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Grupo1:
SÃO CARLOS
2024
Sumário
1. INTRODUÇÃO..................................................................................................................... 2
1.1 Saccharomyces cerevisiae........................................................................................2
2. MATERIAIS E MÉTODOS................................................................................................... 4
3.1 Materiais utilizados:................................................................................................... 4
3.2 Métodos utilizados:....................................................................................................4
3. OBJETIVO........................................................................................................................... 4
4. RESULTADOS E DISCUSSÃO........................................................................................... 4
4. 1. Transformação, clonagem e recombinação em Saccharomyces cerevisiae:... 4
4. 2. Abordagens para a produção de cassetes gênicos:............................................ 6
4. 3. Saccharomyces cerevisiae para a produção de cassetes gênicos:................... 7
4. 4. Vetor e cassete de Cyp51A fusionada a mRFp em célula de mamífero:........... 8
4. 5. Técnica de Gibson Assembly (New England Biolabs):........................................ 9
5. CONCLUSÃO.................................................................................................................... 11
6. REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS................................................................................. 12
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1. INTRODUÇÃO
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um gene de interesse em organismos alvo. Isso é feito para criar mutantes que são
usados para estudar as funções biológicas do produto desse gene. No
procedimento, começa-se com um gene de interesse, chamado gene alvo (open
reading frame, ORF), e as regiões 5' e 3' deste gene são amplificadas por PCR. O
gene cyp51A de Aspergillus fumigatus é usado como marcador auxotrófico ou
dominante e é amplificado a partir de plasmídeos que o contêm. Os fragmentos 5',
3' e o marcador de seleção formam o cassete de deleção, que é inserido no
plasmídeo usando as regiões homólogas presentes nas extremidades do cassete e
o sítio múltiplo de clonagem do gene que será inserido.
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Figura 01: Adaptação do primer
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Em prototrofia é a capacidade do microrganismo de crescer em meio,
composto apenas por sais minerais e açúcares simples, sem a necessidade de
adição de nutrientes específicos. Com várias marcas de seleção são empregados
para a expressão heteróloga em Saccharomyces cerevisiae. Sendo que os genes
marcadores usados para marcas auxotróficas são alelos do tipo selvagem que
codificam enzimas essenciais em vias metabólicas as quais estão relacionadas.
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2. OBJETIVOS
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3. MATERIAIS E MÉTODOS
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25. Terminador trpC + gene de resistência ptrA PCR, primers 7 + 8, 2.889 pb
(200 ng/µL);
26. DNA de esperma de salmão (10 mg/mL);
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shaker). Após a incubação, as alíquotas da suspensão celular foram dispensadas
em tubos estéreis numerados de 1 a 4 para as reações de transformação, conforme
especificado na tabela 01. A desnaturação do DNA do esperma de salmão foi
realizada previamente, ele foi aquecido no termociclador a 98°C por 5 minutos e, em
seguida, colocando-o no gelo para evitar a renaturação. Esse processo foi realizado
pelos técnicos, e o DNA desnaturado foi fornecido para as reações de
transformação. É crucial realizar as reações rapidamente, evitando deixar os tubos
abertos, e montá-las com assertividade e eficiência.
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Para prosseguir com a análise, quatro placas de meio SC URA- sólido foram
preparadas, permitindo o crescimento seletivo das células que incorporaram o
plasmídeo pRS426 circularizado. As placas foram então identificadas conforme
instruído, foi necessário ter um cuidado especial para evitar a contaminação cruzada
durante a inoculação das células. Após a incubação a 30°C por 3 a 4 dias, as
colônias de levedura recombinantes foram fotografasse enviadas aos alunos para
assim serem analisadas para verificar o sucesso da recombinação e isolamento do
plasmídeo desejado. Embora a etapa de PCR não seja realizada neste protocolo,
estudos anteriores sugerem que a maioria das leveduras que crescem no meio SC
URA- são positivas para o cassete de interesse, com uma eficiência estimada em
cerca de 80%. Isso indica que a presença do inserto pode ser inferida com alto grau
de confiança, eliminando a necessidade de testes adicionais.
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RESULTADOS E DISCUSSÃO
Figura 01. Placas inoculadas com S. cerevisiae transformadas para a produção de cassetes de
DNA contendo genes de interesse.
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EcoRI/BamHI foi eficiente, ou seja, a ausência de crescimento confirma que não
houve contaminação do plasmídeo não digerido nas reações de transformação.
Após a transformação das células de Saccharomyces cerevisiae com o plasmídeo
linearizado contendo o cassete de interesse, observamos que as células cresceram
no meio seletivo SC URA- (“synthetic complete” sem uracila), indicando que foram
capazes de incorporar o plasmídeo e complementar a mutação no gene URA3.
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Cassete para Engenharia Genômica: contendo sequências homólogas ao
genoma alvo, juntamente com o gene de interesse e um marcador de seleção, como
URA3. Podendo ser aplicado para a integração dirigida do gene de interesse no
genoma de células de levedura. As sequências homólogas facilitariam a
recombinação homóloga, permitindo a inserção específica do cassete no local
desejado do genoma. Isso seria aplicável em projetos de engenharia genômica para
melhorar características específicas das células de levedura, como aumentar a
produção de metabólitos desejados.
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coloca como uma excelente opção para a construção de cassetes gênicos,
proporcionando facilidade de manipulação genética, eficiência na expressão gênica
e adequação para diversas aplicações.
Alterações no Vetor:
1. Marca de Seleção: a marca de seleção de droga pode ser diferente, já
que a maioria dos marcadores de seleção para células de mamífero
difere daqueles usados em microrganismos como fungos. Um exemplo
comum é o gene de resistência a neomicina/kanamicina (Neor/Kanr).
Esse gene codifica uma enzima que confere resistência a esses
antibióticos.
Cassete Gênico:
1. Gene de Interesse: o gene Cyp51A fusionado a mRFP deve
permanecer no cassete gênico.
2. Promotor: o promotor original do fungo deve ser substituído pelo
promotor apropriado para células de mamíferos, como CMV, SV40, ou
EF1α.
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3. Terminador: o original deve ser substituído por um terminador
apropriado para células de mamífero, como bGH polyA.
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Em comparação com a estratégia utilizada em aula, a Gibson Assembly
destaca-se pela eficiência na montagem de fragmentos maiores e pela capacidade
de conduzir a reação em um único passo, simplificando o processo. Contudo,
ambas as estratégias compartilham conceitos fundamentais. Elas dependem do uso
de enzimas específicas para realizar as reações de ligação e replicação do DNA.
Além disso, ambas requerem que os fragmentos de DNA tenham sequências de
sobreposição para permitir a montagem eficiente. A escolha entre as estratégias
dependerá das necessidades específicas do experimento e das preferências do
pesquisador. Em suma, tanto a técnica de Gibson Assembly quanto outras
estratégias tradicionais compartilham o objetivo comum de facilitar a montagem in
vitro de sequências genéticas.
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4. CONCLUSÃO
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5. REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS
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8. Auxotroph: origem, exemplo e aplicações. Disponível em:
https://maestrovirtuale.com/auxotroph-origem-exemplo-e-aplicacoes/. Acesso em:
07. fev. 2024.
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