desempenharem alguma função celular.
( ) A extremidade 5’ de uma CDS está para o N-terminal de uma proteína, assim como a extremidade
3’ de uma CDS está para o C-terminal.
( ) PCR de baixa estringência tende a gerar amplicons inespecíficos.
( ) Considerando que no ciclo zero uma PCR possua uma único cópia (ou molde) de um dado
fragmento a ser amplificado, no ciclo 30 atingir-se-á a marca de pelo menos 1 bilhão de amplicons.
( ) Na PCR em tempo real recomenda-se a amplificação de fragmentos de tamanhos entre 180 a 250
nucleotídeos.
( ) Usualmente, na temperatura de 72oC da ciclagem de uma PCR, o tempo de 30 segundos é
suficiente para amplificar 500 pares de bases.
3 – A imagem abaixo apresenta padrões de amplificação distintos (bandas em eletroforese) a partir de
pares de primers Forward (F, verdes) e Reverse (R, vermelhos) que se anelam em locais diferentes
num mesmo gene. Explique a imagem:

5
AGT GTA

407pb 373pb 321pb 426pb 336pb 234pb

441pb 133pb 103pb 617pb 549pb

gDNA cDNA
gDNA cDNA