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UNIVERSIDADE DO ESTADO DE MINAS GERAIS

UNIDADE: DIVINÓPOLIS

Fundamentos de
Bioquímica
Prof. Mayron Vasconcelos

Divinópolis
2020
1. Introdução

A Lógica Molecular da Vida


A Lógica Molecular da Vida

1. Introdução

2. Fundamentos Celulares

3. Fundamentos Químicos

4. Fundamentos Físicos

5. Fundamentos Genéticos e
evolutivos
Bioquímica

Bioquímica = Química da Vida


Bioquímica

Final do século XVIII

Antoine Lavoisier Joseph Priestley

Século XIX

Jöns Berzelius Justus von Liebig Louis Pasteur

“Pai da Bioquímica” (1903)

Carl Neuberg
Bioquímica

• Esta nova ciência era denominada química


fisiológica ou então química biológica.

• Publicado a primeira revista oficial desta nova


“ciência” (Zeitschrift für Physiologisce Chemile,
1907)

• Revista norte-americana Journal of Biological


Chemistry (1906) consagrou-se como importante
divulgadora das novas descobertas no campo da
bioquímica, sendo editada até hoje.
Bioquímica
• Do ponto de vista químico, os seres vivos são
constituídos de elementos bastante simples e comuns

• 99% da massa da maioria das células são compostas


por C, H, O e N.

• A vida deve ser tratada como o resultado da


maximização de fatores físicos e químicos presentes
em um sistema aberto e complexo: a célula.

• A bioquímica mostra como o conjunto de moléculas


inanimadas que constituem os organismos vivos
interage para manter e perpetuar a vida
exclusivamente pelas leis físicas e químicas que
regem o universo inanimado.
Bioquímica

O que distingue os organismos vivos dos objetos não vivos?

1. Alto grau de complexidade química e organização;


2. Sistemas para extração, transformação e uso de energia do ambiente;
3. Funções definidas para cada componente e interação regulada entre
eles;
4. Mecanismos para sentir e responder as alterações do ambiente;
5. Capacidade para auto-replicação e automontagem;
6. Capacidade de se alterar ao longo do tempo por evolução gradual
A Lógica Molecular da Vida

Bioquímica descreve em termos moleculares


as estruturas, os mecanismos e os
processos químicos compartilhados por
todos os organismos vivos, e fornece os
princípios organizacionais que
fundamentam a vida em todas as suas
diferentes formas, princípios esses que são
coletivamente referidos como “A Lógica
Molecular da Vida”
A Lógica Molecular da Vida

• “O que vale para a E. coli também vale para um elefante”. (Jacques


Monod, 1954)
A Lógica Molecular da Vida

Proteína de ligação ao TATA-box (regulação da expressão gênica),


semelhante em três organismos consideravelmente diferentes que
estão separados um do outro por bilhões de anos de evolução.
2. Fundamentos Celulares

A Lógica Molecular da Vida


Fundamentos Celulares

Células: são as unidades estruturais e funcionais de todos os seres vivos

• Eucariotos: são células que


possuem envelope nuclear
(carioteca) e organelas envoltas
por membranas

• Procariotos: são células


desprovidas de envelope nuclear
(carioteca), não possuem
organelas envoltas por membranas
Constituintes Bioquímicos da Célula

• Biomoléculas
Hierarquia estrutural na organização
molecular das células
3. Fundamentos Químicos

A Lógica Molecular da Vida


Fundamento Químicos

Em vermelho: Componentes estruturais de células e tecidos


Em amarelo: representam uma fração minúscula do peso do corpo humano,
mas todos são essenciais à vida
99% da massa da maioria das células são compostas por C, H, O e N.
As biomoléculas são compostos de carbono com
uma variedade de grupos funcionais

Nenhum outro elemento químico consegue


formar moléculas com tanta diversidade de
tamanhos, formas e composição.
As biomoléculas são compostos de carbono com
uma variedade de grupos funcionais
Vários grupos funcionais em uma biomolécula

A “personalidade” química de um composto é determinada pela química de seu


grupo funcional e pela sua disposição no espaço tridimensional.
Macromoléculas
Macromoléculas

• O conjunto de todas as proteínas em


funcionamento em determinada
célula é chamado de proteoma da
célula;

• O genoma é a sequência completa


do DNA da célula (ou no caso do
RNA viral, o seu RNA);

• O glicoma da célula é o conjunto de


todas as moléculas contendo
carboidratos;

• O conjunto de todas as moléculas


contendo lipídeos em uma célula
constitui o seu lipidoma.
A estrutura tridimensional é descrita pela
configuração e pela conformação

• Interações entre biomoléculas são invariavelmente


estereoespecíficas, exigindo configurações específicas das
moléculas interagentes.

• Hexocinase e D-glicose

A estrutura tridimensional é descrita pela configuração e pela


conformação
Assimetria Molecular
Configurações de isômeros geométricos

• A configuração é conferida por dois principais fatores:

• (1) ligações duplas, em torno das quais existe pouca ou nenhuma


liberdade de rotação

Isômeros geométricos
Configurações de isômeros geométricos
Isômeros Espaciais ou Estereoisômeros

• (2) pela presença de centros quirais, em torno dos quais grupos


substituintes são arranjados em uma orientação específica.

Molécula quiral

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Isômeros Espaciais ou Estereoisômeros

• Enantiômeros: São imagens especulares


• Diastereoisômeros: Não são imagens especulares
Isômeros Espaciais ou Estereoisômeros
4. Fundamentos Físicos

A Lógica Molecular da Vida


Fundamentos Físicos

• Células e organismos vivos realizam trabalho para manutenção da


vida, crescimento e reprodução

• Trabalho químico à Síntese de componentes celulares

• Trabalho osmótico à Acúmulo e retenção de sais e outros


componentes contra o gradiente de concentração

• Trabalho mecânico à Contração muscular e movimentação de flagelo


Fundamentos Físicos

• Bioenergética descreve como os organismos vivos capturam,


transformam e utilizam a energia

Todos os organismos vivos direta


ou indiretamente da energia
radiante da luz solar

Os organismos vivos são


interdependentes, trocando energia
e matéria através do meio
ambiente
Fundamento Físicos

Leis da Termodinâmica
Primeira lei: Lei da conservação de energia: Numa modificação química ou
física, a quantidade total de energia no universo permanece constante, embora
a forma de energia possa mudar

As células são transdutoras de energia: capazes de converter energia química,


eletromagnética, mecânica e osmótica com muita eficiência (funcionam a
temperatura constante)

Segunda lei: Lei da Entropia: Em todos os processos naturais a entropia do


universo aumenta

Definição rigorosa de entropia: Qualitativamente pode ser descrita como


“desordem” ou “caos” manifestada de várias maneiras
Fundamento Físicos

“Existe uma maré nos casos dos homens


A qual, levando à inundação, nos
encabeça à fortuna.
Mas omitidos, a viagem das vidas deles
Está restrita em sombras e misérias.”
Bioenergética e Termodinâmica

ΔG = ΔH - TΔS

G = Energia livre: H = Entalpia: S = Entropia:

Energia capaz de realizar A máxima energia de um expressão quantitativa


trabalho durante uma sistema termodinâmico; para desordem e caos:
reação a T e P constante:
Reflete o número e o tipo de Se os produtos são
Se a reação libera ligações nos menos complexos e
energia livre reagentes e produtos mais desordenados:
DG = (-) exergônico ganho de entropia
(ESPONTÂNEO) H reg > H prod: DS = (+)
DH = (-) exotémico
Se ganha energia livre Se os produtos são mais
DG = (+) Endergônico H reg < H prod: complexos e mais
(NÃO-ESPONTÂNEO) DH = (+) endotérmico ordenados:
perda de entropia
DS = (-)
• Energia Livre (G):

Energia Livre de Gibbs (G): prediz a direção da reação e a quantidade de


trabalho

A fração de energia disponível para


realizar trabalho = energia livre de Gibbs
(G).

Ela é sempre menor do que a energia


teoricamente liberada. Uma parte é
dissipada como calor
Papel Central do ATP no metabolismo
Acoplamento energético em uma reação química
Ex: Conversão de glicose em glicose-6-fosfato

ΔG>0 ΔG<0
Reação endergônica Reação exergônica
Não espontânea Espontânea
Absorção de energia Liberação de energia
Papel Central do ATP no metabolismo

Catabolismo: reações
degradativas produtoras
de energia livre – ATP.

Anabolismo: vias de
biossíntese que requerem
adição de energia.
O curso energético de uma reação química

As enzimas são catalisadores bioquímicos que aceleram as


reações químicas através da diminuição da energia de
ativação sem alterar o equilíbrio da reação.
Algumas interconversões de energia em
organismos
5. Fundamentos Genéticos e
Evolutivos

A Lógica Molecular da Vida


DNA – Ácido desoxirrobonucléico

• Uma das propriedade mais marcantes dos


organismos e das células vivas seja sua
capacidade de se reproduzir por incontáveis
gerações com fidelidade quase perfeita.

• A continuidade genética está contida em uma


única molécula de DNA

• Síntese de novas fitas idênticas à original


DNA – Ácido desoxirrobonucléico

• Material genético da E. coli é uma única


molécula contendo 4,64 milhões de pares de
nucleotídeos

• Replicado perfeitamente à Gerando


descendentes idênticos
A informação contida no DNA é expressa na forma
de proteínas
Papel das mutações na evolução

• O acúmulo gradual de
mutações durante longos
períodos de tempo resulta em
novas espécies biológicas,
cada uma com uma
sequência única de DNA.
Papel das mutações

Ambiente contendo
apenas galactose

Vantagem

Seleção natural
Fundamento evolutivos

1. Compactação do DNA

2. Sistema de membranas intracelular

3. Formação de associações endossimbióticas

Lynn Margulis, 1938-2011


Boa noite!

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