Estrutura Molecular

Muitos qumicos estavam convencidos de que os tomos existiam mesmo antes do desenvolvimento destas tcnicas sofisticadas fornecerem evidncias irrefutveis. No sculo XIX, quando as composies de incontveis compostos estavam sendo determinadas, foi encontrado que em certos casos compostos diferentes possuam a mesma composio qumica. Assim, a composio C 3H4 foi encontrada para dois compostos orgnicos inteiramente diferentes (como determinado por suas propriedades fsicas e qumicas) - o propino e o propadieno. Resolutos em suas anlises, os qumicos foram forados a concluir que os dois compostos diferem na maneira como seus tomos se ligam. Assim, a noo de estrutura molecular (isto , o arranjo dos tomos no espao) adentrou na qumica e, por conseqncia, suportou a viso de que os tomos eram reais. Em termos modernos, estes compostos so representados por:

Quase que ao mesmo tempo (em 1860), um aspecto mais sutil da estrutura atmica tornou-se aparente - o da disposio espacial tridimensional dos tomos nas molculas. O conceito da estrutura molecular iniciou-se com a evidncia de que os tomos possuiam diferentes ligantes em diferentes posies a despeito de suas composies qumicas serem as mesmas (como nas duas estruturas correspondentes frmula C3H4). Esta uma distino topolgica, isto , baseada em qual tomo ligado em qual outro tomo. A distino adicional introduzida geomtrica, referindo-se disposio espacial dos tomos. Como um exemplo deste tipo de distino, o composto diclorometano (CH2Cl2) pode ser considerado.

A estrutura topolgica da molcula :

com os tomos de hidrognio e cloro ligados a um tomo central de carbono. Foi observado que existe apenas um composto como este. O resultado desta observao foi que a molcula no poderia ser planar porque, se este fosse o caso, seriam encontradas duas molculas diferentes com a frmula CH2Cl2:

O fato de existir apenas um diclorometano sugeria que suas molculas eram tetradricas, porque qualquer que fosse o arranjo dos quatro tomos de cloro e hidrognio ligados ao tomo central de carbono, a molcula seria idntica (desconsiderando-se sua orientao no espao, que era irrelevante)

Com observaes como estas, a noo de geometria molecular assimilou-se qumica e desde ento assumiu uma posio central e fundamental no estudo de propriedades e atividades dos compostos.

Os qumicos do sculo XIX tinham que inferir as geometrias moleculares por experimentao indireta. O entendimento moderno da geometria molecular mais direta (se descontada a interveno computacional que existe entre a observao e a representao). Em particular, a difrao de raios X forneceu imagens incomparavelmente detalhadas de molculas, mesmo to grandes quanto as de protenas, que contm centenas de tomos. A microscopia de tunelamento eletrnico, apesar de ser muito mais recente, promoveu imagens muito mais realistas que confirmaram acima de qualquer dvida as propriedades da geometria molecular. A importncia da determinao (e entendimento) da estrutura molecular no pode ser superestimada. Ao nvel mais simples, as propriedades das molculas pequenas (incluindo a tpica e importante molcula de gua) so devidas em grande parte suas geometrias e no meramente suas composies atmicas. Os oceanos, por exemplo, talvez no existiriam se as molculas de gua fossem lineares e no angulares, pois assim as interaes entre as molculas no seriam to fortes e seria improvvel que gua lquida, e por conseqncia a vida na Terra, existissem. Ao nvel mais complexo, o das

protenas, a estrutura geomtrica era essencial a sua funo bioqumica tinha papel fundamental em todos os organismos vivos. Ns podemos obter informaes sobre a estrutura de uma molcula em diferentes nveis. Conhecendo-se a frmula molecular de uma substncia temos como prximo passo responder a questo: Como os tomos pertencentes a molcula esto ligados ou conectados? Para dar um exemplo simples tomemos a molcula de gua. Neste caso sabemos que o tomo de oxignio est entre os dois tomos de hidrognio, isto HOH e no HHO. Muitos anos atrs os qumicos desenhavam uma linha entre os tomos como , pois achavam que os tomos estavam ligados uns aos outros desta forma. Isto chamado de frmula estrutural e as linhas so chamadas de ligaes. A frmula estrutural ,por exemplo, mostrada na Figura .

Hoje, contudo, temos vrias tcnicas tanto experimentais quanto tericas para a determinao tri-dimensional da estrutura quanto de forma molecular, mesmo para os casos de grandes molculas tais como protenas. Em particular, com estas tcnicas podemos calcular, com altssima preciso, as distncias e ngulo entre os tomos de hidrognio e oxignio em uma molcula de gua (Fig. 2.2). Neste caso, encontra-se que a distncia entre H e O da ordem de 0,97 angstrom = 0,000 000 000 097 metros e o ngulo igual a 104,5 graus.

A seguir mostraremos as formas e estruturas de algumas molculas comuns em nosso dia a dia . Uma delas a amnia que tem uma forma piramidal.Cujo ngulo do pice da pirmide igual a 107,8 graus. J o metano tem uma forma tetrahdrica, como o carbono ocupando o centro da pirmide e os quatro hidrognios nos vrtices pirmide

Molcula de amnia (NH3)

Molcula de metano (CH4)