Taxonomia bacteriana

DIVERSIDADE DOS MICRORGANISMOS

● BACTÉRIAS

● FUNGOS

● VÍRUS

● PROTOZOÁRIOS

● ALGAS
 Taxonomia
Sistemas de classificação dos seres vivos

Linnaeus (séc. XVIII): Reinos Animal e Vegetal

Haeckel (1866): Inclusão do reino Protista: "animais" e "vegetais“ unicelulares

Whittaker (1969): Cinco reinos - características morfólogicas e fisiológicas:

Monera: Procariotos
Protista: Eucariotos unicelulares
Fungi: Eucariotos aclorofilados
Plantae: Vegetais
Animalia: Animais
 Haeckel Whittaker Woese Woese
(1894) (1959) (1977) (1990)
Três reinos Cinco reinos Seis reinos Três domínios

Eubacteria Bactéria
Monera
Protista
Archaebacteria Archaea

Protista Protista
Fungi Fungi
Plantae
Plantae Plantae Eukarya

Animalia Animalia Animalia

Virus?
 Taxonomia

Carl Woese (1990) - O DNA poderia ser considerado um “fóssil” molecular.

Classificação baseada em aspectos evolutivos (filogenéticos)

Comparação das sequências de genes que codificavam o rRNA

Esta nova proposta de classificação subdivide os seres vivos em 3 domínios:

Archaea: Composto por procariotos – Ancestrais das bactérias
Bacteria: Composto por procariotos – Bactérias em geral
Eukarya: Composto por eucariotos – Animais, vegetais, algas, protozoários e
fungos
 A sistemática é a ciência dedicada a inventariar e descrever a
biodiversidade e compreender as relações filogenéticas entre os
organismos.

 Taxonomia: do grego tassein = "para classificar" e nomos = lei.

È a ciência de administrar a descoberta, descrição e
classificação das espécies e grupo de espécies, com suas
normas e princípios

 Filogenia: relações evolutivas entre os organismos

 Classificação definitiva: métodos fenotípicos e genotípicos

 Novas Classificações
• Existem dois grupos de procariotos que são
chamados de archaea e a bactéria.

• Pelo trabalho de Woese (1990), levando em

conta dados de filogenia molecular, elas são tão
diferentes que ocupam dois reinos, e as archaea
são mais próximas dos eucariotos do que as
bactérias
Evolutivamente falando, a classificação de
Whittaker em cinco reinos: Animalia, Plantae,
Fungi, Protista e Monera é antiquada, e
existem hoje apenas três reinos: Archaea,
Bacteria e Eukarya.
As Archaea vivem em ambientes extremos, onde não há
possibilidade de vida para outros seres.
Há Archaea em fontes termais a quase 100oC (Thermus
aquaticus), no Mar Morto, com salinidade altíssima, em
ambientes próximos a vulcões, em fontes de enxofre,
etc.

Comparando: Archaea Eukarya

20oC -
Temperatura ideal de crescimento 2oC - >100oC
40oC
pH ideal de crescimento 1 - 12 7
Capacidade de suportar altas pressões
sim não
atmosféricas
Capacidade de suportar altas salinidades sim não
 As bactérias podem ser classificadas por
várias características:

Fenotípicas X Genotípicas

FORMA TOLERÂNCIA AO O2:

COLORAÇÃO GRAM NUTRIÇÃO

Fonte de carbono Fonte de ATP Fonte de NADPH

autotróficas substrato
CO2 luz
fotolitotróficas inorgânico (NH4+)
autotróficas substrato substrato
CO2
quimiolitotróficas inorgânico (NH4+) inorgânico (NH4+)
heterotróficas compostos compostos
luz
fotoorganotróficas orgânicos (lactato) orgânicos (lactato)
heterotróficas compostos compostos compostos
quimioorganotróficas orgânicos (lactato) orgânicos (lactato) orgânicos (lactato)
As bactérias podem ter diversas formas:
Mas ocorrem com 3 formas fundamentais

 As esféricas são chamadas cocos (geralmente G+)

 Quando alongadas, recebem o nome de bacilos

(geralmente G-)

 Em formas helicoidais, em geral móveis, são

denominadas espirilos (não se coram bem pelo GRAM)
 Métodos fenotípicos

Cocos: De forma esférica ou subesférica (ex: Staphylococcus)

Bacilos ou Bastonetes : Em forma de bastonete (Ex: Bacillus)
Vibrios ou Vibriões : Em forma de vírgula (Ex: Vibrio)
Espirilos ou Espiroquetas : Em forma de espiral (Ex: Treponema e Leptospira)

Vibrios
Cocos
Espiroqueta
Bacilos ou Bastonetes
 Freqüentemente as células bacterianas
aparecem em grupos, e não isoladas.
Os cocos quando aparecem aos
pares, formam os diplococos

Quando dispostos em fileiras são

chamados streptococos

Quando aparecem como cachos de

uvas, denominam-se estafilococos

Os bastonetes podem raramente se apresentar em cadeia

ou na forma de diplobacilos, mas os espirilos somente se
apresentam isoladamente.
Morfologia Bacteriana (M.E.)
Todas as bactérias, com exceção dos micoplasmas,
apresentam uma parede rígida responsável pela forma
da célula e que a protege contra a ruptura. Apesar de
ser rígida e resistente, a parede é permeável, o que
facilita a nutrição da célula.
Uma das formas de classificar as bactérias é em função
da composição da parede bacteriana
A parede das bactérias Gram (+) é simples, formada por
uma espessa camada de peptidioglicano.
A parede das bactérias Gram (-) é mais complexa, pois
além da camada de peptidioglicano ser mais fina que as
Gram (+), apresenta uma camada de lipoproteínas e
outra de lipossacarídeos.
 GRAM +
Tem uma espessa camada de peptidioglicano (mureína) e duas
classes de ácidos teicoicos: Ácido Lipoteicóico que está na
superfície, próximo a camada de peptidioglicano e unido a
membrana citoplásmática e o da superfície da parede que se une
só a capa de peptidioglicano. O ácido Teicóico é responsavel pelo
determinante antigênico do organismo.
 GRAM -
Possui fina camada de peptidioglicano(mureína) unida a uma
membrana exterior por lipoproteínas. A membrana exterior é feita de
ptn, fosfolípidio e LPS. No LPS, a porção de lípideo está no interior do
fosfolípidio e o polisacárideo (antígeno O) está na superficie. O
Lipídeo se chama Lipídeo A e é tóxico, mas o LPS inteiro se chama
Endotoxina. A parede da célula possui poros chamados porinas que
transportam substâncias de baixo peso molecular. Entre a membrana
citoplasmática e a parede celular há um espaço periplásmico com
enzimas hidrolíticas, enzimas inativadoras de antibióticos e ptns de
transporte.
 Podemos diferenciar as bactérias em 2 grandes
grupos, segundo às propriedades de suas
paredes, através da coloração de GRAM:
Gram (-)
• Aparecem com cor avermelhada ao
microscópio óptico quando
submetidas a coloração e GRAM

Gram (+)
• Aparecem com cor arroxeada ao
microscópio óptico quando
submetidas a coloração e GRAM
Propriedades Tintoriais

•Gram-positivas
•Gram-negativas
•Bacilos álcool ácido resistentes -
BAAR
•Não se coram pelo Gram

Gram-negativas BAAR

Gram-positivas
 O Tamanho das bactérias
• As bactérias medem milésimos de milímetro ou
sejam os micrômetros (m), (microscopia ótica)
• Os vírus  dimensões inferiores a 0,2 m (limite
de visibilidade do microscópio ótico)  não
podem ser observados neste instrumento.
• A maioria das bactérias estudadas em
laboratório medem  0,5 a 1,0 por 2,0 a 5,0 m
 Morfologia Colonial

Lisa? Rugosa? Pigmentada? Côncava? Convexa?

Morfologia Colonial
Exigências nutricionais

Autotróficas x Heterotróficas
 Provas bioquímicas

Fermentação açúcar Citrato de sódio

Tipagem enzimática: enzimas do metabolismo

 Enzimas respiratórias
• Pesquisa da Catalase

 Metabolismo glicídico
A maioria das bactérias utiliza os hidratos de carbono
hidrolizando-os até à formação de ácidos com consequente
alteração do pH do meio. Em alguns casos essa hidrólise
conduz à formação de gases.
Enzimas extracelulares e toxinas

 Pesquisa de coagulase : a presença desta enzima indica

patogenicidade; na presença de plasma, os produtores de coagulase
(como o Staphylococcus aureus) vão desencadear os mecanismos da
coagulação.

 Pesquisa de enzimas hidrolíticas: esta prova tem a sua principal

aplicação na caracterização de espécies do género Streptococcus,
alguns dos quais elaboram enzimas hemolíticas
Sorotipagem

Microrganismos inertes às provas bioquímicas

Microrganismos de cultivo difícil

Fins epidemiológicos
Métodos genotípicos

1. Tamanho do DNA
2. Índice Crioscópico
3. Índice Citosina-Guanina (C+G)
4. Hibridização de DNA
5. Sondas moleculares: 50-100pb
6. Sequenciamento de DNA
7. Ribotipagem: RNAr 16S
8. Análise plasmidial
Nomenclatura binomial
• Atribuição de nomes científicos às espécies.

• Formado por duas palavras – o nome do gênero e o restritivo

específico (adjetivo que qualifica o gênero)

Ex:

Escherichia coli ou Escherichia coli

nome homenageia Theodor Escherich,
coli: lembra que habita o cólon humano ou intestino grosso.

Staphylococcus aureus ou Staphylococcus aureus

Staphylo (tipo de agrupamento) + coccus (forma esférica)
aureus (cor de ouro).
Staphylococcus sp. X Staphylococcus spp.
Fora da árvore Filogenética da
“vida”

Vírus
Vírus ciclo lítico
As bactérias são células procarióticas, possuindo
estruturalmente:
• parede celular
• membrana citoplasmática
• citoplasma com numerosos ribossomos
• Núcleo disperso (sem membrana nuclear)
E pode apresentar outras
estruturas como flagelos,
fímbrias, esporos, cápsulas
e também inclusões
citoplasmáticas
Membrana celular ou citoplasmática

• Constituída de lipídeos e proteínas,  semelhante a eucarióticos.

• membrana semi-permeável, seletiva, sede de várias enzimas,
limita o citoplasma.  transporte de íons e metabólitos (ex.
enzimas permeases e porinas)  também atua em numerosos
processos biossintéticos.

Citoplasma com núcleo disperso e numerosos ribossomos

• Uma área  citoplasmática , (granular e rica em RNA)  Uma

área cromatínica ou nuclear, (rica em DNA) e uma porção fluída
com nutrientes dissolvidos
• Na área citoplasmática junto com o RNA  partículas protéicas,
formando corpúsculos com cerca de 20nm de diâmetro 
ribossomas  Estes possuem enzimas que atuam na biossíntese
da célula.
• Na área cromatínica temos o cromossoma bacteriano formado
por DNA circular.
Flagelos
• Organelas especiais de locomoção responsáveis pela
mobilidade bacteriana.
• São representados por longos filamentos ondulados de 3-
12m e compostos por subunidades proteicas (flagelina)
Fímbrias
• Também conhecidas como pili  são apêndices
filamentosos encontrados em algumas bactérias Gram -,
mais finos, mais curtos e geralmente mais numerosos
que os flagelos, sem papel na mobilidade  funções:
• aderência à superfícies
• porta de entrada para material genético na conjugação
bacteriana.
Esporos
• São estruturas de “repouso” altamente
resistentes à agentes físicos e químicos,
formadas por certas bactérias (Bacillus e
Clostridium)  composição  alto teor de
cálcio associado ao ácido dipicolínico.
• A presença do ácido dipicolínico no esporo
está relacionado à desidratação, alta
resistência e termorresistência.
Cápsulas

• Envoltório viscoso que cerca a parede celular,

• ocorre somente em certas bactérias,
• natureza química,  maior parte polissacarídica, é
variada, e depende da espécie bacteriana.
• Fornece um envoltório protetor e também pode servir de
reservatório de alimentos armazenados e despejo de
escória, (????)
• Papel principal: virulência
de algumas bactérias patogênicas
e sua imunogenicidade.
Inclusões Citoplasmáticas

• Em algumas células identificam-se depósitos

concentrados de certas substâncias,
• Os grânulos podem conter diferentes materiais,
(dependendo da célula em questão).
• ex. grânulos de volutina (metacromáticos) –
metafosfatos e polifosfatos
• grânulos de amido, grânulos
polissacarídeos, etc...