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Ttulo: Virologia Bsica Autor: Ricardo Brilhante de Medeiros Editora: CopyMarket.com, 2000
1. Vrus Fitopatognicos
Ricardo Brilhante de Medeiros
Espcies: cauliflower mosaic virus (CaMV, vrus do mosaico da couve-flor), strawberry vein banding, soybean chlorotic mottle, cassava vein mosaic, dahlia mosaic virus. Badnavrus: recentemente descobertos, no-envelopados, baciliformes, genoma de dsDNA descontnuo, circular, um dos genes possui homologia com transcriptase reversas, transmitido por cigarrinha. Espcies: rice tungro baciliform virus (um dos vrus causadores do tungro do arroz).
2. Sem Membrana:
Tenuivrus: filamentosos, multisegmentado (4 RNAs), transmitidos por cigarrinhas, infectam gramneas, aparentemente codificam para protenas de membrana, apesar de membranas no serem encontradas nas partculas purificadas, similares a tospovrus na estrutura genmica. Espcies: rice stripe, rice hoja blanca, maize stripe.
Tymovrus: transmitidos por colepteros, formam vesculas no cloroplasto. Espcies: turnip yellow mosaic, eggplant mosaic, passion fruit yellow mosaic. b) Bastonetes: Tobamovrus: bastonete rgido, rtansmitido mecanicamente com muita facilidade, grande persistncia no ambiente, importncia histrica e como vrus-modelo. Espcies: tobbaco mosaic (vrus do mosaico do fumo), tomato mosaic. Potexvrus: alongados, flexveis, sem vetor. Espcies: potato virus X, papaya mosaic. Potyvrus: partculas flexveis, transmitidos por pulgo, fungo, caro e mosca branca; produzem incluses lamelares do tipo "cataventos" na clula, mais de 300 membros no grupo, grande importncia econmica pelo elevado nmero de espcies. Espcies: agropyron mosaic (caro), sweet potato mild mottle (mosca branca), barley yellow mosaic (Spongospora), potato virus Y (afdeo), bean common mosaic (semente), beet mosaic, lettuce mosaic (semente), papaya ringspot, soybean mosaic (mancha-caf), potato virus A, sugarcane mosaic, tobacco echt, watermelon mosaic. Carlavrus: partculas longas e rgidas, transmitidos por pulgo e mosca branca. Espcies: carnation latent virus. Closterovrus: bastante elongados, 600 - 2000 nm de comprimento, afdeos vetores, restritos ao floema. Espcies: citrus tristeza (vrus da tristeza dos citrus), beet yellows. 2. Genoma Bipartido: a) Isomtrico: Comovrus: transmitidos por colepteros. Espcies: cowpea mosaic, cowpea severe mosaic. Nepovrus: transmitidos por nematides (Xiphinema e Longidorus). Espcies: tobacco ringspot, grapevine fan leaf, potato black ringspot, tomato ringspot. b) Bastonetes: Tobravrus: elongado, vetorados por nematides dos gneros Trichodorus e Paratrichodorus, formam camadas em volta da mitocndria. Espcies: tobacco rattle virus, pepper ringspot. 3. Genoma Multipartido: a) Isomtrico: Ilarvrus: tripartido, transmitido por nematide e caro. Espcies: tobacco streak (necrose branca do fumo). Cucumovrus: tripartido, afdeos. Espcies: cucumber mosaic. Bromovrus: tripartido, transmisso mecnica. Espcies: brome mosaic, broad bean mottle, cowpea chlorotic mottle. b) Baciliforme: Alfafa Mosaic: tambm faz parte da famlia Bromoviridae, apesar da morfologia diferente; 4 partculas, em forma de bastonete e esfrica, 3 so infectivas e 1 no necessria a infeco, afdeos. Hordeivrus: elongado, vetor desconhecido. Espcies: barley stripe mosaic.
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Alm da polimerase viral, a capa proteica necessria ao processo de replicao (apenas para os RNA negativo). mRNAs so encontrados nas clulas infectadas para todos os genes virais. As protenas L (polimerase) e N (capsdeo) so associadas ao RNA genmico formando o complexo ribonucleoproteico (RNPs). No caso dos rhabdovrus, h uma terceira protena NS (fosfoprotena) tambm requerida para a atividade polimerase. RNPs tambm so necessrios para o processo de transcrio; mRNAs possuem estrutura cap (tampa) e so poliadenilados, estas estruturas esto relacionadas com a iniciao da traduo e estabilidade do mRNA. Fatores da hospedeira so necessrios replicao. N provavelmente regula o mecanismo de troca de transcrio para replicao, atravs da ligao aos promotores. Cpia de RNA a partir de RNA um processo nico de vrus de RNA. RNAs no so infecciosos. Caractersticas da Polimerase Viral: O termo replicase ou polimerase referese enzima responsvel pela atividade de replicao (sntese de nova fita de RNA ou DNA) e transcriptase atividade de transcrio (sntese de mRNA). A polimerase viral, assim como as celulares, composta de vrios polipeptdeos com diferentes funes (enzima multifuncional). So encontradas associadas membranas celulares. Sequenciamento levou identificao de sequncias tpicas (motivos) e assim identificao de outras provveis polimerases. Iniciao e terminao ocorrem em stios especficos e requerem fatores da hospedeira. Exemplo da eficincia: 1 cpia de RNA de poliovrus gera 50.000 cpias em apenas 8 horas. Polimerases requerem um cofator inico para atividade (exemplo Mg+2). Entendimento do processo replicativo pode levar ao desenvolvimento de novas estratgias de controle, baseadas em tcnicas biomoleculares.
A transmisso de vrus de plantas por vetores no um processo passivo, ao contrrio um processo dinmico e especfico (apenas determinados vetores transmitem determinados vrus), que depende de genes especficos do vrus e do vetor. Os principais grupos de vetores so: insetos (99% dos artrpodes vetores), sendo que dentre estes os afdeos (pulges) e as cigarrinhas so os mais comuns; temos ainda nematides (ordem Dorylaimida); fungos (Spongospora, por exemplo) e caros. Tipos de relao vrus-inseto vetor: Circulativa (persistente): vrus adquirido atravs do canal alimentar e translocado para outras partes do corpo do inseto vetor; segue-se um perodo de latncia,onde o inseto no consegue transmitir; e ento o vrus injetado na planta atravs da glndula salivar; dividida em dois sub-tipos: Propagativa: vrus multiplica-se no vetor (o que pode ser medido por ELISA), s vezes chega a infectar os ovos do inseto (transmisso transovariana), s vezes acarreta em aumento na mortalidade do inseto vetor; ou seja, neste caso, o inseto mais um hospedeiro do vrus. Exemplos: Fitorhabdovrus, Tospovrus, Fitoreovrus e provavelmente, Geminivrus. No-propagativa: vrus no multiplica-se no vetor. Exemplo: Luteovrus (PRLV). No-circulativa: vrus no circula no corpo do inseto; fica retido nas estruturas alimentares (estilete, canal alimentar, intestino anterior); no h perodo de latncia; o inseto perde a capacidade de transmitir (no mais virulfero) aps a ecdise; vrus no encontrado na hemolinfa ou na glndula salivar; subdivida em: No-persistente: inseto permanece virulfero (retm inoculatividade) por alguns minutos aps alimentar-se na planta infectada; perodo de fome aumenta capacidade de inocular o vrus; tempo necessrio para aquisio e inoculao dura segundos (picadas-de-prova); perodos de aquisio maiores que um minuto diminuem taxas de transmisso. Exemplos: potyvrus, AMV, carlavrus. Semi-persistente: intermedirio entre no-persistente e circulativo; inseto permanece horas inoculativo, tempo de aquisio e inoculao de minutos; perodo de fome no produz efeitos; perodos de aquisio maiores que um minuto aumentam taxas de transmisso; em geral so vrus de floema. Exemplos: closterovrus (Tristeza dos citrus), CaMV (bimodal, caractersticas de no-persistente e semi-persistente). Tipos de vetor versus tipo de vrus: Artrpodes: - Afdeos: potyvrus, caulimovrus, luteovrus. - Cigarrinhas: alguns geminivrus, fitoreovrus, fitorhabdovrus. - Mosca-branca: alguns geminivrus (BGMV). - Tripes: tospovrus. - Besouros: comovrus. - caros: wheat streak mosaic virus, alguns fitorhabdovrus. Nematides: Longidorus e Xiphinema (nepovrus) e Trichodorus (tobravrus); caractersticas de relao nopersistente. Fungos: tobacco necrosis virus, soil-borne wheat mosaic, potato mop-top. Outros modos de transmisso: - Semente e plen: TMV em tomate (tegumento), AMV (embrio), potyvrus (embrio), nepovrus (plen). - Cuscuta e enxertia. Especificidade da trasmisso de vrus por insetos determinada no plano molecular: protenas HC de potyvrus essencial para transmisso, assim como glicoprotenas de tospovrus e receptores virais em tripes; capa proteica de geminivrus, cucumovrus, potyvrus e fitoreovrus. Aspectos Moleculares da Interao Vrus-Vetor: Receptores Celulares e Ligantes Virais A entrada na clula o primeiro evento necessrio infeco viral. Vrus de animais e humanos utilizam receptores celulares (fator celular reconhecido pelo vrus que permite mudana de conformao da membrana plasmtica e consequente abertura de um canal para entrada do vrus na clula) no s para entrarem na clula hospedeira como tambm para se moverem de clula-a-clula.
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Dada a existncia da parede celular circundando a membrana plasmtica na clula vegetal e o fato destas clulas serem diretamente conectadas atravs de plasmodema, os vrus de planta, ao contrrio dos de animais, no podem e no utilizam receptores para sua entrada ou movimento celular. Para se movimentar os vrus de planta utilizam suas prprias protenas de movimento, provavelmente atravs da interao com componentes da planta hospedeira presentes nos plasmodesma; alm da interao com outros componentes da planta para o movimento sistmico; tais componentes poderiam ser chamados fatores de movimento. Vrus de plantas so diretamente introduzidos em suas hospedeiras atravs da re-alimentao por vetores (grande maioria insetos), que introduzem o vrus pela saliva infectada, ou por ao mecnica, ambos envolvendo a destruio parcial da parede celular e perfurao da membrana plasmtica. Alguns vrus de planta, entretanto, infectam, replicam e circulam em seus insetos vetores (os de relao circulativapropagativa), e consequentemente, como os vrus de animais e humanos, precisam interagir com receptores celulares nas clulas do inseto vetor para que possam infect-los e serem transmitidos suas plantas hospedeiras. Esses vrus possuem a capacidade de infectar clulas vegetais e animais, provavelmente pelo fato de serem patgenos de insetos fitfagos que posteriormente adquiriram a capacidade de mover-se em tecidos vegetais (teoria). Exemplos incluem fitorhabdovrus, fitoreovrus, tospovrus e, provavelmente, geminivrus. Os trs primeiros grupos, alis, fazem parte de famlias de vrus de animais e humanos, o que refora a teoria postulada acima. Para o rice dwarf phytoreovirus (RDV) tem sido mostrado que isolados defectivos quanto transmissibilidade (obtidos atravs da sucessiva passagem em plantas hospedeiras por inoculao mecnica) perdem a protena da capa P2 ou partes dela e que P2 est envolvida na adsoro do vrus clulas de cigarrinhas vetoras. P2 seria ento o ligante viral (protena codificada pelo vrus que reconhece o receptor celular). Similarmente, mostrou-se que as protenas da capa do bean golden mosaic e do African cassava mosaic virus (ambos geminivrus) so fatores determinantes da aquisio desses vrus por suas moscas-brancas vetoras, como esperado, visto que as capas proteicas so as protenas mais externas na partcula viral. Adicionalmente, efeitos citopticos em Bemisia tabasci tm sido observados, indicando replicao do vrus no vetor. {- Para luteovrus, que no replicam mas circulam em seus afdeos vetores (relao circulativa no-propagativa), existem inmeras evidncias de aquisio mediada pela interao com receptores vinda de estudos de imunocitoqumica. Adicionalmente mostrou-se que diferentes luteovrus ligam-se especificamente a GroEL, uma protena produzida por uma bactria endosimbionte (Buchnera sp.) no intestino de afdeos vetores, que tem sido proposta como o fator que determina a persistncia de luteovrus na hemolimfa de afdeos vetores. GroEL foi co-purificada com partculas virais via imunoprecipitao, isolada, microsequenciada e identificada por homologia com GroEL de Escherichia coli . O clone obtido foi usado para expresso heterloga e a afinidade por partculas virais foi demonstrada in vitro, assim como alguns aminocidos importantes na interao com a capa proteica foram identificados. Potyvrus e Caulimovrus, que possuem relao no-circulativa com seus afdeos vetores, dependem da capa proteica e de uma protena no-estrutural, denominada helper factor (HF), para a trasmisso via vetor. Tem sido hipotetizado que h uma interao entre os HF desses vrus e fatores celulares, que necessria para a aquisio do vrus pelos vetores. Para tospovrus foi demonstrado que uma protena clonada de uma biblioteca de cDNA de Frankliniella occidendalis (o principal tripes vetor), identificada por homologia como um receptor de arylforina (uma protena envolvida no sistema imune de insetos), liga-se especificamente a TSWV, est localizada no intestino mdio (mesnteron) do inseto, que o stio primrio de infeco, e que anticorpos produzidos contra esta protena bloqueiam a infeco de clulas de F. occidentalis em cultura. Todos esses dados indicam o receptor de arylforina como o provvel receptor de TSWV no vetor. Tambm mostrou-se que o receptor de arylforina possui homologia significativa com receptores celulares de hantavrus (pertencentes mesma famlia dos tospovrus, Bunyaviridae), as beta-integrinas (envolvidas na adeso celular e no sistema imune), o que pode indicar como esse grupo de vrus evoluiu at invadir o reino vegetal (atravs do reconhecimento de receptores similares em tripes). Adicionalmente, vrias evidncias experimentais indicam a glycoprotena G1 de TSWV como o ligante viral. A identificao de receptores para vrus de plantas, animais ou humanos em seus insetos vetores e a identificao e estudo de seus respectivos ligantes virais pode levar ao desenvolvimento de novas estratgias de controle mais eficientes no s das viroses mas tambm dos vetores, basedas em tcnicas de biologia molecular. Um exemplo o uso de plantas transgnicas expressando: (a) toxinas que reconheam especificamente os vetores virais (quimera do ligante e a toxina Bt); (b) o ligante viral ou partes dele (inundao do receptor). Esse estudo tambm pode levar ao entendimento dos mecanismos de evoluo desses grupos de vrus e lanar novas reas de pesquisa em virologia animal e vegetal.
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Inoculao mecnica: abrasivo, tampo. Uso de vetores: quando a inoculao mecnica no possvel. Gama de hospedeiras: listas publicadas pelo CMI.
Microscopia eletrnica: leaf dips, ISEM (immuno-sorbent electron microscopy). Testes sorolgicos: anticorpo, epitopo, soro, antgeno, adjuvante, IgG. - Dupla difuso em gar, teste de aglutinao. - ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay: ensaio imunolgico com enzima conjugada). Testes biomoleculares: Western blotting (transferncia e anlise de protenas). PCR (polimerase chain reaction: reao de polimerase em cadeia). Eletroforese de dsRNA. Hibridizao de cidos nucleicos: - Dot-blot - Northern blotting (transferncia e anlise de RNA). - Southern blotting (transferncia e anlise de DNA). Preo + ++ +++ ++++ ++++ Praticidade + +++++ +++ +++++ +++ Tempo ++++ ++ ++ + ++ Especificidade + +++ ++++ ++++ +++++ Sensibilidade + +++ ++++ +++++ +++++
Tabela 1. Comparao relativa entre algumas das tcnicas de diagnose usadas para vrus de plantas. Tcnica Plantas indicadoras ELISA Western blotting PCR Dot-blot
Valores relativos representados por : + = muito baixo ou muito pouco; ++ = baixo ou pouco; +++ = mediano; ++++ = alto ou muito; +++++ = altssimo.
a) Escape: Evitar condies favorveis doena. Exemplos: Escolha da rea ou regio: nvel de doenas pode ser menor se o plantio for feito em reas com baixa incidncia do vetor. Escolha do local: para escapar de solos infectados (por fungos ou nematides vetores) ou de locais com alta infestao de ervas daninhas infectadas.
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Escolha da data de plantio: condies (temperatura e umidade relativa) desfavorveis ao vetor ou ausncia espordica do vetor (BGMV, tungro). Uso de materiais propagativos sadios (sementes e mudas): importante para potyvrus, nepo, ilar, como, carla, cucumo, rhabdo, sobemo, carmo, potex, tobamo, tymo, bromo, furo, hordei, tobra, tospo, tombus, rymo, bymo, enamo, machlo, faba, capillo, alfamo, num total de cerca de 10% das espcies de vrus. Modificao das prticas culturais: se possvel, manipular o espaamento (que pode afetar a populao do vetor), controle de ervas daninhas, e outros que diminuam o risco de infeces. b) Excluso: Impedir a entrada do vrus (inculo) em uma rea isenta. Exemplos: Medidas estabelecidas atravs da legislao fitossanitria. a) Proibio, certificado de sanidade, inspeo, interdio. b) Comisso de Defesa Sanitria Vegetal. No plano do agricultor: sementes e mudas sadias, tratos culturais. Quarentena: nveis - importao proibida, restrio condicional, livre importao. Eliminao do inseto vetor (em geral, invivel). c) Erradicao: Eliminao do inculo na fonte. Exemplos: Controle biolgico: efeito biocida ou biosttico (inibidor) sobre o vetor, tentativas tm sido feitas com o pulgo vetor de BYDV utilizando-se insetos predadores. Rotao de culturas: quando hospedeiras e no-hospedeiras so utilizadas de maneira rotativa, que acabe reduzindo a populao do vrus. Remoo ou destruio de plantas suscetveis ou doentes: i) Arranquio: remover a fonte de inculo no incio do processo de infeco (TMV, TSWV, etc); ii) Eliminao de hospedeiros alternativos: ervas daninhas (TSWV, tungro); iii) Sanitao: eliminao de resduos (TMV). Eliminao por cultura de meristemas: vrus podem ser eliminados de meristemas, provavelmente pelos altos nveis metablicos, altas concentraes de auxina, competio por nutrientes durante alto metabolismo, processos de oxidao-reduo. Esta tcnica muita usada na produo de batata-smente livre de vrus (PVY, PRLV, PVA, PSTVd, PVS, PVX, PVM) e em ornamentais como crisntemo, dlia, cravo, gladolo, alm de couve-flor (CaMV), morango (vrios vrus), soja (SMV), mandioca (ACMV), banana (CMV), cana-de-acar (SuMV), uva (vrios). d) Proteo: Tornar o inculo no-infectivo no stio de infeco. Exemplos: Pulverizao com fungicidas protetores, no caso dos vrus transmitidos por fungos, e nematicidas, para os transmitidos por nematides. Controle do inseto vetor: pode no ser efetivo para o estabelecimento da doena, mas pode inibir a disseminao, de qualqer forma s efetivo para aqueles vrus de relao circulativa, pois nesse caso a transmisso leva algumas horas para se realizar, durante a alimentao do vetor na planta hospedeira. No caso dos de relao nocirculativa, a transmisso d-se rapidamente, no dando chance para que o inseticida atue eficientemente, j que o vrus pode ser transmitido at na picada-de-prova (exemplo: PVY por pulges). Uso de pesticidas tem sido uma das principais medidas de controle de geminivrus, tospovrus, tungro, rice stripe virus, vrus do mosaico da canade-acar, vrus do mosaico do pepino, etc. leo mineral tem sido usado, em baixa escala, para o controle de vrus como o PVY, pois impede a introduo do estilete do inseto. Modificao do ambiente: circulao de ar / umidade no dossel (para controle do vetor). Proteo cruzada (pr-imunizao): estirpes avirulentas ou de baixa virulncia so usadas para a obteno de variedades imunizadas. Exemplos: vrus da Tristeza dos citrus (cerca de 50 milhes de mudas pr-imunizadas foram produzidas em 1987); vrus do mosaico da soja; vrus da manha anelar do mamoeiro.
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Modificao na nutrio: excesso de nitrognio pode levar a maior suscetibilidade, deficincia de potssio e clcio tambm podem afetar. e) Terapia: Cura da infeco nas plantas doentes. Exemplos: Tratamento trmico em sementes e bulbos (usado para diversas espcies florestais; batata para PVS, fumo para AMV e CMV). Eliminao de partes da planta com infees atravs de desbrota e poda. Viricidas ? f) Resistncia: A resistncia pode ser de natureza fisiolgica, mecnica, funcional; pode ser baseada por exemplo no uso de inibidores, na incompatibilidade metablica, cutcula mais resistente, etc. Resistncia sistmica induzida, tolerncia. Resistncia vertical (altos nveis) e horizontal. Resistncia monognica e polignica (menos pronunciada, mais durvel). Em alguns casos, diversos estirpes precisam ser usadas nos programas de melhoramento para evitar-se a obteno de variedades resistentes a uma nica estirpe. Resistncia da planta ao vetor uma possibilidade, e pode ser dos tipos no-preferncia, antibiose, tolerncia. Exemplos: a incidncia de cucumber mosaic virus diminuiu em diversas cucurbitceas aps a introduo de variedades resistentes Aphis gossypii, o principal afdeo vetor; o mesmo para arroz e o rice hoja blanca virus. O uso de plantas transgnicas expressando a toxina Bt (que age contra insetos) reduziu a incidncia de algumas viroses no algodo e milho. Alguns exemplos de genes de resistncia a vrus encontrados em espcies de plantas selvagens, reportados na literatura: Tm-22 (em tomate contra TMV), Sw5 (em tomate contra TSWV), N (em fumo contra TMV), Ry (em batata contra PVY). Uso de plantas transgnicas resistentes aos vrus: em geral leva menos tempo que o melhoramento tradicional; no entanto requer o domnio prvio da clonagem do gene a ser transposto, e da transformao da planta, encarecendo o produto. Plantas transgnicas resistentes a vrus esto divididas em trs classes: a) Expressando genes de resistncia previamente clonados de outras plantas (resistncia derivada da planta): A resistncia um resultado da ao direta ou indireta do gene que confere resistncia, como no melhoramento tradicional, porm resultante de um s gene. Vantagem: variedades resitentes podem ser obtidas mais rapidamente. Desvantagem: resistncia teoricamente pode ser quebrada mais rapidamente. b) Expressando componentes do prprio vrus previamente clonados (resistncia patgeno-derivada): A resistncia resultado da interferncia da protena viral, expressada em altos nveis na planta transgnica, na replicao do vrus, impedindo os processos de decapsidao (quando a capa proteica usada) ou sntese de genoma viral (quando a replicase usada). Vantagem: mesma da anterior. Desvantagem: em teoria pode forar o aparecimento de estirpes mutantes do vrus. c) Expressando outros genes: inibidores de proteases, interferons e anticorpos, por exemplo. Observaes: Clonagem: pr-requisito para a produo da planta transgnica; atravs do uso de tcnicas como PCR ou de bibliotecas de genes. Transformao de plantas: agroinoculao com Agrobacterium tumefasciens, onde a regio chamada T-DNA do plasmdeo Ti da bactria integrado no genoma da planta (usam-se vetores binrios); outros mtodos so bombardeamento de clulas ou tecidos vegetais com DNA recombinante; eletroporao. Uso de marcadores moleculares: antibiticos como neomicina fosfotransferase II (NPT II) e protenas que inativam antibiticos como gentamicina e higromicina B, herbicidas.
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A indstria biotecnolgica a que mais cresce no mundo, a que menos fere o ambiente e das que possui os mais altos ndices de competio interna. Exemplos de algumas variedades transgnicas atualmente em uso comercial nos EUA: abbora resistente a trs viroses, CMV (cucumber mosaic), zucchini yellow mosaic (ZYMV) e watermelon mosaic II (WMVII), que foi a primeira variedade comercial resistente a vrus; mamo resistente ao TSWV e papaya ringspot. Riscos associados plantas transgnicas: recombinao de genomas de vrus diferentes ou similares pode levar ao aparecimento de estirpes mais virulentas e/ou com diferente gama de hospedeiras; encapsidao heterloga pode levar mudanas na epidemiologia dos vrus; marcadores moleculares podem ter efeitos secundrios, como antibiticos. Mecanismos de resistncia: - No movimento do vrus na planta: interferncia com protenas que se associam aos vrus e ao plasmodesma (movimento clula-a-clula) e aos fatores que auxiliam o vrus no movimento a longa distncia (movimento sistmico). - Interferncia com os fatores celulares que auxiliam as polimerases virais na replicao viral ou com as prprias polimerases, obstruindo os mecanismos de regulao da replicao (exemplos so plantas expressando a protena de 54 kDa de TMV e PEBV, e as polimerases de geminivrus, cucumovrus, BMV, PVX, PVY). - Inibidores dos fatores de patogenicidade do vrus. - Silenciamento gnico: mecanismo proposto onde RNAses da hospedeira detectariam um nvel elevado do mRNA transgnico e ativariam um mecanismo de degradao que acabaria por atingir os RNAs virais, tornando a planta assim resistente; foi proposto quando se constatou que mRNAs no-traduzveis conferiam resistncia. - Antissenso: RNAs antissensos bloqueiariam a traduo do gene viral via complementaridade. - Interferncia com o processo de desencapsidao viral, essencial para a replicao do vrus; ocorre quando a capa proteica expressa e inibe a decapsidao, de modo estereoqumico, pela alta concentrao obtida atravs de promotores fortes, como o CaMV 35S. - Uso de ribozimas: sequncias de RNA com capacidade de cortar RNA. - Uso de RNA satlite: interferncia da replicao do vrus (CMV). - Uso de RNAs defectivos: mesma anterior.
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1960-70: protoplastos (Takebe), cristalografia, replicao in vitro, estudos com fagos que levaram inmeras descobertas de funes celulares (Delbruck,Luria, Lederberg, Lwoff, Avery, Heshey & Chase); sequncia completa da capa do TMV. 1970s: Diener, viroids; Shepherd & Goodman, vrus de planta com DNA; Temin & Baltimore, transcriptase reversa; teste ELISA (Clark & Adams). 1980s: mutagnese oligo-direcionada (Smith); anticorpos monoclonais (Jerne); sequenciamento de DNA (Gilbert, Sanger); surge o HIV (AIDS); receptores virais. 1981: Zacaniello & Baltimore, primeiro cDNA infeccioso (polio). 1984: Ahlquist, clone infeccioso de BMV (primeiro de planta). 1986: Powell-Abel et al., planta transgnica resistente a vrus (TMV). 1990s: clonagem de genes de resistncia de plantas a vrus; primeiras plantas transgnicas ersistentes a vrus passam a ser comercializadas 2000s: substituio das antigas prticas de controle pelas novas estratgias criadas pela biotecnologia?
RNAs Satlites e Vrus satlites: Os vrus satlites codificam capsdeos como os vrus mas no codificam replicases ou outra protena, usam as replicases dos vrus para sua replicao; os RNA satlites no codificam protenas. Constituem-se de fitas simples de RNA. No causam dano replicao dos vrus. So especficos a determinados tipos de vrus. No apresentam homologia com os genes virais. Exemplo: RNA satlite do CMV.
Virusides: Apresentam RNA como os virides: pequeno tamanho, circulares, fechados, fita simples. Porm so dependentes do vrus para replicao e so encapsidados pela capa proteica do vrus, como os RNA satlites. Exemplo: Velvet tobacco mottle virus (VTMoV). Prions: Ainda no encontrados em plantas.
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Aparentemente constituem-se de pequenos polipeptdeos com capacidade replicativa, no associados cidos nucleicos; no entanto, possvel que sejam codificados por pequenas sequncias de RNA ou DNA que ainda no foram purificadas por limitaes experimentais (vrus filtrveis). Exemplo: Encefalite causada pela doena da vaca louca (Inglaterra).
Caract. Tipo Nmero de clulas Parede celular Morfologia Crescimento em meio Metabolismo Tipo de Genoma Sensibilid. Penicilina Sensibilid. Tetraciclina Nmero de genes Reproduo Replicao Capsdeo Fungo Eukar. multi + micelial + sim DNA + ~4000 Sex./ Assex. NA NA Bactria Prokar. uni + elipside + sim DNA + + ~2000 Fisso binria NA NA Nemat Ricktsia Fitoplasma Eukar. multi + Prokar. uni Prokar. uni Vrus partcula NA NA variada no DNA ou RNA ~4 a 20 RNA sat. Viride Viruside Partcula partcula. Partc. NA NA NA NA NA bastonete no RNA 1 Mont. Depen. sim
+ (ondulada) verme elipside pleomrfico + sim DNA ~5000 Sex./ Assex. NA NA +/sim DNA + + ~1000 sim DNA + (remisso) ~1000
NA = no se aplica.
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Caractersticas do genoma: dmero de ssRNA(+), 8-10 kb. Similares a elementos genticos celulares mveis: retrotransposons. Grupo similar em plantas: Caulimovrus (tambm codifica uma trancriptase reversa, sendo portanto um pararetrovrus, com mecanismo de replicao bastante similar; porm no envelopado e possui genoma de DNA). Estrutura genmica simplificada dos retrovrus:
gag vif env nef
transcriptase reversa, RNase H, integrase, protease. CA e NC (protenas do capsdeo), matriz (MA). glicoprotenas [SU(gp120), TM(gp40)]. exportao dos mRNAs para o citoplasma. envolvida na replicao e regulao negativa de CD4. aumenta infectividade. envolvida na replicao de maneira ainda no completamente elucidada, vai para o ncleo, interage com protenas da clula hospedeira.
- Ciclo celular:
ncleo
integrao transcrio reversa encapsidao e montagem CD4 CXCR penetrao nucleocapsdeo brotamento glicoprotenas acumuladas na membrana plasmtica transcrio traduo
(prognie)
O receptor do HIV (CD4) foi um dos primeiros a serem identificados (Gallo & Montagnier, 1984). Desencadeou a procura pelo receptor de outros vrus, desde que logo se percebeu a possibilidade de desenvolvimento de estratgias para bloquear a entrada do vrus na clula; o que ainda no se confirmou na prtica visto que o receptor desempenha funes essenciais para a clula hospedeira.
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Mais de uma dcada depois foi identificado o co-receptor (CXCR4): - Feng et al. (1996. Science 272: 872-877) encontraram um co-receptor a partir da hiptese de que outro receptor deveria existir visto que alguns tipos de clulas que expressam CD4 so no-permissivas. Descrio da estratgia experimental: - 2 grupos de clulas NIH-3T3 (no-permissivas) foram transformadas com: (a) CD4, polimerase T7 e uma biblioteca de cDNAs de linfcitos T (permissivas) e (b) vetores contendo lacZ (sob o controle do promotor T7) e env. - Os dois grupos foram incubados num mesmo meio contendo X-gal (substrato da lacZ) e a seleo foi realizada pela identificao de clulas fundidas (azuis devido ao reconhecimento do promotor T7 pela pol T7 e consequente expresso de -galactosidase e hidrlise de X-gal). - A fuso de duas clulas implica na expresso do co-receptor que foi identificado como uma protena do tipo quimiocinina (p.e. CXCR4) que esto envolvidas no recrutamento de componentes do sistema imune para clulas em processo de inflamao. Controles experimentais utilizados: env- resultou em fuso negativa; outras clulas no-permissivas tambm tornaram-se infectadas. Possvel aplicao teraputica dos receptores: Construo de VSV recombinante expressando CD4 e CXCR4. Infeco em clulas previamente infectadas com HIV. Levou destruio das clulas infectadas. Schnell et al. 1997. Cell 90: 849-857.
Descoberta da transcriptase reversa (Temin & Baltimore, 1970) em retrovrus possibilitou o estudo de drogas inibidoras da replicao desses vrus, o que, anos depois levou produo comercial de AZT, zidovudina, saquinavir (inibidor de protease), etc (complexo de drogas hoje usado terapeuticamente). Paralelo com o estudo de caulimovrus: - Transformao de clulas hospedeiras de caulimovrus (protoplastos) extremamente dificultada (baixssima eficincia devido a restos da parede celular). - Vrus animais so comumente tecido-especficos o que acarreta numa grande variedade de tipos de clulas que podem ser utilizadas, ao contrrio de vrus de plantas. - Caulimovrus so bons modelos para o estudo da atividade de transcrio reversa, visto que no existem empedimentos ticos para a realizao de experimentos com organismos hospedeiros vivos do vrus (planta), ao contrrio do HIV. b) Picornavrus: Representates: poliovrus (poliomielite), rhinovrus (gripe), hepatite A; todos possuem 1 RNA e so isomtricos. Similares em plantas: comovrus (2 RNAs), nepovrus (2 RNAs), potyvrus (1 RNA, bastonete). Caractersticas do genoma e da estratgia de expresso que so idnticas nos picornavrus animais e seus similares em plantas: - ssRNA(+). - VPg (replicao) e cauda de poli(A) (estabilidade) associados ao RNA. - formao de poliprotena precursora a partir de um nico ORF. - clivagem ps-traducional por proteases virais. - No possuem CAP como estrutura de proteo do RNA, regio 5 UTR supre essa deficincia. Essas caractersticas em comum levaram ao estabelecimento da superfamlia dos vrus tipo-picornavrus. Os genomas tambm possuem uma organizao dos genes extremamente similar e domnios (regies das protenas especializadas em determinadas funes) homlogos, indicando uma evoluo monofiltica da superfamlia; ou seja, um provvel ancestral comum.
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ICAM-1
replicao no citoplasma
Tcnica desenvolvida inicialmente com poliovrus, extremamente difundida para outros vrus; permite o estudo da dinmica de replicao do vrus e assim pode ser usada numa grande variedade de experimentos, com infinitas aplicaes. Exemplos de aplicaes: estudo de drogas antivrus e seu modo de ao, estudo de anticorpos antivirais e sua eficincia. Como se obtm a curva: Clulas em cultura so incubadas com vrus purificado por um perodo breve para ligao das partculas s clulas. Concentrao suficiente de vrus adicionada de modo que haja excesso de vrus em relao ao nmero de clulas, para que todas as clulas sejam infectadas. Clulas so lavadas para remoo do excesso (partculas no ligadas) atravs de sedimentao e resuspenso em novo meio de cultura. Alquotas so ento removidas a um determinado intervalo de tempo: clulas so rompidas (lisadas) por tratamento com detergente de modo que todos as partculas virais presentes na alquota (as que estejam dentro e as que j estejam fora das clulas) possam ser contadas. Amostras tratadas com albumina para diminuir o efeito do detergente nos passos subsequentes. Alquotas tratadas so ento usadas em ensaios de placa, que um ensaio simples de infeco de monocamadas de clulas em meio slido. possvel para vrus que sobrevivem a tratamentos com detergentes, o que no acontece com vrus com membranas, por exemplo. (Equivalente ao nmero de partculas)
deteriorao
Existem diversos tipos de curvas de crescimento, dependentes das caractersticas prprias do experimento e do vrus. Exemplo:
elevao
lag
Tempo (horas)
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Sada da clula: lise ocorre aps o aumento da permeabilidade da membrana celular ocasionada pelo vrus (no caso do poliovirus, especificamente pela protena viral 2B). Foi mensurada pela utilizao de corante especfico a ons de clcio (Ca+2): mostrou aumento do influxo de Ca+2 no citoplasma aps infeco viral. Picornavrus inibem a sntese de RNA celular: caracerstica provavelmente comum a muitos vrus. Mecanismo (Clark et al. 1993. Mol. Cell Biol. 13: 1232-1237): - Todo promotor celular contm uma sequncia denominada caixa TATAA, reconhecida no DNA celular pela RNA pol II para que haja transcrio. - H um complexo de protenas, denominado TFIID, que associa-se a todos os mRNAs celulares, para que estes possam ser transcritos. - Uma protena denominada TBP uma das participantes do complexo. - Descobriu-se que a protease 3C de poliovrus (clonada, expressa e purificada de E. coli) cliva TBP in vitro. O mesmo foi verificado quando se purificou TBP de clulas previamente infectadas (controle: clula no infectada). - Transcrio de uma sequncia de DNA contendo um promotor de adenovrus foi inibida pela incubao com 3C purificada (controle: mutante de 3C). Paralelo com vrus de plantas: (i) a curva de crescimento em nico passo pode ser construda (com menor eficincia) utilizando-se hospedeiras de leso local, onde cada leso representar uma partcula viral vivel em determinado momento; (ii) as descobertas feitas com picornavrus abrem um leque de possibilidades experimentais com os seus similares em plantas; (iii) por exemplo a inibio da transcrio celular deve ocorrer tambm em plantas, o que no foi ainda comprovado. c) Togavrus: - Representantes: vrus da rubola (rubella virus), diversos vrus que causam encefalites (Sindbis virus, Eastern encephalitis virus). So envelopados, transmitidos por insetos em geral, com uma molcula de ssRNA(+). Similares em planta: bromovrus, cocumo, ilar (todos sem evelope e com 3 RNAs), tobamo, potex, (ambos sem envelope e formato bastonete). Todos esses vrus fazem parte da superfamlia dos alfavrus. Foram os primeiros clones infecciosos obtidos, a partir de cDNA transcritos in vitro que geraram RNAs infecciosos. Descobriu-se que os nucleocapsdeos so decapsidados por ribossomos (decapsidao portanto um evento paralelo traduo). Descobriu-se que usam a estratgia da leitura contnua (readthrough) para maximizar o nmero de genes (teoria da Economia Gentica): Um cdon de terminao fraco (UGA) encontrado entre os dois genes envolvidos na replicao; os ribossomos continuam a traduzir em 20% das vezes que encontram UGA. O cdon imediatamente adjacente a UGA tambm participa neste processo; para o Sindbis virus mostrou-se que quando o prximo cdon CUA a leitura continua, se a citosina modificada a leitura pra. Assim, uma regio do genoma que codificaria apenas um gene, codifica dois. O mesmo j havia sido descoberto para o bacterifago Q (na sntese de sua protena A1), mostrando novamente como vrus completamente diferentes podem possuir mecanismos extremamente similares de expresso dos seus genes. Os mRNAs subgenmicos so feitos a partir de um promotor interno na fita de RNA(-) ou complementar. Sequncias adjacentes aos terminais 5e 3, com comprimentos de 51 e 19 nt respectivamente, so conservadas dentro de um mesmo gnero e so importantes na sntese de RNA. O processo de encapsidao comea numa regio especfica.
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Sada da clula: por brotamento atravs da interao entre as glicoprotenas e o nucleocapsdeo; deleo de um ou outro levou ao bloqueio na produo de novas partculas completas. Paralelo com vrus de plantas: todos esse dados, gerais e extremamente importantes em termos de replicao e expresso gnica, comearam a ser pesquisados ento para alguns vrus de plantas, e alguns j foram confirmados, como exemplos: j foi encontrada em brome mosaic virus (BMV) e em TMV a regio especfica de incio do processo de encapsidao (cis e trans), o mesmo para promotores internos em rhabdovrus e outros; a estratgia de leitura contnua; assim como j foi possvel o desenvolvimento de clones infecciosos de BMV e outros. d) Papovavrus: Representantes: human papilloma virus (diferentes espcies causam diversos tipos de verrugas e alguns carcinomas), SV40 (vrus modelo); so dsDNA, circular. Similar em plantas: geminivrus (ssDNA circular). Infectam clulas epiteliais, esto presentes na maioria dos indivduos na populao. A maioria das estirpes no causa doenas, mas alguns so oncognicos (nesses casos o genoma viral integrado no humano). Possuem genoma do tipo dsDNA, replicam e montam sua partcula no ncleo, o dsDNA forma um minicromossomo com histonas celulares. SV40 (simian virus 40) um vrus-modelo em vrios tipos de estudos de replicao e patognese por se tratar de um vrus de fcil propagao in vitro e infectar um hospedeiro muito similar ao ser humano (portanto importante nos estudos de patognese). Produz uma protena chamada antgeno T, a qual foi demonstrada a capacidade de estimular a diviso celular, e portanto viral, atravs da ligao duas protenas celulares envolvidas no ciclo celular. Estas protenas esto presentes no ncleo, so chamadas p53 e Rb, e sua funo exata na ativao da diviso celular ainda no est elucidada. Cultura de fibroblastos tem sido extensivamente usada com esses vrus e so sistemas de culturas de clulas bem avanados e formam monocamadas com extrema eficincia. Paralelo com vrus de plantas: culturas de clulas em monocamadas ainda no so possveis com protoplastos, que so cultivados em suspenso, o que se torna limitante em ensaios quantitativos; geminivrus tambm possuem fase da replicao no ncleo; estmulo diviso celular deve ocorrer com alguns vrus de plantas. e) Rhabdovrus: Representantes em animais: vrus da raiva, VSV. Similares em plantas: rhabdovrus de plantas (fitorhabdovrus). Outros vrus similares em animais: paramyxovrus [viroses do sarampo, (measles virus) e da caxumba (mumps virus)], orthomyxo (8 RNAs, Influenza, causador da gripe espanhola). Estrutura genmica:
N P M G L
Genoma produz 5 distintos mRNAs monocistrnicos, que so transcritos sucessivamente com 70% de eficincia a cada parada da polimerase. Virions so liberados no citoplasma por endossomos: pH baixo expe uma regio hidrofbica da protena G que resulta na fuso. Necessidade de glicosilao: descobriu-se ser necessria para o transporte de protenas transmembrnicas no sistema de membranas na clula. Genes e funes: a) P: fosfoprotena necessria replicao e transcrio. b) N: nucleocapsdeo, tambm necessrio replicao e transcrio e proteo contra RNases celulares. c) M: protena matriz, responsvel pela montagem da partcula. d) G: glicoprotena, ligao ao receptor. e) L: replicase e transcriptase.
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H uma atenuao na razo de transcrio de cada promotor no sentido N > P > M > G > L. Descobriu-se com VSV que tubulina (protena que faz parte do citoesqueleto) age como fator de transcrio positivo. mRNAs capeados (cap = mGpppmA) e com poli(A), como os RNAs celulares. Produo de partculas infecciosas completas: experimento feito com VSV (vesicular stomatitis virus, tambm um vrus-modelo) descrito a seguir. - infeco de cultura de clulas com vetor de expresso vaccinia-polimerase T7 (provavelmente o vetor viral mais utilizado). - transfeco com (5) clones contendo os genes de VSV (controle): novas partculas virais podem ser obtidas a partir de cDNA. - Substituio de G de VSV por outra glicoprotena: G de Influenza, levou obteno de VSV recombinante (com G heterlogo na partcula); tornou-se uma ferramenta importante no estudo das glicoprotenas virais. - Mostra a flexibilidade da formao da partcula de VSV. - Requer o uso de lipofectina para transfeco (ao similar a de um detergente, porm sem natureza custica), ou outro qumico similar que forme bolhas. Caractersticas importantes do VSV que tornaram possvel seu uso como vetor de expresso: - Pode crescer em altos ttulos na maioria das clulas de mamferos e facilmente purificado em altas quantidades. - Permite a introduo de genes externos devido simetria bilateral do nucleocapsdeo, que permite o aumento do tamanho do genoma sem a perda da viabilidade (partcula pode crescer de tamanho). - Facilidade com que partculas recombinantes so formadas (no possui mecanismo de excluso de protenas da membrana). - Eventos de recombinao so aparentemente raros ou no acontecem. Influenza: mostrou-se que o vrus sequestra estruturas cap de mRNAs celulares para os seus mRNAs e que a polimerase forma as caudas de poli(A) a partir de um mecanismo de escorregamento, usando pequenas sequncias de UUU como molde. Paralelo com vrus de plantas: vetores virais tambm foram desenvolvidos (TMV, PVX) e so usados para a expresso transiente de genes heterlogos em plantas.
1.1. CARACTERSTICAS GERAIS DOS VRUS ............................................................. ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.2. ORIGEM E EVOLUO DOS VRUS ..................................................................... ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.3. PRINCIPAIS VRUS DE PLANTAS E SUA CLASSIFICAO .................................... ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.4. CRITRIOS UTILIZADOS NA CLASSIFICAO DOS VRUS ................................... ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.5. ALGUNS CONCEITOS DE VALOR TAXONMICO ................................................. ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.6. SINTOMAS CAUSADOS POR VRUS DE PLANTAS ................................................ ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.7. REPLICAO E EXPRESSO GNICA.................................................................. ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.8. MOVIMENTO DO VRUS NA PLANTA .................................................................. ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.9. TRANSMISSO DE VRUS DE PLANTA A PLANTA ............................................... ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.10. EPIDEMIOLOGIA DE VRUS .............................................................................. ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.11. IMPORTNCIA ECONMICA DOS VRUS DE PLANTAS ...................................... ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.12. DIAGNOSE DE VRUS DE PLANTAS ................................................................... ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.13. CONTROLE CONCEITOS GERAIS E MEDIDAS ESPECFICAS PARA VRUS .......... ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.14. HISTRICO DA VIROLOGIA (ANIMAL, HUMANA E VEGETAL)............................ ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.15. OUTROS AGENTES FITOPATOGNICOS SIMILARES A VRUS ............................ ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO. 1.16. PARALELO ENTRE VIROLOGIA ANIMAL E VEGETAL ........................................ ERRO! INDICADOR NO DEFINIDO.
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