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Ciência Direta
Biodegradação sintrófica de contaminantes de hidrocarbonetos
Lisa M Gieg, S Jane Fowler e Carolina Berdugo-Clavijo
Os ambientes anaeróbicos são cruciais para o ciclo global do carbono, onde
o metabolismo microbiano da matéria orgânica ocorre sob uma variedade
de condições redox. Em muitos ecossistemas anaeróbicos, a sintrofia
desempenha um papel fundamental em que as espécies microbianas devem
cooperar, essencialmente como uma única unidade catalítica, para
metabolizar substratos de uma forma mutuamente benéfica. Ambientes
contaminados por hidrocarbonetos, como aquíferos subterrâneos, são
tipicamente anaeróbicos e frequentemente metanogênicos. Processos
sintróficos são necessários para biodegradar hidrocarbonetos em metano, e
estudos recentes sugerem que o metabolismo sintrófico de hidrocarbonetos
também pode ocorrer na presença de aceitadores de elétrons. A elucidação
das principais características dos processos sintróficos em coculturas
definidas beneficiou-se enormemente dos avanços nas ferramentas
baseadas em 'ômicas'. Tais ferramentas, juntamente com abordagens como
a sondagem de isótopos estáveis, estão agora a ser utilizadas para
monitorizar o fluxo de carbono num número crescente de consórcios de
degradação de hidrocarbonetos para identificar os principais intervenientes
microbianos envolvidos nas vias de degradação. O sequenciamento
metagenômico de consórcios que utilizam hidrocarbonetos deve ajudar a
identificar ainda mais as principais características sintróficas e definir as
interações microbianas nessas comunidades complexas.
Endereços
Grupo de Pesquisa em Microbiologia do Petróleo, Departamento de
Ciências Biológicas, Universidade de Calgary, 2500 University Drive NW,
Calgary, Alberta, Canadá T2N 1N4
Autor correspondente: Gieg, Lisa M (lmgieg@ucalgary.ca)
Opinião atual em biotecnologia2014,27:21–29
Esta revisão vem de uma edição temática emBiotecnologia
ambiental
Editado porHauke prejudicaeHoward Junca
Para uma visão geral completa, consulte oEmitire aEditorial
Disponível on-line em 1º de outubro de 2013
0958-1669/$ – ver capa, # 2013 Elsevier Ltd. Todos os direitos
reservados.
http://dx.doi.org/10.1016/j.copbio.2013.09.002
Introdução
A sintrofia, que significa simplesmente 'alimentação conjunta', pode
ser definida mais especificamente como um processo metabólico
termodinamicamente interdependente e mutuamente benéfico que
ocorre entre organismos em que o metabolismo de um
determinado composto por um organismo ocorre apenas quando
os produtos finais são mantidos em baixas concentrações através
do consumo. por um segundo organismo [1--,2,3]. A sintrofia ocorre
amplamente em ecossistemas metanogênicos onde os aceitadores
de elétrons anaeróbicos são limitados ou ausentes, mas também
pode ocorrer em ambientes redox mais elevados ou no
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presença de aceitadores de elétrons [4-]. Na nossa era de
dependência de energia fóssil, a exploração, recuperação e
transporte de combustíveis de hidrocarbonetos levaram à
contaminação de muitos ambientes primitivos superficiais e
subterrâneos rasos que rapidamente se tornam anaeróbicos e, em
muitos casos, metanogênicos. Assim, compreender como os
consórcios sintróficos anaeróbicos participam do metabolismo dos
hidrocarbonetos é crucial para compreender a atenuação natural de
tais contaminantes e para desenvolver estratégias eficazes de
biorremediação e ferramentas de monitoramento.
Principais características do metabolismo sintrófico
Os princípios subjacentes da sintrofia foram descritos de forma
abrangente em revisões recentes [1--,2,3,5] portanto, são
apenas brevemente descritos aqui. Em ambientes sintróficos, os
utilizadores iniciais de substrato consistem em organismos
fermentativos (sintrofos) que iniciam o metabolismo de
compostos como ácidos graxos, álcoois, açúcares, aminoácidos
e compostos aromáticos para produzir intermediários como
acetato, formato e/ou H2[1--]. A oxidação anaeróbica do
substrato inicial é termodinamicamente desfavorável sob
condições padrão, mas torna-se favorável quando parceiros
como os metanógenos consomem os intermediários,
mantendo-os em baixas concentrações.tabela 1). Nestas
reações, são produzidas quantidades relativamente baixas de
energia e essa energia deve ser partilhada entre todos os
parceiros; como tal sintrofia foi considerada um estilo de vida
microbiano extremo [1--,5]. Embora a sintrofia seja mais
frequentemente caracterizada por parcerias de bactérias
fermentativas (sintrofas) com metanógenos arqueais [1--,4-,6-,7-],
interações sintróficas também podem ocorrer na ausência de
metanógenos, particularmente em sistemas caracterizados por
potenciais redox mais elevados [8]. Algumas bactérias, como as
redutoras de sulfatoDesulfovibriospp., são metabolicamente
versáteis, pois respiram sulfato quando este está disponível,
mas mudam para o metabolismo sintrófico na sua ausência.9-].
Outros sintrofos são obrigatórios porque só podem metabolizar
substratos na presença de um parceiro eletroaceitador, como
algunsPelotáculospp. [1--,3].
Mecanismos de transferência de elétrons entre espécies
fundamentam processos sintróficos termodinamicamente
favoráveis. O mecanismo de transferência de elétrons mais bem
compreendido é via H2ou troca de formatos entre os parceiros
sintróficos. Estudos fisiológicos e sequenciamento genômico de
vários sintrofos mostraram que múltiplas enzimas e/ou complexos
ligados à membrana funcionam durante o H2/processos sintróficos
baseados em formato e incluem mecanismos de transferência
reversa de elétrons quando a entrada de energia é necessária [1--]. A
estreita associação de parceiros sintróficos via agregação tem se
mostrado importante para
Opinião atual em biotecnologia2014,27:21–29
22Biotecnologia ambiental

tabela 1

Estequiometria e energia livre de Gibbs para reações envolvidas na degradação sintrófica de hidrocarbonetos acopladas à produção de metano

DG80(kJ/mol) DG0(kJ/mol)b
Reações produtoras de metanoa
-
Acetotrófico CH3COO-+H2Ó! HCO3 + CH4 - 31,0 - 15,6
Hidrogenotrófico 4H2+HCO-+ 3 H!+ CH4+ 3H2Ó - 135,6 - 38,5
Oxidações sintróficas de hidrocarbonetos em acetato e H2
+
Tolueno C7H8+ 7H2Ó! 3,5 canais3COO-+3,5HC10H ++4H2
8 +113,6 - 40,9
-
Naftaleno 10H2Ó! 5 canais3COO + 5H++ 4H 2 +101,1c - 90,2
Hexadecano C16H34+ 16H2Ó! 8 canais3COO-+8h++ 17H2 +470,8c - 91,3
Conversão geral de hidrocarbonetos em metanod
+
Tolueno C7H8+ 7,5 horas2Ó! 4,5 canais4+ 2,5HCO- 3+ 2,5H - 130,5 - 134,1
Naftaleno C10H8+ 10 horas2Ó! 6 canais4+ 4HCO-3+ 4H+ - 189,5 - 206,9
Hexadecano C16H34+ 16h2Ó! 12,25 canais4+ 3,75HCO- 3+ 3,75H+ - 353,5 - 380,0

aDos dados em [46].

bCalculado com os seguintes valores, conforme sugerido em [5]:H2, 10 Pa; bicarbonato, 50 mM; acetato, 50euM; CH4, 50 kPa; substratos, 100euM e
com base na fórmula:DG0=DG80+RTln[(C)c(D)d/(A)a(B)b], ondeR=0,00831 kJK-1mol-1eT =
298 mil.
cOs balanços de massa e os valores de energia livre de Gibbs sob condições padrão são de [24-,25].
dAssume a remoção do produto através de metanogênese acetotrófica e hidrogenotrófica.

transferência de elétrons via H2e formatar [3]. Alinhando-se com
este conceito, mecanismos alternativos para transferência de
elétrons também podem ocorrer via contato direto célula a célula
(transferência direta de elétrons entre espécies) ou pili [8,10] ou via
flagelos [11]. Em ambientes anaeróbicos naturais compostos por
diversas comunidades microbianas e ambientes geoquímicos
dinâmicos, é provável que todos esses mecanismos de transferência
de elétrons estejam ocorrendo.
Ferramentas para desvendar processos sintróficos
Além de uma abordagem baseada em cocultura, existem vários
métodos para estudar interações microbianas. Estes incluem uma
variedade de abordagens baseadas em 'ômicas' (metagenômica,
metatranscriptômica, metaproteômica), avaliando o fluxo de
carbono através de uma comunidade microbiana complexa para
identificar os principais degradadores de substrato por meio de
técnicas de sondagem de isótopos estáveis (SIP), por meio de
métodos espectroscópicos baseados em fluorescenteno local
hibridização (FISH) (Magneto-FISH, CARD-FISH, MAR-FISH, Raman-
FISH) e abordagens espectrais de massa de alta resolução, como
NanoSIMS [2,12,13,14]. O acoplamento da classificação celular com
o sequenciamento completo do genoma de uma única célula,
recentemente demonstrado como um método eficaz para obter
informações genéticas para organismos não cultivados [15-], é outra
abordagem de ponta que pode ser potencialmente aplicada para
ajudar a compreender os processos sintróficos. A genômica e a
transcriptômica permitiram avanços na compreensão dos principais
genes envolvidos nas interações sintróficas em coculturas bem
definidas [1--,7-,9-,16,17-], estendendo assim essas abordagens para
culturas metanogênicas mistas que degradam hidrocarbonetos
ajudará a determinar o potencial sintrófico entre comunidades mais
complexas. Informações metagenômicas recentemente divulgadas
para culturas e ambientes de recursos que degradam
hidrocarbonetos [18-,19-] agora pode ser usado para explorar genes
de 'sintrofia' para ajudar a informar o desenho de estudos
adicionais. Em um ambiente de campo, a implantação de
bioarmadilhas combinadas com13Hidrocarbonetos marcados com C
produziram dados taxonômicos e funcionais sobre
organismos associados à biodegradação anaeróbica de
hidrocarbonetos [4-]; tal abordagem, juntamente com análises
metaômicas e baseadas em FISH, poderia ajudar a resolverno
localinterações sintróficas em aquíferos dinâmicos
contaminados com hidrocarbonetos [12].
Ambientes contaminados por hidrocarbonetos
e consórcios sintróficos
Muitos ambientes sedimentares subterrâneos rasos, como os
aquíferos subterrâneos, tornam-se rapidamente anaeróbicos
após a contaminação por hidrocarbonetos e muitas vezes
tornam-se metanogênicos (por exemplo, [20,21-]). Os
hidrocarbonetos são considerados substratos “difíceis” uma vez
que são relativamente inertes, mas é agora bem conhecido que
podem ser metabolizados anaerobicamente. Embora a
biodegradação metanogênica ocorra paran-alcanos, alcenos,
hidrocarbonetos monoaromáticos e hidrocarbonetos
aromáticos policíclicos (PAHs) [22,23], relativamente pouco se
sabe sobre as vias metabólicas ou interações sintróficas em tais
sistemas. O metabolismo sintrófico é necessário para a
mineralização de hidrocarbonetos em CH4e companhia2e este
processo pode envolver múltiplos micróbios e variações de
caminhos no caminho para a produção de metano (figura 1a).
Várias possibilidades diferentes pelas quais os hidrocarbonetos
podem ser degradados sintroficamente em metano foram
descritas [24-,25]; em particular, determinar o destino do
acetato durante a degradação de hidrocarbonetos tem sido de
-
grande interesse [26-,27 ,28-,29-]. Termodinâmica, condições
ambientais (por exemplo, acetato, CO2e H2concentrações;
temperatura) e a composição da comunidade microbiana
provavelmente determinam qual via metabólica é dominante
em diferentes ecossistemas contendo hidrocarbonetos
metanogênicos [21-,24-,25,28-].
Sintrofia em culturas metanogênicas que
degradam hidrocarbonetos
A degradação sintrófica de hidrocarbonetos por coculturas
raramente foi relatada [5]. Recentemente, Callaghane outros.

Opinião atual em biotecnologia2014,27:21–29 www.sciencedirect.com

 Biodegradação sintrófica de hidrocarbonetosGieg, Fowler e Berdugo-Clavijo 23

figura 1

(a)Condições metanogênicas
H2/CO2-usando (1) Hidrogenotrófico
metanógenos metanogênese
CH3 Sintrofo(s) 4H2+CO2 2H2Ó + CH4
COO- COO- H2

COO-
CH3
COO- H2+ (2) Sintrófico
acetato 4H2+2CO2 oxidação de acetato
ligado a
R COO- CH3COO - +H++ 2H2Ó hidrogenotrófico
R
Oxidantes sintróficos metanogênese
acetato
Butirato?
Outro ? COO
3 -+H+ CO2 + CH4
micróbios? Butirato acetato
Usando acetato (3) Acetotrófico
metanógenos metanogênese

(b)Outras condições de aceitação de elétrons

NÃO
3- (1) redução de nitrato
(Betaproteobactérias)
acetato
Clostridiales (Peptococcáceas)
H2 N2

COO- Fé3+
H2+
acetato (2) redução de ferro
(Dessulfobulbáceas)
Fé2+
H+
ENTÃO
4 2-

HCO-3 +H+ (3) redutor de sulfato

S2- (Deltaproteobactérias)
Biomassa
catadores

Opinião atual em biotecnologia

Modelos conceituais de trabalho para a biodegradação sintrófica de hidrocarbonetos contaminantes sob (a)condições metanogênicas (na ausência de aceitadores
de elétrons) e (b)na presença de aceitadores de elétrons como nitrato, Fe(III) ou sulfato. Sob condições metanogênicas, descobriu-se que a degradação do tolueno
ocorre através da adição de fumarato [41], enquanto metabólitos de ácido carboxílico foram detectados durante a degradação de alquil PAHs [42] en-alcanos [
43,56]. O metabolismo de hidrocarbonetos por sintrofos provavelmente produz H2que pode ser consumido por metanógenos hidrogenotróficos (a1) [29-] e acetato
que pode ser usado diretamente por metanógenos acetotróficos (a3) [28-,29-] ou sofrer oxidação de acetato sintrófico juntamente com metanogênese
hidrogenotrópica (a2) [26-,27-]. Outras interações sintróficas também podem ocorrer sob condições metanogênicas [33--,34]. Na presença de aceitadores de
elétrons, a degradação sintrófica do benzeno porClostridialespode ser acoplado com (b1) redução de nitrato [39], (b2) redução de ferro [35-], ou (b3) redução de
sulfato [36,37--,38].

[30--] mostrou queDesulfatibacillum alkenivoransAK-01, um Em consórcios mistos de degradação de hidrocarbonetos

redutor de sulfato capaz den-biodegradação de alcano via
adição de fumarato, produz metano a partir den-hexadecano na
ausência de sulfato quando co-cultivado com um H2/formato
usando metanogênio. O genoma do AK-01 revelou genes-chave
relacionados aos mecanismos de transferência de elétrons
encontrados em outros sintróficos, e genes para um complexo
associado à membrana conhecido por estar envolvido no
metabolismo sintrófico do lactato por redutores de sulfato.
Genes de hidrogenase associados a H2produção não foi
encontrada, mas genes para três desidrogenases de formato
foram encontrados no genoma AK-01, sugerindo que a
transferência de formato entre espécies pode ser a chave neste
emparelhamento sintrófico [30--].
metanogênicos, evidências de processos sintróficos foram obtidas
usando uma variedade de abordagens (mesa 2). Muitos estudos de
base filogenética revelaram que diversos micróbios compreendem
consórcios metanogênicos que degradam hidrocarbonetos ou
ambientes carregados de hidrocarbonetos. Em uma pesquisa de 26
bibliotecas de clones bacterianos construídas em locais
contaminados com hidrocarbonetos e reservatórios de petróleo,
Graye outros. [6-] mostraram que 96% das sequências bacterianas
disponíveis afiliadas a 15 filos diferentes, incluindoFirmicutese todas
as classes deProteobactérias,entre outros. Kleinsteuber e outros. [4-]
forneceu um resumo dos principais táxons bacterianos associados a
consórcios sintróficos de degradação de hidrocarbonetos
aromáticos. Filótipos relacionados aPelotáculo,

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Opinião atual em biotecnologia2014,27:21–29

24Biotecnologia ambiental
mesa 2

Resumo de relatórios recentes (desde 2008) que descrevem culturas mistas metanogênicas que degradam hidrocarbonetos e abordagens experimentais usadas para avaliar processos sintróficos

Referência Fonte de enriquecimento metanogênico; Abordagens para avaliar processos sintróficos

substrato de hidrocarboneto
Demonstração de perda de hidrocarbonetos Microbiano qPCR ou Estábulo Outros métodos)
juntamente com CH4Produção comunidade T-RFLP isótopo
análise sondagem (SIP)

Jonese outros. [47] Sedimentos fluviais; óleo cru você você Medições isotópicas de carbono de
gás e petróleo
Giege outros. [48] Sedimentos de aquíferos você você
contaminados; óleo cru
Sakaie outros. [31-] Giege Solo de campo de lótus; Campo você você você DNA-SIP
outros. [49] Feisthauere petrolífero de benzeno; óleo cru você você
outros. [50] Vários sites,n-hexadecano Fracionamento isotópico de CH4e companhia Fracionamento de isótopos estáveis
2produzido em relação aos controles CH4
Mayumie outros. [26-] Campo petrolífero; óleo cru produção em relação aos controles você você 14MarcaçãoC para determinar a via
metanogênica dominante
Siegerte outros. [51] Sedimentos portuários;n- CH4e companhia2produção relativa você Metanogênese aprimorada através da
hexadecano, etilbenzeno, naftaleno para controles adição de ferro (III) ou sulfato
Cinzae outros. [27-] Sedimentos fluviais; óleo cru vocêa você você 13Ensaio
C para determinar a via
metanogênica dominante
Siddiquee outros. [52] Lagoas de rejeitos de areias betuminosas; C14, C você você
16, C18n-alcanos
Zhange outros. [32] Sedimentos contaminados com lixiviados de você DNA-SIP
aterros sanitários; antraceno
Wange outros. [53] Campo petrolífero; C15–C20n-alcanos CH4produção em relação aos controles você você
Siddiquee outros. [54] Lagoas de rejeitos de areias betuminosas; C você
14, C16, C18n-alcanos, nafta, BTEX Sedimentos
Fowlere outros. [41] de aquíferos contaminados; tolueno você você

Berdugo Clavijoe outros. [42] Sedimentos de aquíferos você você

Mbadingae outros. [55]
Morrise outros. [29-]
Zhoue outros. [56]
Chenge outros. [57]
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contaminados; naftalenos
Campo petrolífero; C15–C20n-alcanos Sedimentos de CH4produção em relação aos controles você Medições de acetato e formato
aquíferos contaminados; n-hexadecano,n-campo Fracionamento isotópico de CH4e companhia vocêa Proteína-SIP Fracionamento de isótopos estáveis,
petrolífero de ácido hexadecanóico; C15–C20n- 2produzido em relação aos controles CH4 metaproteômica
alcanos Área de eliminação de resíduos de campos produção em relação aos controles CH4 você
petrolíferos; n-hexadecano produção em relação aos controles você você

bronzeadoe outros. [18-] Lagoa de rejeitos de areias betuminosas; C6–C10 você você Metagenoma sequenciado
n-alcanos

aRealizado em estudo anterior com a mesma cultura.

 Biodegradação sintrófica de hidrocarbonetosGieg, Fowler e Berdugo-Clavijo 25
Peptococcaceae, Clostridium, Deltaproteobacteria, Syntrophus, e
Esporotomaculumforam relatados como degradadores anaeróbicos
de hidrocarbonetos em ambientes metanogênicos, enquanto
Cloroflexi, Anaerolineae,eBacteroides (entre vários outros) são
considerados degradadores secundários que eliminam biomassa
morta ou intermediários de hidrocarbonetos junto com acetato e H2
-usando metanógenos [4-]. Membros deSyntrophaceae (Syntrophus,
Smithella)foram identificados em vários ambientes impactados por
hidrocarbonetos e são predominantes emn-culturas que degradam
alcanos ou petróleo bruto, implicando-as como atores-chave no
metabolismo sintrófico de hidrocarbonetos [6-,27-]. Embora a análise
da comunidade microbiana tenha sido frequentemente usada para
inferirsintrofia (mesa 2), estes dados por si só não fornecem provas
definitivas do envolvimento dos vários táxons identificados no
metabolismo sintrófico dos hidrocarbonetos.
Em um estudo que examinou a biodegradação metanogênica do
petróleo bruto pelas comunidades de sedimentos fluviais, Graye
outros. [27-] usaram qPCR para mostrar que as bactérias mais
intimamente relacionadas com Smithelacresceu
predominantemente em paralelo à perda de alcanos e à produção
de metano, sugerindo que esses organismos eram os principais
sintrofos degradadores de hidrocarbonetos. Os ensaios mostraram
que o consumo de acetato se deveu mais à oxidação sintrófica do
acetato juntamente com a metanogênese hidrogenotrófica do que à
metanogênese acetotrófica na cultura. Mayumie outros. [26-]
também chegaram a uma conclusão semelhante usando ensaios de
radiotraçador para examinar a biodegradação metanogênica do
petróleo bruto sob condições de alta temperatura e pressão. O
conhecido termófilo oxidante de acetato sintróficoTermacetogênioe
o H2-usandoMetanotermobacterforam os organismos dominantes
identificados no enriquecimento via sequenciamento do gene 16S
rRNA [26-]. Em um estudo subsequente conduzido com fluidos de
campos petrolíferos semelhantes, mas na presença de CO mais
elevado2concentrações, a metanogênese acetotrófica foi favorecida
[28-].
Sakaie outros. [31-] usaram DNA-SIP para estudar metanogênicos
13C6-degradação do benzeno. O membro cultivado mais próximo
do organismo dominante assimilando13C (chamado Hasda-
A) foiSyntrophus gencianae (85% de identidade). O filotipo
aumentou em abundância durante o curso da degradação do
benzeno, conforme revelado usando qPCR, e tanto acetato
quanto H2-usando metanógenos foram encontrados no
enriquecimento [34]. Também usando DNA-SIP, Zhange outros.
[32] implicadoMetilibium, Legionella,e não classificadoRizobiales
na degradação metanogênica do antraceno, táxons
normalmente classificados como aeróbios e não associados a
processos anaeróbicos. Contudo, as culturas foram derivadas
de material lixiviado de aterro; a presença de diversos
contaminantes no lixiviado pode promover interações
microbianas únicas em comparação com ambientes impactados
apenas por hidrocarbonetos. Morrise outros. [29-] usaram
proteína-SIP, metaproteômica e fracionamento isotópico estável
de CO2e CH4demonstrar que a metanogênese acetotrófica e
hidrogenotrófica ocorreu em um
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extensão relativamente igual durante a mineralização den-
hexadecano por uma cultura conhecida por degradar o petróleo
bruto, mostrando que em alguns sistemas nenhuma via
metanogênica a jusante é dominante.
Estudos conduzidos com uma cultura metanogênica
degradadora de tereftalato mostraram que múltiplas interações
sintróficas podem ocorrer em comunidades degradadoras de
contaminantes [33--,34]. Através de análises metagenômicas e
metaproteômicas,Pelotáculofoi identificado como o principal
degradador de tereftalato por meio de descarboxilação inicial,
produzindo em última análise intermediários como butirato,
acetato e H2/CO2. Os últimos compostos foram
presumivelmente acoplados à metanogênese (Methanosaeta,
Metanolinea) enquanto sintrofos secundários afiliados a
Termotogaee OP5 (CandidatoAcreditava-se que Cloacamonas
acidaminovorans) estivesse envolvido na oxidação do butirato
em acetato e H2. Além disso,Caldisérica (WWE1) foi proposto
para corrigir CO2/H2em butirato, alimentando os oxidantes de
butirato [33--,34]. Embora não seja um hidrocarboneto, os
experimentos conduzidos com tereftalato forneceram novos
insights sobre interações sintróficas complexas que podem
ajudar a informar estudos metanogênicos conduzidos com
hidrocarbonetos.figura 1a mostra um modelo proposto de
degradação sintrófica de hidrocarbonetos acoplado ao CH4
produção baseada em estudos realizados até o momento.
Sintrofia em culturas que degradam hidrocarbonetos
na presença de aceitadores de elétrons
Recentemente foi sugerido que processos sintróficos podem
ocorrer durante a biodegradação de hidrocarbonetos
(principalmente para o benzeno), mesmo na presença de
aceitadores de elétrons, como nitrato, Fe(III) ou sulfato.figura 1
b). Usando uma cultura de enriquecimento com degradação de
benzeno e redução de Fe (III), Kunapulie outros. [35-] usou DNA-
SIP com13C6-benzeno para identificar as principais bactérias
degradadoras do benzeno. Com base nos resultados, os autores
propuseram que o benzeno foi degradado através de interações
sintróficas entrePeptococcáceaseDesulfobulbáceasfilotipos em
que o primeiro acoplou a oxidação do benzeno à redução do
ferro, produzindo H2que serviu de fonte de energia para este
último. Postulou-se que outros organismos marcados agem
acetogenicamente ou usam biomassa morta ou produtos de
fermentação secundária.
Usando sedimentos de aquíferos contaminados com BTEX
incubados sob condições de redução de sulfato, Herrmanne outros.
[36] também usou DNA-SIP com13C6-benzeno em um experimento
de curso de tempo para caracterizar a comunidade degradadora de
benzeno. A partir dos resultados, os autores propuseram que uma
dominanteCryptanaerobacter/Pelotomaculumfitótipo iniciou o
ataque ao benzeno, degradando-o incompletamente em
intermediários como acetato e/ou H2que poderia ser consumido por
metanógenos ou redutores de sulfato [36]. Análises subsequentes
de proteína-SIP com base metagenômica com a cultura (usando13C6
-benzeno e13C-CO2) revelou três principais proteínas marcadas
diferencialmente
Opinião atual em biotecnologia2014,27:21–29
26Biotecnologia ambiental
grupos, provavelmente derivados de três grupos funcionais
de organismos que metabolizam diferentes fontes de
carbono [37--]. Notavelmente, um grupo de proteínas
associadas principalmente com o Clostridiales
(Peptococcaceae, Cryptanaerobacter/Pelotomaculum)incluiu
quase toda a via do benzoil CoA (parte inferior da via
envolvida no metabolismo anaeróbico de hidrocarbonetos
aromáticos), além de proteínas envolvidas no CO2fixação e
redução dissimilatória de sulfato; esta descoberta foi
consistente com os relatórios anteriores de que este filotipo
era o principal degradador de benzeno [36]. Em um estudo
separado, H2e descobriu-se que adições de acetato ao
enriquecimento inibiam a degradação do benzeno; isso não
seria esperado se a degradação do benzeno estivesse
diretamente ligada à redução do sulfato [38].
Finalmente, também foi relatado que a degradação sintrófica do
benzeno ocorre sob condições de redução de nitrato [39]. Mesmo
após o cultivo num quimiostato durante 8 anos, descobriu-se que
uma comunidade microbiana associada ao biofilme que realiza a
degradação do benzeno dependente de nitrato é muito diversa.
Quando h2foi adicionado ao quimiostato, a taxa de degradação do
benzeno foi reduzida, sugerindo que H2a transferência pode
desempenhar um papel. Uma análise de DNA-SIP dependente do
tempo com13C6-benzeno mostrou quePeptococaceaee
Betaproteobactériasfilotipos foram enriquecidos em frações
pesadas. Os autores postularam que oPeptococaceaeestava
degradando o benzeno em H2e acetato que eram então consumidos
peloBetaproteobactérias,com ambos os processos acoplados à
redução de nitrato [39].
Dezenas de bactérias que podem metabolizar hidrocarbonetos sob
diversas condições de aceitação de elétrons foram isoladas [22,23,40
], portanto, essas observações representam um afastamento da
ideia de que apenas organismos individuais estão metabolizando
hidrocarbonetos quando os aceitadores de elétrons estão
disponíveis. Embora as razões termodinâmicas para isso não sejam
claras, o metabolismo sintrófico de outros substratos como o
butirato foi relatado em outros sistemas mistos na presença de
aceitadores de elétrons como o sulfato, portanto há precedência
para essas observações [21-]. Curiosamente, em todos os
enriquecimentos alterados com benzeno descritos acima,
Peptococcáceasfilotipos foram identificados como os degradadores
primários e sabe-se que algumas cepas dentro desta classe (por
exemplo,Pelotomáculo)são sintrofos obrigatórios que requerem
parceiros metabólicos para realizar reações favoráveis [1--,3]. Estes
estudos demonstram que a composição de uma determinada
comunidade microbiana, juntamente com as capacidades
metabólicas dos membros microbianos, pode influenciar
grandemente o caminho do fluxo de carbono através de um
ecossistema.21-,38].
Mecanismos de ativação de hidrocarbonetos sob
condições sintróficas
Os mecanismos pelos quais os substratos de hidrocarbonetos
são ativados sob condições sintróficas não são claros. A adição
de fumarato é a mais frequentemente relatada
Opinião atual em biotecnologia2014,27:21–29
mecanismo de ativação de hidrocarbonetos anaeróbicos, como
ocorre para a ativação de aromáticos e alcanos substituídos por
metila sob condições redutoras de nitrato e redutoras de sulfato
[40]. Sob condições metanogênicas, apenas o tolueno
demonstrou sofrer adição de fumarato (por exemplo, [41]).
Metabólitos de adição de fumarato não foram detectados
durante a degradação metanogênica do PAH substituído por
metila [42] oun-alcanos [43] mesmo que os genes necessários
(por exemplo,bundaAque codifica a alquilsuccinato sintase)
foram detectados em vários enriquecimentos metanogênicos
que degradam petróleo bruto [44]. Curiosamente, numa cultura
metanogénica degradadora de alcanos de cadeia curta, onde o
bundaAgene foi detectado no metagenoma, Tane outros. [18-]
detectaram produtos de adição de fumarato de alcanos
ramificados, mas não den-alcanos. A confirmação dos
mecanismos de ativação de hidrocarbonetos através da
detecção dos metabólitos necessários durante o metabolismo
sintrófico permanece difícil, possivelmente devido a fortes
interações sintróficas que não conduzem ao acúmulo de
metabólitos. Não se sabe se outros mecanismos de ativação de
hidrocarbonetos além da adição de fumarato ocorrem durante
o metabolismo de hidrocarbonetos metanogênicos [43], no
entanto, Abu Labãoe outros. [45] detectaram uma suposta
benzeno carboxilase (via proteômica) na cultura redutora de Fe
(III) implicada no metabolismo sintrófico do benzeno [35-].
Assim, os consórcios sintróficos que degradam hidrocarbonetos
parecem abrigar alguns genes para enzimas ativadoras de
hidrocarbonetos anaeróbicos conhecidos, embora seja difícil
confirmar sua atividade. Outras abordagens, como
transcriptômica, qRT-PCR ou proteômica podem potencialmente
auxiliar na detecção da expressão de genes de ativação de
hidrocarbonetos em sistemas mistos.
Conclusões e direções futuras
Interações mutuamente benéficas entre microrganismos sintróficos
ocorrem amplamente durante a ciclagem da matéria orgânica,
inclusive em ambientes contendo hidrocarbonetos. Embora se saiba
que ocorre o metabolismo de hidrocarbonetos metanogênicos, a
definição de parcerias sintróficas em tais sistemas está longe de ser
compreendida. O fato de o metabolismo sintrófico de
hidrocarbonetos ocorrer mesmo na presença de aceitadores de
elétrons como nitrato, Fe (III) ou sulfato mostra que as interações da
comunidade microbiana não são diretas e que existem múltiplas
estratégias metabólicas no ambiente natural. Estudos genômicos,
transcriptômicos e mutantes conduzidos com coculturas definidas
estão produzindo novas informações sobre como os micróbios
interagem e se beneficiam energeticamente através de diferentes
mecanismos de transferência de elétrons entre espécies. Trabalho
futuro com a cocultura AK-01/metanogênio [30--] provavelmente
servirá como um paradigma para o metabolismo sintrófico de
hidrocarbonetos e o isolamento de outros micróbios com
capacidades semelhantes é uma clara necessidade de pesquisa. A
compreensão da degradação sintrófica de hidrocarbonetos tem
implicações claras para aplicações de biorremediação, mas novos
conhecimentos podem ser usados para desenvolver aplicações
biotecnológicas relacionadas com a recuperação de energia
microbianamente melhorada a partir de fósseis.
www.sciencedirect.com
 Biodegradação sintrófica de hidrocarbonetosGieg, Fowler e Berdugo-Clavijo
reservatórios de energia, controle de biofilme (por exemplo,
relacionado à corrosão de oleodutos de transmissão de
petróleo) e eletromicrobiologia [6-,8]. Com a recente divulgação
de novas informações metagenômicas de ambientes associados
a hidrocarbonetos [18-,19-], determinar os atores microbianos,
as vias metabólicas e as interações entre os micróbios
envolvidos no metabolismo sintrófico dos contaminantes
oferece a promessa de novas descobertas.
Papel da fonte de financiamento
A preparação desta revisão foi financiada pelas bolsas
Discovery e Genome Canada do Natural Science and
Engineering Research Council (NSERC) concedidas ao
LMG. A SJF foi apoiada pelas bolsas de pós-graduação
NSERC Alexander Graham Bell e Alberta Innovates
Technology Futures.
Referências e leituras recomendadas
Artigos de particular interesse, publicados dentro do período de revisão,
foram destacados como:
- de interesse especial
- - de interesse pendente
1. Sieber JR, McInerney MJ, Gunsalus RP:Informações genômicas sobre
-- sintrofia: o paradigma para a cooperação metabólica anaeróbica.
Ann Rev Microbiol2012,66:429-452.
Uma revisão abrangente que descreve os princípios da sintrofia, incluindo
características recentemente elucidadas através da análise genômica. Fornece um
ponto de partida para o exame de genes de sintrofia em uma variedade de genomas
e metagenomas.
2. Morris BEL, Henneberger R, Huber H, Moissl-Eichinger C: Sintrofia
microbiana: interação para o bem comum.FEMS Microbiol Rev.
2013,37:384-406.
3. Carimbos AJM, Plugge CM:Transferência de elétrons em comunidades
sintróficas de bactérias anaeróbias.Nat Rev Microbiol2009, 7:568-577.
4. Kleinsteuber S, Schleinitz KM, Vogt C:Principais jogadores e equipe
- brincar: comunidades microbianas anaeróbicas em aquíferos
contaminados com hidrocarbonetos.Appl Microbiol Biotecnologia2012,
94:851-873.
Visão geral abrangente da ecologia microbiana associada a ambientes
anaeróbicos contaminados com hidrocarbonetos.
5. McInerney MJ, Sieber SJ, Gunsalus RP:Sintrofia em ciclos globais
anaeróbicos de carbono.Curr Opin Biotecnologia2009, 20:623-632.
6. Gray ND, Sherry B, Hubert C, Dolfing J, Chefe IM:Metanogênico
- degradação de hidrocarbonetos de petróleo em ambientes subterrâneos:
remediação, formação de petróleo pesado e recuperação de energia.Adv
Appl Microbiol2010,72:137-161. Visão geral abrangente de aplicações
relacionadas à metanogênese de hidrocarbonetos; também fornece uma
análise mostrando os táxons mais comumente associados a ambientes
contendo petróleo.
7. Walker CB, Redding-Johanson AM, Baidoo EE, Rajeev L, He Z,
- Hendrickson EL, Joachimiak MP, Stolyar S, Arking AP, Leigh JA e
outros:Respostas funcionais de archaea metanogênicas ao
crescimento sintrófico.ISME J2012,6:2045-2055.
Usando análises transcricionais e proteômicas, as respostas funcionais de um
H2- o uso de metanogênio durante o crescimento sintrófico e não sintrófico foi
avaliado para identificar genes importantes expressos por H2parceiros
consumidores envolvidos em interações sintróficas.
8. Lovley DR:Eletromicrobiologia.Ann Rev Microbiol2012, 66:
391-409.
9. Meyer B, Kuehl J, Deutschbauer AM, Price MN, Arkin AP, Stahl DA:
- Variação entreDesulfovibrioespécies em sistemas de transferência
de elétrons usados para crescimento sintrófico.J Bacteriol2013, 195:
990-1004.
www.sciencedirect.com
27
Este estudo destaca a expressão de genes associados à sintrofia em dois
diferentesDesulfovibrioespécies, mostrando que pode haver múltiplas
respostas genéticas relacionadas à conservação de energia durante o
crescimento sintrófico, mesmo dentro do mesmo gênero.
10.Kato S, Hashimoto K, Watanabe K:Metanogênese facilitada pela
sintrofia elétrica via minerais de óxido de ferro (semi)condutores.
Microbiol Ambiental2012,14:1646-1654.
11.Shimoyama T, Kato S, Ishii S, Watanabe K:Flagelo medeia a simbiose.
Ciência2009,323:1574.
12.Órfão VJ:Métodos para revelar parcerias microbianas enigmáticas na
natureza.Curr Opin Biotecnologia2009,12:231-237.
13.Hazen TC, Rocha AM, Techtmann SM:Avanços no monitoramento de
micróbios ambientais.Curr Opin Biotecnologia2013,24:526-533.
14.von Bergen M, Jehmlich N, Taubert M, Vogt C, Bastida F, Herbst
FA, Schmidt F, Richnow HH, Seifert J:Insights de
metaproteômica quantitativa e sondagem de isótopos estáveis
em proteínas na ecologia microbiana.ISME J2013. doi: 10.1038/
ismej.2013.78..
15.Rinke C, Schwientek P, Sczyrba A, Ivanova NN, Anderson IJ,
- Cheng JF, Darling A, Malfatti S, Swan BK, Gies EAe outros:Insights sobre
a filogenia e o potencial de codificação da matéria escura microbiana.
Natureza2013,499:431-437.
Classificação celular combinada com amplificação do genoma completo de uma única célula
para revelar informações genômicas sobre organismos não cultivados, uma ferramenta que
pode ajudar a revelar informações genômicas sobre organismos sintróficos que têm sido
difíceis de obter em cultura pura.
16.Rotaru AE, Shrestha PM, Liu F, Ueki T, Nevin K, Summers ZM, Lovely
DR:Transferência de elétrons entre espécies via hidrogênio e
formato, em vez de conexões diretas de elétrons em coculturas de
Pelobacter carbinolicuseGeobacter sulfurreducens. Appl Ambiente
Microbiol2012,78:7645-7651.
17.Shrestha PM, Rotaru AE, Summers ZM, Shrestha M, Liu F,
- Lovley DR:Análise transcriptômica e genética da transferência direta
de elétrons entre espécies.Appl Ambiente Microbiol2013, 79:
2397-2404.
Mostra que as análises transcriptômicas podem ajudar a deduzir processos de
transferência de elétrons entre espécies que ocorrem por H2/formato ou via contato
célula a célula.
18.Tan B, Dong X, Sensen CW, Foght JM:Análise metagenômica de
- uma cultura microbiana anaeróbica que degrada os alcanos: potenciais vias de
ativação de hidrocarbonetos e papéis inferidos dos membros da comunidade.
Genoma2013. 10.1139/gen-2013-0069. Primeira análise metagenômica
publicada de uma cultura mista degradadora de hidrocarbonetos metanogênicos.
19.Um D, Caffrey SM, Soh J, Agrawal A, Brown D, Budwill B, Dong X,
- Dunfield P, Foght JM, Gieg LMe outros:A metagenômica dos ambientes de
recursos de hidrocarbonetos indica que os táxons e genes aeróbicos são
inesperadamente comuns.Tecnologia Científica Ambiental 2013,47:
10708-10717.
Apresenta um levantamento taxonômico de 160 amostras ambientais associadas a
hidrocarbonetos e uma análise de alto nível de 12 metagenomas de areias betuminosas
profundas, jazidas de carvão, reservatórios de petróleo e lagoas de rejeitos de areias
betuminosas, cujos dados agora podem ser usados para explorar características
metabólicas em hidrocarbonetos ambientes incluindo genes relacionados à sintrofia.
20.Kleikemper J, Pombo SA, Schroth HM, Sigler WV, Pesaro M, Zeyer J:
Atividade e diversidade de metanógenos em um aquífero contaminado
com hidrocarbonetos de petróleo.Appl Ambiente Microbiol 2005,71:
149-158.
21.Struchtemeyer CG, Duncan KE, McInerney MJ:Evidência para
- metabolismo sintrófico do butirato sob condições de redução de
sulfato em um aquífero contaminado com hidrocarbonetos.FEMS
Microbiol Eco2011,76:289-300.
Conduziu estudos fisiológicos com sedimentos de aquíferos para mostrar que o
metabolismo sintrófico do butirato ocorre mesmo na presença de aceitadores de
elétrons disponíveis, como o sulfato, demonstrando uma precedência para esse
metabolismo em ambientes naturais.
22.Luta JM:Biodegradação anaeróbica de hidrocarbonetos
aromáticos: caminhos e perspectivas.J Mol Microbiol
Biotecnologia2008,15:93-120.
23.Mbadinga SM, Wang LY, Zhou L, Liu JF, Gu JD, Mu BZ:Comunidades
microbianas envolvidas na degradação anaeróbica de alcanos.Int
Biodeter Biodegradado2011,65:1-13.
Opinião atual em biotecnologia2014,27:21–29
28Biotecnologia ambiental
24.Dolfing J, Larter SR, Chefe IM:Restrições termodinâmicas em
- Biodegradação metanogênica do petróleo bruto.ISME J2008,2:442-452.
Descreve as restrições termodinâmicas que desempenham um papel na
determinação das diferentes rotas utilizadas nas vias a jusante para a degradação de
hidrocarbonetos metanogênicos.
25.Dolfing J, Xu A, Gray ND, Larter SR, Chefe IM:A paisagem
termodinâmica da degradação metanogênica de PAH.
Microb Biotecnologia2009,2:566-574.
26.Mayumi D, Mochimaru H, Yoshioka H, Sakata S, Maeda H,
- Miyagawa Y, Ikarashi M, Takeuchi M, Kamagata Y:Evidência de oxidação
sintrófica de acetato acoplada à metanogênese hidrogenotrófica no
reservatório de petróleo de alta temperatura do campo petrolífero de
Yabase (Japão).Microbiol Ambiental2011, 13:1995-2006.
Mostrou que a degradação de hidrocarbonetos foi acoplada à oxidação
sintrófica do acetato e à metanogênese hidrogenotrófica, em vez de via
metanogênese acetoclástica durante a biodegradação do petróleo bruto sob
condições de alta temperatura e pressão, como seria esperado em um
reservatório de petróleo.
27.Gray ND, Sherry A, Grant RJ, Rowan AK, Hubert CRJ,
- Callbeck CM, Aitken CM, Jones DM, Adams JJ, Larter SR, Chefe IM:A
significância quantitativa deSyntrophaceaee parcerias sintróficas
na degradação metanogênica de alcanos de petróleo bruto.
Microbiol Ambiental2011,13:2957-2975.
Um filotipo afiliado aSyntrophaceae (Smithella)demonstrou aumentar em abundância
simultaneamente com a degradação de alcanos e a produção de metano, sugerindo
sua importância como um importante degradador de petróleo. Além disso, foi
demonstrado que o destino do acetato ocorre através da oxidação sintrófica do
acetato juntamente com a metanogênese hidrogenotrófica.
28.Mayumi D, Dolfing J, Sakata S, Maeda H, Miyagawa Y, Ikarashi M,
- Tamaki H, Takeuchi M, Nakatsu CH, Kamagata Y:A concentração de dióxido
de carbono determina caminhos metanogênicos alternativos em
reservatórios de petróleo.Comunidade Nacional2013,4artigo 1998, doi:
10.1038/ ncomms2998..
Demonstra que fatores ambientais, como CO2concentrações, podem alterar a
via de formação de metano (por exemplo, destino do acetato) durante a
biodegradação do óleo.
29.Morris BEL, Herbst FA, Bastida F, Seifert J, von Bergen M,
- Richnow HH, Suflita JM:Interações microbianas durante o óleo residual en-
metabolismo de ácidos graxos por um consórcio metanogênico.
Representante da Microbiol Ambiental2012,4:297-306.
Usando abordagens como medições de proteínas-SIP e gases isotópicos, este estudo
mostra que tanto a metanogênese acetotrófica quanto a hidrogenotrófica podem
ocorrer durante a biodegradação do petróleo bruto.
30.Callaghan AV, Morris BEL, Pereira IAC, McInerney MJ, Austin RN,
- - Groves JT, Kukor JJ, Suflita JM, Young LY, Zylstra GJe outros:A
sequência do genoma deDesulfatibacillum alkenivoransAK-01: um
modelo para oxidação anaeróbica de alcanos.Microbiol Ambiental
2012,14:101-113.
Sequenciamento do genoma de um redutor de sulfato / sintrófico facultativo que degrada
alcanos que poderia servir como um organismo modelo para elucidar as principais
características das parcerias de degradação de hidrocarbonetos sintróficos.
31.Sakai N, Kurisu F, Yagi O, Nakajima F, Yamamoto K:
- Identificação de supostas bactérias degradadoras de benzeno em
culturas de enriquecimento metanogênico.J Biosci Bioeng2009,
108:501-507.
Identificou um filotipo supostamente degradante de benzeno por DNA-SIP e
mostrou um aumento na abundância do filotipo durante a degradação
metanogênica do benzeno.
32.Zhang S, Wang Q, Xie S:A sondagem com isótopos estáveis identifica
degradadores de antraceno em condições metanogênicas.
Biodegradação2012,23:221-230.
33.Lykidis A, Chen CL, Tringe SG, McHardy AC, Copeland A,
-- Kyrpides NC, Hugenholtz P, Macarie H, Olmos A, Monroy O, Liu WT:
Múltiplas interações sintróficas em um consórcio metanogênico
degradador de tereftalato.ISME J2011,5:122-130. Usando análise
metagenômica, foi proposta a ocorrência de múltiplas interações sintróficas
em uma cultura de enriquecimento degradante de contaminantes
metanogênicos.
34.Wu JH, Wu FY, Chuang HP, Chen WY, Huang HJ, Chen SH, Liu WT:
Análise comunitária e proteômica de consórcios metanogênicos
degradando tereftalato.Appl Ambiente Microbiol 2013,79:105-112.
Opinião atual em biotecnologia2014,27:21–29
35.Kunapuli U, Lueders T, Meckenstock RU:O uso de estável
- sondagem isotópica para identificar os principais microrganismos redutores
de ferro envolvidos na degradação anaeróbica do benzeno.ISME J2007, 1:
643-653.
Primeiro relatório que sugere que processos sintróficos estão envolvidos no metabolismo de
hidrocarbonetos sob condições anaeróbicas não metanogênicas e que organismos Gram-
positivos podem ser os principais degradadores anaeróbicos de benzeno.
36.Herrmann S, Kleinsteuber S, Chatzinotas A, Kuppardt S, Lueders T,
Richnow HH, Vogt C:Caracterização funcional de uma cultura
anaeróbica de enriquecimento degradante de benzeno por sondagem
com isótopos estáveis de DNA.Microbiol Ambiental2010,12:401-411.
37.Taubert M, Vogt C, Wubet T, Kleinsteuber S, Tarkka MT, Harms H,
-- Buscot F, Richnow HH, von Bergen M, Seifert J:O Protein-SIP permite a
análise do fluxo de carbono resolvida no tempo em um consórcio
microbiano redutor de sulfato e degradador de benzeno.ISME J 2012,6:
2291-2301.
Em uma cultura proposta para degradar sintroficamente o benzeno na
presença de sulfato, o uso de proteína-SIP permitiu a atribuição de grupos
proteicos aos filotipos microbianos envolvidos na assimilação do carbono do
benzeno ou CO2para rastrear o fluxo de carbono através da comunidade.
38.Rakoczy J, Schleinitz KM, Muller N, Richnow HH, Vogt C:Efeitos do
hidrogênio e do acetato na mineralização do benzeno sob
condições redutoras de sulfato.FEMS Microbiol Eco2011, 77:
238-247.
39.van der Zaan BM, Saia FT, Stams AJM, Plugge CM, de Vos WM, Smidt
H, Langenhoff AA, Gerritse J:Degradação anaeróbica do benzeno
sob condições desnitrificantes:Peptococcáceas como
degradadores de benzeno dominantes e evidência de processos
sintróficos.Microbiol Ambiental2012,14:1171-1181.
40.Callaghan AV:Investigações metabólicas de ambientes anaeróbicos
impactados por hidrocarbonetos.Curr Opin Biotecnologia 2013,24:
506-515.
41.Fowler SJ, Dong X, Sensen CW, Suflita JM, Gieg LM: Metabolismo
metanogênico do tolueno: estrutura da comunidade e
intermediários.Microbiol Ambiental2012,14:754-764.
42.Berdugo-Clavijo C, Dong X, Soh J, Sensen CW, Gieg LM:
Biodegradação metanogênica de hidrocarbonetos aromáticos
policíclicos de dois anéis.FEMS Microbiol Eco2012,81:124-133.
43.Aitken CM, Jones DM, Maguire MJ, Gray ND, Sherry A, Bowler BFJ,
Ditchfield AK, Larter SR, Chefe IM:Evidência de que a ativação do
petróleo bruto ocorre por diferentes mecanismos sob condições
metanogênicas e redutoras de sulfato.Geochim Cosmochim Acta
2013,109:162-174.
44.Callaghan AV:Enzimas envolvidas na oxidação anaeróbica de n-
alcanos: do metano às parafinas de cadeia longa.Microbiol Frontal
2013,4artigo 89, doi: 10.3389/fmicb.2013.00089..
45.Abu Laban N, Selesi D, Rattei T, Tischler P, Meckenstock RU: Identificação
de enzimas envolvidas na degradação anaeróbica do benzeno por uma
cultura de enriquecimento redutora de ferro estritamente anaeróbica.
Microbiol Ambiental2010,12:2783-2796.
46.Thauer RK, Jungermann K, Decker K:Conservação de energia em
bactérias anaeróbias quimiotróficas.Bacteriol Rev.1977, 41:
100-180.
47.Jones DM, Head IM, Gray ND, Adams JJ, Rowan AK, Bennett B, Huang
A, Brown A, Bowler BFJ, Oldenburg T, Erdmann M,
LarterSR:Biodegradação do petróleo bruto via metanogênese em
reservatórios de petróleo subterrâneos.Natureza2008,451:176-180.
48.Gieg LM, Duncan KE, Suflita JM:Produção de bioenergia através da
conversão microbiana de óleo residual em gás natural.Appl Ambiente
Microbiol2008,74:3022-3029.
49.Gieg LM, Davidova IA, Duncan KE, Suflita JM:Metanogênese, redução de sulfato
e biodegradação de petróleo bruto em campos petrolíferos quentes do
Alasca.Microbiol Ambiental2010,12:3755-3762.
50.Feisthauer S, Siegert M, Seidel M, Richnow HH, Zengler K, Gründger F,
Krüger M:Impressão digital isotópica de metano e CO2formação a
partir de hidrocarbonetos alifáticos e aromáticos.Organização
Geoquímica2010,41:482-490.
51.Siegert M, Cichocka D, Herrmann S, Gründger F, Feisthauer S,
Richnow HH, Springael D, Krüger M:Metanogênese acelerada a
partir de hidrocarbonetos alifáticos e aromáticos
www.sciencedirect.com
 Biodegradação sintrófica de hidrocarbonetosGieg, Fowler e Berdugo-Clavijo 29

sob condições redutoras de ferro e sulfato.FEMS Microbiol Lett
2011,315:6-16.
52.Siddique T, Penner T, Semple K, Foght JM:Biodegradação anaeróbica de cadeia
mais longan-alcanos acoplados à produção de metano em rejeitos de areias
betuminosas.Tecnologia Científica Ambiental2011, 45:5892-5899.
53.Wang LY, Gao CX, Mbadinga SM, Zhou L, Liu JF, Gu JD, Mu BZ:
Caracterização de uma cultura de enriquecimento metanogênico
degradante de alcanos a partir de água de produção de um
reservatório de petróleo após 274 dias de incubação.Int Biodeter
Biodegradado2011, 65:444-450.
54.Siddique T, Penner T, Klassen J, Nesbø C, Foght JM:Comunidades
microbianas envolvidas na produção de metano a partir de
hidrocarbonetos em rejeitos de areias betuminosas.Tecnologia Científica Ambiental2012,
49:9802-9810.
55.Mbadinga SM, Li KP, Zhou L, Wang LY, Yang SZ, Liu JF, Gu JD, Mu BZ:
Análise da comunidade metanogênica dependente de alcanos
derivada da água de produção de um reservatório de petróleo em
alta temperatura.Appl Microbiol Biotecnologia 2012,96:531-542.
56.Zhou L, Li KP, Mbadinga SM, Yang SZ, Gu JD, Mu BZ: Análises den-alcanos
degradando a dinâmica da comunidade de um consórcio
metanogênico de alta temperatura enriquecido a partir de água de
produção de um reservatório de petróleo por uma combinação de
técnicas moleculares.Ecotoxicologia2012, 21:1680-1691.
57.Cheng L, Rui J, Li Q, Zhang H, Lu Y:Enriquecimento e dinâmica de novos
sintrofos em uma cultura metanogênica que degrada hexadecano de
um campo petrolífero chinês.FEMS Microbiol Eco2013, 83:757-766.

www.sciencedirect.com Opinião atual em biotecnologia2014,27:21–29