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RESOLUÇÃO DA LISTA DE EXERCÍCIOS PARA PROVA PRÁTICA – (1) Extração do DNA plasmidial; (2) Eletroforese
horizontal em gel de agarose; (3) Mutação induzida por luz UV
1) Qual a importância de centrifugar os tubos com a cultura de bactérias mais de uma vez?
R: para conseguir maior quantidade de células e também de DNA plasmidial (que é importante
para oferecer um melhor resultado na eletroforese, quando será analisado o movimento das
moléculas de DNA.)
SOLUÇÃO DE NaOH Favorece o rompimento celular e a dupla fita de DNA (por favorecer
um ambiente alcalino)
5) Cite qual seria uma provável conformação do DNA plasmidial para as regiões
identificadas pelas letras A, B e C (considerando a presença da forma circular relaxada,
forma linear e forma superenovelada).
A mobilidade das formas do DNA no gel não depende somente do tamanho da molécula,
mas da densidade, torção do DNA e de outros fatores. Assim, como nem sempre o DNA está
na forma linear e descondensada, podem ser causadas diferenças na migração do
fragmento no gel. É válido lembrar que tal forma de migração não é idêntica para todas as
moléculas e que existem outros fatores que interferem nesse quesito.
O DNA superenrolado é capaz de migrar mais rapidamente porque passa pelos poros com
menor dificuldade devido, por exemplo, a sua “pequena área ocupada”. O DNA circular é o
mais lento, pois por ocupar maior área acaba se “prendendo” aos poros e encontrando
maior dificuldade para a migração.
6- Marina estava realizando uma eletroforese horizontal em gel de agarose. Após realizar
todos os passos anteriores corretamente, aplicou a mistura da amostra + tampão nas
canaletas e iniciou a eletroforese. Cite dois sinais que indicam que a corrente elétrica
realmente está passando pela cuba.
R.:
R.: Ele não terá o controle necessário de quanto ainda resta para completar a corrida do
DNA pelo gel, pois não visualizará a posição do fragmento, além de que enfrentará maior
dificuldade na deposição da amostra nas canaletas, uma vez que essa substância facilita a
aplicação da amostra no gel (acrescentam cor na amostra) .
8- Normalmente adiciona-se glicose junto ao DNA nas canaletas do gel de agarose. Por
qual motivo?
R.: A glicose auxilia na manutenção do DNA no fundo da canaleta do gel de agarose, uma
vez que eleva a densidade da amostra e faz com que ela afunde rapidamente no poço,
importante para que o fragmento possa penetrar corretamente na matriz.
R.: O erro foi ligar de forma invertida o ânodo e o cátodo. Uma vez que o fragmento de DNA
corre em direção ao polo positivo, este deve estar do lado mais distante das canaletas onde
se aplica o gel. Logo, a forma correta seria:
QUESTÕES RELACIONADAS À PRÁTICA 3
10- Luísa fez todo o procedimento, seguindo o roteiro corretamente. No entanto, após
incubar a placa pelo tempo determinado percebeu que as colônias haviam crescido quase
normalmente. Sabendo que Paulo esteve no laboratório durante o processo, o que pode
ter ocorrido?
R: Paulo provavelmente abriu a incubadora, fazendo com que o reparo dependente de luz ou
fotorreativação do DNA ocorresse. Esse mecanismo viabiliza o reparo de lesões pelas
bactérias, revertendo a mutação causada por luz UV. A enzima fotoliase remove os dímeros
de timina- reconhece os dímeros e se liga a eles, utilizando energia da luz para clivar as
ligações cruzadas. Caso não houvesse a abertura da incubadora, a enzima DNA fotoliase
reconhecia os dímeros mas não seria capaz de se ligar a eles.
11- A luz UV é absorvida por purinas e pirimidinas, sendo que a absorção pelas pirimidinas
é consideravelmente maior. Essa absorção é capaz de gerar dois produtos, no caso das
pirimidinas: dímeros de pirimidina e hidratos de pirimidina. Por quais mecanismos os
dímeros de pirimidina causam mutação?