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ESTRUTURA E FUNÇÃO DAS

BASES NITROGENADAS,
NUCLEÓTIDOS E ÁCIDOS
NUCLÉICOS

Dulce Nhassico
dnhassico@gmail.com
Maio de 2023
Objectivos do Capítulo
No final deste capítulo o estudante deverá saber:
☻ Explicar a relação entre nucleósideos, nucleotideos e ácidos nucleicos
☻ Descrever as unidades fundamentais dos ácidos nucleicos, nucleotídeos, e nucleósideos reconhecendo
algumas de suas funções biológicas
☻ Identificar e desenhar a estrutura básica das bases nitrogenadas e indicar a principal diferença entre elas
☻ Mencionar as propriedades químicas das bases nitrogenadas
☻ Explicar a importância biomédica dos nucleósidos, nucleótidos e ácidos nucléicos
☻ Listar as funções dos nucleótidos e dos ácidos nucléicos
☻ Descrever estruturas e funções de alguns nucleotídeos não poliméricos
☻ Nomear os constituintes dos nucleótideos
☻ Diferenciar nucleotídeos de nucleosídeos; nomear nucleotídeos e nucleosídeos; descrever a formação
dos nucleotídeos;
☻ Nomear o tipo de ligações existentes entre os diferentes constituintes dos nucleótideos;
☻ Nomear os nucleósidos e nucleótideos comuns;
☻ Indicar as reacções quimícas dos nucleósideos e nucleótideos
☻ Descrever a estrutura do DNA e do RNA;
☻ Descrever o modelo da dupla-hélice;
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☻ Descrever a desnaturação do DNA;
Definições
● Bases Nitrogenadas – São compostos químicos formados por anéis,
levemente alcalinos que contêm nitrogénio. Juntamente com açucar e um
ácido fosfórico, elas compõem o RNA e o DNA.

● Nucleosídeos - nucleotídeo sem o agrupamento fosfato. São produtos


de hidrólise química ou enzimática, ocorrem em quantidade muito
pequena na célula.

● Nucleotídeos - moléculas presentes nas células formadas por bases


nitrogenadas, fosfato e pentose. A maior parte deles são encontrados
unidos, formando os ácidos nucleicos.

● Ácidos nucleicos - macromoléculas constituídas por nucleotídeos e que


formam dois importantes componentes das células, o DNA e o RNA.
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Generalidades

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IMPORTÂNCIA BIOMÉDICA

● Análogos sintéticos de
bases nitrogenadas e
nucleósidos podem ser
usados como fármacos no
tratamento de doenças
cancerígenas; doenças
causadas por defeitos no
metabolismo de
nucleótidos, etc.

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IMPORTÂNCIA BIOMÉDICA (cont.)

● Nucleótidos constituem o código genético. Este por sua


vez fornece uma base para explicar a maneira como os
defeitos nas proteínas podem provocar doenças de forum
genético, para explicar o diagnóstico e provavelmente o
tratamento desses distúrbios.

● Os ácidos nucleícos constituem o material genético de


todos os seres vivos. Alterações na sua estrutura trazem
que afectam o funcionamento do organismo.

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NUCLEÓTIDOS

Funções: ● Nucleotídeo mais conhecido:


● Nas células, a maioria deles trifosfato de adenosina – ATP
encontra-se na sua forma ● Fonte imediata de energia no
polimérica (DNA ou RNA); metabolismo: ATP e GTP;
● Principal função: armazenamento ● Mediadores fisiológicos:
e transferência da informação ● ADP – agregação plaquetária
genética. ● cAMP/ cGMP – agem como
segundos mensageiros
● Nucleotídeos livres e derivados ● GTP – capeamento de
desempenham uma grande extremidade 5’ do mRNA e
variedade de funções metabólicas formação de microtúbulos.
não-relacionadas à informação
genética:
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NUCLEÓTIDOS
Funções: ● Percursores : GTP- síntese
● Intermediários activados no de tetrahidrobiopterina
metabolismo celular: (hidroxilação para
● UDP-Glc - síntese de formação do óxido nítrico
glicogénio (NO), metabolismo dos
● GDP-manose – síntese de aminoácidos aromáticos).
glicoproteinas ● Componentes de
● CTP – metabolismo de coenzimas: NAD+,
fosfolípidos NADP+, FAD,
● Efectores alostéricos: ● Efectores alostéricos:
Controlam processos Controlam processos
metabólicos - ADP, ATP, AMP. metabólicos - ADP, ATP,
AMP.
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COMPONENTES DOS NUCLEÓTIDOS
Cada nucleótido é formado por três compostos característicos

1. Uma base nitrogenada


(purínica ou pirimidínica)

2. Um monossacárido (pentose)

Ribose ou desoxirribose

3. Uma a três moléculas de


fosfato

"Os nucleosídeos compreendem


a base nitrogenada ligada apenas
ao açucar” 9
COMPONENTES DOS NUCLEÓTIDOS

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COMPONENTES DOS NUCLEÓTIDOS

● Exemplo de um Nucleótido

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A. BASES NITROGENADAS

Base nitrogenada ou azotada


● São compostos formados por aneís, que contëm
nitrogénio e são levemente alcalinos;
● São classificadas em dois grupos: purinas e pirimidinas;
● Purinas – são maiores e contêm dois anéis;
● Pirimidinas – são menores e possuem apenas um anel;
● Os grupos funcionais mais importantes são os nitrogénios
do anel, os grupos carbonila e amino exociclícos;

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A. BASES NITROGENADAS

Bases nitrogenadas (cont.)


● A, G e C são encontrados tanto nos
ribonucleotídeos e assim como nos
desoxiribonucleotídeos;
● U é encontrada basicamente em ribonucleotídeos,
e T somente em desoxiribonucleotídeos;
● Os ribonucleotídeos são encontrados no RNA;

● Os desoxinucleotídeos são encontrados no DNA.

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A. BASES NITROGENADAS

Tipos de bases nitrogenadas

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A. BASES NITROGENADAS

1. A. Bases purínicas

Adenina Guanina 15
A. BASES NITROGENADAS

1.B. Pirimidínicas

Citosina Uracilo
Timina 16
A. BASES NITROGENADAS
1.1. Propriedades químicas das bases
nitrogenadas
● Tem carácter hidrofóbico e são relativamente
insolúveis em PHs próximos á neutralidade.
● As bases purínicas e pirimidínicas dos ácidos
nucléicos podem assumir diferentes formas
tautoméricas.
● Tautômeros são isômeros de conversão fácil,
diferindo entre si apenas nas posições dos
hidrogênios. Formam emaprelhamentos não
usuais.
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A. BASES NITROGENADAS
1.1.1. FORMAS TAUTOMÉRICAS

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B. MONOSSACÁRIDO

Pentose
● Nos ribonucleotídeos, a pentose é ribose;
● Nos desoxirribonucleotídeos, o açúcar é a
2’-desoxirribose.
C5H10O5 C5H10O4

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C. ÁCIDO FOSFÓRICO
Ácido Fosfórico
● A adição de um ou mais radicais
fosfato à OH do carbono 5' da
pentose, através de uma ligação
covalente (fosfoéster) completa a
estrutura dos nucleotídeos;

● Os grupos fosfato são


responsáveis pelas cargas
negativas dos nucleotídeos e dos
ácidos nucléicos;

● A adição de um segundo ou
terceiro grupo fosfato ocorre em
seqüência, dando origem aos
nucleotídeos di e trifosfatos,
respectivamente. 20
LIGAÇÕES ENTRE OS COMPONENTES DO NUCLEÓTIDO

1. b-N-Glicosídica

Ligação B1’-1 21
Ligação B1’-9
LIGAÇÕES ENTRE OS COMPONENTES DO NUCLEÓTIDO

2. Fosfoéster

??

A pentose se liga ao grupo fosfato através de


uma ligação fosfoéster com a hidroxila ligada
ao carbono-5 da pentose.
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NOMENCLATURA

Nomeclatura dos nucleosídos

Nucleosídeos da pirimidina = raíz do nome da base + idina


Ex: Citidina, Uridina, Timidina

Nucleosídeos da purina = raíz do nome da base + osina


Ex: Guanosina, Adenosina

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NOMENCLATURA (nucleósido e nucleótido)
ÁCIDO
BASE NUCLEÓSIDO NUCLEÓTIDO
NUCLÉICO
Adenina Adenosina Adenilato RNA
Desoxiadenosina Desoxiadenilato DNA
Guanina Guanosina Guanilato RNA
Desoxiguanosina Desoxiguanilato DNA
Citosina Citidina Citidilato RNA
Desoxicitidina Desoxicitidilato DNA
Timina Timidina ou Timidilato ou DNA
desoxitimidina desoxitimidilato
Uracilo Uridina Uridilato RNA
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NOMENCLATURA IUPAC
ABREVIA-
NUCLEÓTIDO ÁCIDO FOSFATO
TURA
Ácido 5'-adenílico Adenosina-5'-monofosfato AMP
Ácido 5'-citidílico Citidina-5'-monofosfato CMP
Ribonucleótido
Ácido 5'-guanílico Guanosina-5’-monofosfato GMP
Ácido 5'-uridílico Uridina-5'-monofosfato UMP
Desoxiadenosina
Ácido desoxiadenílico dAMP
monofosfato
Desoxi- Ácido desoxicitidílico Desoxicitidina monofosfato dCMP
ribonucleótido Desoxiguanosina
Ácido desoxiguanílico dGMP
monofosfato
Ácido timidílico Timidina monofosfato TMP

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NOMENCLATURA IUPAC

NUCLEÓTIDOS DE DNA

26
NOMENCLATURA IUPAC

NUCLEÓTIDOS DE RNA

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REACÇÕES DOS NUCLEÓSIDOS/NUCLEÓTIDOS

● Metilação
● Hidroximetilação
● Aminação
● Desaminação
● Depurinação

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REACÇÕES DOS
NUCLEÓSIDOS

● Metilação
I. Por acção das metil
transferases.

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REACÇÕES DOS
NUCLEÓSIDOS

● Desaminação
I. Remoção do grupo
amino. Mais comum na
citosina e vai resultar
em uracila.

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REACÇÕES DOS NUCLEÓTIDOS
● Reacção de Depurinação

31
Ligação fosfodiéster
● Polimerização por
esterificação
Formação de polímero de
nucleótidos,o ácido nucléico.
Nucleótidos unidos por
ligações fosfodiéster.
Resulta da esterificação de
um grupo fosfato e duas
pentoses adjacentes.
Esterificação:

3’-OH
+
grupo fosforil 5’ do nucleótido seguinte 32
33
POLIMERIZAÇÃO DE NUCLEÓTIDOS

34
REAÇÕES DOS NUCLEÓTIDOS
● Polimerização por esterificação

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Ácidos Nucléicos
Importância:
● Determinam a formação e o desenvolvimento de
todas as formas de vida
● O DNA é responsável pela transferência de
informação genética para os descendentes
● Conhecimento da estrutura e função  compreender
a genética, aspectos de fisiopatologia e a base das
doenças genéticas.
Tipos:
● ADN (DNA)
● ARN (RNA)

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Ácidos Nucleícos
● DNA – ácido desoxirribonucléico:
armazenador da informação genética
na maioria dos seres vivos.

● RNA – ácido ribonucléico:


armazenador da informação genética
em alguns vírus.

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Ácidos Nucleícos

O Dogma Central da Biologia Molecular

Foi postulado por Francis Crick em 1958. Explica como


ocorre o fluxo de informaçao do código genético. Explica os
processos de replicação e transcrição do ácido
desoxirribonucleico (DNA) e tradução do ácido ribonucleico
(RNA) em proteinas.

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Ácidos Nucleícos
O Dogma Central da Biologia Molecular

39
Dogma Central

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PROPRIEDADES QUÍMICAS E FÍSICAS DOS ÁCIDOS NUCLÉICOS

● Absorvem radiação UV a 260nm (Bases) quando


em solução e a pH fisiológico.
● É útil para quantificação do ácido nucléico presente
numa solução.

● Desnaturação e renaturação (replicação,


transcrição)
● O ponto de fusão (tm) é tanto maior quanto maior a
quantidade de pares guanina-citosina na molécula.
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PROPRIEDADES QUÍMICAS E FÍSICAS DOS ÁCIDOS NUCLÉICOS

● Interações entre os anéis cíclicos levam a um


empilhamento das bases em uma conformação planar;

● O empilhamento das bases é mantido por interações


eletrônicas (forças de van der Waals, dipolo-dipolo) -
reduz o contato com a água e o espaço entre as bases;

● Pontes de hidrogênio entre bases complementares e o


pareamento de bases na estrutura do DNA.

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PONTES DE HIDROGÉNIO ENTRE AS BASES

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Acidos Nucleicos
● Polímeros de nucleotídeos: DNA e RNA
● Oligonucleotídeos < 50 bases
● Polinucleotídeos > 50 bases

● Ligação entre nucleotídeos: fosfodiéster


Posições 3’ - 5’
● Unidade variável - base nitrogenada

● Fosfatos são ácidos

● Ácidos nucléicos formam poliânions em


pH fisiológico;

● São pouco susceptíveis a ataques


nucleofílicos.
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Acidos Nucleicos
O Açúcar-Fosfato forma a espinha dorsal ou esqueleto da cadeia

45
DNA
● Localização celular:
● núcleo e mitocôndria

● Estrutura elucidada por Watson e Crick em 1953

● Armazena e transmite a informação genética

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ESTRUTURA DO DNA
● Em forma de dupla hélice
● Composta por :
Desoxiadenilato (dAMP)
Desoxiguanilato (dGMP)

Desoxicitidilato (dCMP)

Timidilato (TMP) OU Desoxitimidilato (dTMP)

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Estrutura do DNA -
polaridade

Orientação 5’3’

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H
Estrutura do DNA
● Estrutura primária – sequência de
desoxiribonucleótidos.
● Extremidade 5’ : -OH fosforilado
● Extremidade 3’: -OH livre.

49
Estrutura do DNA
☻ Estrutura secundária (dupla hélice)
☻ resultade interacções do tipo pontes de hidrogénio entre
bases nitrogenadas de cadeias complementares, que
adoptam a forma de hélice dupla.

50
Estrutura do DNA
Pareamento das bases
☻ Complementaridade entre:
☻Adenina e Timina
☻Citosina e Guanina

Timina + Citosina = Adenina + Guanina


 Timina + Citosina + Adenina + Guanina =
100%

51
Estrutura do DNA

☻Adenina e Timina formam


2 pontes de H.

☻Citosinae guanina
formam 3 pontes de H.

 As cadeias na hélice -
disposição assimétrica:
Concavidade maior e
menor
52
A Dupla Hélice do DNA

● Cada volta da hélice


possui em média
cerca de 10 bases
nitrogenadas.

● A hélice enrola-se
para a direita.

● As hélices são
antiparalelas
(sentido e
polaridade opostos). 53
O e n o v e l a m e n t o d o DNA p ro t e g e o s grupos apolares da água

Interior
Bases
pare adas 54
Estrutura do DNA

Forma B (DNA-B)
● Forma mais estável
(padrão)
● Predominante no DNA
cromossômico
● 10,5 bases por volta

55
Estrutura do DNA

Forma A (DNA-A)
● Variante da forma B surge
devido a redução da
humidade relativa em
75%
● 11 pares de bases por
volta
● Predominante em híbridos
DNA-RNA ou RNA-RNA
(dupla fita)

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Estrutura do DNA

Forma Z (DNA-Z)
● Rotação para a esquerda
-12 pares de base por
volta
● Devido à sequencias
repetidas C e G
● Suspeita-se que é
importante para a
regulação da expressão
gênica e recombinação

57
Estrutura do DNA
As v ar i a ç õe s e st r ut ur ai s

58
Estrutura do DNA

DNA pode adquirir formas menos usuais:

● Arranjos cruciformes
● Fita tripla
● Dobramento

Importantes no processo de reconhecimento do


DNA por certas proteínas e enzimas

59
Tripla hélice

60
Propriedades químicas da fita de DNA

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Estrutura do DNA
● Estrutura terciária
● Resulta do superenrolamento da hélice dupla
de DNA (super-hélice)

● Esta estrutura é adquirida quando a molécula


sofre enrolamento no sentido da progressão e
dobra-se sobre si mesmo.
● O enrolamento é feito em torno de proteínas
(Histonas)  empacotam e organizam o DNA em
NUCLEOSSOMOS  CROMOSSOMOS
62
Estrutura do DNA

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Estrutura e Função do RNA
● Polímero de ribonucleosídeos 5’monofosfatos;
● Função estrutural (ribossoma), transportadora e catalítica
(ribozima).
● RNA Composto por Adenilato, Guanilato, Citidilato e
Uridilato;
● Ligações 3’,5’-fosfodiéster linear de fita simples;
● Podem apresentar uma estrutura secundária e terciária
que envolve o pareamento de bases intramoleculares,
empilhamento de bases e pontes de hidrogênio entre
diferentes parte da molécula.

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Estrutura do RNA

65
Estrutura do RNA
● Estrutura primária – Linear

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Estrutura do RNA
● Estrutura secundária
– Folha de trevo

Resulta das interações


do tipo pontes de
hidrogénio entre as
bases nitrogenadas
complementares da
MESMA cadeia
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Estrutura do RNA
● Estrutura terciária – pouco conhecida para a
maioria dos RNA.
● Conhece-se a estrutura do tRNA que é designada de
L invertido.

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Estrutura do RNA

TIPO DE RNA
● RNA mensageiro mRNA

● RNA transportador tRNA

● RNA ribossômico rRNA

● RNA nulceares snRNA e RNA de interferencia RNAi


(metabolism do mRNA e controle da expressao
genetica).

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Estrutura e Função do RNA
mRNA
● Contém a informação codificada no DNA, a qual será
traduzida em proteína
● O mRNA pode ser monocistrônico ou policistrônico

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Estrutura do RNA
tRNA
● Ativa os aminoácidos -
haste aceptora - para que
a formação da ligação
peptídica seja
energeticamente
favorável
● Reconhece códons no
mRNA - alça do
anticódon.

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Estrutura do RNA

rRNA
● O ribossoma é o aparelho
da síntese protéica (65%
RNA e 35% proteína);
● O rRNA corresponde a 80
% do RNA celular.

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Bibliografia
1. A. Lehninger - LEHNINGER: Principles of Biochemistry. 6ª Edição

2. R. K. Murray; D.A.Bender; K.M.Botham; P.J. Kennelly; V. W.

Rodwell; P.A. Weil - Harper’s Ilustrated Biochemistry – 28th edition

– McGraw Hill. 2009

3. G. Meisenberg; W. Simmons – Principles of Medical Biochemistry

– Mosby. 1998

4. L. Stryer - Biochemistry. 4ª Edição – FREEMAN. 1999

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