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Organização Gênica dos

Seres Vivos
Genes e Genomas de Procariotos e
Eucariotos

Prof. Henrique Santana Costa, M.Sc.


OS SERES VIVOS
OS SERES VIVOS

• Todo genoma (eucarioto ou procarioto) possui a


função de servir como repositório replicativo da
informação codificada pelo DNA que o constitui.

• Genomas procarióticos, contudo, são


relativamente mais simples que genomas
eucarióticos.
PROCARIOTO X EUCARIOTO

 Tamanho do genoma.

 Estrutura molecular.

 Distribuição de genes.
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

Cromossomo único → dsDNA circular

Replicon

Exceções Lineares

Streptomyces lividans Rhodococcus fasciens Espiroquetas (Borrelia)


CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

Tamanho do Genoma

~9,5x106pb

Mycoplasma genitalium

Saccharomyces
cerevisiae

~0,6x106pb

~13x106pb
Myxococcus xanthus
PROCARIOTO

◙ Cromossomo de E. coli

• Molécula de DNA fita dupla circular de 4,2 X 10³ pb.

• Por ser capaz de se auto-duplicar, o cromossomo bacteriano é


considerado um replicon.

• Sua estrutura compacta dedica-se quase que exclusivamente à


codificação de proteínas (genes estruturais).
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

◙ Superposição de genes

• Organização gênica que permite que uma mesma seqüência


codifique duas proteínas diferentes.

• Fenômeno freqüente em vírus, bactérias e organelas celulares


(mitocôndrias).
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

Códon de Iniciação → (Start Codon) Alternativo.


CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

Alteração do Quadro de Leitura.


CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

◙ Colinearidade

• Equivalência entre a seqüência nucleotídica do gene e a


seqüência de aminoácidos da proteína.

• Eucariotos possuem interrupções em suas seqüências


nucleotídicas.
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

Colinearidade: Gene  Proteína

3n nucleotídeos → n aminoácidos
GENES → EUCARIOTO X PROCARIOTO

5’ 3’
GENOMA → EUCARIOTO X PROCARIOTO
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

 Ausência de complemento  Praticamente sem


diplóide. seqüências redundantes.

Genoma
E. coli

• Colinearidade entre
genes e produtos
protéicos. • Unidades genéticas
acessórias.

 Quase todo genoma → codificação e  Seqüências codificantes em ambas


regulação. as fitas.
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

◙ Organização dos genes em operons

• Genes que codificam produtos com funções relacionadas


(componentes de uma mesma rota metabólica).

• Responsáveis pelo controle da expressão gênica.

• Mostram-se presentes apenas em procariotos.

• Seus produtos são regulados pela presença de substrato.


CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

 Unidades transcricionais policistrônicas (Operons).

 Regiões intercistrônicas → 1 a 30 pb (até 40 pb)


CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

◙ Coorientação da transcrição e da replicação de


genes

• A fim de evitar colisões entre a RNA-polimerase e o aparato


protéico da replicação, as unidades transcricionais mais ativas
estão orientadas em relação à origem de replicação.

• Replicação bidirecional → avançam em direções opostas ao longo


do cromossomo (encontrando-se num sítio de terminação).
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

◙ Posicionamento de genes evolutivamente


relacionados em sítios opostos do mapa genético

• Padrão de organização explicado (supostamente) por uma prévia


duplicação do genoma.

• Genes que codificam proteínas envolvidas numa mesma rota


metabólica.
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

◙ Localização preferencial dos genes em sítios


próximos à origem de replicação

• Maior concentração de genes próxima ao ponto no qual a


replicação do DNA inicia do que próxima ao término da mesma.

• Aumento do nível de expressão gênica.


CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

◙ Elementos genéticos móveis

• Todo genoma de procarioto está contido num único cromossomo.

• Exceção → elementos genéticos móveis.


CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

1. Bacteriófagos.

2. Plasmídeos.

3. Transposons.
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

◙ Plasmídeos

• Elementos extra-cromossomais com capacidade de replicação autônoma


constituídos por uma molécula de DNA fita dupla circular.

• Sua seqüência nucleotídica tem pouca ou nenhuma homologia com o cromossomo


da célula hospedeira (elemento estranho a bactéria).

• Conferem vantagens adaptativas às bactérias que os


possuem.

→ produção de toxinas
→ produção de pilinas
→ produção de adesinas

■ Conferem resistência a múltiplos antibióticos (tornam


problemático o tratamento quimioterápico de determinadas
infecções.)
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

◙ Plasmídeos

• Elementos extra-cromossomais com capacidade de replicação autônoma


constituídos por uma molécula de DNA fita dupla circular.

• Sua seqüência nucleotídica tem pouca ou nenhuma homologia com o cromossomo


da célula hospedeira (elemento estranho a bactéria).

• Conferem vantagens adaptativas às bactérias que os


possuem.

→ produção de toxinas
→ produção de pilinas
→ produção de adesinas

■ Conferem resistência a múltiplos antibióticos (tornam


problemático o tratamento quimioterápico de determinadas
infecções.)
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

◙ Bacteriófagos

• Não possuem uma maquinaria própria (incapazes de se multiplicarem na ausência


de um hospedeiro).

• Elementos extra-cromossomais que ganharam a capacidade de sintetizar um


capsídeo protéico.
• Podem apresentar genomas de RNA, ssDNA circular ou dsDNA linear (colifagos).

Virulentos → multiplicam-se dentro da célula hospedeira


dando origem a outros que são liberados após a lise celular
(ciclo lítico).

Temperados → podem se integrar no genoma bacteriano


(linhagem lisogênica), ou entrar em ciclo lítico.
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

◙ Bacteriófagos → replicons potencialmente letais.

◙ Plasmídeos → replicons não letais (dentro de suas células hospedeiras).

•Etapas da infecção → colisão, adsorção e injeção do ácido nucléico.

Ciclo lítico → O genoma do fago é expressado. Proteínas estruturais são


sintetizadas e o genoma viral é encapsidado (produção de novas partículas virais).

Ciclo lisogênico → O genoma do fago se integra, por recombinação, no genoma


bacteriano. O genoma do fago pode eventualmente ser liberado (sendo capaz de
iniciar um ciclo lítico).

# Lisógena → Bactéria que carrega uma cópia do genoma viral integrada ao seu
cromossomo.
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

◙ Transposons

→ seqüências de DNA inseridas em novos sítios genômicos (catalisadas a partir de


enzimas específicas - transponsases).
→ envolvem processos de recombinação e replicação gerando 2 novas cópias do
elemento genético transponível original.

# uma que permanece no sítio parental.


# outra que aparece num determinado sítio alvo.

• Alteração da integridade de seus sítios-alvo.

1. ativação de genes inativos


2. deleções, inversões e fusões cromossômicas

* Conferem significativa plasticidade genética nos genomas que as possuem.


CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

◙ Classificação

Transposons simples (IS)→ carregam apenas a informação genética essencial para


a transposição.
Transposons complexos → carregam, também, informações não relacionadas a
transposição .

# resistência a antibióticos
# capacidade de movimentação entre bactérias
CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

Cromossomo único → dsDNA circular

Replicon

Exceções Lineares

Streptomyces lividans Rhodococcus fasciens Espiroquetas (Borrelia)


CARACTERÍSTICAS → PROCARIOTO

Tamanho do Genoma

~9,5x106pb

Mycoplasma genitalium

Saccharomyces
cerevisiae

~0,6x106pb

~13x106pb
Myxococcus xanthus
PROCARIOTO X EUCARIOTO

• 97% dos genes são de regulação. • 3% dos genes são de regulação.

• 3% São seqüências não codantes • 97% São seqüências não


(inter-espaçadores gênicos). codantes (inter-espaçadores
gênicos).

→ cópia única (0 – 30 pb)


GENOMA → EUCARIOTO X PROCARIOTO
PROCARIOTO X EUCARIOTO
COMPARAÇÕES → EUCARIOTO
Número de Genes
70000

60000

50000
50000
45000
Número de Genes

40000

30000
30000

19000
20000
13600

10000 6340
4288
517
0
Mycoplama E. coli Levedura Drosofila Ascaris Humano Arroz Milho
Genes não interrompidos X interrompidos COMPARAÇÕES → EUCARIOTO
COMPARAÇÕES → EUCARIOTO
Tamanho dos genes em kb
PARADOXO DO VALOR DE “C”
CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO
Existência de múltiplas cópias de
algumas seqüências.
Presença de complemento Abundância de seqüências
diplóide. redundantes.

Quase todo genoma: não Seqüências codificantes


codificação e regulação. em apenas uma das fitas.
Raramente apresenta unidades
genéticas acessórias.
CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO

Não há Colinearidade: Gene  Proteína

3n nucleotídeos  n aminoácidos
CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO

 Não há Operons.

Exceção

Caenorhabditis elegans
Nematódeo: 25% dos genes
CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO

1. DNA de cópia única


(45%).

2. DNA Moderadamente
Repetitivo (30%).

3. DNA Altamente
Repetitivo (25%).
GENOMA NUCLEAR HUMANO
Características
 dsDNA.
 Genoma Linear.
 23 cópias (46 Cromossomos).
GENOMA DE ORGANELAS

Características

 dsDNA.

 Genoma Circular.

 Várias cópias por organela.


GENOMA HUMANO
Genoma Humano

Genoma Nuclear Genoma Mitocondrial


3300Mb 16,6kb
30.000 - 50.000 genes 37 genes

~25% ~75%

Genes e seqüências DNA Dois genes 22 genes 13 genes codificadores


gene-relacionadas extragênico de rRNA de tRNA de polipeptídeos

Únicas ou
moderadamente repetitivas ~60% ~40%
~10% ~90%

DNA DNA não- Único ou baixo Moderado a


codificador codificador número de cópias altamente repetitivo

Pseudogenes Fragmentos Íntrons, se- Repetido em Repetições


de genes qüências não- tandem ou repe- dispersas
traduzidas etc. tições agrupadas
CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO

Famílias Funcionalmente Similares


 Relacionados mas não idênticos → Globina
CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO

Famílias gênicas codificadoras de RNA


 Genes de rRNA → 5 agrupamentos de 50 repetições em tandem.
 Genes de Trna → grande família dispersa (40 subfamílias).
 Genes de snRNA → grande família dispersa.
CARACTERÍSTICAS → EUCARIOTO

Famílias Funcionalmente Idênticas → Histonas

 Replicação dependente → restrito a fase S.


 Replicação independente → nível basal em todo CC.
 Replicação tecido-específico.

H1
H1
CONCLUSÃO

 Existem diferenças significativas entre genomas procariotos e


eucariotos.

 Procariotos → genomas pequenos, circulares, poucos genes,


operons e unidades genéticas acessórias.

 Eucariotos → genomas grandes, lineares, muitos genes, sem


operons e sem unidades genéticas acessórias.

 Eucariotos apresentam genomas mais complexos que os


procariotos.

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