Bioquímica

Prof. Dr. Krain Melo

Bioenergética e Metabolismo

Prof. Dr. Krain Melo

Como a energia move a vida?
 É necessária para os 1) Movimento
organismos vivos 2) Transporte
executarem diversas ativo
funções biológicas 3) Síntese

MAS, qual é a fonte de energia?

Como obter energia?

Como utilizar energia?

Classificação dos organismos
Classificação dos organismos

Carboidratos
Lipídeos
Proteínas

Dependência dos organismos

autotróficos para produção
desses compostos orgânicos
 Organismos

• Obrigatórios: Utilizam O2 como

agente oxidante para obter energia.
AERÓBICOS
• Facultativos: Ausência ou
presença de oxigênio Ex. Escherichia coli

• Utilizam agentes oxidantes como

sulfato e nitrato. Ex.: Bactérias
nitrificantes, sufulrosas como
Acidithiobacillus ferrooxidans. ANAERÓBICOS

*Obrigatórios*: morrem na presença de

O2 Ex. Bacilo causador do tétano (Clostridium tetani).
 Metabolismo
Uma série de reações químicas intrincadas que permitem obter,
armazenar e utilizar energia para realização das funções celulares.

As reações cooperam para 4 funções:

v Obter e energia química (luz solar ou nutrientes);

v Converter nutrientes à moléculas próprias da célula
(precursores)

v Polimerizar macromoléculas;

v Sintetizar e degradar biomoléculas especializadas.

Fluxo energético e de compostos
 Vias Metabólicas

à Anabolismo: à Catabolismo:
Via Biossintética Via degradativa
- Utilização de energia na - Extração de energia
forma de Trabalho - Simplificação das

- Síntese de biomoléculas moléculas a compostos

- Multiplicação comuns

è Endergônica è Exergônica
 Vias Metabólicas
As vias catabólicas e anabólicas estão relacionadas
O ATP e o NADPH produzidos pela degradação de metabólitos complexos
são fonte de energia para reações biossintéticas e outras reações
è Termodinâmica e metabolismo

è O fluxo de moléculas e energia ocorrem

em vias

à Catabolismo:
- Extração de energia
- Simplificação das moléculas a compostos
comuns

à Anabolismo:
- Utilização de energia na forma de Trabalho
- Síntese de moléculas complexas
- Multiplicação
 Vias Metabólicas

- São interdependentes

- São coordenadas
 - Mais de 2000

Mapa Metabólico reações

conhecidas
catalisadas por
enzimas
diferentes
- Sumariza a
interdependência e
coordenação das - São simples e
reações anabólicas e de tipos comuns
catabólicas

- Mais de 1000
reações podem
ocorrer ao mesmo
tempo na E. coli
 Vias Anfibólicas

Conjunto de reações que podem ser tanto Anabólicas como Catabólicas.

àDependem da condição energética da célula

à Biossíntese e degradação são quase sempre distintas

1 Ocorrem por vias diferentes.

2 Envolvem enzimas diferentes numa mesma via.

3 Podem ser compartimentalizadas.

4 – Vias irreversíveis

5 – Possuem etapas limitantes

 As vias metabólicas ocorrem em locais
específicos das células
• Mitocôndria: ciclo do ácido cítrico, fosforilação oxidativa, oxidação de ácidos
graxos, degradação de aminoácidos
• Citosol: glicólise, via das pentoses-fosfato, biossíntese de ácidos graxos,
gliconeogênese

• Lisossomo: digestão enzimática

• Núcleo: replicação e transcrição de DNA, processamento do RNA
• Aparelho de Golgi: processamento pós-traducional de proteínas de membranas e
proteínas secretoras, formação da membrana plasmática e vesículas

• RER: síntese de proteínas ligadas a membranas e proteínas secretoras

• REL: biossíntese de lipídeos de esteróides
• Peroxissomos (glioxissomos): reações de oxidação, catalisadas por aminoácido-
oxidases e catalase, reações do ciclo do glioxilato nas plantas
 A vida demanda de Energia
Mesmo em repouso, a maquinaria bioquímica está permanentemente extraindo e
utilizando energia.

TERMODINÂMICA
Área da ciência que se dedica ao estudo da ENERGIA e seus efeitos
A vida traz desafios, mas obedece as Leis da Termodinâmica

1º Lei da Termodinâmica è a “Energia é conservada”, não pode ser criada ou destruída,

‘apenas transformada’.
2º Lei da Termodinâmica è um processo será espontâneo se o CAOS do Universo
aumentar.

Sistema + Vizinhança = Universo

A Vida e Ordem
Como a Vida pode acontecer num sistema ordenado, considerando a 2º lei da
Termodinâmica?
Como criar ordem a partir do caos???
 Termodinâmica:
é o conjunto de princípios que regem as transformações de energia.

A energia não pode ser criada nem destruída, a quantidade de energia no

universo é constante. Pode, somente, mudar a forma ou o local em que ela se
apresenta.

Nos processos espontâneos existe uma tendência a

aumentar o grau de desordem. O universo sempre
tende para a desordem crescente: em todos os
processos naturais a entropia do universo
aumenta.
 Expressa a quantidade de energia
capaz de realizar trabalho durante uma
DG= DH -T DS
reação a temperatura e pressão
constantes
 Os componentes de ΔG

Energia livre de Gibbs, G:

Quando a reação libera energia a variação na energia livre de Gibbs tem sinal negativo
DG<0 (exergônica)
Quando a reação absorve energia a variação na energia livre de Gibbs tem sinal positivo
DG>0 (Endergônica)
Entalpia, H:
É o conteúdo de calor de um sistema.
Reflete o número e o tipo de ligações químicas nos reagentes e nos produtos
Quando uma ligação libera calor DH tem, por convenção ,um sinal negativo.
DH< 0 (Exotérmica)
Quando uma ligação absorve calor DH tem, por convenção ,um sinal positivo
DH>0 (Endotérmica)
Entropia, S:
É uma expressão do grau de desordem de um sistema.
Quando os produtos de uma reação são menos complexos ou mais desordenados que os
reagentes a reação ocorre com ganho de entropia
DS>0 (Aumento da desordem)
DS<0 (Diminuição da desordem)
 Entendendo os componentes de ΔG

ΔG: variação na energia livre

ΔH: variação na entalpia
* Calor liberado ou absorvido durante a
reação
* NÃO prevê se uma reação é favorável
* Energia livre para realizar trabalho
* Aproxima-se de 0 assim que uma
reação atinge o equilíbrio
* Prevê se uma reação é favorável ou
espontânea
ΔS: variação na entropia
* Aumento ou diminuição do grau de
desordem
* NÃO prevê se uma reação é favorável

Ocorre perda líquida de energia. A reação ocorre espontaneamente.

Reação exergônica

Reação em equilíbrio à NÃO OCORRE NOS ORGANISMOS VIVOS

à “Desequilíbrio” existe a custa de energia (retirada do meio)

Ocorre ganho líquido de energia. A reação NÃO ocorre espontaneamente.

Reação endergônica
 è Vida versus 2º Lei da Termodinâmica

- A vida ocorre com a ΔS < 0 local a custas da ΔS > 0 do meio externo

- A quebra de nutrientes ajuda a reduzir localmente a entropia

à Os organismos vivos são SISTEMAS ABERTOS EM EQUILÍBRIO ESTACIONÁRIO COM O

MEIO.

àTermodinâmica clássica à sistemas ISOLADOS à troca ENERGIA com o MEIO

à atinge, INEXORAVELMENTE, o EQUILÍBRIO com a vizinhança

- VIDA à SISTEMA ABERTO à troca MATERIA E ENERGIA com o MEIO

à Não atinge o EQUILÍBRIO com o MEIO à Se atingir à MORTE

Os organismos vivos preservam a sua ordem interna pela retirada de

energia do meio na forma de nutrientes ou energia solar, e devolvem
para o meio na forma de calor e entropia
 è Vida versus 2º Lei da Termodinâmica

à Os organismos vivos ingerem substância com ALTA ENTALPIA e BAIXA ENTROPIA e os

convertem em compostos com BAIXA ENTALPIA e ALTA ENTROPIA

àO conteúdo ENTRÓPICO dos alimentos é tão importante como o ENTÁLPICO.

à A energia é transformada (1º Lei da Termodinâmica)

- Sistema organizado à Baixa Entropia à é mantido

à Estado estacionário à Fluxo constante mantido pelo gradiente de concentração ou pelo

gasto de ΔG;

à O gasto de ΔG ocorre de modo “morro abaixo” através do acoplamento de processos

endergônicos e exergônicos
à O sistema é dissipativo à Rendimento é “baixo”
èVida versus 2º Lei da Termodinâmica

a) Organismos vivos extraem energia da sua vizinhança

à Envolvem Reações de Óxido-Redução

b) Parte da Energia é convertida em trabalho

c) Parte da Energia é convertida em Calor

à > ΔS da vizinhaça

d) Liberação de produtos na forma de moléculas simples

à > ΔS da vizinhaça

e) Parte da energia é utilizada para síntese de moléculas

complexas
à < ΔS local à ordenamento

2ª Lei da termodinâmica: entropia do universo

aumenta durante os processos químicos e físicos
MAS NÃO REQUER que o aumento ocorra dentro
do próprio sistema reativo
 Termodinâmica e Acoplamento de reações

[ C eq ] c [ D eq ] d
Keq =
DG = DG 0 + RT ln K eq [ A eq ] a [ B eq ]b
ΔG0 = ΔG equivalente à condição de equilíbrio na condição padrão
à Segundo a equação, a ΔG depende da concentração dos reagentes

Se ΔG = 0 à no equilíbrio à DG 0 = -RT ln K eq = DH - TDS

A B+C ΔG0’ = + 5 kcal/mol

B D ΔG0’ = - 8 kcal/mol
A C+D ΔG0’ = - 3 kcal/mol
 O Acoplamento de reações

à Uma reação termodinamicamente não-favorável pode ser transformada em uma

favorável através do acoplamento de uma reação termodinamicamente favorável.
à Ativação de reagentes
à Conformação ativada da proteína
à Gradiente de íons
 Termodinâmica de algumas reações bioquímicas

Reações com valores de ΔG

próximos de ZERO podem ser
facilmente revertidas pela
mudança nas concentrações de
produtos e de reagentes
 Termodinâmica de algumas reações bioquímicas

è Reações com valores de ΔG próximos de ZERO podem ser facilmente

revertidas pela mudança nas concentrações de produtos e de reagentes

Entretanto, certas enzimas que operam longe do equilíbrio estão

estrategicamente localizadas nas vias metabólicas:

– As vias metabólicas são “irreversíveis”

– Cada via metabólica possui uma etapa inicial limitante
– As vias catabólicas e anabólicas são distintas

1 A 2 ΔG0’ < 0

Y X ΔG0’ < 0

As rotas de inter-conversão independentes permitem a existência de sistemas de

controle independentes.
 Adenosina Trifosfato
è 1 das 100 moléculas essenciais - Metabólitos primários - para a Vida
è Moeda universal de Energia na Bioquímica

à A hidrólise de ATP é Exergônica

ATP + H2O ADP + Pi ΔG0’ = - 7,3 kcal/mol

ATP + H2O AMP + PPi ΔG0’ = - 10,9 kcal/mol

 Adenosina Trifosfato
A hidrólise de ATP impulsiona o Metabolismo ao deslocar o equilíbrio

A B ΔG0’ = + 4,0 kcal/mol

[B] eq 0

À 25 oC a Keq será:
K 'eq = = 10 -DG '/ 298,15*1,987*2.303
= 0,00115
[ A] eq

A + ATP + H2O B + ADP + Pi ΔG0’ = - 3,3 kcal/mol

ΔG0’Total= + 4,0 kcal/mol + (- 7,3 kcal/mol) = - 3,3 kcal/mol

[B] eq [ ADP] eq [Pi] eq 0

K 'eq = x = 10 -DG '/ 298,15*1,987*2.303

= 262
[ A]eq [ ATP] eq

O Acoplamento da hidrólise de ATP permite reverter um processo não-favorável num

favorável num fator de 105 vezes em condições padrão.
 Adenosina Trifosfato
è A ΔG de hidrólise de ATP dentro de uma célula é de 12000 cal/mol (12 kcal/mol)

O que explica o alto potencial doador de fosforila do ATP???

ATP + H2O ADP + Pi ΔG0’ = - 7,3 kcal/mol

Glicerol 3-Fosfato + H2O Glicerol + Pi ΔG0’ = - 2,2 kcal/mol

 Adenosina Trifosfato
èA ΔG de ativação da hidrólise de ATP é alta e somente a hidrólise enzimática é viável

1) Produto da hidrólise é estabilizado por ressonância

2) Repulsão eletrostática no ATP evita

as estruturas de ressonância

3) Ionização dos produtos da hidrólise de ATP

4) Estabilização dos produtos de hidrólise por hidratação

A ligação fosfodiéster NÃO É rica em energia!!!

 Oxidação de compostos Carbonados
è Um ser humano típico (70 kg) tem aproximadamente 100 g de ATP
è ATP tem um alto número de renovação – turnover number
- Em repouso: 40 kg de ATP em 24 horas à 28 g/min
- Em exercício vigoroso à 500 g/min
- Para corrida de 2 horas à 60 kg de ATP

O Organismo está constantemente oxidando

combustíveis para formar ATP
Quanto mais reduzido o Carbono maior a energia extraída
 Potencial doador de Fosforila
è O ATP não é a única molécula na célula capaz de doar fosforilas
è Existem moléculas com maior potencial doador de fosforila do que o ATP

São moléculas
formadas a partir
da oxidação dos
combustíveis:
Compostos
carbonados
 Potencial doador de Fosforila
èO ATP não é a única molécula na célula capaz de doar fosforilas
è Existem moléculas com maior potencial doador de fosforila do que ATP

São capazes de doar Pi para o ADP

è Fosforilação “ao nível do

substrato”

è Posição intermediária permite

que o ATP funcione como
carreador de fosforilas.

è Funcionam como Tampões de

fosforilas para o ATP
 Potencial doador de Fosforila
è Creatina-Fosfato é um tampão de Pi na célula muscular
è Seu alto potencial doador de Pi permite formar ATP a partir de ADP no exercício

A quantidade de ATP
disponível na célula
muscular é suficiente para
apenas 1 segundo de
exercício extenuante.
 Síntese de ATP
è Pequena parte do ATP é obtido a partir da “fosforilação ao nível do substrato”
- Anaeróbica
è Maior parte é formada por uma BOMBA DE PRÓTONS movida por um gradiente de
concentração
- Aeróbica

Membrana
Extração de Energia dos alimentos
Temas Recorrentes do Metabolismo
 Os Carreadores: coenzimas

Anel iso-aloxazina
Os Carreadores: coenzimas

R = H ou Pi
Os Carreadores: coenzimas
 As Reações Recorrentes do Metabolismo
2) Reações de Ligação (Ligases)
- União de moléculas à custas da energia livre da clivagem de ATP

3) Reações de Isomerização (Isomerases)

- Reações de rearranjo molecular è Prepara a molécula para reações subsequentes
 As Reações Recorrentes do Metabolismo
4) Reações de transferência (Transferases)
- Muito variáveis
- Grupo fosforila é transferido do ATP para outra molécula
- Ativação de substrato
 As Reações Recorrentes do Metabolismo
5) Reações de Hidrólise (Hidrolases)
- A água quebra uma ligação à quebra de macromoléculas
 Controle do fluxo metabólico
1. Controle alostérico – regulação por retroalimentação

A B C D

2. Modificações covalentes – inter-conversão enzimática

 Controle do fluxo metabólico

[ ATP] + 1 2 [ ADP] Inibe vias Catabólicas

Carga Energética =
[ ATP] +[ ADP] +[ AMP] Estimula vias Catabólicas