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Prática computadores 3:

InterPro
Objetivos
+1. Qual o nome da proteína?

+2. Caracterização da proteína.

+3. Relação estrutura/função, processos biológicos e moleculares


em que participa.
1. Qual o nome da proteína?

Glutathione peroxidase 1
Glutathione peroxidase

Protege a hemoglobina nos


eritrócitos da degradação
oxidativa.
Nas plaquetas, desempenha
um papel crucial de glutationa
peroxidase no metabolismo do
ácido araquidónico

É uma enzima que catalisa a redução de hidroxiperóxidos pela glutationa. A sua


principal função é proteger contra o efeito prejudicial dos hidroxiperóxidos
formados endogenamente.
Caracterização
D Domínio
Caracterização
F Família
Caracterização
H Superfamília homóloga

Thioredoxin-like superfamily: Vários processos biológicos regulam a atividade de proteínas alvo através
de alterações no estado redox dos grupos tiol (S2 a SH2), onde um doador de hidrogênio está ligado a
uma proteína dissulfato intermediária. Tais processos incluem o sistema ferridoxina, o sistema NADP e o
sistema glutationa. Várias dessas proteínas dissulfato compartilham uma estrutura comum, consistindo em
um núcleo α/β/α de três camadas.
Caracterização
S Site

Active Site (37-52) : Sequência em U


Cada subunidade possui um sítio ativo onde a selenocisteína está
localizada. A selenocisteína é um aminoácido que contem selênio
e desempenha um papel crucial na atividade catalítica da GPx-1.

Conserved site (74-81)


Caracterização
Outras Características

A enzima está ligada à membrana, estando esta sequência fora do citoplasma.


Caracterização
R Resíduos

Selenoenzimas tetraméricas que catalisam a redução de uma variedade de hidroperóxidos


incluindo peroxidases lipídicas, usando GSH como substrato doador de eletrões específico. A
GSH peroxidase contém um resíduo de selenocisteína por subunidade, que está envolvido na
catálise. Diferentes isoenzimas são conhecidas em mamíferos, que estão envolvidas na
proteção contra espécies reativas de oxigênio, na regulação redox de muitos processos
metabólicos, na eliminação de peroxonitrato e na modulação de processos inflamatórios.
Processos Biológico

A Glutathione Peroxidase 1 (GPx-1) está envolvida num importante processo biológico


relacionado à proteção celular contra danos oxidativos. O seu papel principal é catalisar a redução
de peróxidos, especialmente o peróxido de hidrogênio (H2O2),

Resposta ao stress oxidativo:

Qualquer processo que resulte numa mudança no estado ou atividade de uma célula ou organismo
(em termos de movimento, secreção, produção de enzimas, expressão genética, etc.) como
resultado de stress oxidativo, um estado frequentemente resultante da exposição a níveis elevados
de espécies reativas de oxigênio, por ex. anião superóxido, peróxido de hidrogênio (H2O2) e
radicais hidroxilo.
Função Molecular
Catálise da reação:

2 glutathione + H2O2 = glutathione disulfide + 2 H2O

Glutathione Hydrogen peroxide Glutathione disulfide Water


Componente Celular

• Citoplasma
• Mitocôndria

Desempenha um papel crucial na


neutralização de peróxidos e na
proteção das estruturas celulares
contra danos oxidativos.
Estrutura

A estrutura da GPx-1 é geralmente composta


por quatro subunidades idênticas, formando um
tetrâmero,estrutura quaternária.

Estrutura cristalina da selenocisteína em


glicina mutante da glutationa peroxidase 1
humana.
Bibliografia
+ Caracterização
https://www.uniprot.org/blast/uniprotkb/ncbiblast-R20231214-144435-0756-12816566-p1m/overview
https://www.ebi.ac.uk/interpro/protein/reviewed/P07203/

+ Função Molecular
https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/GTerm?id=GO:0004602
https://www.uniprot.org/uniprotkb/P07203/entry
+ Processo Biológico

https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/GTerm?id=GO:0006979
+ Componente Celular
https://www.uniprot.org/uniprotkb/Q7L4Q3/entry#subcellular_location
+ Estrutura

https://swissmodel.expasy.org/repository/uniprot/Q7L4Q3?csm=5DB11579C66FE8E5

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