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Exercícios de Aminoacidos, proteínas e enzimas para Bioquimica – 135h

Entregar até 16 e 17 de setembro de 2010 para os monitores Rodrigo ou


Mozer (laboratório de bioquímica). Pode ser entregue por outros caso a
presença não seja possível. Se feito manualmente, com letra legível. O
exercício valerá presença.

1. Classifique os grupamentos químicos das cadeias laterais dos


aminoácidos triptofano (Trp), valina (Val), glicina (Gly), ácido
glutâmico (Glu), arginina (Arg) e fenilalanina (Phe) como:
a)hidrofóbico
b)polar
c)ácido
d)básico
e)neutro
f)aromático
2. O que os aminoácidos Treonina e Tirosina têm em comum?
3. Represente a estrutura primária do polipeptídeo Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu,
identificando na cadeia polipeptídica:
a) o N-terminal,
b) o C-terminal,
c) os resíduos de aminoácidos,
d) as cadeias laterais,
e) as ligações peptídicas.
4. Por que a Glicina não apresenta atividade ótica?
5. Quais aminoácidos são capazes de formar pontes de H? quais
promoveriam interações hidrofóbicas? quais se enquadram em
ambas as categorias?
6. O que é pI de um aminoácido e como é calculado?
7. Por que o aminoácido histidina é considerado o melhor tampão em pH
7?
8. Faça a dissociação completa, a partir do pH 1 de:
Um aminoácido monoaminomonocarboxílico
Um aminoácido diaminomonocarboxílico
Um aminoácido monoaminodicarboxílico
9. O que é um peptídio?
10.Como são classificados os peptídeos de acordo com o no de
aminoácidos?
11.Escolha três aminoácidos quaisquer e monte um peptídio,
demonstrando seus produtos.

12.Qual(is) aminoácido(s):
a) está positivamente carregado em pH 7,0;
b) possui grupo R aromático, sendo hidrofóbico e neutro em qualquer
pH;
c) possui grupo como R um hidrocarboneto saturado;
d) é o único com cadeia lateral com pKa aprox.=7;
e) possui um grupo alfa-amino;

13.TITULAÇÃO DA GLICINA: Para cada uma das afirmativas abaixo


identifique os pontos chave na titulação.

a) Em que ponto a glicina estará presente predominantemente na forma


+H3N-CH2-COOH.
b) Em que ponto o pH tem valor igual ao pKa de ionização do grupo
carboxila da glicina.
c) Em que ponto o pH tem o valor igual ao pKa de ionização do grupo
amino da glicina.
d) Em qual ponto a glicina tem capacidade máxima de tamponamento.
e) Em qual ponto a carga líquida média da glicina é igual a zero.
f) Em qual ponto o grupo carboxila da glicina está totalmente titulado.
g) Em qual ponto metade dos grupos carboxila está ionizada.
h) Em qual ponto a glicina está totalmente titulada.
i) Em qual ponto a forma predominante é +H3N-CH2-COO-.
j) Em qual ponto da titulação a espécie predominante é H2N-CH2-COO-
k) Se deseja usar a glicina como tampão eficiente, quais pontos
apresentam os piores valores de pH para capacidade tamponante.

14.O que você entende por região de pH tamponante?


15.Que características uma molécula deve ter para ser chamada de
"Zwitterion"?
16.Quais os fatores que influenciam a solubilidade das proteínas?
17.Caracterize detalhadamente os diferentes níveis estruturais de
organização das proteínas, descrevendo as forças responsáveis pelos
mesmos.
18.Quais os níveis de organização estrutural que seriam danificados
durante o processo de desnaturação de uma proteína?
19.Por que a solubilidade de uma proteína é baixa em um pH próximo
ao seu pI?
20.Defina:
a) Enzimas
b) Centro ativo
21.Qual a função das enzimas nos sistemas biológicos? O que
aconteceria se as reações metabólicas ocorressem sem a presença
das enzimas?
22.Quais as principais formas de regulação das enzimas? Descreva-as,
exemplificando.
23.Dê exemplos de aminoácidos que por suas características químicas
podem estar presentes na superfície de uma proteína de membrana
e de uma proteína do sangue e explique.
24.Definir proteínas globulares e fibrosas. Citar exemplos.
25.Descreva as estruturas regulares alfa-hélice, beta folha e dobra beta
que compõem a estrutura secundária das proteínas globulares.
26.Definir estrutura quaternária de proteínas globulares. Citar exemplos
de proteínas com estrutura quaternária.
27.Para inibir a ação de uma enzima, pode-se fornecer à célula uma
substância que ocupe o sítio ativo dessa enzima. Para isso, essa
substância deve:
a) estar na mesma concentração da enzima.
b) ter a mesma estrutura espacial do substrato da enzima.
c) recobrir toda a molécula da enzima.
d) ter a mesma função biológica do substrato da enzima.
e) promover a denaturação dessa enzima.

28.Para cada alternativa a seguir, indique se V ou F:

a) a unidade d medida de Km é velocidade por segundo


b) Km = k2 + k-1/k1.
c) Km é igual à concentração de substrato que resulta em velocidade
máxima de reação.
d) Em concentração muitas altas de substrato, a velocidade de reação é
independente da concentração do substrato.
e) A concentração do complexo ES permanece constante ao longo da
reação.
f) A concentração da enzima é normalmente muito mais baixa que a
concentração do substrato .
g) A velocidade de reação é igual ao produto da concentração do
complexo ES pela constante k2, ou: Vo = [ES] x k2.

29.Sobre as enzimas, indique se V ou F:

a) Para funcionar eficientemente, precisam estar em concentrações


semelhantes às concentrações dos reagentes.
b) Aumentam o valor da constante de equilíbrio, dessa forma
favorecendo a formação do produto.
c) Aumentam a velocidade de conversão do reagente em produto.
d) Asseguram a conversão completa de substrato em produto.
e) Asseguram que o produto é termodinamicamente mais estável que o
substrato.
f) Diminuem a energia de ativação para a conversão de substrato em
produto.
g) São consumidas nas reações que catalisam.
30.Tomando uma grande dose de vitamina A, uma pessoa pode suprir
suas necessidades por vários dias; porém, se fizer o mesmo em
relação à vitamina C não terá o mesmo efeito, necessitando de
reposições diárias dessa vitamina. Essa diferença na forma de
administração se deve ao fato de a vitamina:

a) A ser necessária em menor quantidade.


b) A ser sintetizada no próprio organismo.
c) A ser lipossolúvel e ficar armazenada no fígado.
d) C ser mais importante para o organismo.
e) C fornecer energia para as reações metabólicas.