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Introdução a biologia molecular

A biologia molecular explora o estudo da vida célula – tronco totipotente,


em escalas moleculares camada interna de células. Dará origem ao
embrião
- Cartilagem e células do coração não se
regeneram, tem apenas o processo de Camada externa de células que
cicatrização. forma a parte do embrião. Dará origem a
placenta.
é um tipo de divisão celular que ocorre
em todas as células eucarióticas e garante a
formação de duas células-filhas. É um processo
importante para o crescimento e regeneração
de organismos multicelulares e para a
reprodução assexuada de organismos
unicelulares

são capazes de
formar células de qualquer tecido do corpo,
inclusive tecidos embrionários e
extraembrionários. Costuma-se dizer que esse
https://www.educamaisbrasil.com.br/enem/ 1
tipo de célula é capaz de originar um
organismo por inteiro.
: é um tipo de divisão celular em que há
formação de quatro células-filhas com metade
do número de cromossomos da célula-mãe.
Nesse processo, ocorrem duas divisões
celulares consecutivas, as quais são chamadas
de meiose I e meiose II.

Passagem de informações
específicas dos organismos parentais para seus
descentes durante a reprodução

https://www.educamaisbrasil.com.br/enem/ 2 a combinação de 23 cromossomos


de casa pró núcleo resulta em um zigoto com
- Quem decide o sexo do feto é o homem
36 cromossomos e neste momento a fertilização
- Só é chamado de óvulo quando o ovócito é está concluída e o desenvolvimento
fecundado. embrionário se inicia

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Segmentos do DNA/RNA que codificam - Uma pentose (açúcar de cinco carbonos),
uma cadeia polipeptídica ou uma molécula de uma base contendendo nitrogênio (base
RNA nitrogenada) e um ou mais grupos fosfato.

- O açúcar presente no nucleotídeo pode ser


uma ribose ou uma desoxirribose. A
desoxirribose diferencia-se da ribose, pois a
desoxirribose possui um átomo de oxigênio a
menos ligado ao segundo átomo de carbono
do anel."
Conjunto do material genético
(RNA/DNA) de uma célula viva ou vírus
- As bases nitrogenadas apresentam um ou dois
anéis que incluem átomos de nitrogênio:

Citosina (C), timina (T) e uracila (U) são bases


denominadas pirimidinas e caracterizam-se por
possuírem um anel de seis átomos.
Guanina (G) e a adenina (A) são bases
https://pt.wikipedia.org/wiki/Genoma 1
denominadas purinas e destacam-se por
possuírem um anel de seis átomos fusionado a

Ácidos nucleicos um anel de cinco átomos.

- (ácido desoxirribonucleico) é um ácido


nucleico que apresenta todas as informações
genéticas de um indivíduo, é um tipo de ácido
nucleico que possui papel fundamental na
hereditariedade, sendo considerado o
portador da mensagem genética.

(ácido ribonucleico) é uma molécula


responsável pela síntese de proteínas das
células do corpo. Sua principal função é a
produção de proteínas. Por meio da molécula
de DNA, o RNA é produzido no núcleo celular, - A pentose é o elo entre a base nitrogenada
sendo encontrado também no citoplasma da (purina ou pirimidina) e o grupo fosfato. A
célula pentose se liga ao grupo fosfato através de
- Os ácidos nucleicos são compostos por uma ligação fosfoéster com a hidroxila ligada
nucleotídeos ao carbono-5 da pentose. A ligação entre a
base nitrogenada e a pentose é feita
covalentemente através de uma ligação N-
glicosídica com a hidroxila ligada ao carbono –
1 da pentose.

: são formadas entre


resíduos de açúcar e agua, enquanto os grupos
fosfato (que estão completamente carregados
em pH próximo de 7) interagem com grupos
positivos como proteínas, ions metálicos e
poliaminas. – conecta as bases nitrogenadas

o
https://brasilescola.uol.com.br/biologia 1
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Os nucleotídeos faz parte da estrutura dos ribossomos e
sucessivos (em DNA/RNA) são ligados participa do processo de tradução dos
covalentemente por meio de pontes de códons para construção das proteínas. 75%
grupos fosfato, em que o grupo 5’-hidroxila de do RNA total
uma unidade nucleotídica une-se ao grupo - Se associa a um conjunto de proteínas para
3’-hidroxila do nucleotídeo seguinte por meio formar os ribossomos
de ligação fosfodiéster; dessa forma, os
esqueletos covalentes dos ácidos nucléicos -Presente nos ribossomos onde ocorre a
consistem de resíduos fosfato e pentose, ou síntese proteica
seja, são hidrofílicos. - Conectam o tRNA e as proteínas acessórias
necessárias para a síntese proteica
Tipos de rna - Cada subunidade ribossomal apresenta suas
próprias moléculas de rRNA
formado no núcleo e contém a
“mensagem” - o código transcrito a partir do
DNA - para a síntese das proteínas Cada
conjunto de três nucleotídeos no RNAm é
chamado de CÓDON. 1 a 5% do RNA total
(sequencia genética)
-Fita simples, copiada do DNA, trazendo
mensagem para a síntese proteica

- Localizado principalmente no RER


- Forma códons (“diz a sequência de aa que
o RNAt terá que trazer)

-Cópia do DNA https://essaseoutras.com.br/tipos-de-rna 1

presente no citoplasma e é responsável Tipo Tamanho Função


pelo transporte dos aminoácidos até os tRNA Pequeno Transporte de aa
ribossomos para a síntese proteica. Possui para o local de
sequência de nucleotídeos correspondente síntese
ao códon chamada de ANTI-CÓDON. 10 a rRNA Diversos Forma os
15% do RNA total ribossomos,
juntamente com
-Estrutura Tridimensional (síntese proteica) proteinas
-Encaminha aminoácidos dispersos no mRNA Diversos Deterina a
citoplasma ao local onde ocorrerá a síntese sequência de aa
proteica na proteína
snRNA Pequeno Processa o Mrna
-Cada tipo de aa apresenta seu próprio inicial nos
conjunto de tRNA, os quais se ligam ao aa e o eucriotos
transportam para a extremidade 5’ do mRNA miRNA Pequeno Afeta a
expressão gênica
-Para cada códon do mRNA existe um (crescimento,
ANTICÓDON correspondente no tRNA à desenvolvimento
síntese proteica siRNA Pequeno Afeta a
expressão
gênica. Utilizam
para bloquear a
expressão do
gene de
interesse

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- Procarioto não tem núcleo, Por isso se diz
Transcrição que sua transcrição é acoplada com a
tradução
são enzimas que
transcrevem DNA em RNA. Usando um O DNA apresenta sequências
molde de DNA, a RNA polimerase constrói específicas, denominadas PROMOTORES,
uma nova molécula de RNA através do que sinalizam exatamente onde a síntese
pareamento de bases. Por exemplo, se do RNA deve ser iniciada
houver um G no molde de DNA, a RNA
- reconhecidos por fatores de
polimerase adicionará um C à nova
transcrição que, ligados ao DNA,
cadeia crescente de RNA.
interagem com outros fatores, formando
- A RNA polimerase sempre constrói uma um complexo ao qual a RNA polimerase se
nova fita de RNA na direção 5' para 3'. Isto associa
é, ela só pode adicionar nucleótidos de
RNA (A, U, C ou G) à extremidade 3' da
cadeia

https://pt.khanacademy.org/science/biolo 1

A RNA polimerase liga-se frouxamente à


dupla fita de DNA e reconhece o promotor
https://pt.khanacademy.org/science/biolo 2
- A ligação ocorre entre o nucleotídeo
presente e o fosfato doC5’ do nucleotídeo
trifosfato a ser incorporado;
• Reconhecem e ligam-se em
sequências específicas do DNA - A RNA polimerase não necessita de
• Desnaturam o DNA na altura dos primer para iniciar a síntese.
nucleotídeos que serão transcritos;
Muitos promotores eucarióticos possuem
• Mantém as fitas de DNA separadas
uma sequência chamada de Ele é
na região de síntese
reconhecido por um dos fatores gerais de
• Estabiliza o híbrido DNA:RNA na
transcrição, permitindo que outros fatores
síntese;
de transcrição e eventualmente a RNA
• Renatura o DNA imediatamente
polimerase se liguem. Ele também contém
após a síntese;
muitos As e Ts, o que torna mais fácil de
• Termina a síntese do RNA.
separar as fitas de DNA.
A transcrição:
- Processo pelo qual uma molécula de
RNA é sintetizada apartir da informação
contida na sequência de nucleotídeosde
uma molécula de DNA fita dupla;
- É sintetizado no núcleo e segue para o
citoplasma – eucariotas.

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O transcrito de RNA é quase idêntico à fita
de DNA não molde ou codificante.
Contudo, as fitas de RNA têm a base
uracila (U) em vez de timina (T), assim
como um açúcar ligeiramente diferente no
nucleótido. Assim, como podemos ver no
diagrama acima, cada T da fita
codificante é substituído por um U no
transcrito de RNA.

A RNA polimerase vai continuar


transcrevendo até encontrar sinais para
parar. O processo de término da
transcrição é chamado terminação e isso
acontece uma vez que a polimerase
transcreve uma sequência de DNA
conhecida como terminador.

https://pt.khanacademy.org/science/biolo 3
• Após a ligação da RNA polimerase,
Uma vez que a RNA
forma-se o complexo de iniciação
polimerase está na posição do promotor, o
da transcrição
próximo passo da transcrição — o
• O complexo abre-se formando a
alongamento — pode começar.
bolha de transcrição;
Basicamente, o alongamento é a fase que
• Essa abertura ocorre na região
a sequência de RNA fica mais longa,
promotora – TATAbox
graças à adição de novos nucleotídeos.
• A fita recém formada não
Durante o alongamento, a RNA polimerase permanece ligada com a fita de
"caminha" ao longo de uma fita de DNA, DNA molde
conhecida como fita molde, da 3' para 5'. • Transcritos primários - originarão
Para cada nucleotídeo no molde, a RNA mRNAs - na sua migração donúcleo
polimerase adiciona um nucleotídeo de para o citoplasma sofrem
RNA correspondente (complementar) à modificações antes deatravessarem
extremidade 3' da fita do RNA. a carioteca.
• Modificação das suas extremidades
e remoção de íntrons
• Este conjunto de modificações no
transcrito nuclear originará o mRNA,
pronto para migrar para o
citoplasma.

https://pt.khanacademy.org/science/biolo 4

@study.biomediciner
No splicing do RNA, partes
específicas do pré-RNAm,
• Após o início da transcrição da chamadas íntrons são reconhecidas e
molécula de mRNA é adicionado removidas por complexos proteína-e-RNA
um resíduo de guanina à sua chamados de spliceossomos. Os íntrons
extremidade 5’ podem ser vistos como sequências "lixo"
• Este resíduo chamado “cap” sofre, que devem ser retiradas para que a
então, metilação ( adição do "versão de partes boas" da molécula de
radical metil – CH3) Resultando na RNA possa ser montada.
formação de uma 7 metilguanosina
O que são as "partes boas"? As partes do
• O cap protege a extremidade 5’ da RNA que não são cortadas são
ação de exonucleasese também é chamadas exons. Os exons são colocados
utilizado para reconhecimento pelo juntos pelo spliceossomo para formar o
ribossomo, do sítio de início do RNAm maduro final, que é enviado para
processo de síntese proteica . fora do núcleo.
O grupo do início (final 5') é chamado de
cap, enquanto o grupo de terminação
(final 3') é chamado de cauda. Tanto o
cap quanto a cauda protegem o
transcrito e ajudam-no a ser exportado do
núcleo e a ser traduzido nos ribossomos
("máquinas" de fazer proteínas)
encontrados no citosol
https://pt.khanacademy.org/science/ap-bi 1
A cap 5' é adicionada ao primeiro
nucleotídeo do transcrito durante a somente os éxons de um gene que
codificam uma proteína. Não só os íntrons
transcrição. A cap é uma guanina (G)
não carregam informações para construir
modificada e protege o transcrito de ser
uma proteína, como eles
quebrado. Ela também auxilia o ribossomo
a se ligar ao RNAm e começar a leitura realmente têm que ser removidos para que
para fazer uma proteína. o mRNA codifique uma proteína com a
sequência certa. Se o spliceossomo falha
ao remover um íntron, um mRNA com "lixo"
extra será feito, e uma proteína errada vai
https://pt.khanacademy.org/science/ap-bi 2 ser produzida durante a tradução

. Quando uma sequência chamada sinal 1ª etapa – RNAm cortado entre os éxons e
de poliadenilação aparece em uma íntrons – enzimas
molécula de RNA durante a transcrição, RNPnp(ribonucleoproteínas nucleares).
uma enzima corta o RNA em dois naquele
2ª etapa – retirada dos íntrons e união dos
ponto. Outra enzima adiciona
éxons - enzimas RNPnp(ribonucleoproteínas
aproximadamente 100100100 -
nucleares)
200200200 nucleotídeos de adenina (A)
para cotar o final, formando uma cauda *Ocorre no nucleo
poli-A. A cauda torna o transcrito mais
estável e ajuda a exportá-lo do núcleo
para o citosol.

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Tradução Características:
– Especificidade : um determinado códon
A tradução envolve "decodificar" um RNA sempre codifica o mesmo AA;
mensageiro (RNAm) e usar sua informação
– Universalidade: é conservado em todas
para produzir um polipeptídio ou cadeia
as espécies;
de aminoácidos. No geral, polipeptídio é
basicamente uma proteína (com a - Redundância ou Degeneração: um AA
diferença técnica que algumas proteínas pode ter mais de 1 trinca que o codifica;
grandes são formadas por muitas cadeias
– Contínuo: sempre lido de 3 em 3 base
de polipeptídios.
Na tradução, os códons de um RNAm são
Em um RNAm, as
lidos por ordem (da extremidade 5' para a
instruções para a produção de um
extremidade 3') por moléculas chamadas
polipeptídeo vêm em grupos de três
de RNAs de transferência ou RNAt.
nucleotídeos chamados códons
Cada RNAt possui um anticódon, um
• Existem 616161 códons diferentes
conjunto de três nucleotídeos que se liga
para os aminoácidos
ao códon correspondente no RNAm
• Três códons de "parada" marcam o através do pareamento de bases. A outra
polipeptídeo como terminado extremidade do RNAt traz o aminoácido
especificado pelo códon
Um códon AUG é um sinal de "início" para
começar a tradução (também especifica
o aminoácido metionina

https://pt.khanacademy.org/science/ap-bi 3

• Um ribossomo (o qual tem duas


parte, uma pequena e uma grande)
• Um RNAm com as instruções para a
proteína que será construída
• Um RNAt "iniciador" transportando o
primeiro aminoácido da proteína,
que quase sempre é a metionina
(Met)
Durante a iniciação, essas peças devem se
unir de maneira correta. Juntas, elas
https://pt.khanacademy.org/science/ap-bi 4 formam o complexo de iniciação, a
configuração molecular necessária para
começar a fazer uma nova proteína.

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primeiro o RNAt transportando a metionina alongamento é quando o
se liga a subunidade ribossômica polipeptídeo se torna mais longo.
pequena. Juntos, se ligam à extremidade
5' do RNAm através do reconhecimento Nosso primeiro RNAt transportador de
metionina começa no compartimento do
do cap 5' GTP (adicionado durante o
meio no ribossomo, chamado de sítio P. Ao
processamento no núcleo). Em seguida,
lado, um novo códon é exposto em outro
eles "caminham" ao longo do RNAm na
compartimento, chamado de sítio A. O
direção 3' e param quando alcançam o
sítio A será o "desembarque" para o
códon de iniciação (com frequência, mas
nem sempre, o primeiro AUG) próximo RNAt, aquele cujo anticódon é o
correspondente perfeito (complementar)
do códon em exposição.

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Uma vez que o RNAt correspondente
desembarca no sítio A é hora da ação: isto Replicação
é, a formação de uma ligação
• A replicação do DNA
peptídica que conecta um aminoácido a
é semiconservativa. Cada fita na
outro. Esta etapa transfere a metionina do
dupla hélice atua como modelo
primeiro RNAt para o aminoácido do para a síntese de uma nova fita
segundo RNAt no sítio A. complementar.
[agora temos dois aminoácidos, um
(minúsculo) polipeptídeo! A metionina • O novo DNA é feito por enzimas
denominadas DNA polimerases, que
forma o N-terminal do polipeptídeo, e o
necessitam de um molde e
outro amioácido é o C-terminal.
um primer (iniciador) e sintetizam
Terminação: A tradução acaba em um DNA na direção 5' para 3'.
processo chamado terminação. A
terminação acontece quando um códon • Durante a replicação do DNA, uma
de parada no RNAm (UAA, UAG ou UGA) nova fita (fita líder) é feita como
uma peça contínua. A outra (fita
entra no sítio A.
tardia) é feita em pequenas partes.
Códons de parada são reconhecidos por
proteínas chamadas de fatores de • A replicação do DNA requer outras
liberação, os quais se adaptam enzimas além da DNA polimerase,
perfeitamente no sítio P (embora não incluindo DNA primase, DNA
sejam RNAt). Fatores de liberação helicase, DNA ligase,
e topoisomerase
confundem a enzima que normalmente
forma as ligações peptídicas: fazem-na
adicionar uma molécula de água ao Uma das moléculas chave
último aminoácido da cadeia. Essa reação na replicação do DNA é a enzima DNA
separa a cadeia do RNAt, assim a proteína polimerase. DNA polimerases são
recém-produzida é liberada. responsáveis pela síntese do DNA: elas
adicionam nucleotídeos, um por um, à fita
Depois que as unidades ribossômicas se
crescente de DNA, incorporando somente
separam do RNAm e entre si, cada
aqueles que são complementares à fita
elemento pode (e normalmente fazem isso
molde.
rapidamente) tomar parte em um novo
ciclo de tradução.

https://pt.khanacademy.org/science/ap-bi 5

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• Sempre precisam de uma fita molde Proteínas chamadas proteínas ligadoras de
fita simples recobrem as fitas separadas de
• Adicionam nucleotídeos somente na
DNA próximo ao garfo de replicação,
terminação 3' de uma fita de DNA
impedindo-as de ligarem-se novamente
• Não conseguem dar início à em uma hélice dupla.
formação de uma cadeia de DNA;
Polimerases de DNA
requerem uma cadeia pré-existente
somente podem adicionar nucleotídeos à
ou uma pequena sequência de
extremidade 3' de uma fita existente de
nucleotídeos chamada de primer
DNA (elas utilizam o grupo -OH livre
• Elas revisam (ou conferem) seu encontrado na extremidade 3' como um
trabalho, removendo a maior parte "gancho", adicionando um nucleotídeo a
dos nucleotídeos erroneamente este grupo na reação de polimerização)
adicionados à cadeia
A primase faz um primer de RNA, ou
A adição de nucleotídeos requer energia. um trecho curto de ácido nucleico
Essa energia vem dos próprios
complementar ao molde, que
nucleotídeos, que possuem três fosfatos
ligados à sua estrutura (bastante fornece uma extremidade 3' para a
semelhante à molécula de ATP). Quando a DNA polimerase trabalhar. Um primer
ligação entre os fosfatos é quebrada, a típico tem cerca de cinco a dez
energia liberada é usada para formar uma nucleotídeos. O primer inicia a
nova ligação entre o novo nucleotídeo e a síntese de DNA, isto é, faz com que
cadeia crescente
ela comece.
Uma vez que o primer de RNA está
replicação sempre começa em em seu lugar, a DNA polimerase o
locais específicos no DNA, que são
"amplia", adicionando nucleotídeos
chamados de origens de replicação e são
reconhecidos pela sua sequência.
um por um para fazer uma nova fita
de DNA que é complementar à fita
Proteínas especializadas reconhecem a molde.
origem, ligam-se a este sítio, e abrem o
DNA. Conforme o DNA se abre, duas DNA polimerases
estruturas com formato de Y, chamadas podem somente fazer DNA na direção 5'
de garfos de replicação, são formadas, para 3', e isto coloca um problema
juntas compõem o que é chamada durante a replicação. Uma dupla hélice
uma bolha de replicação. Os garfos de de DNA é sempre antiparalela; em outras
replicação movem-se em direções opostas palavras, uma fita vai na direção 5' para 3',
à medida que a replicação acontece. enquanto a outra vai na direção 3' para 5'.
Isto faz com seja necessário que as duas
Helicase é a primeira enzima de
novas fitas, que também são antiparalelas
replicação a se ligar na origem de
a seus moldes, sejam feitas de maneiras
replicação. A função da helicase é
ligeiramente diferentes.
avançar os garfos de replicação
"desenrrolando" o DNA (quebrando as
pontes de hidrogênio entre os pares de
bases nitrogenadas).

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Uma das novas fitas, a que se desloca de Os primers de RNA são removidos e
5' para 3' em direção ao garfo de substituídos por DNA através da atividade
replicação, é a fácil. Esta fita é feita da DNA polimerase I, a outra polimerase
continuamente, porque a DNA polimerase envolvida na replicação. Os cortes que
está se movendo na mesma direção que o permanecem depois dos primers são
garfo de replicação. Esta fita sintetizada substituídos e fechados pela enzima DNA
continuamente é chamada fita líder. ligase.

https://pt.khanacademy.org/science/ap-bi 6

A outra fita nova, que se desloca de 5'


para 3' distanciando-se do garfo, é mais
intricada. Esta fita é feita em fragmentos
• Helicase abre o DNA no garfo de
porque, conforme o garfo avança, a DNA
replicação
polimerase (que se afasta do garfo) se
separa e se religa ao DNA recentemente • Proteínas ligadoras de fita
exposto. Esta fita intricada, que é feita em simples recobrem o DNA ao redor do
fragmentos, é chamada fita tardia garfo de replicação para evitar que o
DNA se enrole.
Pinça: mantém as moléculas de DNA
polimerase III no lugar à medida que elas • Topoisomerase trabalha na região à
sintetizam DNA. A pinça deslizante é uma frente do garfo de replicação para
proteína em forma de anel e evita que a evitar enrolamento excessivo.
DNA polimerase da fita tardia escape
• Primase sintetiza primers de RNA
quando ela reinicia em um novo
complementares à fita de DNA.
fragmento de Okazaki
• DNA polymerase III aumenta os primers
Topoisomerase também desempenha um
adicionando nucleotídeos na
importante papel na manutenção durante
extremidade 3', para fazer a maior parte
a replicação do DNA. Esta enzima evita
do novo DNA.
que a dupla hélice de DNA à frente do
garfo de replicação torne-se muito • Primers de RNA são removidos e
estreitamente enrolada à medida que o substituídos com DNA pela DNA
DNA é aberto. Ela age fazendo cortes polimerase I
temporários na hélice para liberar tensão,
depois fecha os cortes para evitar dano • As lacunas entre fragmentos de DNA
permanente. são fechadas pela DNA ligase.

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