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NUCLEOTDEOS
Tanto o DNA como o RNA so formados pelo encadeamento de grande nmero de molculas menores, os nucleotdeos, formados por trs tipos de substncias qumicas:
Base nitrogenada, composto por uma cadeia fechada de carbonos que contm nitrognio; Uma pentose; Um fosfato.
NUCLEOTDEOS X NUCLEOSDEOS
Nucleosdeo
NUCLEOTDEOS
Cinco tipos: Adenina, Guanina, Citosina, Timina e Uracila. Adenina e Guanina: Duplo anel de tomos de carbono (anis aromticos); chamadas de purinas ou bases pricas. Citosina, Timina e Uracila: Um anel de carbono; chamadas pirimidinas ou bases pirimdicas.
DNA: Adenina Timina; Citosina Guanina RNA: Adenina Uracila; Citosina - Guanina
BASES NITROGENADAS
PENTOSES
A ligao de um nucleotdeo com outro entre o fosfato de uma unidade e a pentose da outra.
PENTOSES
Nucleosdeo
Nucleotdeo
Ligao Fosfodister
A ligao feita por pontes de hidrognio: Timina (T) liga-se Adenina (A) - duas pontes de hidrognio; Citosina (C) liga-se Guanina (G) - trs pontes de hidrognio.
Tais pontes de hidrognio so formadas em decorrncia da presena de grupos ceto (C=O) e amino (C-NH2) nas bases;
TeU
ceto
A
amino
G
grupo ceto
e amino
C
grupo ceto
e amino
Pirimidina < Purina Logo, AT e CG tem, aproximadamente, o mesmo tamanho; Isso proporciona uma dimenso proporcional ao longo da molcula de DNA.
ANTIPARALELAS;
Devido ao pareamento das bases, as fitas de DNA so ditas COMPLEMENTARES; Isso assegura uma replicao mais precisa; Ligao glicosdica entre a pentose e a base no esto diretamente opostas na dupla-hlice; Tal fato gera duas cavidades: maior e menor; Na cavidade maior, as bases ficam expostas ao solvente, interagindo com molculas sem precisar romper a estrutura do DNA.
Foras de Van der Walls entre os anis aromticos de bases adjacentes (ao lado);
REFLEXO
Qual a ligao mais difcil de ser quebrada? Adenina Timina ou Guanina Citosina? Se uma sequncia de uma fita de polinucleotdeos fosse AATCCATGT, qual seria o filamento complementar?
DESNATURAO E RENATURAO
So processos importantssimos para a replicao, recombinao e transcrio do material gentico; Desnaturao: pontes de hidrognio entre as fitas complementares so rompidas; Renaturao: inverso da desnaturao.
DESNATURAO
Pode ocorrer por aumento de temperatura, tratamento com cidos ou bases, agentes desnaturantes e concentrao de sal; Pareamento entre as bases no apresenta a mesma estabilidade separao de GC exige temperaturas mais altas, ou concentrao de agentes desnaturantes, devido diferenas do nmero de pontes de hidrognio.
DESNATURAO
Tm: Temperatura na qual 50% do DNA encontra-se desnaturado; A Tm depende da proporo de bases AT em relao GC;
[ ] GC
Temperatura
Tm
RENATURAO
Ocorre atravs do resfriamento; O anelamento ocorre a uma temperatura de 25C abaixo da Tm; medida que algumas bases se associam, a velocidade de renaturao aumenta;
RENATURAO
TIPOS DE DNA
Sinttico
curtas
pr-
Tipo B, A e Z: Diferem quanto conformao e podem facilitar ou dificultar a interao da molcula com protenas.
DNA TIPO B
Forma clssica descrita por Watson e Crick e mais abundante; Dupla-hlice gira para a direita; Conclui uma volta a cada 10pb (pares de base).
Obs: Em soluo, geralmente o DNA assume a conformao B. Quando h pouca gua disponvel para interagir com a dupla hlice, o DNA assume a conformao A.
DNA TIPO A
DNA TIPO Z
Dupla-hlice gira para a esquerda; Ocorre quando o acar e a base nitrogenada ficam do mesmo lado da ligao glicosdica; Cadeia aparece na forma de zigue-zague; Apresenta estrutura mais longa e fina; Conclui uma volta a cada 12pb (pares de base);
TOPOISOMERASES
As fitas de DNA podem, assim, passarem uma sobre a outra e alterarem o superenrolamento da molcula;
So importantes nos eventos de replicao, transcrio e recombinao; Enzimas alvos de drogas antimicrobianas e anticancergenas.
ESTRUTURA DO RNA
Polmero linear de nucleotdeos unidos por ligaes fosfodister 53; Ribose - acar presente; Timina (T) substituda pela Uracila (U); Normalmente fita simples, embora possa apresentar pareamento intracadeia (estrutura similar ao DNA tipo A); Alguns vrus apresentam RNA fita dupla como genoma; Hbridos DNA:RNA (estrutura tipo A) so formados na transcrio.
rRNA (ribossomal): componente dos ribossomos. Representa 75% do RNA total da clula; tRNA (transportador): carrega os resduos de aminocidos at os ribossomos para a sntese de protenas.
mRNA
rRNA e tRNA
CDIGO GENTICO
snRNA (pequenos nucleares): ligados a protenas formando as ribonucleoprotenas (snRNP) que tem funo de produzir mRNA funcionais; Ribozimas: pequenos RNAs presentes no ncleo e citoplasma com funes estruturais e catalticas.
INTERAES DNA/PROTENAS
Protenas: organizam, replicam e transcrevem as informaes do DNA; No especficas: empacotam estabilidade da molcula; e mantm a
Especficas: ligam-se a sequncias definidas de nucleotdeos. Auxiliam o incio da transcrio e controlam esse processo.
INTERAES DNA/PROTENAS
Para o reconhecimento do DNA por protenas, as fitas no precisam estar abertas; Bases expostas so reconhecidas por aminocidos na cavidade maior (principalmente) e menor do DNA;
INTERAES DNA/PROTENAS
Competio: duas protenas reconhecem o mesmo stio. A ligao depende da [ ] de cada uma e da intensidade da ligao; Cooperao: protenas s se ligam conjuntamente. Ocorre tambm com protenas que s se ligam aps a ligao de uma primeira que reconhece a sequncia do DNA; Autocooperao: quando protenas iguais se ligam adjacentes e a primeira facilita a ligao das demais.