Este documento discute novas abordagens para a fenotipagem de plantas, incluindo conceitos, ferramentas e perspectivas. Ele descreve como plataformas de fenotipagem utilizam sensores de imagem e espectroscopia para medir características fenotípicas de plantas de forma não destrutiva, precisa e em larga escala para apoiar programas de melhoramento genético. Essas plataformas automatizadas podem capturar imagens digitais, de fluorescência, termográficas e espectrais para avaliar caracter
Este documento discute novas abordagens para a fenotipagem de plantas, incluindo conceitos, ferramentas e perspectivas. Ele descreve como plataformas de fenotipagem utilizam sensores de imagem e espectroscopia para medir características fenotípicas de plantas de forma não destrutiva, precisa e em larga escala para apoiar programas de melhoramento genético. Essas plataformas automatizadas podem capturar imagens digitais, de fluorescência, termográficas e espectrais para avaliar caracter
Este documento discute novas abordagens para a fenotipagem de plantas, incluindo conceitos, ferramentas e perspectivas. Ele descreve como plataformas de fenotipagem utilizam sensores de imagem e espectroscopia para medir características fenotípicas de plantas de forma não destrutiva, precisa e em larga escala para apoiar programas de melhoramento genético. Essas plataformas automatizadas podem capturar imagens digitais, de fluorescência, termográficas e espectrais para avaliar caracter
Pós-graduanda: Cyntia B. M. Farias Introdução O melhoramento de plantas cultivadas visa: Tolerância ao estresse • Extremos de luminosidade abiótico • Temperatura • Disponibilidade de água no solo • Baixa disponibilidade de nutrientes
Para garantir a sustentabilidade da produção agrícola em
um cenário de mudanças climáticas globais. Introdução
• Para enfrentar tais desafios, os programas de melhoramento genético de
plantas precisam ampliar a base genética de prospecção e acelerar a busca por meios para a mensuração de novas características fenotípicas.
• Os desafios do melhoramento reside na Fenotipagem das plantas em
estudo. 1. Precisão • É necessário avançar em: 2. Reprodutibilidade 3. Exploração de novas características Objetivo • Apresentar os conceitos e as ferramentas disponíveis para auxiliar aqueles interessados nas novas técnicas e soluções empregadas na fenotipagem de plantas, em diferentes escalas, com as mais diferentes finalidades. Desenvolvimento • A Fenotipagem de plantas tem como base o tripé:
Genótipo
Ambiente Fenótipo Fenotipagem?
• Derivada da palavra fenótipo, a fenotipagem é o ato de determinar os
valores qualitativos ou quantitativos das características em estudo e relacioná-las ao desempenho de um genótipo em determinado ambiente (Dhondt et al., 2013). Fenômica? • Disciplina aplicada à Fenotipagem em larga escala;
• Termo “fenoma” = conjunto de todos os fenótipos possíveis de um
determinado genótipo.
• Fenômica = caracterização completa do conjunto de fenótipos de um
genoma. • O estudo do crescimento, desempenho e composição dos genótipos. Fenotipagem • São análises ópticas não destrutivas.
• Usa de softwares e hardwares, que possibilitam a avaliação em larga escala.
• Analisa moléculas, organelas de uma célula ou do organismo como um todo.
• Na prática, isso tem sido possível por meio da utilização de estruturas
denominadas plataformas de fenotipagem de plantas. Plataformas de Fenotipagem de plantas Fenômica Ciência Espectroscopia Imagens
radiação visível (400-700nm)
Podem serem fixas ou móveis,
com vários sensores de imagem. infravermelho próximo (800-2500nm)
infravermelho longo (8-15 µm)
Plataformas de Fenotipagem de plantas • Estão atreladas a programas de melhoramento de plantas, direcionados a seleção de genótipos tolerantes aos estresses bióticos e abióticos.
• Plataformas automatizadas estão espalhadas por países da Europa, como França,
Alemanha, Bélgica, Inglaterra, Oceania, além dos Estados Unidos.
• As plataformas são usadas por instituições públicas e privadas.
• Incorporam avanços recentes nas áreas: da robótica e computação.
• Amplia os campos de estudo da Biologia vegetal. Pelo trabalho de Biólogos, Físicos,
Matemáticos, Geneticistas, Bioquímicos, Fisiologistas e Melhoristas de Plantas Plataformas de Fenotipagem de plantas • Atualmente, o desenvolvimento de plataformas de fenotipagem é dominado por algumas poucas empresas que detêm os registros e comercializam módulos de imagens e “softwares” de automação.
• Entre as principais críticas estão o alto custo de implantação, a qual requer
uma infraestrutura apropriada; a dependência do fabricante para ajuste, calibração, validação e manutenção; restrição ao porte máximo das plantas que podem ser avaliadas.
• Além disso, a inclusão ou retirada de uma estação de medição e qualquer
alteração no “software” e, consequente, na forma de obtenção dos dados, necessariamente requer a participação do fabricante. Estação para a geração de imagens digitais
• Trata-se de uma estação dedicada à captura de imagens das raízes mas,
principalmente, da parte aérea das plantas para determinar as características relacionadas à arquitetura e ao tamanho dos órgãos vegetais.
• As imagens mais utilizadas para esta finalidade são obtidas a partir de
câmeras digitais que operam no padrão de cores RGB (Red: Green: Blue).
• Para a obtenção dessas imagens não pode haver sobreposição de estruturas.
• Funciona muito bem para plantas jovens ou de pequeno porte.
Estação para a geração de imagens por fluorescência • Usa da técnica de fluorescência da clorofila, em condições controladas.
• Essa técnica só é possível se houver absorbância da luz em qualquer região
do espectro eletromagnético.
• Com o uso dessa estação é possível determinar por exemplo infecções
causadas por vírus mesmo antes da doença se manifestar.
• A maioria dos trabalhos busca determinar a fluorescência emitida pelas
clorofilas, afim de avaliar plantas com diferentes níveis de estresse. Estação para a geração de imagens por fluorescência 1. Conseguem mapear uma área muito pequena;
2. Avalia apenas uma planta inteira por vez;
3. O limite da área foliar não pode ultrapassar o tamanho do
Desvantagem equipamento; dos fluorômetros 4. Não pode ser usado em plantas cultivadas em larga-escala;
5. As folhas devem estar na posição horizontal;
6. As folhas devem serem mantidas a uma mesma distância do
detector; Estação para a geração de imagens na faixa do espectro visível • Faixa espectral visível (400-700 nm);
• Utilizadas para a captura de imagens da parte aérea das plantas em
plataformas de fenotipagem.
• Baseia-se no método de sensoriamento remoto;
• Tomando-se por base a reflectância na região do espectro
eletromagnético em que os pigmentos vegetais absorvem mais fortemente a radiação, foram desenvolvidos vários índices com o objetivo de monitorar a biomassa, a fenologia, as condições fisiológicas das plantas e a deficiência de nutrientes, especialmente nitrogênio. Estação para a geração de imagens termográficas • Os sistemas que geram imagens térmicas na região infravermelha do espectro eletromagnético geralmente operam nas faixas de comprimento de onda de 3 a 5 μm ou 7 a 13 μm.
• Em ambas as faixas, a radiação emitida
pelo objeto em análise é capturada e transformada automaticamente em temperatura. Estação para a geração de imagens termográficas • As imagens térmicas têm sido usadas com frequência na pesquisa científica como sensores para o monitoramento do estado hídrico de plantas em sistemas automatizados de irrigação e, também, para a seleção de plantas tolerantes ao estresse salino e ao déficit hídrico.
• Todas essas aplicações têm como princípio os mecanismos de abertura e
fechamento estomáticos.
• As imagens termográficas, portanto, podem auxiliar na definição dos
genótipos mais tolerantes e dos mais susceptíveis aos diferentes tipos de estresses em programas de melhoramento vegetal Estação para a geração de imagens na região infravermelha do espectro • A captura da imagem compreende uma faixa localizada entre o visível e micro- ondas, com comprimentos de onda que variam de 0,7 a 100 μm.
• A faixa do infravermelho próximo, que se estende de cerca 0,7-3,0 µm, é
particularmente útil para a análise de metabólitos primários associados diretamente ao crescimento vegetal.
• A radiação infravermelha penetra a maiores profundidades no tecido vegetal,
sendo muito aplicada em avaliações de lesões internas dos frutos. Estação para a geração de imagens na região infravermelha do espectro
1. Açúcares solúveis e poliméricos;
2. Compostos orgânicos nitrogenados; Usada também na 3. Proteínas e aminoácidos; determinação de compostos do 4. Biomassa; metabolismo 5. Lipídeos; celular como: 6. Água; 7. Vitaminas e 8. Sais minerais. Conclusões e perspectivas • Nos últimos anos, os avanços principalmente na área de espectroscopia por imagem permitiram o surgimento de novos métodos de fenotipagem de plantas, os quais são mais rápidos e precisos do que os métodos tradicionais.
• A vantagem está na preservação da amostra, o que permite a avaliação de uma
determinada característica ao longo do ciclo da cultura.
• Permite inferências mais seguras e confiáveis sobre a forma, a estrutura e o
metabolismo das plantas.
• A automação do processo de medição das características avaliadas possibilitado
economia de tempo, recursos e mão-de-obra. GRAT A!
Avaliação dos Descritores Morfoagronômico e Morfoanatomia da Lâmina Foliar de Pilocarpus: Microphyllus Stapf ex Wardleworth – Rutaceae, Ananas Comosus Var. Erectifolius (L. B. Smith) Coppens & F. Leal – Bromeliacea e Psychotria Ipecacuanha (Brot.) Stokes