Metabolismo

e bioenergética
 O que é o metabolismo?

combustível energia

trabalho bioquímica
breve lembrete das
enzimas...
 Vida

✓ Replicação ✓ Catálise

Enzimas
= grupo de substâncias orgânicas que têm
funções catalisadoras, catalisando reações
químicas específicas que, sem a sua presença,
nāo aconteceriam ou de maneira extremamente
lenta.
As enzimas vão permitir as reações celulares de
ocorrer como catalisadores aumentando de
varias ordem de grandeza a velocidade das
reações sem serem consumidos no processo.
A manutenção da vida depende de um conjunto de reações químicas que devem
atender duas exigências fundamentais:

- precisam ser altamente específicas de modo a gerar produtos definidos

- devem ocorrer a velocidades adequadas à fisiologia da célula

A insuficiência na produção ou na remoção de metabólitos pode levar a condições

patológicas (ex: a fenilcetonúria)
PKU: o excesso de fenilalanina no sangue é neurotóxicos
e sua posterior transformação em fenilactato e
fenilacetato também exercem uma atividade neurotóxica

RETARDO MENTAL

HOMEOSTASE

A homeostase é o processo pelo qual os sistemas biológicos regulam e

mantêm um ambiente interno equilibrado, apesar das mudanças no
ambiente externo (temperatura, níveis de glicose, pH, pressão
sanguínea, ...)

A Glicemia precisa ser mentida constante !

(Álcool durante a hipoglicemia, com diabético)
Quantas enzimas diferentes existem no corpo humano?
cerca de 3.428 enzimas !!! Em outras palavras,
17% de nossas proteínas são enzimas!!!!
Mapa metabólica do ser humano
as vias metabólicas de uma célula são muito mais complexas do que o sistema de metrô de uma
cidade!
 Vias metabólicas

Características comuns das mapas metabolicas e do metro:

1.Conectividade: mapas são sistemas interconectados.

2.Fluxo de informações ou substâncias ao longo das vias.
3.Regulação e controle: mecanismos de regulação e controle para garantir um fluxo adequado.
4.Interdependência: diferentes vias ou linhas dependem umas das outras
Vias metabólicas

Mapa do metrô de São Paulo

 METABOLISMO

Conjunto de
Conjunto de reações
reações químicas
químicas que ocorrem
organizadas, sequenciaisnas células que
e controladas ou no
são
responsáveis por todas as transformações químicas em uma célula determinada
interior de organismos vivos.

Vias metabólicas:
• Glicólise
• Gliconeogênese
• Ciclo de Krebs
• Síntese de Glicogenio
• Degradação de Glicogenio
• Fosforilação Oxidativa
• Síntese de lipídeos
• Degradação de lipídeos
• Síntese de Colesterol
• Pentoses-fosfato
• Síntese de Corpos Cetonicos
• Catabolismo de aminoácidos
• Ciclo da uréia

Tipicamente uma célula eucariótica possui a capacidade de sintetizar mais de 30.000 proteínas
diferentes que catalisam milhares de reações diferentes envolvendo centenas de metabólitos,
que partilham mais de uma via metabólica.
Vias metabólicas

biossíntese

Ex. biossíntese em uma célula Ex. contração muscular

Leis da termodinâmica

• Primeira lei da termodinâmica: princípio da conservação de energia.

“Para qualquer transformação física ou química, a quantidade total de
energia no universo permanece constante, a energia pode mudar de forma ou ser
transportada de uma região para outra; entretanto, ela não pode ser criada ou
destruída.”

• Segunda lei da termodinâmica: tendência do universo à desordem crescente.

“Em todos os processos naturais, a entropia do universo aumenta.”
SISTEMA
SISTEMA Materia

ABERTO
FECHADO
ISOLADO Energia:
Calor
Trabalho
Entropia
Termodinâmica

Células = Sistemas abertos

→ Sistema tende a ir para um aumento da desorganização = Entropia

 BIOENERGÉTICA

Estudo quantitativo das transformações de energia que ocorrem

nas células vivas, bem como da natureza e função dos
processos químicos nelas envolvidos.
Bioemregética considera o fluxo de energia nos
sistemas vivos ou seja a transformação de energia
que permite a produção e a utilização de energia na
forma de moléculas de ATP (= moeda energética)
 Bioenergética

A bioenergética estuda o quantitativo das transformações

de energia que ocorrem nas células vivas, ou seja, as
mudanças de uma forma de energia para outra.
 Transdução de energia

fototróficos quimiotróficos

Somos quimiorganotróficos !!!

(= obtenção de energia por meio de reações químicas a partir de compostos orgânicos
Bioenergética

De onde tiramos a nossa energia?

K K K

Esquema simplificado do processo de obtenção de energia em quimiorganotróficos : a oxidação dos nutrientes leva
a redução de coenzimas que são oxidados por O2, produzindo ATP.
Termodinâmica

Princípios:

A célula de qualquer organismo vivo constitui um sistema estável de reações químicas mantidas
afastadas do equilíbrio.

A célula permanece fora do equilíbrio a custa da energia retirada do meio ambiente.

Assim, as células ao sintetizarem macromoléculas complexas a partir de precursores simples,

produzem e mantém uma ordem jogando para o meio ambiente as moléculas da combustão.
Termodinâmica

Energia livre de Gibbs

A variação de energia livre de Gibbs (ΔG) é uma medida que expressa a quantidade de energia
disponível para realizar trabalho a temperatura e pressão constantes.

G – energia livre de Gibbs

H – entalpia
S – entropia

Equilíbrio:

aA + bB cC + dD
Termodinâmica

Acoplamento de energia

reações exergônicas (espontâneas) versus reações endergônicas

→ Acoplamento das reações permite a síntese de várias moléculas de ATP que vão servir para fazer as biossínteses
Bioenergética

ATP: “moeda” energética da célula

ligações P-O-P fosfoanidrido

Porque a hidrólise de ATP é tão favorável e libera cerca de 31kJ/mol?
Hidrólise do ATP

DG’° ≈ -31 kJ/mol

- Ressonância do HPO4-2
- Grau de ionização elevado do
ATP e de seus produtos de
hidrólise a pH 7.0
- Cargas negativas do ATP
(repulsões eletrostáticas)
- Solvatação (moléculas de agua
cercando as moléculas)
Bioenergética

Hidrólise do ATP
Bioenergética

Compostos de alta energia

DG’º hidrólise < -25 kJ/mol

Bioenergética
Bioenergética

Coenzimas como transportadores de elétrons

Reações de oxidação-redução:

Agente redutor: molécula doadora de elétrons

Agente oxidante: molécula receptora de elétrons

C6H12O6 + 6O2 6CO2 + 6H2O

NAD+/FAD NADH/FADH2

Os nucleotídeos NAD+, NADP+, FMN e FAD são coenzimas hidrossolúveis que sofrem oxidações
e reduções reversíveis em muitas das reações metabólicas de transferência de elétrons.

- Eles são presentes em concentrações baixas nas células

- A biossíntese e distribuição de NADH celular e NADPH são altamente compartimentalizadas
(ex: mitocôndria, citosol).
Bioenergética

Vias metabólicas
Rota metabólica: conjunto de reações químicas que produz um determinado produto ou conjunto de produtos,
ou degrada um determinado substrato ou conjunto de substratos; ex: glicólise que degrada a glicose em piruvato.

Dois tipos de rotas:

- catabólicas (onde há degradação, ou “quebra” de compostos);
- anabólicas (que é a síntese, ou seja, formação de compostos).

As vias catabólicas são acompanhadas por liberação de energia livre, enquanto o anabolismo requer energia para ser
realizado.
Bioenergética

- Vias catabólicas: convergentes

- Vias anabólicas: divergentes

- Algumas vias são cíclicas, ou seja, um precursor da via é regenerado por meio de uma série de reações.
Bioenergética

Características das rotas metabólicas:

- Irreversibilidade
- Direcionamento
- Compartimentalização
- Regulação

DG’°<0

Enz.1

B
Bioenergética

Características das rotas metabólicas:

- Irreversibilidade
- Direcionamento
- Compartimentalização
- Regulação

DG’°<0
A=B?
A

Enz.2 Enz.1

C B

→ciclo fútil
Bioenergética

Características das rotas metabólicas:

- Irreversibilidade
- Direcionamento
- Compartimentalização
- Regulação

DG’°<0

x
Enz.2 Enz.1

C B
Bioenergética
 Bioenergética

Características das rotas metabólicas:

- Irreversibilidade
- Direcionamento
- Compartimentalização
- Regulação
Ex. Glicólise
Termodinâmica da reação :
Glicose + 2 NAD(P)+ = 2 Piruvato + 2 NAD(P)H + 4 H+ (∆G’°= −133.6 kJ/mol)
ADP + Fosfato + H = ATP + H2O
+ (∆G’°= +26.4 kJ/mol)
_________________________________________________________________________
_
Glicose + 2 NAD(P)+ + n ADP + n Fosfato =
2 Piruvato + 2NAD(P)H + nATP + nH2O + (4 − n)H+

n = 1 to 5 mol ATP/mol glucose.

Segundo a termodinâmica, a célula teria a capacidade de sintetizar, a

partir de uma molécula de glicose, até 5 moléculas de ATP por molécula de

glicose oxidada. Porém na glicólise, apenas 2 moléculas de ATP são

produzidas.

(Yu Ng et al., Scientific Reports, 9, 2019)

→ Várias caminhos existem para oxidar a glicose más somente um faz sentido
nas transformações químicas necessárias para a célula
Bioenergética

Características das rotas metabólicas:

- Irreversibilidade
- Direcionamento
- Compartimentalização
- Regulação

(Yu Ng et al., Scientific Reports, 9, 2019)

As rotas metabólicas são direcionadas pelo equilíbrio

termodinâmico e também dependem do investimento e
abundância em metabólitos de cada rota.

→ Várias caminhos existem para oxidar a glicose más somente um faz sentido
nas transformações químicas necessárias para a célula
Bioenergética

Características das rotas metabólicas:

- Irreversibilidade
- Direcionamento
- Compartimentalização
- Regulação

→ As rotas metabólicas são compartimentalizadas nas células (Ex. a glicólise, o ciclo

de Krebs e a fosforilação oxidativa). Essa propriedade leva a ter intermediários que
também são compartimentalizados (ATP, NADH, etc)
Bioenergética

Características das rotas metabólicas: Fluxo metabólico de uma via com múltiplas etapas

- Irreversibilidade
- Direcionamento
- Compartimentalização
- Regulação 2

Existe dois tipos de reações:

1. Limitado pelo substrato: reação em
equilíbrio. Neste caso a velocidade da reaçao
depende da concentraçao do substrato.
2. Limitado pela enzima: reação exergônica =
passo limitante da via que « compromete »
o metabolito com a via.

Enzimas específicas (pelo menos uma) para

catalisar apenas anabolismo ou catabolismo.
Bioenergética

Características das rotas metabólicas:

- Irreversibilidade
- Direcionamento
- Compartimentalização
- Regulação

Sistema multienzimático sequencial

 Exemplos de enzimas regulatórias

Fosfofrutokinase –1 (PFK-1):

ALOSTERIA
Glicogênio Fosforilase

ALOSTERIA MODIFICAÇÃO COVALENTE

Bioenergética

Características das rotas metabólicas:

- Irreversibilidade
- Direcionamento
- Compartimentalização
- Regulação

Como regular o fluxo de metabólitos de uma via metabólica?

Regulação da atividade enzimática

Fluxo de metabólitos de uma via metabólica pode ser

modulado por:

• número de cópias de enzimas (por controles

transcricionais/traducionais/protein turnover)

(minutos até horas)

• mudança da atividade enzimática das enzimas da via

por

- controle por modificação covalente ou ligação a

proteína reguladora (ex: Hexoquinase IV) (segundos até
minutos)

- regulação alostérica (milisegundos)

- seqüestro da enzima ou do substrato em

compartimentos diferentes
Controles transcricionais,
traducionais, e pós-
traducionais
- Regula o número de
cópias de enzima
- Minutos ou até horas
Modulação da atividade
enzimática
 Modulação da atividade
enzimática

- Controle por
modificação
covalente ou
ligação a
proteína
reguladora
(Hexoquinase IV)
(seg até
minutos)

- Regulação
alostérica
(milisegundos)

- Seqüestro da
enzima ou do
substrato em
compartimentos
diferentes
 Modulação da atividade
enzimática

- Controle por
modificação
covalente

- Mais comum:
fosforilação

Ativação/desativação por
Fosforilação/defosforilação
 Como analisar uma rota metabolica?
1) identificar o(s) reagente(s) que alimenta(m) a via metabólica
2) Identificar o(s) produto(s) final(is)
3) Identificar as ramificações da via metabólica
4) Identificar reações irreversíveis e de equilíbrio (reversíveis)
5) Geralmente essas reações são pontos de regulação

Exemplo: