B3BQ1 – BIOQUÍMICA 1

LISTA de exercícios de fixação e aprofundamento – Leia e pesquise nos livros textos

e na internet. Responda as
seguintes questões.

1) Proteínas vertebradas. O que quer dizer o termo arcabouço (ou coluna vertebral)
peptídico?
É a cadeia polipeptídica principal da proteína.

2) Ondas permanentes. A forma do cabelo é determinada em parte pelo padrão

de pontes dissulfeto na queratina, sua proteína principal. Como os cachos podem
ser induzidos?
A partir do estabelecimento de novas ligações dissulfeto transversais na cisteína.

3) Localização é tudo . A maioria das proteínas tem exteriores hidrofílicos e

interiores hidrofóbicos. Você esperaria que esta estrutura fosse aplicável às
proteínas inseridas no interior hidrofóbico das membranas? Explique.
Não, nesse caso é necessário que as proteínas tenham o seu exterior hidrofóbico para
que consigam interagir e permanecer no interior hidrofóbico das membranas.

4) Considere os peptídeos Gly—Pro—Ser—Glu—Thr (cadeia aberta) e Gly—

Pro—Ser—Glu—Thr com uma ligação peptídica conectando a treonina ae a
glicina. Esses peptídeos são quimicamente os mesmos?
Não, como a conformação espacial desses peptídeos é diferente, eles
desempenharão funções distintas, sendo assim, são quimicamente distintos.

5) Considere os peptídios Ser—Glu—Gly—His—Ala e Gly—His—Ala—Glu—Ser.

De que modo esses dois peptídios se diferenciam?
Como a ordem de ligação dos aminoácidos desses peptídeos é distinta, eles são
aminoácidos diferentes.

6) Isômero contrastantes. A poli-L-leucina (um polírmero) em um solvente

orgânico, tal como o dioxano é uma α hélice, enquanto que a poli-L-isoleucina não
forma. Por que esses amino ácidos com o mesmo número e tipos de átomos têm
diferentes tendências de formação de hélices?
Porque ainda que possuam a mesma quantidade e tipo de átomos presentes, os dois
aminoácidos possuem conformações espaciais diferentes, sendo assim, as ligações
de hidrogênio se formarão diferentemente para formar a sua estrutura secundária.

7) O que são os ângulos de Ramachandran?

São as combinações mais e menos estáveis dos ângulos C alfa-N e C alfa-C.

8) Você ouviu um comentário que a diferença entre os fios de lã e os fios de seda

está na diferença entre as estruturas em alfa-hélice e folha-beta pregueada. Você
considera válido esse ponto de vista? Justifique em caso afirmativo ou negativo.
Sim, a conformação alfa-hélice é mais condensada do que a folha-beta, sendo assim,
a conformação folha-beta é mais estendida, ou seja, acaba ficando visivelmente mais
fina (como a seda) enquanto a lã fica mais densa por ser alfa-hélice.

9) Pense a respeito e responda. As roupas de lã natural encolhem quando lavada

em água quente, mas itens deitos de seda não. Proponha uma razão baseada nas
informações da estrutura bioquímica.
A estrutura da seda é uma folha-beta pregueada que é mais “distendida” que a lã,
sendo assim ela já possui menos ligações que podem ser quebradas e causar
modificação estrutural, além disso essa conformação permite que a seda seja mais
compacta o que lhe confere maior resistência. Enquanto a lã possui conformação alfa-
hélice e por isso consegue encolher/esticar (desnaturar) mais facilmente, pois existem
mais ligações para serem desfeitas, já que é menos compacta.

10) Ativa outra vez. Uma mutação que troca um resíduo de alanina no interior de
uma proteína por um resíduo de valina leva a perda de atividade. No entanto, a
atividade é recuperada quando uma segunda mutação em uma posição diferente
muda um resíduo de isoleucina por um de glicina. De que modo poderia essa
segunda mutação levar a restauração da atividade?
Essa segunda mutação poderia restaurar a atividade dessa proteína caso essa nova
sequência de aminoácidos formada possua função homóloga à sequência anterior
que foi desfeita.