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Paciente Idade ID Data do exame

MARCIO BERNSTEIN 58 years old MED125552633 05/04/2022

Solicitante Modalidade Exame


DR. TERCIO ROCHA PT GENOMA FULL
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Resumo dos resultados

Não foram encontradas mutaçôes específicas para cânceres ou tumores do tipo hereditário / familiar que fossem
suficientes geneticamente preditivas geminativas / celulas herdadas com mutaçôes preditivas e confirmadas no
exame NGS.
Foram contradas mutações heterozigóticas, recessivas e dominantes em genes como por exemplo: P53 e BRAC1,
mTOR que predispõem um indivíduo a câncer ou tumores de varias etiologias podendo ou nâo se manifestar. estes
disseminam-se com alta incidência na população. No entanto, foram encontradas mutações que são significativas na
regulação do sistema imunológico. Essas mutações resultam na produção de uma proteína não funcional ou nenhuma
proteína dependendo do gene. Como resultado, a proteína não pode transmitir sinais que estimulam uma resposta
imune o que pode levar a canceres ou tumores e doenças adiquiridas somaticamente ao longo da vida do individuo.

Resultados completos:

CHEK2 [OMIM# 604373] - Positivo


MLH1 [OMIM# 120436]
MSH2 [OMIM# 609309]
MSH6 [OMIM# 600678]
PMS2 [OMIM# 600259]
NF1 [OMIM# 613113]

Síndromes de suscetibilidade a câncer/tumor


Características clínicas Guo Y et al. (2014) relataram mutações germinativas de ACD, o gene que codifica a proteína de
telômero TPP1 na insuficiência da medula óssea herdada [5]. Uma variante patogênica da DCA também foi descrita em
uma família com leucemia linfocítica crônica [6]. A síndrome de Hoyeraal-Hreidarsson também pode ser causada por
uma mutação germinativa na ACD [7].

Variantes em CHEK2 têm sido associadas a um fenótipo semelhante à síndrome de Li-Fraumeni [8], que é
caracterizada por uma maior suscetibilidade a vários tipos de câncer, incluindo câncer de mama, sarcoma de partes
moles, tumores cerebrais, carcinoma adrenocortical e leucemias. Outros cânceres também podem ser observados.
Ruijs et al (2009) identificaram quatro famílias com um fenótipo Li-Fraumeni-like e uma mutação heterozigótica em
CHEK2; uma família incluiu dois indivíduos com linfoma de Hodgkin [9].

Mutações bialélicas nos genes de reparo de incompatibilidade de DNA MLH1, MSH2, MSH6 e PMS2 estão associadas
a um distúrbio chamado síndrome da deficiência de reparo de incompatibilidade constitucional (CMMR-
D) [10].

A CMMR-D está associada a um risco aumentado de câncer infantil, incluindo malignidades hematológicas (15%),

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tumores cerebrais (48%) e cânceres gastrointestinais (32%) [11]. As neoplasias hematológicas mais prevalentes
observadas são o LNH e a leucemia linfoblastóide aguda [10]. A idade média de diagnóstico para pacientes que
desenvolvem linfoma é de 5 anos [10]. Os pacientes também podem apresentar características tipicamente associadas
à neurofibromatose tipo 1, como manchas café com leite ou neurofibromas [10].

Mutações heterozigóticas nos genes MLH1, MSH2, MSH6 e PMS2 estão associadas à síndrome de Lynch, uma
condição autossômica dominante com risco aumentado de vários tipos diferentes de malignidades, incluindo câncer de
cólon, endométrio, ovário e estômago.
Mutações na NF1 estão associadas à neurofibromatose 1 (NF1), uma doença neurocutânea autossômica dominante
associada ao aumento do risco de tumores benignos e malignos [12].

Resultado do Exame:

NPAT [OMIM# 601448]


POTE1 [OMIM# 606478]
TERF2IP [OMIM# 605061]
TP53 [OMIM# 191170] - Positivo
ADA [OMIM# 102700]
CASP10 [OMIM# 601762]

As malignidades mais comuns incluem gliomas, tumores de bainha de nervos periféricos, leucemia mielomonocítica
juvenil, feocromocitoma, tumores estromais gastrointestinais, rabdomiossarcoma e tumores malignos de tritão. Os
pacientes também têm um risco relativo aumentado de LNH na infância de 10 [13].
Uma mutação heterozigótica no NPAT foi descrita em primos de quatro irmãos que apresentavam entre 22 e 26 anos
de idade com linfoma de Hodgkin nodular linfocitário predominante [14].
Variantes patogênicas heterozigotas germinativas em POT1 foram recentemente relatadas em câncer de tireoide,
câncer de mama, carcinoma de células renais, câncer colorretal e leucemia linfocítica crônica familiar [6, 15]. Uma
mutação POT1 foi recentemente relatada implicando preenchimento de extremidade de telômero defeituoso e
truncamento de telômero em Coats plus [16].

Mutações em TERF2IP foram descritas em pacientes com melanoma familiar e leucemia linfocítica crônica familiar [6,
17].
Mutações heterozigóticas em TP53 estão associadas à síndrome de Li-Fraumeni (LFS), um distúrbio de suscetibilidade
ao câncer [18]. Os cânceres mais comuns associados à LFS são sarcomas de tecidos moles, osteossarcomas, câncer de
mama na pré-menopausa, tumores cerebrais, carcinomas adrenocorticais e leucemias. Vários outros tipos de câncer,
incluindo linfomas de Hodgkin e não-Hodgkin, também foram descritos em famílias com LFS [18].

Imunodeficiências e Distúrbios Autoimunes

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Característicasclínicas Mutações no gene ADA estão associadas à imunodeficiência combinada grave autossômica
recessiva, que está associada à função defeituosa das células T e B [19]. Esta condição tem sido associada a um risco de
5% de LNH [19, 20]. Mutações da linha germinativa heterozigótica no CASP10 estão associadas à síndrome
linfoproliferativa autoimune (ALPS). Pacientes com ALPS frequentemente apresentam infecção viral fulminante por
Epstein-Barr, hipogamaglobulinemia ou linfoma [21].

CD27 (TNFRSF7) [OMIM#186711] - Positivo


CTLA4 [OMIM#123890]

Mutações homozigotas ou heterozigotas compostas em CD27 estão associadas à síndrome linfoproliferativa. O


fenótipo pode variar significativamente, desde hipogamaglobulinemia limítrofe baixa assintomática até uma resposta
inflamatória sistêmica sintomática completa com complicações relacionadas ao EBV com risco de vida, incluindo
linfohistiocitose hemofagocítica, um distúrbio linfoproliferativo e linfoma maligno que requer transplante de células-
tronco [22, 23]
Mutações da linha germinativa heterozigótica no CTLA4 estão associadas à ALPS caracterizada por trombocitopenias
autoimunes e infiltração linfocítica anormal de órgãos não linfoides, incluindo pulmões, cérebro e trato
gastrointestinal, resultando em enteropatia [24].

DOCA8 [OMIM#611432] -
FAS (TNFRSF6) [OMIM# 134637] - Positivo

A síndrome de infecção recorrente por hiper-IgE autossômica recessiva é causada por mutação homozigótica ou
heterozigótica composta no gene DOCK8 [25].
O ALPS tipo 1A é causado por mutações heterozigóticas no gene FAS [26]. O distúrbio é causado por apoptose
linfocitária defeituosa e está associado a linfadenopatia crônica e esplenomegalia e citopenias autoimunes [26]. O
ALPS está associado a um risco aumentado de 51 vezes de linfoma de Hodgkin e de 14 vezes de linfoma não Hodgkin.
A média de início dos sintomas é de 5 anos e a idade média de diagnóstico do linfoma é de 28 anos [26].

FASLG [OMIM#134638]
ITK [OMIM#186973]
IKZF1[OMIM#606023] - Positivo

Mutações heterozigóticas em FASLG estão associadas com ALPS tipo 1 B [27]. Mutações em ITK estão associadas a
uma forma autossômica recessiva de síndrome linfoproliferativa [28, 29]. Uma mutação germinativa IKZF1 pode
causar uma forma autossômica dominante de imunodeficiência comum variável (ICV) que está associada a uma
diminuição marcante no número de células B e é uma predisposição para leucemia linfoblástica aguda precursora de
células B, pancitopenia e doenças autoimunes. 31].

MAGT1 [OMIM#300715] - Postivo

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PIK3CD [OMIM#602839]
SH2D1A (SAP) [OMIM# 300490] - Positivo
NFRSF13B (TACI) [OMIM# 604907] - Positivo
FOI [OMIM# 300392]

Mutações em MAGT1 estão associadas à imunodeficiência ligada ao X com defeito de magnésio, infecção pelo vírus
Epstein-Barr e neoplasia [32, 33]
Mutações heterozigóticas em PIK3CD estão associadas à imunodeficiência caracterizada pelo aparecimento de
infecções sinopulmonares recorrentes e outras infecções na primeira infância [34, 35].
A síndrome linfoproliferativa ligada ao X (XLP1) é causada por mutações no gene SH2D1A . O XLP1 está associado à
extrema sensibilidade ao vírus Epstein Barr, que leva à mononucleose infecciosa grave ou fatal, hipogamaglobulinemia
adquirida e risco de 20% de linfoma [1, 36]. As mulheres portadoras são tipicamente assintomáticas [37].
Mutações no TNFRSF13B são uma causa de ICV, que é uma doença heterogênea caracterizada por produção
prejudicada de anticorpos após vacinação ou exposição ao antígeno e níveis séricos reduzidos de IgG, IgA e IgM [38].
Os sintomas podem incluir infecções sinopulmonares crônicas [38]. As primeiras manifestações clínicas ocorrem
tipicamente na infância ou adolescência [38]. Mellemkjaer et ai. (2002), identificado casos de LNH em 176 pacientes
com ICV, indicando um aumento de 6 vezes na incidência de LNH em comparação com a população geral [39].
Mutações em TNFRSF13B podem ser herdadas de forma autossômica dominante ou recessiva, e a penetrância é
incompleta [38].
A síndrome de Wiskott-Aldrich (WAS) é uma imunodeficiência rara ligada ao cromossomo X causada por mutações no
gene WAS . Os achados clínicos podem incluir trombocitopenia com plaquetas pequenas, otite média recorrente e
eczema. A maioria dos pacientes é diagnosticada na primeira infância. O risco de malignidades linforreticulares, como
o linfoma, é de 13%.

NBN (NBS1) [OMIM# 602667]


As c Mutações bialélicas na ATM estão associadas à ataxia telangiectasia (AT), que é caracterizada por ataxia
cerebelar progressiva de início na infância, telangiectasias da conjuntiva, imunodeficiência e aumento do risco de
câncer [40]. O risco geral de câncer ao longo da vida é de 30-40%, com 40% dos tumores sendo LNH e
aproximadamente 5% sendo HL. Outros cânceres associados incluem leucemia, câncer gástrico, câncer de mama e
meduloblastoma.
Mutações no NBN estão associadas à rara doença autossômica recessiva síndrome de quebra de Nijmegen (NBS). As
características da NBS incluem microcefalia, características faciais dismórficas, imunodeficiência, instabilidade
cromossômica e maior suscetibilidade ao câncer. Em uma série de 55 pacientes, 29% desenvolveram linfoma, que foi o
câncer mais comum observado na coorte [41]. A idade de início variou de 1 a 22 anos [41]. Mutações bialélicas no NBN
também foram associadas à anemia aplástica [42].

RECQL3 (BLM) [OMIM# 604610]


Mutações em RECQL3 estão associadas à síndrome de Bloom, uma doença autossômica recessiva caracterizada por

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deficiência de crescimento, imunodeficiência, eritema sensível ao sol e suscetibilidade ao câncer [43]. O risco de câncer
ao longo da vida para pacientes com síndrome de Bloom é de 20% [44], incluindo um risco de 13% de LNH e um risco
de 1% de LH [1]. Outros riscos de câncer incluem câncer colorretal, de mama, laringe e de pele [44].

KLHDC8B [OMIM# 613169]


As clínicas Mutações germinativas em BRCA1 aumentam os riscos de câncer de mama ou de ovário e todos os outros
tipos de câncer, incluindo linfoma de Hodgkin e não-Hodgkin[45, 46]
Mutações germinativas no BRCA2 aumentam os riscos de câncer de mama ou de ovário e todos os outros tipos de
câncer, incluindo linfoma de Hodgkin e não-Hodgkin[45, 46]
Mutações somáticas recorrentes no gene CARD11 foram previamente identificadas em amostras de tumor de
linfoma difuso de grandes células B [47, 48]. Uma mutação missense heterozigótica na linha germinativa em CARD11
também foi descrita em uma família com linfocitose de células B policlonais hereditárias e esplenomegalia [49]. A
linfocitose de células B é uma condição que se assemelha à leucemia linfocítica crônica e pode ser difícil de distinguir
clinicamente do linfoma.
Salipante et al (2009) identificaram uma família com múltiplos indivíduos com HL, onde a doença segregou com uma
translocação cromossômica que interrompeu o gene KLHDC8B [50]. Em três outras famílias com HL uma variante na
região 5 não traduzida do gene KLHDC8B foi encontrada para segregar com o fenótipo da doença [50].

PRF1 [OMIM# 170280]


Mutações bialélicas no PRF1 estão associadas à linfohistiocitose-2 hemofagocítica familiar (FHL2), um distúrbio com
risco de vida causado pela proliferação descontrolada de células T CD25+ e ativação de macrófagos que fagocitam
células sanguíneas [51]. Os sintomas podem incluir febre, hepatoesplenomegalia, citopenias, hipertrigliceridemia e
hipofibrinogenemia. O início é tipicamente na infância, no entanto, casos de início tardio também foram descritos [52].
Clementi et al (2005) identificaram mutações bialélicas de PRF1 em 4 de 29 pacientes com LH ou LNH que também
apresentavam características clínicas de linfohistiocitose hemofagocítica [53]. Além disso, 4 pacientes tinham uma
mutação heterozigótica no gene PRF1 .

IMD68; MYD88D [OMIM# 602170]


Este gene codifica uma proteína adaptadora citosólica que desempenha um papel central na resposta imune inata e
adaptativa. Esta proteína funciona como um transdutor de sinal essencial nas vias de sinalização do receptor de
interleucina-1 e Toll-like. Essas vias regulam a ativação de numerosos genes pró-inflamatórios. A proteína codificada
consiste em um domínio de morte N-terminal e um domínio C-terminal do receptor Toll-interleukin1. Pacientes com
defeitos nesse gene têm maior suscetibilidade a infecções bacterianas piogênicas. O splicing alternativo resulta em
múltiplas variantes de transcrição. [fornecido por RefSeq, fevereiro de 2010] câncer de células sanguíneas raro
caracterizado por um excesso de glóbulos brancos anormais na medula óssea. Essas células anormais têm
características tanto de glóbulos brancos (linfócitos) chamados células B quanto de células mais maduras derivadas de
células B conhecidas como células plasmáticas.

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STXBP2 [OMIM# 601717]


Mutações bialélicas de STXBP2 foram descritas em pacientes com linfohistiocitose-5 hemofagocítica familiar (FHL5),
um distúrbio genético de citotoxicidade linfocitária que normalmente se apresenta nos primeiros dois anos de vida
[54]. Casos atípicos com início tardio na idade adulta também foram descritos [54]. As complicações associadas da
linfo-histiocitose hemofagocítica (HLH) podem incluir imunodeficiência, doença granulomatosa pulmonar ou hepática,
encefalite ou linfoma. Rohr e outros descreveram um indivíduo com mutações bialélicas de STXBP2 que apresentou
linfoma de Hodkin aos 6 anos de idade, 2 anos antes do primeiro aparecimento de HLH [54].

Métodos de teste:
A cobertura abrangente da sequência das regiões de codificação e junções de splicing de todos os genes neste painel é
realizada. Os alvos de interesse são enriquecidos e preparados para sequenciamento usando o sistema Agilent
SureSelect. O sequenciamento é realizado usando a tecnologia Illumina e as leituras são alinhadas à sequência de
referência. As variantes são identificadas e avaliadas usando uma coleção personalizada de ferramentas de
bioinformática e interpretadas de forma abrangente por nossa equipe de diretores e conselheiros genéticos. Todos
patogênicos e prováveis.
Referencias OMIM Chip Illumi

Para o médico:
Variantes encontradas sugerem possibilidade de:
large B-cell lymphoma, primary mediastinal larbe B-cell lymphoma, high grade B-cell lymphoma, and diffuse large B-
cell lymphoma

Recommendações
Tratamentos favoraveis:

* chemotherapy agents available for treatment of lymphoma. They include steroids, platinum drugs, such as Platinol
(cisplatin), and other chemotherapy drugs, such as Oncovin or Vincasar (vincristine), Adriamycin (doxorubicin), and
methotrexate.

*Transplantes de células-tronco
Os transplantes de células-tronco, às vezes chamados de transplantes de medula óssea, envolvem células na medula
onde novas células sanguíneas são produzidas. Uma alta dose de quimioterapia pode danificar essas células, e os
transplantes são usados para substituí-las.
As células-tronco também são usadas para tratar pacientes com linfoma em remissão ou que têm uma recaída. Em uma
versão, chamada transplante autólogo de células-tronco, as próprias células do paciente são coletadas antes do
tratamento e depois devolvidas ao paciente por via intravenosa após o tratamento.

Entre outros:
*Terapia direcionada

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Drogas nesta categoria de terapias bloqueiam alguns dos processos normais envolvidos no crescimento tumoral. Estes
incluem medicamentos conhecidos como inibidores de proteassoma, como Velcade (bortezomib), e inibidores de
quinase, como Imbruvica (Ibrutinib) e Calquence (acalabrutinib)

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