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As fábricas celulares microbianas Bio Med Central

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enzimas e potenciais de utilização de termófilos e termoestáveis ​em


biorefinação
Pernilla Turner, Gashaw Mamo e Eva Nordberg Karlsson *

Endereço: Dept Biotecnologia, Centro de Química e Engenharia Química, Universidade de Lund, PO Box 124, SE-221 00 Lund, Suécia Email: Pernilla Turner - pernilla.turner@biotek.lu.se ;

Gashaw Mamo - gashaw.mamo@biotek.lu.se ; Eva Nordberg Karlsson * - eva.nordberg_karlsson@biotek.lu.se

* autor correspondente

Publicação: 15 de março de 2007 Recebidos: 04 de janeiro de 2007


Aceito: 15 março de 2007
As fábricas celulares microbianas 2007, 6: 9 doi: 10.1186 / 1475-2859-6-9

Este artigo é disponível a partir de: http://www.microbialcellfactories.com/content/6/1/9 © 2007 Turner et

ai; licenciado BioMed Central Ltd.


Este é um artigo Open Access distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution (h ttp: //creativecommons.org/licenses/by/2.0 ), Que permite a utilização livre, distribuição, e
reprodução em qualquer meio, desde o trabalho original, devidamente citada.

Abstrato
No mundo de hoje, há uma tendência crescente para o uso de biomassa renovável, barato e facilmente disponível na produção de
uma grande variedade de química fina e de massa em diferentes biorrefinarias. Biorefinarias utilizar as actividades de células
microbianas e as suas enzimas para converter a biomassa em produtos alvo. Muitos destes processos requerem enzimas que são
operacionalmente estável a alta temperatura permitindo assim por exemplo fácil de mistura, uma melhor solubilidade do substrato, a
taxa elevada de transferência de massa, e o risco reduzido de contaminação. Termófilos foram frequentemente proposta como
fontes de enzimas termoestáveis ​industrialmente relevantes. Aqui nós discutimos as aplicações existentes e potenciais de termófilos
e enzimas termoestáveis ​com foco na conversão de carboidratos contendo matérias-primas. A sua importância em biorefinarias é
explicada através de exemplos de conversões de lignocelulose e de amido para produtos desejados. Estratégias que melhoram
thermostablity de enzimas tanto na Vivo e em vitro também são avaliadas. Além disso, esta revisão trata a esforços no
desenvolvimento de vetores para expressar enzimas recombinantes em hospedeiros termófilas.

fundo aceitação geral. A maioria das bactérias termófilas caracterizadas hoje


enzimas termoestáveis ​e microorganismos têm sido temas de muita crescem abaixo do limite hiperterm�ila (com algumas exceções, como Thermotoga
pesquisa durante as últimas duas décadas, mas o interesse em termófilos e e Aquifex
como suas proteínas são capazes de funcionar a temperaturas elevadas, [5]), enquanto espécies hipertermofílicos são dominados pela Archaea.
na verdade começou tão cedo quanto em 1960 pelo trabalho pioneiro de
Brock e seus colegas [ 1]. Os microrganismos são, com base nas suas
temperaturas de crescimento timas, divididos em três grupos principais, ou Use e o desenvolvimento de técnicas de biologia molecular, permitindo a análise
seja psicrófilos (abaixo de 20 ° C), mesófilos (temperaturas moderadas), e genética e de transferência de genes para a produção recombinante, levaram a
termófilos (temperaturas elevadas, superiores a 55 ° C) [2]. Apenas alguns um aumento da dramaticamente actividades no campo de enzimas termoestáveis
eucariotas são conhecidos a crescer acima desta temperatura, mas alguns ​durante a década de 1990. Isto também estimulou o isolamento de um número de
fungos crescem no intervalo de temperatura 50 - 55 ° C [3]. Vários anos micróbios a partir de ambientes térmicos a fim de aceder a enzimas que poderiam
atrás Kristjansson e Stetter [4], sugeriu uma divisão adicional das termófilos aumentar significativamente a janela para as operações de bioprocessamento
e um limite hipertermilo (crescimento a e acima de 80 ° C) que tem hoje enzimáticas. Um dos exemplos comercializados bem sucedidas iniciais era
alcançada utilização analítica de uma enzima termoestável, Taq- polimerase, em cadeia da
polimerase

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reacções (PCR) para amplificação de DNA, e um número de outras enzimas de lidades de conservação prolongada (à temperatura ambiente), o aumento da
ADN modificando a partir de fontes termófilas já, desde então, foi comercializado tolerância a solventes orgânicos [14], a redução do risco de contaminação, bem
nesta área [6-8]. Outra área de interesse tem sido a prospecção de enzimas como perdas de actividade baixa durante o processamento (quando ficam abaixo
industriais para utilização em produtos técnicos e processos, muitas vezes em da T m da enzima), mesmo a temperaturas elevadas, muitas vezes utilizados em
uma escala muito grande. As enzimas podem ser vantajoso como catalisadores matérias-primas pré-tratamentos.
industriais, eles raramente requerem iões metálicos tóxicos para a
funcionalidade, criando assim a possibilidade de utilizar mais ambientalmente
amigável processamento [9]. enzimas termoestáveis ​oferecer alternativas de Descoberta e utilização de enzimas termostáveis, em combinação com a
catalisador sólidas, capazes de suportar as condições, muitas vezes produção e desenvolvimento recombinante usando tecnologias evolução dirigidos
relativamente severas do processamento industrial. ao sítio e enzima, ter apagado alguns dos primeiros dificulta identificados ( por
exemplo acesso limitado e a especificidade do substrato) para uso em biocatálise
industrial. Hoje, um número de empresas de biotecnologia são continuamente
prospecção de novos, e adaptando enzimas existentes para reações de maiores
Conversão de biomassa em açúcares para por exemplo utilização de energia foi volumes e condições de processo mais graves [15]. Enzima prospecção
um tema de preocupação cerca de 30 anos atrás. interesse renovado em frequentemente incide sobre a recuperação do gene directamente a partir da
conversões biocatal�icas surgiu recentemente, com a crescente preocupação natureza por técnicas de sondagem moleculares, seguindo-se a produção
sobre a instabilidade e possível esgotamento dos recursos petrolíferos fósseis, recombinante num hospedeiro seleccionado. A disponibilidade de genes que
bem como a crescente preocupação ambiental, eo foco é novamente colocado em codificam enzimas estáveis, e conhecimento de características estruturais nas
biorefinação, eo conceito de biorrefinaria. Em biorefinação, recursos renováveis, enzimas, também podem ser utilizados no desenvolvimento molecular para
tais como culturas agrícolas ou de madeira são utilizados para a extracção de melhoria da enzima (Tabela 1).
produtos intermédios ou para bioconversão directa em produtos químicos,
produtos de base e combustíveis [10,11]. enzimas termoestáveis ​tem uma
vantagem óbvia, como catalisadores nestes processos, como elevadas
temperaturas, muitas vezes promover uma melhor penetração da enzima e da Em vitro estratégias de evolução pode utilizar genes que codificam proteínas
parede celular desorganização das matérias-primas [12]. Pelo desenvolvimento termoestáveis ​como andaimes estáveis. Quando o desenvolvimento de
paralelo em biologia molecular, novo e enzimas estáveis ​desenvolvidos também andaimes de enzimas termoestáveis, o material de partida é uma coluna
têm uma boa possibilidade de ser produzido em níveis adequados. Esta revisão vertebral já estável, criando, assim, uma boa possibilidade de evolução para
discute o potencial e possibilidades de enzimas termoestáveis, desenvolvidos ou optimizar a função em condições seleccionadas para a actividade. Um exemplo
isoladas a partir de termófilos, incluindo exemplos em que células inteiras são em que este tipo de desenvolvimento tem sido utilizado é a diversificação da
considerados, em bioconversões de matérias-primas renováveis ​com uma especificidade de ligação de um módulo de ligação de hidratos de carbono,
perspectiva biorefinação. Exemplos de enzimas termoestáveis ​comerciais que CBM4-2 proveniente de uma xilanase obtida a partir da bactéria termófila Rhodothermus
actuam em matérias-primas renováveis ​será ilustrada. marinus [ 30]. módulos de ligação de carboidratos permitem o reconhecimento
polissacarídeo aperfeiçoá-lo [31] e têm potencial como afinidade lida em
diferentes tipos de aplicações, como recentemente revisto por Volkov e colegas
de trabalho [32]. Usando CBM4-2, que tem tanto de alta estabilidade térmica e
boa produtividade em E. coli

Estabilidade e desenvolvimento de enzimas termoestáveis


sistemas de expressão, uma proteína estável ao calor único poderia ser desenvolvido
Em aplicações industriais com termófilos e enzimas termoestáveis, enzimas com especificidade para diferentes polímeros de hidratos de carbono [27], bem como
isoladas são hoje domina sobre microorganismos. Uma enzima ou uma proteína no sentido de uma glicoproteína [33], que mostra o potencial de biologia molecular
é chamado termoestável quando uma alta definido desdobramento (transição) para o desenvolvimento de especificidade selectiva de uma única proteína com
temperatura (T m), ou uma meia-vida longa, a uma temperatura elevada propriedades desejáveis ​globais.
seleccionado, é observada. A temperatura elevada deve ser uma temperatura
acima do limite thermophile para o crescimento [> 55 ° C]. A maioria, mas não
todas as proteínas de thermophiles são termoestáveis. enzimas extracelulares Em vitro estratégias de evolução são mais comumente usado para aumentar a
mostram geralmente elevada termoestabilidade, uma vez que não pode ser estabilidade (Tabela 1), muitas vezes, usando genes que codificam para enzimas
estabilizado por factores específicos de células, como solutos compatíveis [13]. não termoestáveis ​com actividades desejadas, para o desenvolvimento de uma
Além disso, algumas enzimas termoestáveis ​também têm sido identificadas a melhor estabilidade térmica, e usando a temperatura do ensaio de rastreio como
partir de organismos de crescimento a temperaturas mais baixas (ver, por uma pressão de selecção [3436]. Isso poderia, por exemplo, incluir o
exemplo B. licheniformis amilase abaixo). razões fundamentais para escolher desenvolvimento de celobiohidrolases termoestáveis, que são incomuns entre os
enzimas termoestáveis ​em bioprocessamento é, claro, a termoestabilidade termófilos, mas benéfico para conversões de lignocelulose. Além disso, estas
intrínseca, o que implica possi- estratégias podem ser utilizadas para optimizar a estabilidade no interior da célula
hospedeira durante recombinante

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Tabela 1: Uma visão geral das características sugeridas para termoestabilidade interno, seleccionado a partir de estudos estruturais de homólogos, juntamente com algum desenvolvimento
abordagens para introduzir termoestabilidade, e desenvolvimento de proteínas termoestáveis.

características propostas para a estabilização interna em Fatores contribuintes Referências


proteínas termoestáveis

estabilização Helix Baixa frequência de C β- aminoácidos ramificados ( por exemplo Val, Ile, Thr). aminoácidos específicos em extremidades [16, 17]
helicoidais ( por exemplo Pró)

Estabilizar interacções na proteína dobrada pontes de dissulfeto; As ligações de hidrogénio; [18-24]


interacções hidrófobas; interacções aromáticos; redes
de par iónico (resíduos carregados); Encaixe de
extremidades soltas

Estabilizar interacções entre os domínios / subunidades formação de oligómero através por exemplo redes de par de iões [17, 19, 25]
embalagem densa Aumentar hydrophobicit núcleo ;, preencher cavidades. [19]
Não é um recurso geralmente aplicáveis ​como mostrado por Karshikoff & Ladenstein [21]

aminoácidos expostos à superfície estáveis Baixo nível de aminoácidos de superfície propensas a desamidao ( por exemplo Gln, Asn) ou a degradação [17, 24]
oxidativa ( por exemplo Cys, Met)

Abordagens para introduzir termoestabilidade metodologia de engenharia


interno em proteínas mesófilos

A redução de comprimento ou estabilizador laços superficiais e voltas local com base na estrutura de mutagénese dirigida. [17, 24]
relatados resultados promissores para: deleções Loop;
Prolina-estabilização de malhas; Docking de pontas soltas.

Introduzir interacções de estabilização local com base na estrutura de mutagénese dirigida. Sucesso relatado para a introdução de íon-pares, pontes [17, 24]
dissulfeto, enquanto a embalagem núcleo e estabilização hélice geralmente não resultam em ganho de alta
estabilidade.

tela de atividade da biblioteca diversificada à temperatura desejada evolução dirigida e outros métodos aleatórios utilizado com sucesso em vários casos [24, 26]

Abordagens para desenvolver proteínas termoestáveis

especificidade diversificando (Estrutura-base) directed evolution por por exemplo oligonucleotídeo randomização na região sítio ativo, utilizado [27]
com sucesso
Melhorar a actividade a valores de pH seleccionados evolução dirigida [28]
Ampliando gama de temperaturas para a actividade através da (Estrutura-base) directed evolution [29]
introdução de flexibilidade na região do local activo Patente por Diversa. Pode ser feito por exemplo por randomização oligonucleótido na região do sítio activo.
Mutagénese de saturação em posições seleccionadas também utilizado.

Substituição de aminoácidos expostos à superfície para conseguir a Dirigida ao local ou mutagénese de saturação em posições seleccionadas para reduzir Gln, Asn, Cys, Met, sugeriu [16, 17]
estabilidade a longo prazo

expressão [37]. Alternativamente, a identificação de características em trocas de aminoácidos são para ser esperado [38-43], e muito pequenas
thermostabilising enzimas estáveis ​pode ser utilizada para manipular a alterações 3D-estrutural pode, por conseguinte, ser suficiente para lidar com as
estabilidade em enzimas menos estáveis, usando mutagénese sitedirected várias condições extremas [38,42]. Para identificar racionalmente o tipo de
(Tabela 1). Adaptações de biomoléculas em condições extremas envolve interacções de estabilização utilizados, vários estudos têm sido realizados, onde
um compromisso de estabilidade e flexibilidade, a fim de optimizar o estado 3D-estruturas de uma única enzima isolada a partir de uma variedade de
funcional de proteínas, em vez de para maximizar a estabilidade [38,39]. A organismos de crescimento a diferentes temperaturas têm sido investigados.
energia livre de estabilização ( Δ G N → VOCÊ) de proteínas globulares Estes estudos incluem um número de enzimas intracelulares [17,19,20,42] e
independentes de origem mesófilos é marginal (na gama de 30-65 kJ / mol), algumas enzimas extracelulares, por exemplo endoglucanase [23] e lipase [44].
que corresponde a algumas interacções fracas, e a diferença entre uma Um número de características têm sido propostos a partir destes estudos (Tabela
proteína termoestável e uma proteína de origem mesófilos ( ΔΔ G N → VOCÊ), 1), e por exemplo

aumento em iões para pares e redes de par iónico foi frequentemente


corresponde a apenas algumas interacções adicionais. Além disso, apesar observada, especialmente em enzimas de espécies hipertermofílicos. ligações
de vários estudos estatísticos de sequências primárias, não há estratégias dissulfeto é outra característica de estabilização de proteínas, demonstrou ser
gerais em termos de preferido importante para muitos

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enzimas e proteínas, que também foi recentemente mostrado para proteínas enzimas. Para dar alguns exemplos, monooxigenases pode ser utilizado
intracelulares hipertermófilos, parecendo ser especialmente comum em para a hidroxilação e reacções de oxidação de Baeyer-Villiger [55]. reduo
pequenas proteínas [18]. Estabilização de proteínas menos estáveis ​utilizando estereosselectiva de compostos de carbonilo aos coois quirais podem ser
estas estratégias requer conhecimento estrutural e que pode ser bastante preparados utilizando álcool desidrogenases, entre os quais alguns dos
complicado para prever o efeito de introdução de resíduos de aminoácidos origem termofílicas são relatados [56]. À medida que estas enzimas são
novos interagir. Apesar destas dificuldades, continua a evolução de enzimas coenzima dependente, as estratégias de regeneração tem que ser
estáveis ​com actividades desejadas, usando ambas as técnicas dirigidos ao considerada (ver abaixo a secção seguinte). síntese epóxido, utilizando
sítio e ao acaso, preparar o caminho para as enzimas mais eficazes. Espera-se lipases ou oxidorredutases, têm um grande potencial para a síntese de uma
assim que a utilização de enzimas termostáveis ​em aplicações industriais irá vasta gama de produtos químicos, e reacções enzimáticas poderia
aumentar com o tempo, levando a uma maior disponibilidade e preço mais substituir alguns produtos químicos tóxicos [57]. formação da ligação CC
baixo, melhorando assim o seu potencial em aplicações em grande escala, pode ser levada a cabo com liases [58]. glicosídeo hidrolases e
como biorefinação. transferases pode catalisar a síntese de glicósido (eventualmente, por meio
de hidrólise inversa), para a produção de glico-oligossacarídeos de
comprimentos definidos,

Biorrefinarias para a utilização de recursos renováveis


A biorrefinaria recentemente se tornou um conceito-chave utilizado nas
estratégias e visões de muitos países industrializados, sendo impulsionada por
uma combinação de preocupações ambientais (encorajando produtos químicos e
combustíveis renováveis ​e gás de efeito estufa net desanimadora), políticos e Estas reacções podem ser realizadas usando células livres ou imobilizadas
econômicos [45-49]. Um biorrefinaria é definido como um sistema de combinação inteiros, em bruto, enzimas purificadas ou imobilizadas, muitas das quais são
de tecnologias necessárias entre as matérias-primas renováveis, produtos baseadas em organismos recombinantes [15]. Para aumentar a disponibilidade do
intermediários e produtos industriais finais [10,11] (Fig. substrato, enzimas de hidrólise de polímero dar uma contribuição significativa. Por
exemplo, glicosídeo hidrolases (que também são utilizadas no processamento de
1). O objectivo é produzir tanto alto valor, produtos de baixo volume e de baixo valor, alimentos e alimentos para animais) degradar de armazenagem e de construção
produtos de alto volume ( por exemplo combustíveis) [10]. As matérias-primas (ou os de materiais poliméricos de plantas e árvores em oligo- e blocos de construção de
seus produtos de repouso) podem ser utilizados directamente como matéria prima monossacárido, que são mais fáceis de microrganismos para assumir e
para bioprocessamento, ou ser utilizados como substratos baratos para processos de metabolizar. Isto pode ser desejável se biocatalisadores de célula inteira (, isto é,
fermentação a partir da qual os produtos podem ser extraídos [50]. Dependendo da proteína recombinante nativa ou de outro modo produzir metabolicamente
matéria-prima disponível em diferentes países, a biomassa de diferentes origens têm manipulado microorganismos) são seleccionados, o que pode ser o caso quando
sido sugeridos como matérias-primas, e incluem, por exemplo, milho [51], trigo [52], os produtos da via metabólica são os compostos alvo. As enzimas que actuam nas
cana-de-açúcar [46,53], colza, algodão, sorgo, mandioca [ 54] e lignocelulose [47]. Os ligações glicosídicas pode também ser utilizado para a modificação dos produtos
sistemas mais simples de biorrefinaria ter em princípio processamento fixa de um tipo naturais contendo glicosídeos como antioxidantes flavonóides [61]. A possibilidade
de matéria-prima ( por exemplo grãos) para um produto principal, enquanto que as de usar células inteiras, bem como enzimas isoladas para posterior
mais flexíveis utilizar uma mistura de matéria-prima de biomassa para produzir uma processamento aumenta a diversidade de blocos de construção potencialmente
variedade de produtos. Diferentes tipos de matérias-primas de biomassa podem ser produzidos, e uma série de produtos metabólicos já hoje foram identificados como
utilizados, tais como colheita inteira ( por exemplo cereais e milho), ou matéria-prima produtos químicos plataforma interessantes.
de lignocelulose ( por exemplo biomassa a partir de madeira ou resíduos) [10,11]. De
modo a conseguir uma conversão eficiente da matéria-prima, uma mistura de
mecânica, biocatalíticas e tratamentos químicos são esperados para ser combinado.
Nosso foco será sobre as conversões biocatal�icas e exemplos usando culturas ou
lignocelulose como matérias-primas será dado.
produtos químicos de plataforma
O Departamento de Energia dos Estados Unidos publicou uma lista de blocos de
construção químicos de valor superior, ou seja produtos químicos de plataforma que
podem ser derivadas a partir de biomassa por conversão biológica ou química e
posteriormente convertido para um número de produtos químicos de alto valor ou
Biocatálise, envolvendo acções enzimáticos ou microbianos, realizar uma tarefa materiais [62] de base biológica. Os blocos de construção 12 valor de topo estão listados
dupla nos sistemas de biorrefinaria, ambos os blocos de construção metabolizável na Tabela 2. Cada bloco de construção pode ser convertida para vários produtos
(geradores de geração de açúcares a partir de polímeros) para mais converss, e químicos de alto valor ou de materiais e as potenciais aplicações industriais são
actuando como catalisadores específicos na conversão de blocos de construção em enormes (alguns dos quais estão listados na Tabela 2). Todos os blocos de construção
produtos desejados (especificidade de conversão) . Uma ampla gama de tipos de listados podem ser produzidos a partir de (óleos de celulose, hemicelulose, amido ou
reacção, por exemplo oxidações, reduções, formações de ligação carbono-carbono, vegetal) de biomassa, quer por fermentação ou por em vitro conversões enzimáticas
e hidrólise, pode ser catalisada utilizando através

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Colheitas e grãos ( amido,


lignocelulose)
combinado
lignocelulose ( cellolose, hemicelulose,
vários FEEDSTOCK pectina)

processamento de -processos Bio resíduos

sólidos municipais
Tecnologias de
Processos químicos

processos térmicos

processos físicos

PRODUTOS
combustíveis ( sólido, líquido e gasoso)

Produtos quimicos ( pharma, especialidades,


mercadorias)

materiais ( polímeros)

etanol intermediários bioplásticos tensioactivos

biodiesel ácidos gordos detergentes adesivos

biogás óleos lubrificantes, corantes, pigmentos, tintas

figuraesquemática
Visão 1 do princípio básico de uma biorrefinaria, juntamente com alguns exemplos de produtos
Visão esquemática do princípio básico de uma biorrefinaria, juntamente com alguns exemplos de produtos.

os açúcares intermediários; glucose, frutose, xilose, arabinose, para o xylan à conversão xilitol: xilanase (EC 3.2.1.8), xilosidase (CE
lactose, sacarose e, respectivamente (glicerol 3.2.1.37), e xilose redutase (CE
isentos). Nas rotas biocatal�icas sugeridas, fermentações de organismos 1.1.1.21). Uso de xilanase termoactivos e termoestável permitir a acção
mesófilos ainda estão dominando entre os top 12, e em alguns casos a rota enzimática a ter lugar simultaneamente com o passo de aquecimento, sem
biotransformação não é conhecida e precisa ser explorado. A fim de alcançar necessidade de pré-arrefecer o sistema, por conseguinte, encurtando o tempo de
uma utilização eficiente de materiais de biomassa ( por exemplo para libertar processamento. Ao adicionar xilosidase termoestável (activo em
tanto açúcares quanto possível a partir da matéria-prima), acredita-se que xilo-oligossacarídeos), hidrólise eficiente em monómeros de xilose pode ser
existe uma necessidade de biocatalisadores termoestáveis ​eficientes. alcançado. Conversão de xilose em xilitol é no entanto catalisada por uma NAD
(P) H-dependente xilose redutase: por conseguinte, para reduzir a necessidade
de co-factores (e os seus custos), a adição de uma enzima de reciclagem de
co-factor de, ou catálise de células inteiras utilizando co-factores intracelulares
Catálise a alta temperatura poderia por exemplo ser vantajoso na devem ser considerados. Hoje em dia, a xilose em xilitol conversões são
bioconversão do xilano da hemicelulose a partir de materiais frequentemente relatados utilizando pentose diferente utilizando estirpes de
lenhocelulósicos em xilitol (Tabela 2, [63]). A dificuldade de degradação da levedura [67], mas um problema com estas estirpes está ainda a conversão de
lignocelulose foi relatada por diversos autores [64-66], e um pré-tratamento xilitol em xilulose. Em xilose fermentação de leveduras, como
térmico é frequentemente incluída para melhorar a degradabilidade destes
materiais. O tratamento térmico também é relatado para melhorar a
penetração da enzima hemicelulase para conversões [12], melhorando a Pichia e Candida, este passo é catalisada por uma desidrogenase NAD +
disponibilidade xilano. Três enzimas são necessárias dependente xilose, enquanto nas bactérias do passo correspondente é
catalisado por uma xilose isomerase.

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Tabela 2: priorizado blocos de construção derivados de açúcar, conforme listado pelo Departamento de Energia dos EUA. Adaptado a partir de [62].

Blocos de construção carbonos Pathways derivativos usos diretos ou utilizações de


derivados

1,4 diácidos fermentação aeróbia a produzir THF, 1,4-butanodiol, γ- solventes verdes, Fibras (Lycra, e outros),
(Succínico, fumárico, málico e) 4 diácidos C4 de patways do ciclo de butirolactona, pirrolidonas, ésteres, TBD, polímeros solúveis em água
Krebs diaminas, 4,4-Bionelle, ácido
hidroxibutírico, os derivados de
succinato insaturados, derivados de
succinato hidroxi, hidroxibutirolactona

ácido 2,5-dicarboxílico furano 6 desidratação oxidativo de açúcares C6 Numerosos derivados de furano, polysters Furanoic (garrafas,
conversão (química) Enzimática? succinato, ésteres, ácido levulínico, recipientes) filmes As poliamidas
poliaminas furanoic, análogos de (nylons) novos
polietileno tereftalato

3-hidroxipropiónico ácido 3 fermentação aeróbia Acrilatos, acrilamidas, ésteres, fibra Sorona, lentes de contacto, as
1,3-propanodiol, ácido malónico, fraldas (polímeros super-absorventes)
propionol,
ácido aspártico 4 A conversão do oxaloacetato no ciclo de butanodiol amina, amina análogos de amino ácidos
Krebs por meio de fermentação aeróbica tetra-hidrofurano, butirolactona dicarboxílicos C4 1,4 Pharma e
ou conversão enzimática amina-, anidrido aspártico, intermediários adoçante
poliaspártico, vários diácidos
amino substituídos

ácido glucárico 6 Um passo de oxidação com ácido nítrico de Dilactonas, monolactones,


amido (químico) a fermentação aeróbia ésteres e amidas polyglucaric Solventes, Propriedades
nylons de diferente

Ácido glutâmico 5 fermentação aeróbia Dióis, dióis, diácidos aminados, ácido Monómeros para poliésteres e
glutárico, pirrolidonas substituídas poliamidas

ácido itacónico 5 fermentação do fungo aeróbio butanodiol metilo, butirolactona, Solventes, polímeros (BDO, GBL,
tetra-hidrofurano família, pirrolidonas, THF), látex de nitrilo
poliitacónico

ácido levulínico 5 Catalisada por ácido decomposição de δ- aminolevulinato, metil oxigenados de combustível, solventes,
celulósicos e açúcares Biotransformação? tetra-hidrofurano, δ- policarbonato síntese
butirolactona, acrilatos de acetilo, os ácidos
succínicos acético-acrílico, ácido difenólico

3-hidroxibutirolactona 4 A degradação oxidativa de Hidroxibutiratos, epóxi δ- Elevado valor compostos farmacêuticos,


Biotransformação amido? butirolactona, butenóico, furanos, solventes, análogos de amino para fibras
análogos para pirrolidonas lycra

glicerina 5 transesterificação enzimática ou produtos de fermentação, propileno produtos de uso pessoal / oral cuidados,
química dos óleos glicol, 1,3- propanodiol, diácidos, álcool produtos farmacêuticos, alimentos / bebidas,
propílico, dialdeído, epóxidos, ácidos polióis poliéteres, anticongelante, umectante
glicéricos, polysters ramificados e polióis

sorbitol 6 A hidrogenação de glicose Etileno glicol, propileno glicol, Polietileno, tereftalatos de isossorbida
(químico) a fermentação aeróbia glicerol, ácido láctico, isossorbida, (garrafas), anticongelante, PLA (ido
ou biotransformação polissacáridos ramificados poliltico), polímeros solúveis em água

Xilitol / arabinitol 5 fermentações aeróbicas ou Etileno glicol, propileno glicol, Não nutritivo adoçantes, anidros,
anaeróbicas ou conversões glicerol, ácido láctico, furanos resinas polyster insaturados,
enzimáticas de lignocelulose hidroxi, ácido xylaric, polióis anticongelante

engineeed metabolicamente Saccharomyces cerevisiae transformada com a conversão de xilose a xilitol com a conversão superior a 95%, mas, como uma
xilose redutase (a partir de P. stipidis) tem xilitol como um produto final, e este nova enzima dependente de co-factor é introduzido, a reciclagem de co-factor
organismo tem sido utilizado para de tem de ser considerada [68].

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enzimas industriais e aplicações relacionadas / Amido degradação e modificação


Biorefining Amido de plantas cultivadas é uma das fontes de energia mais abundantes e
Para ilustrar ainda mais a utilização de biocatalisadores termoestáveis ​em acessíveis do mundo. É composto de amilose e amilopectina, e uma
matérias-primas renováveis, em grande escala, que irá incidir sobre o perspectiva geral da principal estrutura indicando locais de ataque enzimático
potencial e aplicações de enzimas hidrolíticas (proteases, lipases e é dado na Fig. 2. O milho é a cultura mais utilizado no processamento de
glicosídeo hidrolases), os quais são estabelecidos em escala industrial. amido, em indústrias, mas de trigo, de batata e de tapioca também são
aplicações de protease e lipase só serão mencionados brevemente (para importantes culturas enquanto que o arroz , sorgo, batata-doce, araruta, sagu
revisões, ver [69-72]) e especial ênfase será colocada em glicosídeo e feijão mung são utilizados em menor medida [75].
hidrolases.

Hidrolases (e transferases relacionados com a sequência) que actuam sobre o


De acordo com um relatório do Business Communications Company Inc, o mercado mundial de amido são membros da α- superfamília amilase, que consiste de um grande
enzimas industriais foi estimado totalmente $ 2 bilhões em 2004 [73]. Além disso, a taxa de número de enzimas relacionados com a sequência primária com um
crescimento anual de enzimas industriais está previsto para ser entre 4 e 5% e com isto vem preços mecanismo catalítico de fixação [76], grupos no libertador α- configuração. A
inferiores de enzimas, devido a uma intensa competição no mercado. O mercado enzima industrial superfamília pertence glicosado clã hidrolase GH-H, e consiste em 3 famílias
pode ser separado em secções de aplicação: (1) enzimas técnicas, (2) enzimas alimentares, e (3) relacionados com a sequência de glicosídeo hidrolases (GH13, 70 e 77 [77])
enzimas para rações animais. A maior seção é enzimas técnicas em que as enzimas utilizadas para catalisar uma variedade de reacções [ver arquivo adicional 1]. sequências de
detergentes e papel e celulose constituem 52% do mercado total mundial [73]. Principais enzimas consenso específicas, e um número variável de domínios, acredita-se ser
nesta secção são enzimas hidrolíticas, classificadas como proteases e amilases, que compreendem responsável pelas variações da especificidade, conduzindo a hidrólise ou a
20 e 25% do mercado total, respectivamente [73]. Hidrolases são geralmente fáceis de usar em actividade de transferase, bem como especificidade de substrato diferente.
bioprocessos, como eles normalmente não requerem co-fatores ou substratos complexos. Além

disso, eles podem ser usados ​em um estágio inicial no material prontamente disponível encontrados

na floresta e agricultura. Algumas aplicações disponíveis a partir de materiais de biomassa onde

variantes termoesteis foram consideradas estão listadas [ver arquivo adicional 1] em conjunto com

as actividades de enzimas que podem ser utilizadas para a sua degradação ou modificação. amido processado é utilizada, principalmente, para a glucose, maltose, e a produção
Aplicações de exemplos seleccionados com uma perspectiva biorefinação será ainda mais discutida de oligossacáridos, mas um número de produtos / intermediários também pode ser
no texto nas respectivas secções abaixo. Algumas aplicações disponíveis a partir de materiais de produzido através de ciclodextrinas. A glicose pode ser adicionalmente convertido para
biomassa onde variantes termoesteis foram consideradas estão listadas [ver arquivo adicional 1] em xaropes de alta frutose, a dextrose cristalina e xaropes de dextrose, que são usados
conjunto com as actividades de enzimas que podem ser utilizadas para a sua degradação ou ​em aplicações de alimentos [78]. A glicose pode também, naturalmente, ser
modificação. Aplicações de exemplos seleccionados com uma perspectiva biorefinação será ainda fermentada para produzir etanol (ver biocombustível abaixo), os aminoácidos ou os
mais discutida no texto nas respectivas secções abaixo. Algumas aplicações disponíveis a partir de ácidos orgânicos [78]. Conversão para o xarope de alto teor de frutose por glucose
materiais de biomassa onde variantes termoesteis foram consideradas estão listadas [ver arquivo isomerase (EC 5.3.1.5) é normalmente executado a 55-60 ° C e pH 7,0-8,5 [78], o que
adicional 1] em conjunto com as actividades de enzimas que podem ser utilizadas para a sua requer uma enzima termoestável. A frutose é um adoçante popular, em parte por causa
degradação ou modificação. Aplicações de exemplos seleccionados com uma perspectiva da disponibilidade de grandes quantidades de amido de milho com baixo custo.
biorefinação será ainda mais discutida no texto nas respectivas secções abaixo.

Cortar biorefinação
O passo inicial na colheita é biorefinação fraccionamento. Isto é conseguido processamento do amido é geralmente realizada em um processo de hidrise em
por ambos os processos biológicos [74] física, química e. Após um passo dois passos de liquefacção e sacarificação. Liquefação, é a conversão de amido
física começando, muitas vezes moagem, o processo biológico emprega granular em dextrinas mais curtas, de cadeia de comprimento solúveis [DE
diferentes hidrolases, dependendo do que tipo de cultura é fracionado. O (equivalentes de dextrose) 9-14]. Em liquefacção, o amido é gelatinizado por
fraccionamento é frequentemente acompanhada por temperaturas elevadas, meio de tratamento térmico que requer uma temperatura por volta de 70 a 90 °
o que exige enzimas termoestáveis ​e termoactivos. processos químicos C (para o milho) [78], mas para garantir a remoção de todos os complexos
podem ser usados ​para algumas aplicações, mas podem gerar produtos lípido-amilose, um processo de temperatura preferida é acima de 100 ° C [78] .
secundários tóxicos e indesejáveis, e nós não incidirá sobre os métodos Quando o amido-lama é arrefecida para baixo que forma um gel
aqui. Em vez disso, a degradação enzimática do amido de cereais e à termo-irreversível, por um processo conhecido como retrogradação, em que as
utilização de produtos obtida com este irá servir como um exemplo do cadeias de amilose interagir por ligação de hidrogénio [79]. A ordem cristalina é
potencial de enzimas termoestáveis ​neste tipo de processamento. A palha então perdida e os grânulos de amido de inchar como a amilose e amilopectina
pode também ser processado para utilizar os hidratos de carbono presentes cadeias são hidratados [80]. A termoestável α-
na fraco lignocelulósico (ver abaixo).

amilase [ver arquivo adicional 1] é adicionado antes do tratamento térmico,


o que tem lugar a 105-110 ° C durante 5-7 min [81]. O amido-lama é então
flash-arrefecida para 95 ° C e

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β
α

maltose e maltotriose
β- limite de dextrina

pululanase
amylopullulanase

neopullulanase
isopullulanase

Panose

isopanose

Figura 2
ataque enzimático em parte de uma molécula de amilopectina
ataque enzimático em parte de uma molécula de amilopectina. moléculas de glicose são indicados como círculos e as extremidades redutoras são marcados por uma linha através do
círculo.

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mantida a essa temperatura durante 60-120 min para completar a gel de amido moreversible que consiste em amilopectina com cadeias
liquefacção enzimática [81,82]. Por conseguinte, uma enzima altamente laterais encurtado e alongadas, mas livre de amilose [79]. O gel obtido
termoestável é exigido que irá ser activa durante todo o processo. Hoje em comporta-se semelhante a gelatina (e pode substituir a gelatina obtida a
dia existem, além das enzimas originalmente usados Bacillus partir da medula óssea de vacas) e tem muitos usos na indústria alimentar.
stearothermophilus ou B. licheniformis, numerosos exemplos disponível e Aplicações de amylomaltases em amido também incluir a formação de
comercializado por exemplo Vale "™ Ultra-fino" do Vale Research / Diversa, cicloamiloses [87] e a produção de isomalto oligossacáridos [88].
Multifect AA 21L ® da Genencor e Termamyl ® e Liquozyme ® da Novozymes
[ver arquivo adicionais 2]. Idealmente, a enzima deve estar activa e estável
a um pH baixo (~ 4,5) e não exigir cálcio para a estabilidade. Algumas
enzimas modificadas têm sido relatados para cumprir estas propriedades As ciclodextrinas (CDs) são outros produtos derivados do amido com uma
desejadas [ver arquivo adicional 2]. O teor de água no amido-lama é gama de aplicações possíveis, devido ao interior apolar que pode hospedar
geralmente bastante alta (35%), como uma alta viscosidade aumenta a "moléculas convidadas" e solubilizar e estabilizá-los [89]. Existem CDs de
temperatura de fusão do amido [83]. A redução do teor de humidade pode diferentes tamanhos, adequados para diferentes aplicações. Exemplos de
ser mais económico, e tem mostrado ser possível, quando, incluindo um aplicações de CDs e seus derivados são: transportadores para
tratamento de corte [82]. Este foi no entanto acompanhado por aumento da terapeuticamente
formação de isomaltose [82], e o aumento das temperaturas também importante péptidos, proteínas e
exigiria enzimas com muito elevada estabilidade térmica. oligonucletidos [90], a solubilização e a estabilização de uma gama de
moléculas farmacêuticas [91], separações analíticas [92], e diversas aplicações
em alimentos e cosméticos, têxteis, e adesivos [93]. Há também grandes
dextrinas cíclicos, geralmente conhecidas como cicloamiloses [94] ou LR-Cd
[95]. Estes produtos podem ser sintetizados por CGTases [96] ou
amylomaltases [87,97]. Cicloamiloses pode ser utilizado como um material de
Sacarificação envolve a hidrólise de oligossacáridos remanescentes (8-12 revestimento, em adesivos, para materiais plásticos biodegradáveis, como um
unidades de glucose) para um ou outro xarope de maltose por β- amilase ou aditivo de elevado energia para refrigerantes, como um retardador de
de glucose / glucose xaropes por glucoamilase [84]. O processo é retrogradação para melhoria de pão, de geleias resistentes congelamento e para
executado a um pH de 4,2-4,5 e 60 ° C, temperatura à qual o actualmente a produção de arroz não-pegajoso conforme descrito por Larsen, 2002, e
utilizados Aspergillus niger glucoamilase é estável. Ainda, a temperatura tem referências aí [98]. Cicloamiloses também têm sido propostos para auxiliar no
de ser arrefecida após liquefacção e o pH tem de ser ajustado, a fim de que re-enrolamento da proteína, agindo como uma chaperona artificial [99] e para a
a glucoamilase actuar. Mais economicamente viável seria utilizar uma solubilização dos compostos maiores, por exemplo Buckminster fulereno (C60,
enzima activa no mesmo pH e gama de temperatura como as enzimas de C70) [95].
liquefacção. Kim et al. têm relatado recentemente em um glicoamilase de solfataricus
Sulfolobus, que é optimamente activa a 90 ° C e pH 5,5-6,0. Esta enzima
também formado menos isomaltose, uma reacção secundária comum, do
que a glucoamilase fúngica disponível comercialmente [85]. Para aumentar Biodegradação e modificação de lenhocelulose
a eficiência na sacarificação, uma enzima desramificadora, tais como a Lignocelulose é um importante exemplo de uma matéria-prima abundante,
pululanase, podem ser adicionados ao processo. misturas de enzimas produzido em grandes quantidades para a produção de produtos florestais,
termoestáveis ​são hoje disponíveis no mercado contendo tanto glicoamilase muitas vezes deixando uma fração significativa de resíduos de produtos não
e pululanase, por exemplo OPTIMAX ® utilizadas. resíduos agrícolas, como palha, também tem significativa
conteúdo lignocelulose.
enzimas (Incluindo comercialmente disponíveis alimentação

enzimas) que hidrolisam a lignocelulose polimérico em intermediários metabolizáveis


da Genencor. ​mais curtos, ou que reduzem a viscosidade de polissacárido não amido de cereais em
alimentos para animais ( por exemplo
O amido gelatinizado (obtido a partir de liquefacção) também pode ser cevada, centeio, aveia) [100] pode ser usado para melhorar a utilização da fracção
modificado por amylomaltases (CE 2.4.1.25, e membros de GH 77) que são de hidratos de carbono lignocelulósico. À medida que os materiais
4- α- glucanotransferases transferência α- 1,4-glucano ligado fragmentos do lignocelulósicos, muitas vezes são submetidas a tratamentos térmicos para facilitar
amido para um aceitador, que pode ser o grupo 4-OH de outra α- 1,4linked a degradação, enzimas termoestáveis ​tem uma clara vantagem. enzimas
glucano ou glucose [86]. Nas plantas, esta enzima é também chamado de alimentares têm sido no mercado há 15 anos e o valor estimado deste mercado é
enzima disproportionating ou D-enzima [79]. Vários amylomaltases cerca de US $ US360 milhões [100]. processamento de alimentos para animais é
termoestáveis ​e termoativos industrialmente relevantes são conhecidos até normalmente realizada a temperaturas elevadas [101], de modo usar e
à data ( Thermus espécies, desenvolvimento de enzimas estáveis ​e robustos foi imperativo.

Thermococcus espécies, e Aquifex aeolicus, [ ver arquivo adicional 2]), com


temperaturas óptimas entre 75 e 90 ° C. Amylomaltase catálise resulta na
conversão em uma tera-

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Lignoceluloses de paredes de células de plantas são compostas por celulose, enzimas termoesteis (ing ou microrganismos termofílicos) desejável. Embora
hemicelulose, pectina, lenhina e (os três anteriores sendo polissacarídeos). A as celulases clivar um único tipo de ligação, os substratos cristalinos com a
celulose é o principal constituinte de todo o material de planta e a molécula sua extensa padrão de ligação necessária a acção de um consórcio de
orgânica mais abundante na crosta terrestre [102], enquanto hemiceluloses e enzimas livres ou complexos de multi-componentes, alternativamente
pectinas são polissacarídeos de matriz de parede da célula da planta. Muitas chamados celulosomas [110]. módulos de ligação a hidratos de carbono
enzimas estão envolvidas na degradação deste recurso biomassa [103], e ligados por ligantes para os módulos catalíticos também podem dar
eles são muitas vezes construídas por módulos discretos (o mais comum contribuição significativa para a acção das enzimas, e melhorar a eficiência
sendo os módulos catalíticos ou de hidratos de carbono de ligao), ligadas da degradação, especialmente em substratos lenhocelulósicos complexos
entre si por péptidos ligantes curtos, às vezes ligar um módulo catalítica com [111-113]. Outras melhorias na eficiência nível na degradação da celulose
especificidade para a celulose com um módulo hemicellulosespecific. Tal (mais rápido e menos dispendioso), criaria ambos os benefícios ambientais e
ajuda vários sistemas de enzimas na criação de degradação eficiente dos económicos, motivando ensaios utilizando misturas de enzimas, bem como
materiais lignocelulósicos. Além do que, além do mais, vários microrganismos células manipuladas, e ainda é um dos principais desafios aberta para a
produzem enzimas individuais múltiplas que podem actuar em sinergia. A Fig. investigação [114].
3 mostra uma vista geral de alguns polímeros presentes em lignocelulose, e
os locais de ataque para um número de enzimas que actuam sobre estes
substratos. Mais exemplos de
conversões hemicelulose
A hemicelulose é o segundo biomassa renovável mais abundante e
a representa 25-35% de biomassa lignocelulósica [115]. As hemiceluloses são
lignocelulose enzimas degradantes de origem termófilos com especificidades polímeros heterogéneos construídas por pentoses (D-xilose, D-arabinose),
diferentes são dadas [ver arquivo adicionais 3]. hexoses (Dmannose, D-glucose, D-galactose) e ácidos de açúcar [115]. As
hemiceluloses em madeira contêm principalmente xilanos (Fig. 3B),
conversão de celulose por celulases enquanto que em glucomananas de madeira macia (Fig. 3C) são as mais
A celulose é um composto de homopolissacárido β- unidades de comuns [115]. Há várias enzimas responsáveis ​pela degradação da
D-glucopiranose ligadas por β- ( 1 → 4) -glucosídicas. A unidade repetitiva hemicelulose. Na degradação de xilano,
menor é a celobiose, que os resíduos de glicose sucessivas são rodados
de 180 ° em relação à outra [104-106]. As enzimas de hidrólise de celulose por exemplo endo-1,4- β- xilanase (EC 3.2.1.8), β- xilosidase (CE
( ou seja celulases) são divididos em três grupos principais: endoglucanases, 3.2.1.37), α- glucuronidase (CE 3.2.1.139), α- L-arabinofuranosidase (CE
celobio-hidrolases (e exoglucanases), e β- 3.2.1.55) e esterase acetylxylan (CE
3.1.1.72) (Fig. 3B) todos agem sobre os diferentes heteropolímeros
glucosidases, todos os três atacar β- ligações 1,4-glicosicas [107,108]. As disponíveis na Natureza. Na degradação glucomanano, β- mananase (EC
endoglucanases ([EC 3.2.1.4], classificadas em 12 famílias de GH 3.2.1.78), e β- manosidase (EC 3.2.1.25) são clivar o esqueleto do polímero
diferentes, com dois inversores e retenção de mecanismos de reacção, e (Fig. 3C). A cadeia principal de clivagem de endo enzimas (xilanases e
com diferentes dobras) catalisam a clivagem de ligações internas aleatório mananases) estão entre os mais bem conhecidos. A maioria das
na cadeia de celulose, enquanto celobiohidrolases (EC 3.2.1.91, GH 5 , 7 sequências de xilanase são classificados sob família GH 10 e 11 (ambos de
[reteno] e 6, 9 [inversora]) atacar as extremidades da cadeia, libertando retenção), e algumas outras enzimas são encontradas em outras famílias
celobiose. β- glicosidases (EC 3.2.1.21, GH1, 3 [reteno] e 9 [inversora]) são (ambos inversora e reter [77]). Mananases são predominantemente
apenas activo em celo-oligossacáridos e celobiose, libertando glicose (Fig. classificadas sob família GH 5 e 26 (ambos com mecanismo de retenção),
3A). e apenas uma enzima bifuncional é a data classificadas em GH44
[invertendo]. Essas famílias têm representantes de origem termofílica.

A importância industrial significativo para celulases foi alcançado durante a


década de 1990 [109], principalmente dentro têxtil, detergente e indústria de
papel e polpa ( por exemplo na destintagem de papel reciclado). Várias
enzimas termoesteis foram caracterizada [ver arquivo adicional 3], e tem A hemicelulose é, tal como a celulose, uma fonte importante de açúcares
havido muitos ensaios nestas áreas como a termoestabilidade é altamente fermentáveis ​para aplicações Biorefining (ver também
relevante para o desempenho das enzimas. biocombustível abaixo), e degradação eficientes é vital para a sua utilização.
Tal como exemplificado antes, também é possível prever uma potencial
aplicação na produção de intermediários para produtos químicos verdes ( por
Degradação da celulose (Fig. 3A) em açúcares fermentáveis ​para a exemplo xilitol). Outras aplicações biotecnológicas também são estabelecidas
produção de produto de base é uma área de biorrefinaria, que investiu para estas enzimas, muitos dos quais motivam o uso de enzimas termoestáveis.
enormes esforços de pesquisa, pois é um pré-requisito para a posterior A selecção de enzimas é mostrada abaixo [ver arquivo adicional 3]. Uso de
produção de energia, ver endo-1,4 β- xilanases (EC 3.2.1.8.) no processo de branqueamento de pastas
biocombustível abaixo. Ela é susceptível de ser realizado, pelo menos em parte, a para fabrico de papel é um conceito
temperaturas elevadas para facilitar a degradação, assim MAK

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β
β
UMA.
β

β β

B. β
α

C.
β β

β
α

α
α

D. αα
α

Figura 3 e locais de ataque enzimático de polímeros a partir de lignocelulose simplificado


estruturas
estruturas simplificado e locais de ataque enzimático de polímeros a partir de lignocelulose. Um fragmento de cadeia de celulose (A) é mostrado, juntamente com fragmentos
hipotéticas do xilano hemiceluloses (B), glucomanano (C), e pectina (D). Locais de ataque de algumas das principais enzimas que actuam sobre o respectivo material são
indicadas por setas. O tipo de ligação glicosídica da cadeia principal é indicada entre parêntesis à direita de cada fragmento do polímero. Os hidratos de carbono são indicados
como círculos, e a extremidade redutora de cada cadeia principal é marcada por uma linha através do círculo. Branco = glicose, verde = xilose, ácido glucurónico = amarelo,
vermelho = Inose-árabe, luz azul = manose, azul escuro = galactose, ácido galacturónico cinzento =, e rosa = resíduos de açúcar indefinidos. grupos acetato são mostrados como
triângulos, como grupos fenólicos, diagonais e grupos metilo como rombs.

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introduzida por pesquisadores finlandeses, que é de grande interesse ambiental cacau e tabaco e como uma ferramenta analítica na avaliação de produtos
devido à possibilidade de diminuir o consumo de branqueamento químico em vegetais [136,137]. Em algumas aplicações, pode ser mais eficiente a
etapas posteriores [116,117]. Devido às condições do processo, as enzimas que utilização de enzimas termostáveis, particularmente quando se utiliza
funcionam a altas temperaturas e valores de pH elevados são desejáveis ​na substratos (que também pode ser outra que ocorre naturalmente moléculas
seguinte processo de branqueamento. Enzimas de termófilos satisfazer a procura contendo glicósido com ligações semelhantes aos do pectina) que são
de temperatura, uma vez que exibem estabilidade térmica intrínseca, e uma fracamente solúveis à temperatura ambiente, tal como a naringina e rutina,
actividade máxima a uma temperatura elevada, e por exemplo a xilanase de presente em frutos [138]. Muitas enzimas estão envolvidas na degradação
Xyn10A R. marinus foi mostrado para melhorar o brilho, em sequências de da pectina (alguns exemplos principais mostrados na Fig 3D), mas são
branqueamento de polpas de madeira dura e de madeira macia kraft preparados referidos por vários nomes diferentes, o que pode ser bastante confuso.
por processamento Kraft, quando se introduz o passo de tratamento com enzima, Eles podem estar a actuar quer por hidrólise ou por trans-eliminação; esta
a 80 ° C [118]. Várias patentes foram arquivados em xilanases termoestáveis ​em última realizada por liases [128]. Polymethylgalacturonase, (endo)
relação à utilização em polpa [119-121], incluindo por exemplo aminoácido poligalacturonase (depolimerase pectina, pectinase, EC 3.2.1.15),
substituído GH11 enzimas para melhorar o desempenho [122]. As xilanases são polygalacturonase (CE 3.2.1.67), e exopolygalacturanosidase (CE 3.2.1. α- L-rhamnosidases
também produzidos em escala industrial, como aditivos em alimentos para aves (CE
de capoeira [123] e como aditivos para farinha de trigo para melhorar a qualidade
dos produtos cozidos [63].

3.2.1.40, em GH família 28, 78 e 106) hidrolisar ramnogalacturonano na


Mananases têm potencial no branqueamento da polpa, especialmente em combinação espinha dorsal péctico. α- L-arabinofuranosidases (CE 3.2.1.55, α- L-AFases
com xilanase [124], e aplicações em alimentos e alimentos para animais incluem encontrados em 5 famílias diferentes de GH) hidrolisam as cadeias laterais de
viscosidade decrescente acção dos extractos de café para a produção de café L-arabinose, e endo-arabinase (CE 3.2.1.99, GH43) agir em arabinano
instantâneo [125]. cadeias laterais em pectina [140]. Estas duas enzimas operam sinergicamente
em arabinano ramificado degradantes para produzir Larabinose [126]. liases
Conversão de pectinas de polissacáridos (PL), que, tal como a GH foram classificadas em famílias de
As pectinas são o terceiro grupo polissacárido estrutural principal da parede sequências relacionadas com, clivar o polímero de ácido galacturónico pela β- eliminação
celular das plantas, abundante em polpa de beterraba [126] e fruta, por exemplo em e compreendem por exemplo liase polymethylgalacturonate (pectina liase, EC
citrinos e de maçã, onde pode formar-se a metade do teor polimérico da parede 4.2.2.10), liase poligalacturonato (pectato liase, CE
celular [127]. A espinha dorsal de pectina, que é constituído por regiões de
ácidos homo-galacturónico (por vezes metilado), e regiões de ambos ramnose e
ácido galacturónico (Fig. 3D), tem cadeias laterais de açúcar neutros constituídos 4.2.2.2), e exopolygalacturonate liase (pectato-liase de dissacárido, EC
a partir de L-ramnose, arabinose, galactose e xilose [128] . resíduos de 4.2.2.9) [77139141]. Pectinesterase (esterase pectinmethyl,
L-ramnose na espinha dorsal transportar cadeias laterais contendo arabinose e pectinmethoxylase, EC 3.1.1.11) de-esterificar os encadeamentos de éster de
galactose. Há também cadeias laterais xylogalacturonan único [127]. Pectina tem metilo do esqueleto de pectina [139]. pectinases termoestáveis ​não são tão
encontrado ampla utilização comercial, especialmente na indústria têxtil [129] e freqüentemente descrito, mas os relatórios mostram alguns termoestável α- L-rhamnosidases,
na indústria alimentar como espessante, agente de textura, agente emulsionante, por exemplo de Clostridium stercorarium [ 142] e a partir de uma estirpe de
estabilizador, agente de enchimento em produtos de confeitaria, produtos perto relacionada com Thermomicrobium [ 138]. A poligalacturonase
lácteos, e produtos de padaria, etc [130]. Também é estudada pelo seu potencial termoestável a partir de um molde termofílica, thermophile Sporotrichum, otimamente
na entrega de drogas e na indústria farmacêutica [131], e é interessante como ativa a 55 ° C também tem sido relatada e pode ser relevante para a indústria
um suplemento alimentar para seres humanos devido ao seu efeito de de suco de fruta [143] [ver arquivo adicionais 3]. vários termoestável α- L-AFases
abaixamento do colesterol possível [132]. A pectina também tem um potencial em (também envolvidas na degradação da cadeia lateral de xilano) são descritos
fazer películas biodegradáveis ​[133]. Apesar destas aplicações, as pectinas são, na literatura (listado em hemicelulases [ver arquivo adicional 3]).
semelhante à celulose e hemiceluloses, materiais residuais comuns que podem
ser convertidos em açúcares solúveis, etanol [134], e de biogás [135].

biocombustível
Durante a crise mundial do petróleo na década de 70 o interesse no uso de celulases
para produzir açúcares fermentáveis ​de resíduos celulósicos foi despertado tanto nos
pectinases microbianos são responsáveis ​por 25% das vendas enzimas alimentares Estados Unidos e na Europa. O objetivo era então a tornar-se menos dependente do
mundial [136], e são utilizados extensivamente para a clarificação de sumos de fruta, petróleo e reduzir as importações de petróleo. Actualmente, esta necessidade é
extracção de sumo, produção de amido pectinfree, refinamento de fibras vegetais, ainda mais franco, não só por causa do aumento do custo do petróleo, mas também
desengomagem de fibras naturais, de tratamento de águas residuais, de cura de porque há uma necessidade de reduzir o efeito estufa
café,

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as emissões de gases e, em geral melhorar a qualidade do ar. Hoje, existem igualmente bem como S. cerevisiae [ 153], mas até mesmo temperaturas mais
programas especiais em um número de países-alvo para o desenvolvimento de elevadas são desejados. A fermentação também pode ser realizado por bactérias
produção de biocombustíveis a partir de recursos renováveis, examinando as anaeróbias termo-activo. Por exemplo, alguns termófilos isoladas a partir de fontes
possibilidades de, por exemplo, biogás, bioetanol, biodiesel e células de termais Icelandic um bom desempenho na produção de etanol a partir de
combustível. hidrolisados ​lignocelulolíticos, mas necessita de mais testes [154].

O bioetanol é o combustível renovável mais comum hoje em dia, e por exemplo


a "Iniciativa de Biocombustíveis" nos EUA (US Department of Energy), se hidrólise enzimática de celulose de glucose é hoje predominantemente
esforça para fazer costcompetitive etanol celulósico em 2012 e supostamente realizada por fungos, por exemplo, Trichoderma, Penicillium e Aspergillus [ 155],
correspondem a um terço do consumo de combustível dos Estados Unidos em mas a competir com os resultados de hidrólise de ácido, degradação mais
2030. O "Energia para o Futuro" na UE, tem o objetivo de ter 12% de energias eficiente, presumivelmente em é necessária uma temperatura mais
renováveis ​na UE até 2010 [144]. O etanol é vulgarmente derivados a partir de elevada, e algumas enzimas relevantes foram descritos a partir termófilos e
grãos de milho (amido) ou de cana de açúcar (sacarose) [145]. A sacarose hipertermófilos [ver arquivo adicional 3]. O obstáculo reside na expressão
pode ser fermentados directamente para o etanol, mas o amido é hidrolisado de uma série de proteínas e montá-los
em glicose antes que pode ser fermentado, geralmente por Saccharomyces
cerevisiae [ 146]. Etanol fermentação do amido pode ser melhorada através da em vitro [ 151], mas demonstrou-se que as celulases de diferentes origens,
utilização de melhores enzimas e as estirpes e preferencialmente hidrolisar o com temperatura óptima diferente variando de mesófilos para termofílica,
amido a partir de grãos inteiros sem um pré-tratamento químico e com podem ser combinados em conjunto e ainda exibem sinergismo substancial
simultânea liquefação, sacarificação e fermentação [147]. na degradação do material celulósico [156]. Um endoglucanase de Acidothermus
cellulolyticus, que foi fundido com T. reesei celobiohidrolase e expresso em T.
reesei foi exemplo para melhorar os rendimentos de sacarificação, [157].
Endoglucanase e actividade de celobio-hidrolase não é no entanto
suficiente, como o produto de degradação (celobiose) inibe as enzimas
No entanto, o material de biomassa de amido, bem como cana-de-açúcar, é antigos e mais blocos de despolimerização da celulose. Para resolver esta
limitada e para o biocombustível renovável de ser capaz de competir com inibição do produto, β- glucosidases têm de ser adicionado, ou manipulados
combustíveis fósseis, é necessário um processo custo-eficaz de um recurso em estirpes de produção que são capazes de fermentar celobiose e
renovável ainda mais abundante. Agrícola e biomassa florestal estão celotriose em etanol [158]. Thermophiles ainda não tenham desempenhado
disponíveis em quantidades suficientes para ser considerado para a um papel importante na engenharia metabólica, devido à quantidade limitada
produção em larga escala de combustíveis à base de álcool [148]. resíduos de vetores e ferramentas disponíveis para a sua modificação. mesófilos Em
urbanos são uma fonte adicional de biomassa; estima-se que a celulose é vez disso, conhecidos como S. cerevisiae são usados, e, recentemente, tem
responsável por 40% dos resíduos sólidos urbanos [148]. produtos à base de sido modificada com genes de uma via de xilose e de fungos a partir de uma
celulose pode ser competitiva com produtos derivados de custos de via de arabinose bacteriana, o que resultou numa estirpe capaz de crescer
processamento de recursos fósseis fornecidas são reduzidos [149]. em ambos os açúcares pentoses e hexoses com rendimentos melhorados
Infelizmente, devido à estrutura complexa e cristalino de lignocelulose, este de etanol [159]. Também são necessárias tecnologias melhores para
material é muito mais difícil do que para hidrolisar o amido. é necessária uma pré-tratamento da biomassa. Mecânicas, químicas, biológicas ou
conversão eficiente de material ligno-celulósico em açúcares fermentáveis, pré-tratamentos térmicos aumentar a acessibilidade de celulase por remoção
mas requer melhores estirpes ou sistemas de enzimas que são capazes de de lignina e hemicelulose e por interromper parcialmente a estrutura de
converter tanto pentoses e hexoses e tolerar condies de stress [150]. O uso fibras. Uma revisão recente é dada por Wyman et al. [160] e a comparação
de celulases, hemicelulases, termoestáveis ​e microrganismos termofilicos na foi feita entre tecnologias principais [161].
degradação do material lignocelulósico oferece uma vantagem de minimizar
o risco de contaminação e pode permitir que um processo de um único passo
de hidrólise enzimática, a fermentação, e a destilação do etanol formado
[151].

possibilidades de produção dos biocatalisadores


Uma consideração importante ao selecionar um biocatalisador é a
perspectiva de produzi-lo em quantidades suficientes. Estas considerações
Hoje em dia, as fases de hidrólise e de fermentação são separados. A etapa de incluem a escolha de produzir pelo hospedeiro nativo, ou, se o gene que
fermentação é geralmente realizada por Saccharomyces cerevisiae ou Zymomonas codifica uma enzima de interesse deve ser transferido para um hospedeiro
mobilis, mas esta pode ser uma desvantagem, uma vez que a temperatura tem de seleccionado para a produção recombinante. De um modo geral, a
ser reduzido a partir do passo de hidrólise, que é melhor realizada à temperatura expressão do gene não é um problema relacionado com o thermophilicity da
mais elevada, pelo menos 50 ° C [152]. levedura termoativos, proteína alvo e os que têm origem a partir termofílica

Kluyveromyces marxianus, activa-se a 50 ° C, realizada

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recursos cumprir os mesmos gargalos de produção como os seus [164], a cultura comercial em grande escala de termófilos para a produção da
homólogos de mesófilos. enzima continua a ser um desafio económico. O elevado custo dos processos
de fermentação de larga escala para a produção de enzimas por termófilos e
Outra consideração importante, crucial para a implementação de hipertermófilos é justificável apenas para poucas aplicações específicas.
biocatalisadores, é o custo de produção, e há alguns anos atrás por
exemplo Genencor International estava a trabalhar sob um subcontratação
do escritório de Biomassa Programa (EUA), para reduzir os custos de a produção da enzima recombinante em hospedeiros mesófilas e
celulase, a fim de fazer a degradação em açúcares fermentáveis ​mais termófilas
rentável [162]. Redução do custo de produção de enzimas termófilas é fundamental para o
seu avanço em grande escala. Uma alternativa para reduzir os custos de
produção e aumentar o rendimento destes processos é a utilização de
degradação da celulose por celulases em grande escala é (como se referiu no tecnologia recombinante. Uma grande variedade de enzimas termoestáveis
biocombustível à secção) geralmente levada a cabo por estirpes fúngicas [155], mas ​tem sido clonada e expressa com sucesso em organismos mesófilos, tais
a introdução de enzimas mais termoactivos existe uma possibilidade para a como Escherichia coli [ 165], Bacillus subtilis
produção heteróloga em hospedeiros bacterianos, que geralmente possuem maiores
taxas de crescimento do que os fungos. A dificuldade em usar celulases bacterianas [166], Saccharomyces cervisae [ 167], Pichia pastoris [ 168],
é que eles são maiores enzimas, mais complexos e muitas vezes parte de uma Aspergillus oryzae [ 169], Kluyveromyces lactis [ 170], e Trichoderma reesei [ 171].
celulossoma com muitas actividades diferentes. A pesquisa também foi destinado
para melhorar as espécies de fermentação utilizados atualmente por engenharia
metabólica. No entanto, as diferenças na utilização de codões ou dobragem incorrecta das
proteínas pode resultar em actividade enzimática reduzida ou baixo nível de
expressão [172,173]. Além disso, muitas enzimas complexas, como hetero ou
produção de enzimas por thermophiles aqueles que requerem co-factores ligados covalentemente podem ser muito
Cultivo de termófilos a temperatura elevada é tecnicamente e difíceis de produzir em hospedeiros mesofílicas. Isto iniciou a busca de
economicamente interessante, uma vez que reduz o risco de ferramentas genéticas para a sobre-expressão de tais enzimas em sistemas
contaminação, reduz a viscosidade, tornando assim mais fácil a mistura, e hospedeiros termófilas. Até agora, uma série de vectores têm sido
conduz a um elevado grau de solubilidade substrato. No entanto, em desenvolvidos para a expressão de proteínas em vários hospedeiros
comparação com os seus homólogos mesófilos, a biomassa obtida por termofílicas (Tabela 3). O uso dos novos sistemas de expressão termófilas é, no
estes organismos é normalmente infelizmente baixa. O rendimento celular entanto, ainda em nível de pesquisa e mais trabalho ainda antes da exploração
de baixo levanta problemas tanto para a produção em grande e pequena em grande escala ou industrial pode ser considerado.
escala, o que torna extensivos estudos sobre as suas enzimas muito difícil.
Isso provocou considerável pesquisa com o objetivo de melhorar o
rendimento das células termofílica. Até à data, vários relatórios sobre
composições de mídia e otimização de cultura de diferentes thermophiles enzimas isoladas ou aplicações de células inteiras?
estão disponíveis [163]. equipamentos especiais e processos específicos enzimas termófilas são potencialmente aplicáveis ​numa grande variedade de
foram desenvolvidos para melhorar os processos de fermentação de processos industriais, principalmente devido à sua estabilidade extraordinária
termófilos e hipertermófilos [164]. Contudo, operacional a altas temperaturas e tolerância desnaturante. Tais enzimas são
usadas na indústria química, indústria alimentar, farmacêutica, papel, têxteis
e outras indústrias [182-185]. A maioria destas aplicações utilizam enzimas
termostáveis ​recombinantes que tenham sido

Tabela 3: vectores construídos para expressão sistema termofílica

Hospedeiro plasmídeo Tipo Referência

thermophilus Thermus pMKMOO1 Transporte [174]


thermophilus Thermus pMKE1 Transporte [175]
solfataricus Sulfolobus pEXSs Transporte [176]
Talaromyces sp. CL240 pUT737 Shuttle, Integração [177]
Rhodothermus marinus prM100 Transporte [178]
Pyrococcus abyssi pYS2 Transporte [179]
Thermoanaerobacterium saccharolyticum pRKM1, pRUKM Transporte [180]
Thermoanaerobacterium saccharolyticum pUXK, pUXKC Integração [180]
Sulfolobus acidocaldarius pAG1 / pAG2 Transporte [181]
Pyrococcus furiosus pAG1 / pAG2 Transporte [181]

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expressa em hospedeiros mesófilos. Dependendo do tipo de aplicação, a a bactéria termófila anaeróbio xilanolica, Thermoanaerobacter mathranii, mostrada
natureza das reacções e a pureza do produto, a preparação de enzima pode para fermentar a xilose na fracção de hemiceluloses a partir de palha de
ser isento de células (em bruto, parcialmente purificada ou homogénea) ou trigo oxidados alcalina molhado em etanol sem desintoxicação anterior
associado a células. Por exemplo, o uso de desidrogenases livre de células é [191]. Ainda assim, o crescimento em lignocelulose pré-tratada pode variar
dificultada pela necessidade de co-factores caras e sensíveis [186] enquanto dependente tanto organismo e substrato origem [189]. Além disso, a
transaminases sofrem de equilíbrio das reacções desfavoráveis ​[187]. Neste insolubilidade de lignocelulose cria problemas em manter a homogeneidade
sentido, aplicações de células inteiras podem ser mais atraente. aplicações de em reactores que fazem a monitorização e controle dos parâmetros do
células inteiras também foram relatados no processamento de alimentos, processo difícil. Portanto, assim como para os seus homólogos mesófilos,
fazendo uso de termófilos recombinante α- glucosidase expressa em Lactococcus utilização eficiente de termófilos em bioprocessos integradas precisa de
lactis investigação aprofundada. Nos últimos anos, foram feitos relatos sobre o
cultivo de estado sólido de termófilos em lignocelulose [192,193]. Em
[188]. alguns casos, em comparação com o líquido de fermentação submersa
mais tradicional, melhor conversão foi alcançado sob cultivo sate sólido
O uso de células inteiras é de especial interesse para a transformação de [194].
lignocelulose. A bioconversão envolve dois passos principais; sacarificação e
fermentação. Sacarificação é a hidrólise de polímeros de hidratos de carbono
(celulose e hemicelulose) em açúcares, e este hidrolisado é então utilizado
como substrato no passo de fermentação por microrganismos que o
transformam em produtos metabólicos ( por exemplo etanol, ver Biocombustível).A utilização de microrganismos que ocorrem naturalmente é, no entanto,
bioconversão microbiana de célula inteira oferece uma possibilidade atractiva geralmente não suficientemente eficientes na transformação do substrato em
de um único passo de transformação, em que os microrganismos produzem produtos de valor mais elevado. Assim, é imperativo para melhorar a robustez
enzimas que degradam o sacarolíticos lignocelulose e fermentar os açúcares dos micróbios para uma maior hidrólise do substrato e maiores rendimentos de
libertados, o que poderia levar a uma eficiência mais elevada do que nas produtos por meio de engenharia metabólica. A engenharia metabólica foi
conversões lignocelulósicos de várias etapas comuns [189,190]. prosseguido em hospedeiros mesófilos, resultando em estirpes de interesse
biorrefinaria que produzem elevados rendimentos de etanol [195,196],
propanodiol [197,198], acetato de [199], ido adico [200], ácido succínico [201] e
ácido láctico [ 202]. No entanto, os relatórios de engenharia metabólica têm
sido muito raro para thermophiles [203], mas pode aumentar com a
A associação íntima da celulose e da hemicelulose a lenhina na parede celular disponibilidade / desenvolvimento de ferramentas genéticas. Vários
das plantas, no entanto, tornam este substrato difícil de degradar em açúcares organismos termofilicos tais como Thermoanaerobium brockii
monoméricos em rendimentos elevados (em comparação com açúcar- ou
culturas contendo amido, por exemplo cana-de-açúcar ou milho). Pré-tratamento
(utilizando vapor, ácido ou alcalino) é, assim, necessário para tornar os [204], Clostridium thermohydrosulfuricum [ 205], e Moorella sp. HUC22-1
polímeros de hidratos de carbono disponíveis para a hidrólise enzimática e [206], têm sido estudados para a produção de etanol. A engenharia
fermentação [155,191]. Entre os métodos de pré-tratamento, a alta temperatura metabólica de tais termófilos para melhorar a produtividade e a eficiência
pré-tratamento usando água quente líquido é mostrado para fazer a biomassa da utilização de diferentes substratos, como celulose, hemicelulose e
(especificamente a parte celulose) mais acessíveis ao ataque enzimático. pectina pode ser muito interessante etanol.
Desenvolvimento de sistemas de fermentação para termófilos é aqui atraente,
uma vez que permite a poupança de energia, reduzindo o custo de
arrefecimento após a vapor pré-tratamento, redução do risco de contaminação, Observações finais
e melhorar as taxas de sacarificação e fermentação. Além disso, na produção Termófilos e enzimas especialmente termófilas até à data ganhou um grande
de etanol, condições termofilicas resultar na evaporação de etanol contínua interesse tanto como ferramentas analíticas, e como biocatalisadores para
permitindo que a colheita durante a fermentação. fermentação simultânea e aplicação em larga escala. Utilização destas enzimas é, contudo, ainda hoje,
recuperação do produto pode diminuir a inibição do produto do processo de apesar de muitos esforços, muitas vezes limitados pelo custo das enzimas.
fermentação (pelo etanol), reduzir o volume de água consumida por Com um mercado crescente para as enzimas, que leva à produção em
arrefecimento destilaria, e o tempo necessário para a destilação, o que leva a volumes maiores, o custo é, contudo, previsto para diminuir. Além disso, com
um processo mais eficiente. Um problema associado com os procedimentos de uma mudança de paradigma na indústria em movimento a partir de fósseis
pré-tratamento de lignocelulose é, no entanto, a libertação de produtos de para com a utilização de recursos renováveis, a necessidade de catalisadores
degradação que podem inibir o crescimento microbiano [191], mas algumas microbianos é previsto para aumentar, e certamente não haverá uma
bactérias termofílicas têm mostrado resultados promissores em fermentar necessidade contínua e aumentou de biocatalisadores selectivos
hidrolisados ​de lignocelulose em etanol, como termoestáveis ​no futuro.

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