Disciplina RFM0004- Bioqumica Geral Exerccios T4- Aminocidos, peptdeos 1.

Desenhe a estrutura tpica de um aminocido, indicando as seguintes caractersticas: grupos funcionais, cadeias laterais, formas inicas. 2. O que confere diferentes caractersticas aos aminocidos? Defina quais so essas caractersticas e como elas esto relacionadas com a estrutura e funo das protenas. 3. Cite trs aminocidos que so positivamente carregados em pH neutro, e trs aminocidos que contm grupamentos hidroxila. 4. Para os aminocidos abaixo calcule a carga e desenhe seu estado de ionizao em pH 7. Histidina (pK1= 1,82, pKR=6,0 e pK2=9,17) Cistena ( pK1= 1,82, pKR=8,3 e pK2=10.8) Arginina ( pK1= 2,2, pKR=12,5 e pK2=9,0) 5. O que o pI de um aminocido? Para cada aminocido abaixo, calcule o pI. Histidina (pK1= 1,82, pKR=6,0 e pK2=9,17) Cistena ( pK1= 1,82, pKR=8,3 e pK2=10.8) Arginina ( pK1= 2,2, pKR=12,5 e pK2=9,0) 6. Considere os seguintes aminocidos: G, L, S, Q, R, D. Responda: a) da lista acima, qual aminocido o mais polar? Por qu? b) em qual pH o aminocido da questo a) tem maior solubilidade em gua? Por qu? c) em qual pH o aminocido da questo a) tem menor solubilidade em gua? Por qu? d) da lista acima, qual aminocido o menos polar? Por qu? e) em qual pH o aminocido da questo d) tem maior solubilidade em gua? Por qu? f) em qual pH o aminocido da questo d) tem menor solubilidade em gua? Por qu? g) em pH 4, quais aminocidos vo migrar para o nodo, quais vo migrar para o ctodo e quais no iro migrar em um campo elctrico? h) em pH 5, quais aminocidos vo migrar para o nodo, quais vo migrar para o ctodo e quais no iro migrar em um campo elctrico? 7. Identifique no peptdeo abaixo: as ligaes peptdicas, as extremidades aminoterminal e carboxiterminal, as cadeias laterais e o grupo ao qual cada aminocido pertence. D os nomes de cada aminocido.

8. a) Qual o aminoterminal do tripeptdeo Gli-Ala-Asp? b) Qual o peso molecular aproximado de uma protena composta por 300 aminocidos? c) Aproximadamente quantos aminocidos so necessrios para formar uma protena com um peso molecular de 110.000 Da? 9. Os resduos de aminocidos presentes em uma protena so extremamente importantes para sua estrutura e funo. Discuta a afirmao anterior citando exemplos. 10. Uma enzima presente em um extrato de planta precisa ser purificada. Um dos primeiros passos de purificao que o pesquisador pretende fazer uma cromatografia de troca inica. O pesquisador sabe que o pI dessa enzima de 6,4 e que ela estvel em pH de 5 9, em temperatura ambiente. Sabendo que o pesquisador possui os dois tipos de resinas abaixo, qual seria o melhor procedimento a ser tomado para a purificao inicial dessa enzima? Explique. Resina Diethylaminoethyl (DEAE) Shephadex Carboxymethyl (CM) Shephadex Carga Positiva Negativa pH de trabalho 2-9 6-10