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Controle Biológico 178 (2023) 105145

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Controle biológico

Página inicial do jornal:www.elsevier.com/locate/ybcon

Compostos voláteis produzidos por bactérias endofíticas afetam adversamente as


características de virulência deRalstonia solanacearum

Maryam Yousefvand, Behrouz Harighi*, Abdolbaset Azizi


Departamento de Proteção Vegetal, Faculdade de Agricultura, Universidade do Curdistão, Sanandaj, Irã

DESTAQUES

• Várias bactérias endofíticas foram identificadas comoBaciloespécies usando análise molecular.


• Bactérias endofíticas identificadas têm atividade antagônica contraRalstonia solanacearum.
• Essas cepas produzem VOCs com atividade antibacteriana.
• Esses VOCs inibiram as características de virulência deR. solanacearum in vitro.
• VOCs reduziram a incidência de murcha de batata causada porR. solanacearumem estufa.

ARTIGOINFO ABSTRATO

Palavras-chave: Neste estudo, investigamos os efeitos de compostos orgânicos voláteis (VOCs) produzidos por bactérias endofíticas
murcha bacteriana
pertencentes aoBacilogênero sobre as características de virulência deRalstonia solanacearumR32, o agente causal da murcha
Controle biológico
bacteriana da batata. Os resultados da análise de cromatografia gasosa-espectrometria de massa mostraram que as cepas
bactérias endofíticas
B. safensisHar267,B. pumilusFer469,B. zhangzhouensisKh690,B. aeriusKh867, eB. wiedmanniiAh945 capaz de produzir 10, 4,
Batata
18, 6 e 12 VOCs com alta qualidade, respectivamente. Todas as bactérias endofíticas produziram VOCs que reduziram
Ralstonia solanacearum
características de virulência
significativamente os sintomas de murchana planta, inibiu a população celular deR. solanacearumR32em vitro, e reduziu a
Compostos voláteis população de células tanto na parte aérea quanto nas raízes das plantas inoculadas em diferentes níveis. Os VOCs reduziram
significativamente a fixação deR. solanacearumCélulas R32 para tecidos radiculares de plantas de batata, bem como
motilidade quimiotaxica para extrato de raiz. Nossos resultados revelaram que os VOCs podem reduzir a motilidade de
enxame, natação, espasmos e formação de biofilme porR. solanacearumR32 que são importantes para a patogenicidade. A
análise de microscopia eletrônica de varredura revelou várias anormalidades morfológicas noR. solanacearumCélulas R32
expostas aos VOCs produzidos porB. safensisHar267 eB. aeriuscepas Kh867. Os resultados apresentados neste estudo
mostraram que os VOCs produzidos por bactérias endofíticas investigadas podem reduzir a doença da murcha bacteriana. A
investigação dos mecanismos das atividades de biocontrole aumenta nosso conhecimento para projetar melhores métodos
para controlar patógenos bacterianos.

1. Introdução 2014). Após a infecção das plantas,R. solanacearummultiplica e produz


exopolissacarídeos e outros fatores de virulência resultando no desenvolvimento
Ralstonia solanacearumcomo uma bactéria transmitida pelo solo causa a doença de dos sintomas de murcha (Genin e Denny, 2012). Dentro dos vasos do xilema,
murcha vascular em mais de 200 espécies de plantas em todo o mundo e foi classificada algunsR. solanacearumas células usam motilidade contraída para se mover ao
como o segundo patógeno bacteriano mais importante (Peeters e outros, 2013). Para longo da parede do vaso (Liu e outros, 2001).
localizar as raízes das plantas, as células bacterianas exigiam detecção, quimiotaxação e A murcha vascular é conhecida como um dos fatores mais limitantes no
motilidade flagelar em relação aos exsudatos das raízes.Tans-Kersten et al., 2001; Yao e cultivo de plantas de batata em todo o mundo.Elfinstone, 2005). A ampla
Allen, 2006).R. solanacearumAs células aderem à superfície da raiz através da produção gama de hospedeiros do agente causal e a adaptabilidade para sobreviver
de exopolissacarídeos, entram nas raízes através de feridas ou aberturas naturais e, em várias condições ambientais por longos períodos tornam o controle
finalmente, atingem os vasos do xilema.Dalsing e Allen, muito difícil. O manejo da doença com diferentes estratégias

* Autor correspondente.
Endereço de email:bharighi@uok.ac.ir (B. Harighi).

https://doi.org/10.1016/j.biocontrol.2022.105145
Recebido em 22 de novembro de 2022; Recebido no formulário revisado em 20 de dezembro de 2022; Aceito em 29 de dezembro de 2022
Disponível online em 7 de janeiro de 2023
1049-9644/© 2022 Elsevier Inc. Todos os direitos reservados.
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incluindo métodos físicos, químicos, culturais e biológicos tem sido ACG GTT ACC TTG TTA CGA CTT-3′, posição 1512–1492 (Escherichia coli)] (
extensivamente investigado.Yuliar et al., 2015). Nenhum método de controle Weisburg e outros, 1991), egyrBgene usando primersgyrBF (5′- TTA TCT ACG
parece ser completamente adequado contra a murcha bacteriana. Nesse sentido, ACC TTA GAC G − 3′) egyrBR (5′- TAA ATT GAA GTC TTC TCC G − 3′) com base
o controle biológico utilizando bactérias com atividade antagônica parece ser um no método descrito anteriormente (Liu e outros, 2013). Os produtos de PCR
método seguro e de baixo custo para o manejo da murcha bacteriana.Álvarez et foram sequenciados usando um sequenciador de DNA ABI3730XL (Applied
al., 2019). Vários estudos indicaram o potencial de bactérias como agentes de Biosystems). O16S rRNAegyrBas sequências de genes obtidas foram
controle biológico, incluindo cepas não patogênicas de alinhadas e ajustadas manualmente quando necessário usando o software
R. solanacearum, rizobactérias promotoras do crescimento de plantas e bactérias BioEdit Sequence Alignment Editor 7.0.9.0 (Salão, 2011). As comparações de
endofíticas no controle da murcha bacteriana (Yuliar et al., 2015). sequências foram realizadas com outras sequências depositadas no banco
Bactérias endofíticas colonizam plantas internamente como patógenos de dados NCBI usando o programa BlastN. A análise filogenética de Máxima
de plantas e podem ter o potencial de competir e suprimir a virulência de Verossimilhança foi realizada usando o software MEGA versão 6.0 (Tamura e
organismos patogênicos.Rosenblueth e Martinez-Romero, 2006). O outros, 2013) e uma árvore filogenética foi construída (foi realizada análise
crescente interesse em bactérias endofíticas para o controle de doenças de de bootstrap com 1000 réplicas).
plantas é baseado em sua capacidade de ser biologicamente ativo contra o
patógeno por meio da competição pela absorção de nutrientes, antibiose, 2.3. Efeito dos VOCs no desenvolvimento da murcha
produção de sideróforos, produção de enzimas e/ou indução de resistência
sistêmica.Compant et al., 2005). Os tubérculos de batata (cultivar Sprite) foram semeados em vasos de
Foi relatado que as bactérias produzem e liberam vários compostos plástico contendo solo esterilizado a vapor (composto por 50% de areia, 20%
orgânicos voláteis (VOCs) com atividades biológicas significativas, incluindo a de argila, 30% de turfa, pH 7,2). A suspensão deR. solanacearumCélulas R32
inibição do crescimento de fitopatógenos.Garbeva e Weisskopf, 2020). VOCs com ou sem exposição aos VOCs de cepas de bactérias endofíticas por três
são definidos como pequenas moléculas menores que 300 Dalton com baixo dias a 28–30◦C foi preparado em água estéril (densidade de cerca de 1×108
ponto de ebulição e alta pressão de vapor. Essas moléculas podem se UFC. ml−1). As hastes das mudas de batata foram pontuadas com palito
espalhar facilmente no ambiente mesmo a distâncias (Chowdhury e outros, estéril e 50µL foi inoculado (entre o terceiro e o quarto internódio) usando
2019). A atividade antibacteriana direta de VOCs bacterianos foi relatada. uma seringa estéril. As plântulas foram incubadas em casa de vegetação
Muitos agentes de biocontrole comoPseudomonaseBaciloEspécies têm sido (85% de umidade, 28–30◦C, fotoperíodo 12h/12h dia/noite). O relativo da
relatadas como emissoras de VOCs com ações antibacterianas contra incidência da doença e eficácia do biocontrole foi calculado usando a
patógenos bacterianos de plantas.Rajer et al., 2017; Xie e outros, 2018). Foi seguinte fórmula (Kheirandish e Harighi, 2015).
demonstrado que os VOCs emitidos porBacillus amyloliquefaciensSQR-9 e Incidência da doença = (número de folhas murchas por vaso/ número total de
Pseudomonas fluorescens WR-1 pode reduzir as características de virulência folhas por vaso)×100.
deRalstonia solanacearum(Raza et al., 2016a; Raza et al., 2016b). Além disso, Eficácia do biocontrole = [(incidência da doença nos vasos de controle - incidência da
VOCs liberados porBacilo spp. foram encontrados para ter efeitos inibitórios doença nos vasos tratados com antagonista)/incidência da doença no controle]×
e causar anormalidades morfológicas emR. solanacearumcélulas (Tahir et 100. Vasos tratados com antagonista e controle incluem plântulas
al., 2017). Além disso, foram relatados os efeitos de VOCs bacterianos na inoculadas com patógeno bacteriano não exposto ou pré-exposto com
indução de resistência sistêmica em plantas. VOCs produzidos porBaciloe VOCs, respectivamente.
Pseudomonas cepas demonstraram melhorar a resistência em plantas As plantas inoculadas foram então cortadas acima do solo, o peso fresco dos
contra Erwinia carotovorasubesp.carotovoraeR. solanacearm(Ryu et al., brotos foi medido e depois secos em estufa a 80◦C por 72 h e o peso seco foi
2004; Tahir et al., 2017; Kashyap et al., 2022). medido. Os experimentos em casa de vegetação foram conduzidos em arranjo
Os principais objetivos do presente estudo foram identificar bactérias fatorial em delineamento inteiramente casualizado com três repetições e três
endofíticas como potenciais agentes antagonistas contraR. solanacearumR32, experimentos individuais. Plantas inoculadas com não expostasR. solanacearum
avaliar os efeitos dos VOCs produzidos por essas bactérias endofíticas na taxa de R32 e água estéril foram usados como controle positivo e negativo,
crescimento, alteração estrutural e características de virulência, como motilidade, respectivamente. A análise dos dados foi realizada usando o programa de
quimiotaxia, fixação e formação de biofilme. Além disso, os principais VOCs software SAS e a comparação das médias foi feita com o teste da diferença
produzidos por bactérias endofíticas contraR. solanacearumR32 foram mínima significativa (Duncan) a um nível de probabilidade de 5%.
identificados usando cromatografia gasosa-espectrofotometria de massa (GC-MS).
2.4. Avaliação da atividade antibacteriana de VOCs produzidos por
bactérias endofíticas
2. Materiais e métodos
A atividade antibacteriana dos VOCs contraR. solanacearumR32 foi
2.1. Cepas bacterianas e condições de crescimento avaliado em meio de casaminoácido-peptona-glicose (CPG) usando
placas divididas. O crescimento noturno das bactérias endofíticas
As bactérias endofíticas previamente isoladas das diferentes plantas, (ajustado para a concentração de cerca de 1×108UFC.mL−1) foi semeada
bem comoRalstonia solanacearumR32 (GenBank Acc. Nº OP713766), que em um compartimento da placa, enquanto o outro compartimento foi
exibiu doença de murchamento em plantas de batata obtidas do inoculado pontualmente com 50µL do patógeno (1×107UFC.mL−1). No
departamento de proteção de plantas, Universidade do Curdistão foram controle, o patógeno foi cultivado sozinho. As placas foram seladas
usados neste estudo. Consequentemente, as bactérias endofíticas e o com parafilme e então incubadas a 28–30◦C por 3 dias. A partir daí, a
patógeno bacteriano foram cultivados em ágar nutriente (NA) ou cloreto de população celular doR. solanacearumR32 foi medido por placa (Tahir et
trifeniltetrazólio (TTC), respectivamente, e depois armazenados a 4–6◦C como al., 2017). Três repetições foram realizadas para cada tratamento.
estoque de trabalho ou cultivado em meio de caldo nutritivo (NB) por 24 h a
26–28◦C com agitação. Por fim, glicerol estéril foi adicionado à concentração 2.5. Efeito de VOCs na colonização de R. solanacearum R32
final de 20% e armazenado a - 20◦C para armazenamento a longo prazo.
As bactérias endofíticas (1×108UFC.mL−1) foi espalhado em um
2.2. Identificação molecular das bactérias endofíticas compartimento da placa dividida contendo meio Nutrient Agar (NA),
enquanto o outro compartimento (meio CPG) foi inoculado com 50µL doR.
Cepas bacterianas endofíticas foram identificadas por sequenciamento solanacearumR32 (1×107UFC.mL−1). As placas foram então incubadas a
parcial de nucleotídeos do16S rRNAgene usando PCR com dois primers 28-30◦C por 48 horas, oR. solanacearumAs células R32 foram suspensas em
universais, fD2 (5′-AGA GTT TGA TCA TGG CTC AG-3′, posição 8–27) e rP1 [5′- água destilada estéril, a concentração ajustada para

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108UFC.mL−1com um espectrofotômetro, e 1 mL foi adicionado a cada pote 108UFC.mL−1) foi semeada em meio NA. Para os ensaios de motilidade de natação
contendo tubérculos de batata previamente preparados conforme descrito na e espasmos, 2µL de preparado na horaR. solanacearumR32 foi manchado em
seção 4.2. Potes sem suspensão bacteriana servem como controles. Os vasos placas contendo meio CPG mais 0,2 e 1,6% de ágar, respectivamente. Nas demais
foram mantidos em casa de vegetação com ciclo claro/escuro de 12:12 h a 28–30◦C placas, 30µL das bactérias endofíticas foram semeadas em meio NA e ambas as
e irrigados com água estéril em intervalos de dois dias. Após 28 dias, raízes e placas foram colocadas em lados opostos. Em seguida, todas as placas foram
brotos foram selecionados, esterilizados superficialmente com hipoclorito de seladas com parafilme e incubadas a 26–28◦C. Os diâmetros dos halos de
sódio a 1% por 3 a 5 minutos e lavados várias vezes com água estéril. Os tecidos enxameação, natação e motilidade espasmódica foram medidos a cada intervalo
vegetais foram então homogeneizados assepticamente com um pilão e almofariz de 12 h. Para a motilidade espasmódica, a morfologia das bordas da colônia foi
em 1 mL de água destilada esterilizada. Alíquotas de 50µL foram espalhados em observada usando um microscópio de luz. O experimento foi feito em três
meio CPG, incubados a 26–28◦C por 48 h, e as colônias foram contadas como repetições (Tahir et al., 2017).
UFC.g−1de tecidos vegetais frescos. Todos os experimentos foram repetidos três
vezes com três repetições independentes. 2.10. ensaio de quimiotaxia

2.6. Ensaio de fixação da raiz de batata Bactérias endofíticas foram semeadas em um compartimento das placas
divididas contendo meio NA conforme descrito anteriormente. No outro
R. solanacearumSuspensões de células R32 com ou sem exposição a compartimento, meio tampão de quimiotaxia (0,1 mM EDTA, 10 mM K2HPO4,
VOCs de bactérias endofíticas por 72 h a 26–28◦C foram preparados (ajustados ágar 0,35%, pH 7,2) foi preparado, o orifício de 5 mm do meio foi removido
para cerca de 1×107UFC.mL−1). Posteriormente, raízes de batata não feridas foram e, em seguida, preenchido novamente com 50µL de extrato de raiz de batata
submersas em suspensões de patógenos por 1 h. Em seguida, os segmentos (cultivar Sprite). Então, preparado na horaR. solanacearumAs células R32
radiculares inoculados foram colocados individualmente em 15 mL de água foram inoculadas no local a uma distância de 15 mm do orifício. As placas
destilada estéril. Após agitação por 10 s, o excesso de água foi removido foram seladas com parafilme e então incubadas a 28–30◦C. O movimento do
suavemente. Um grama foi separado das pontas das raízes e triturado, diluído R. solanacearumAs células R32 em direção ao extrato da raiz foram medidas
seriadamente em água destilada estéril e semeado para quantificar UFC.g−1da raiz por contagem de CFU.mL−1da célula em meio CPG. Este experimento foi
(Dalsing e Allen, 2014). Três repetições foram consideradas para cada tratamento. realizado em três repetições (Tahir et al., 2017).

2.11. Microscopia eletrônica de varredura (MEV)


2.7. Efeito de VOCs na produção de EPS por R. solanacearm
A microscopia eletrônica de varredura (MEV) foi conduzida para observar
Extração e quantificação de EPS foram realizadas usando o método mudanças morfológicas externas noR. solanacearumCélulas R32. Células
descrito anteriormente (Dubois e outros, 1956). Resumidamente, o bacterianas com ou sem exposição aos VOCs de bactérias endofíticas por
R. solanacearumCélulas R32 com e sem exposição aos VOCs de bactérias dois dias a 26–28◦C foram coletados em tubos Eppendorf, lavados com água
endofíticas por 72 h foram suspensas em água destilada esterilizada e destilada esterilizada e centrifugados (10 min, 3600g, 4◦C). Em seguida, as
agitadas a 40◦C por meia hora para solubilizar o EPS presente na solução e células peletizadas foram espalhadas na lâmina limpa. Após fixação em
depois centrifugar a 12.000gpor 10 min. Em seguida, dois volumes de etanol solução de glutaraldeído 2,0% por 2 h em temperatura ambiente, a amostra
gelado foram adicionados ao sobrenadante coletado e incubados a 4◦C por foi lavada duas vezes com água destilada esterilizada. A desidratação
24h. O EPS precipitado foi obtido por centrifugação a 12.000gpor 10 min a 4◦ seriada foi feita em soluções de etanol de 20%, 40%, 60%, 80% e 100% por
C, dissolvido em água destilada esterilizada e após dois dias, o teor de EPS 10 minutos cada vez, seguida de etanol 100% por 1 hora. As amostras foram
foi quantificado pelo método fenol-ácido sulfúrico. Esses experimentos então colocadas a -20◦C durante a noite seguido pelo processo de liofilização
tiveram três réplicas. a - 40◦C por 3h. Finalmente, as amostras foram revestidas com ouro e
micrografias eletrônicas foram feitas usando um sistema TSCAN SEM (TSCAN
2.8. Ensaio de formação de biofilme SEM, TSCAN, Tchecoslováquia).

A capacidade de formação de biofilme deR. solanacearumCélulas R32 com ou 2.12. Identificação de VOCs produzidos por bactérias endofíticas usando
sem exposição aos VOCs de bactérias endofíticas foram testadas em tubos de GC–análise MS
polipropileno. Crescimento noturno de cepas bacterianas endofíticas (1×108
UFC.mL−1) foram preparados e 10 μL foram cultivados em um compartimento das Para coletar os VOCs produzidos por cada bactéria endofítica, foi
placas divididas contendo meio NA. No outro compartimento, um microtubo utilizada uma placa de três compartimentos. Um compartimento contendo
contendo 190 μL de meio caldo CPG que foi inoculado com 10 μL deR. meio NA foi semeado com 100µL (1×108UFC.mL−1) crescimento recente de
solanacearumR32 (1×107UFC.mL−1) foi colocado verticalmente. As placas foram cada bactéria endofítica, e o segundo compartimento contendo meio CPG
então seladas com parafilme e mantidas a 28–30◦C por 48h. Em seguida, 25 μL de foi inoculado com 5µL (1×107UFC.mL−1) de
solução de cristal violeta a 1% foram adicionados a cada tubo e mantidos em R. solanacearumR32, e no terceiro compartimento foi colocado 0,3 g de
temperatura ambiente por 15 minutos. Em seguida, os tubos foram lavados duas carvão ativado estéril para adsorver os VOCs. Além disso, o mesmo desenho
vezes com tampão fosfato. Posteriormente, 2 ×200 μL de etanol 95% foram experimental sem bactérias endofíticas foi usado como controle.
adicionados a cada tubo, o volume resultante foi levado a 1 mL com água Posteriormente, as placas foram seladas com parafilme e incubadas a 28–30
destilada estéril e a absorbância foi medida a 540 nm usando um ◦C por 72h. Em seguida, as armadilhas de carvão ativado foram transferidas

espectrofotômetro (SPECORD 210, Analytik Jena, Alemanha). O experimento foi para frascos de vidro e acetato de etila (1: 1,25 W/V) foi adicionado. Os VOCs
conduzido em delineamento inteiramente casualizado com três repetições ( adsorvidos foram extraídos por agitação por 20 min, seguido de
O'Toole e Kolter, 1998). centrifugação (2500g, 5 min) e os sobrenadantes foram analisados usando
um dispositivo de cromatografia gasosa conectado a um espectrômetro de
2.9. Comportamentos de motilidade de enxame, natação e espasmos massa (Agilent 7890B GC System / 5977A MSD).
Um microlitro da amostra coletada foi injetado na coluna HP-5 ms
Para o ensaio de motilidade de enxame, crescimento durante a noite de (30 m×0,25 mm, 0,25µm), a temperatura inicial da coluna foi fixada em
R. solanacearumR32 (concentração aproximada de 107UFC.mL−1) foi 60◦C, que foi então aumentado para 260◦C a uma taxa de 7◦C.min−1, e
preparado e 2µL foi colocado em um compartimento das placas divididas mantida por 5 min. O espectrômetro de massa foi operado no modo de
contendo meio CPG mais 0,7% de ágar. No outro compartimento, 30µL das ionização de elétrons a 70 eV, com varredura contínua de 50 a 550m/z.
bactérias endofíticas (concentração aproximada de Gás de arraste hélio com pureza de 99,999%, pressão de 34 psi e

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taxa de fluxo de 1 mL.min−1foi utilizado nesta fase. Os compostos foram foi construída uma árvore filogenética que mostra a posição da cepa
identificados comparando seus espectros de massa com os bancos de dados do entre as cepas-tipo dos gênerosBaciloespécies (Figura 1).
dispositivo, incluindo os bancos de dados do National Institutes of Standards and
Technology (NIST) e Wiley, juntamente com a comparação dos índices de inibição 3.2. Efeito de VOCs no desenvolvimento da doença da murcha bacteriana
e o padrão de falha relatado para eles (Dewanjee e outros, 2015).
A análise estatística revelou diferenças significativas entre os
2.13. Análise estatística tratamentos quanto à inibição do desenvolvimento da murcha (F = 848,34; P
<0,0001) porR. solanacearumR32 exposto a VOCs produzidos por bactérias
Os dados de cada experimento foram avaliados estatisticamente por meio de endofíticas em comparação com o controle (tabela 1). Os resultados obtidos
análise de variância (ANOVA), seguida de diferença menos significativa (LSD) e revelam que os VOCs produzidos pelas cepasB. wiedmanniiAh945 eB.
teste de Duncan (P=0.05), empregando SAS ver. software 9.1. Todos os zhangzhouensisKh690 com cerca de 100% teve os maiores efeitos
experimentos foram conduzidos em delineamento inteiramente casualizado. decrescentes no desenvolvimento da murcha porR. solanacearumR32 (
Gráficos e figuras foram plotados usando o programa Excel. Figura 2DE ANÚNCIOS). A análise estatística revelou diferenças significativas
entre os tratamentos quanto ao aumento da massa fresca (F = 21,55; P<
3. Resultados 0,0001) e peso seco (F = 6,18; P = 0,0025) de brotos em planta inoculada por
R. solanacearumR32 exposto a VOCs produzidos por bactérias endofíticas
3.1. Identificação das bactérias endofíticas em comparação com o controle não tratado (tabela 1). DeformaçãoB.
zhangzhouensisKh690 eB. wiedmanniiAh945 com cerca de 81% e 79%, teve
As sequências de nucleotídeos obtidas foram submetidas ao banco de dados os maiores efeitos de aumento no peso fresco da parte aérea (Figura 2B). Da
de sequências de nucleotídeos do NCBI sob os números de acesso OP217053- mesma forma, cepasB. zhangzhouensisKh690 eBacillus wiedmanniiAh945
OP217057 e OP267569-OP267573 para o16S rRNAegyrBgenes, respectivamente. com cerca de 49% e 43%, teve os maiores efeitos de aumento no peso seco
Resultados do sequenciamento parcial de nucleotídeos do16S rRNAe gyrBgenes da parte aérea (Figura 2C).
revelaram que cepas bacterianas endofíticas agrupadas no Bacilogênero. Os
resultados da pesquisa Blast revelaram que as cepas Har267, Fer469, Kh690, 3.3. Atividade antibacteriana de VOCs contra R. solanacearum R32
Kh867 e Ah945 tinham 99-100% de similaridade comB. safensis, B. pumilus, B.
zhangzhouensis, B. aerius,eB. wiedmannii,respectivamente. O De acordo com a análise estatística, diferenças significativas foram

Figura 1.Árvore filogenética de parciais16S rRNAegyrBsequências de genes que mostram a posição de cepas de bactérias endofíticas (mostradas em negrito), além de cepas de
referência selecionadas taxonomicamente semelhantes. A análise foi realizada pelo método de Máxima Verossimilhança com modelo de cálculo Tamura-Nei no MEGA versão 6.0. A
barra de escala representa o número de substituições por site. Os números nos pontos de ramificação indicam o valor de bootstrap derivado de 1.000 réplicas.

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tabela 1 e a colonização radicular foi avaliada quantitativamente (CFU.g−1de tecidos


Efeito de VOCs produzidos por bactérias endofíticas no desenvolvimento da murcha por vegetais). A análise estatística revelou diferenças significativas entre os
Ralstonia solanacearumR32 em condições de casa de vegetação e análise de variância tratamentos em relação à raiz (F = 65,55; P<0,0001) e colonização de brotos
(ANOVA) dos dados. (F = 20,26; P<0,0001) porR. solanacearumR32 exposto a VOCs produzidos por
Média do Quadrado bactérias endofíticas em comparação com o controle (mesa 2). Nas raízes,
Fonte de df controle biológico Peso fresco de Peso seco de estirpesBacillus wiedmanniiAh945 e
variação atividade (%) tiro (g) tiro (g) B. zhangzhouensisKh690 com 95% apresentou os maiores efeitos de
redução seguido porB. aeriusKh867,B. safensisHar267, eB. pumilusFer469
Har267 11.67b 17.23b 3.48abc
Fer469 6.67b 11.61b 2.11c com efeitos de redução de 56% e 50%, respectivamente (Fig. 3B). Além disso,
Kh690 100a 47,97a 4,93a nossa descoberta revelou que VOCs produzidos por cepasB. wiedmannii
Kh867 3.71b 11.03b 2.38bc Ah945 eB. zhangzhouensisKh690 diminuiu as populações de
Ah945 100a 44.04a 4.46ab
R. solanacearumR32 para cerca de 80,32%, seguidoB. safensisHar267,
Ctrl+ 0b 9.51b 2.54bc
Ctrl- 100a 36,79a 4.30ab B. pumilusFer469, eB. aeriusKh867 em 49% de efeito de redução em brotos em
Tratamento 6 7688,66* 851,30* 3,86* comparação com o controle não exposto (Fig. 3C).
Erro 14 22.07 89,50 0,63
valor F 848,34 21h55 6.18
CV (%) 8,70 14.69 12.91 3.5. Efeito de VOCs de bactérias endofíticas na fixação radicular de R.
solanacearum R32
* Significativo ao nível de 5% de probabilidade; df = Graus de Liberdade; CV = coeficiente de
variação; A significância entre as médias de tratamento é apresentada como as diferentes letras
A habilidade deRalstonia solanacearumCélulas R32 pré-expostas a VOCs
minúsculas. Os dados são apresentados como a média de três réplicas.
de bactérias endofíticas para se ligarem às raízes de plantas de batata
(cultivar sprite) foram investigadas. Com base nos resultados da ANOVA,
encontrado entre os tratamentos em termos de redução da população de células
existiram diferenças significativas entre todos os tratamentos (F = 29,37; P<
(F = 77,73; P<0,0001) doR. solanacearumR32 exposto a VOCs produzidos por
0,0001) (mesa 2). A maior inibição pertenceu aB. wiedmanniiAh945 e
bactérias endofíticas em comparação com o controle (mesa 2).
B. zhangzhouensisKh690 com 95,99% e 91,03%, respectivamente,
Todas as bactérias endofíticas reduziram significativamente a população
seguido porB. pumilusFer469 (56,36%), B. aeriusKh867 (53,96%) e
celular doR. solanacearumR32 em vários níveis em comparação com o
B. safensisHar267 (45,31%) em comparação com o controle (Fig. 4A).
controle. DeformaçãoB. zhangzhouensisKh690,B. wiedmanniiAh945, eB.
safensis Har267 com cerca de 45,34%, 44,76% e 43,02% de redução da
população de células, respectivamente, apresentou o maior efeito, seguido 3.6. Efeito de VOCs na produção de EPS e biofilme por R. solanacearum
porB. pumilusFer469, eB. aeriusKh867 com reduções de 28,48%% e 34,30%, R32
respectivamente (Fig. 3A).
Com base nos resultados da ANOVA, existem diferenças significativas entre os
tratamentos em termos de produção de EPS porR. solanacearumR32 (F = 27536,4;
3.4. Efeito de VOCs na colonização de R. solanacearum R32 P<0,0001) (mesa 2). Os VOCs produzidos pelas cepas Ah945 e Kh690 mostraram
um efeito negativo significativo, enquanto a diminuição na produção de EPS foi de
Vinte e oito dias após o tratamento das mudas de batata com 55,51% e 44,38%, respectivamente, após a exposição aos VOCs em comparação
R. solanacearumCélulas R32 expostas a VOCs de bactérias endofíticas, parte aérea com o controle (Fig. 4B).

Figura 2.Efeitos de VOCs produzidos porB. safensisHar267,B. pumilusFer469,B. zhangzhouensisKh690,B. aeriusKh867, eB. wiedmanniiAh945 em (a) incidência da doença,
(b) peso fresco da parte aérea, (c) peso seco da parte aérea e (d) plantas de batata inoculadas representativas porR. solanacearumR32 comparado ao controle não exposto
(Ctrl+) ou inoculado por água estéril (Ctrl-). As barras de erro indicam o SE das três réplicas. Letras diferentes indicam diferenças significativas (P =0,05).

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mesa 2
Efeito de VOCs produzidos por bactérias endofíticas na população celular, colonização de raízes e brotos, fixação e produção de exopolissacarídeos (EPS) de
R. solanacearumR32 e análise de variância (ANOVA) dos dados.
Média do Quadrado

Fonte de df Atividade antibacteriana (OD600 Colonização (CFU×107/g de Colonização (CFU×104/g de Anexo (CFU×104/g de raiz) EPS
variação nm) raiz) broto) (µg/ml/
OD)

Har267 0,98c 80b 3b 17.7b 1,98a


Fer469 1.24b 83b 2.9b 14.2b 1,68b
Kh690 0,94c 7.8c 1.2c 2.9c 1.09c
Kh867 1.13b 71b 3b 14.9b 2.01a
Ah945 0,96c 8.8c 1.2c 1.3c 0,88d
Ctrl 1,73a 160a 5.8a 32.4a 1,97a
Tratamento 5 0,269** 9.35** 846952338** 3.842** 0,740**
Erro 12 0,0034 1.427 41.797.055 1.308 0,000026
valor F 77,73 65,55 20.26 29.37 27536.4
CV (%) 5.07 17.52 22.77 19,98 0,32

* * Significativo ao nível de 1% de probabilidade; df = Graus de Liberdade; CV = coeficiente de variação; A significância entre as médias de tratamento é apresentada como as diferentes letras
minúsculas. Os dados são apresentados como a média de três réplicas.

Figura 3.Efeitos de VOCs produzidos porB. safensisHar267,B. pumilusFer469,B. zhangzhouensisKh690,B. aeriusKh867, eB. wiedmanniiAh945 na população celular de
R. solanacearumR32 (a) em ensaio de cultura dupla, (b) raízes de batata inoculadas e (c) brotos de batata inoculados em comparação com o controle não exposto (Ctrl). As barras de erro
indicam o SE das três réplicas. Letras diferentes indicam diferenças significativas (P = 0,05).

Figura 4.Efeitos de VOCs produzidos porB. safensisHar267,B. pumilusFer469,B. zhangzhouensisKh690,B. aeriusKh867, eB. wiedmanniiAh945 em (a) fixação radicular, (b)
produção de exopolissacarídeo (EPS) e (c) formação de biofilme deR. solanacearumR32 em comparação com o controle não exposto (Ctrl). As barras de erro indicam o SE
das três réplicas. Letras diferentes indicam diferenças significativas (P = 0,05).

Conforme apresentado emTabela 3, o resultado da ANOVA mostrou diferença entre os tratamentos na enxameação (F = 7,93; P<0,0001), natação (F = 9,20;
significativa entre todos os tratamentos na produção de biofilme por P<0,0001) e espasmos (F = 7,22; P<0,0001) avaliações de motilidade (Tabela 3
R. solanacearumR32 comparado com o controle não exposto (F = 5,23; P = ). Nossa descoberta revelou que a motilidade de enxame deR. solanacearum
0,0089). Os VOCs produzidos por bactérias endofíticas revelaram um efeito Células R32 expostas a VOCs de cepas bacterianas endofíticas foram
de inibição significativo na formação de biofilme porR. solanacearum R32.O significativamente inibidas após 72 h. Conforme ilustrado em Fig. 5A e B, as
resultado indica diminuição de 58,80% e 53,84% na formação de biofilme cepasB. safensisHar267,B. zhangzhouensisKh690, eB. aeriusKh867 com uma
porR. solanacearumR32 exposto a VOCs deB. wiedmannii Ah945 eB. média de 4,4, 4,5 e 4,8 mm, respectivamente, mostrou os maiores efeitos de
zhangzhouensiscepas Kh690, respectivamente (Fig. 4C). inibição deR. solanacearumCélulas R32 em comparação com o controle com
uma média de 6 mm.
3.7. Efeito de VOCs nos comportamentos de motilidade de R. solanacearum R32 Correspondentemente, os VOCs produzidos porB. zhangzhouensisKh690,
B. aeriusKh867, eB. wiedmanniiAh945 inibiu a motilidade natatória deR.
De acordo com a análise estatística, existem diferenças significativas solanacearumR32 a 14,5, 15,4 e 16,7 mm, respectivamente

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Tabela 3
Efeito de VOCs produzidos por bactérias endofíticas na motilidade de natação, enxame, espasmos, formação de biofilme e quimiotaxia deR. solanacearumR32 e análise de variância
(ANOVA) dos dados.

Média do Quadrado

Fonte de variação df Zona de enxame (mm) Zona de natação (mm) Zona de contração (mm) quimiotaxia biofilme
(107UFC/ml) (OD540nm)

Har267 4.4d 17.6b 5.8b 6.4b 0,66ab


Fer469 5.3b 17.3b 5.6b 5.8b 0,67ab
Kh690 4.5d 14.5d 4.4c 4.6b 0,48b
Kh867 4.8cd 15.4cd 5.5b 5.4b 0,73ab
Ah945 5.2bc 16.7bc 5.8b 1.3c 0,48b
Ctrl 6.0a 21.3a 6.6a 9.2a 1.04a
Tratamento 5 0,044** 0,73** 0,033** 9.574** 0,12**
Erro 12 0,005 0,079 0,004 6.971 0,024
valor F 7,93 9.20 7.22 13.73 5.23
CV (%) 14.66 16.42 12.02 13,99 15

* * Significativo ao nível de 1% de probabilidade; df = Graus de Liberdade; CV = coeficiente de variação; A significância entre as médias de tratamento é apresentada como as diferentes letras
minúsculas. Os dados são apresentados como a média de três réplicas.

Figura 5.Efeitos de VOCs produzidos porB. safensisHar267,B. pumilusFer469,B. zhangzhouensisKh690,B. aeriusKh867, eB. wiedmanniiAh945 na motilidade de enxame deR.
solanacearumR32 em comparação com o controle não exposto (Ctrl). O diâmetro da zona de motilidade (a) e a placa representativa do ensaio de motilidade de enxame (b) foram
mostrados. Três réplicas foram usadas para cada tratamento. As barras de erro indicam o SE das três réplicas (P = 0,05).

Figura 6.Efeitos de VOCs produzidos porB. safensisHar267,B. pumilusFer469,B. zhangzhouensisKh690,B. aeriusKh867, eB. wiedmanniiAh945 na motilidade natatória deR. solanacearum
R32 em comparação com o controle não exposto (Ctrl). O diâmetro da zona de motilidade (a) e a placa representativa do ensaio de motilidade natatória (b) foram mostrados. Três
réplicas foram usadas para cada tratamento. As barras de erro indicam o SE das três réplicas (P = 0,05).

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