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. Mutação Missense
. Mutação Nonsense
Mutações Frameshift
TRANSIÇÃO são substituições de uma base pirimídica por outra pirimídica, ex.: T→C
translocação
1
Exercícios de cálculo
Calcule o número de aminoácidos das 13 proteínas codificadas pelo mtDNA
humano
5. Considere os dados abaixo indicados, relativos ao DNA mitocondrial humano.
- Do total de bases do mtDNA (16.6 kilo-bases), 600 não codificam nem para proteínas nem
para RNA;
- As duas moléculas de RNA ribossómico codificadas pelo genoma mitocondrial implicam,
respectivamente, 950 e 1560 bases;
- A extensão média de cada um dos 22 tRNAs é de 70 bases.
5.1. Calcule o número de aminoácidos das 13 proteínas codificadas pelo mtDNA humano.
13490 bp – 1540 bp = 11950 bp 1aa = 3 bases; 11950 bases = 3983 aa (13 proteínas)
Frequência do alelo
19. Numa população de 1000 indivíduos saudáveis escolhidos aleatoriamente, ao estudar dois
alelos, a e b, de um locus autossómico, encontrou para o alelo mais raro, b, um homozigoto e
10 heterozigotos.
Total de ind. = 1000; locus com 2 alelos (a, b), encontrou-se um indivíduo homozigótico = bb e
10 indivíduos heterozigóticos = ab
20. Numa população de 100 homens encontrou dois com uma determinada mutação do gene
SRY, considerado um gene determinante da diferenciação testicular.
26. Num indivíduo afetado por uma doença autossómica dominante de manifestação tardia o
estudo de um polimorfismo intragénico com quatro alelos revela uma heterozigotia 1,2. O
cônjuge é homozigótico 3,3. O filho é heterozigótico 1,3 e o seu cônjuge é heterozigótico 2,4.
Os seus dois descendentes são também heterozigóticos, um é 1,2 e o outro 3,4.
26.2. Este polimorfismo é informativo nesta família? Quem pode ter herdado o alelo mutado?
*27. Num indivíduo afetado por doença recessiva ligada ao X o estudo de um polimorfismo
intragénico com dois alelos revela uma hemizigotia 1. A mãe é heterozigótica 1,2 e o pai é
hemizigótico 1. Uma das irmãs é homozigótica 1,1 e a outra irmã é heterozigótica 1,2. a) Este
polimorfismo é informativo nesta família? Quem herdou o alelo mutado? É possível oferecer
um diagnóstico pré-natal?
29. Um casal no qual existe uma gravidez em curso recorre a uma consulta de Aconselhamento
Genético. Os membros do casal são primos. Sabem que existe na família uma doença com um
padrão de transmissão recessiva ligada ao X e estão preocupados com o estatuto do feto. O
casal tem já duas filhas (saudáveis) e um filho (doente), que é o mais novo dos três.
b.3) É possível determinar o sexo do feto com base no resultado obtido para o marcador?
31. Numa situação de hereditariedade recessiva ligada ao X, o estudo de um polimorfismo
risco
31. Numa situação de hereditariedade recessiva ligada ao X, o estudo de um polimorfismo
c) o doente é hemizigótico 2;
32. Um casal de indivíduos saudáveis tem 3 filhos igualmente saudáveis (2 rapazes e uma
rapariga). O casal tem mais uma filha, que apresenta uma doença monogénica de
hereditariedade AD.
32.2. Que hipóteses podem ser colocadas para explicar a situação em causa e como as poderia
testar?
32.3. Admitindo que a doença tem uma penetrância de 60%, calcule o risco:
a) O risco de um doente com uma neomutação poder ter um neto doente é___________
homozigótico é______________.
probabilidade
35. Para uma doença com AD imprinting paterno, indique a probabilidade de um casal ter
*36. Considere um casal em que a mulher tem uma doença monogénica de transmissão
autossómica dominante. O casal tem dois filhos do sexo masculino, sendo o mais velho
doente. Sabendo que esta patologia tem uma penetrância de 65%, calcule (justificando os
cálculos efetuados):
40. Calcule a probabilidade (justifique sucintamente) de um homem com uma doença AD com
imprinting paterno:
Sabendo que esta anomalia é hereditária e devido a um alelo recessivo de um locus bi-alélico
autossómico:
1.3. Faça uma estimativa de quantos indivíduos poderão ser portadores desse alelo recessivo
entre os indivíduos normais.
2. O sangue de 200 indivíduos de uma amostra populacional foi recolhido aleatoriamente com
intenção de determinar eletroforeticamente os tipos de haptoglobina presentes, tendo-se
observado as seguintes frequências genotípicas: Hp1Hp1= 32%; Hp1Hp2= 46%; Hp2Hp2= 22%.
2.1. Com base nesses dados faça uma estimativa das frequências dos alelos autossómicos Hp1
e Hp2 na população representada por essa amostra.
2.2. A amostra da questão anterior pode ser considerada como representativa de uma
população em equilíbrio de Hardy e Weinberg?
2.3. Qual a frequência de casais heterozigóticos Hp1Hp2 x Hp1Hp2 que deve ser esperada na
população representada por essa amostra?
3.2. Se a frequência de indivíduos Rh-negativo (dd) for estimada de 16%, qual a probabilidade
de um casal Rh-positivo ter um filho Rh- negativo?
Todos
11111111111
1. Considere a sequência 5’→ 3’ de um gene hipotético, abaixo indicado. A região promotora está
representada em letras itálicas, estando a sequência da região do intrão representada por letras
minúsculas:
- 50 GTGTAGCTAA AGTATAGCCT GTCCTTGATA GAAGCTTCGA TATATTTAGT
+ 1 AGACTACCGT CACCTTGAAG AATGTGCTGT CTTACTCTGT ACGAACGGAA
+ 51 ACGAgtctag taaagcctgt ccttgataga agcttcgact gactagtact
+ 101 ggacttagCA CTTGAAGGAC CTGTGGACCT AGTCTAATCG TGAACGTAAG
+ 151 AATAAAGCTA TCCCGCCTGT
1.1. Quantos bp apresenta o gene?
1.2. Quantos bp apresenta o promotor?
1.3. Qual o primeiro nucleótido a ser transcrito?
1.4. Assinale no gene a sequência TATAbox.
1.5. Em que nucleótido se inicia o intrão?
1.6. Em que nucleótido se inicia o 2º exão?
1.7. Escreva a sequência 5’→ 3’ do hnRNA (RNA heterogéneo nuclear ou transcrito primário),
resultante da transcrição do gene.
1.8. Escreva a sequência 5’→ 3’ do mRNA resultante do processamento do hnRNA deste gene.
1.9. Qual o primeiro codão de iniciação da tradução?
1.10. Dada a sequência codificante do mRNA na alínea 1.8 qual é a sequência de aminoácidos da
proteína traduzida? (Consulte a Tabela 1)
1.11. Considerando os codões de terminação UAA, UAG e UGA, quantos aminoácidos serão
traduzidos a partir do mRNA?
1
1.1 220 bp (no gene é incluído também a região promotora)
1.2 50 bp
1.7 5’-AGA CUA CCG UCA UGA AGA AUG UGC UGU CUU ACU CUG UAC GAA CGG AAA CGA
guc uag uaa agc cug ucc uug aua gaa gcu ucg acu gac uag uac ugg acu uag CAC UUG AAG GAC
CUG UGG ACC UAG UCU AAU CGU GAA CGU AAG AAU AAA GCU AUC CCG CCU GU-3’
1.8 5’-AGA CUA CCG UCA UGA AGA AUG UGC UGU CUU ACU CUG UAC GAA CGG AAA CGA
CAC UUG AAG GAC CUG UGG ACC UAG UCU AAU CGU GAA CGU AAG AAU AAA GCU AUC CCG
CCU GU-3’
1.9 AUG (este é sempre o primeiro codão de iniciação é preciso encontrar na sequência)
1.11 18 aa
2.
A enzima que “separa” as duas hemicadeias da hélice de DNA designa-se por helicase. A
topoisomerase/girase, por seu lado, tem por função impedir o super-enrolamento da cadeia
de DNA. A enzima que sintetiza o primer de RNA, necessário para o início da replicação,
designa-se de primase. As enzimas que realizam a síntese da nova cadeia de DNA podem ser
do tipo I ou do tipo III, e chamam-se DNA polimerase. Um dos 3 constituintes dos nucleótidos
são as bases azotadas, que podem ser purinas ou pirimidinas A nova cadeia de DNA, que usa
como molde a hemi-cadeia 5´-3’ designa-se de “_____lagging____strand” e vai sendo
sintetizada em fragmentos (fragmentos de Okazaki). A enzima que liga os fragmentos de DNA
sintetizados é a DNA Ligase.
3
a) 5’
b) mRNA
c) 5’
d) RNA polimerase
e) Ribossoma
5' ATG GGC TCC ATC GGC GCA CCC AGA TGA 3'
4.1 3´-TAC CCG AGG TAG CCG CGT GGG TCT ACT 5’
4.2 5’-AUG GGC UCC AUC GGC GCA CCC AGA UGA-3’
4.3 Met – Gly – Ser – ILE – Gly – Ala – PRO – Arg - STOP
6. Foi construído um polímero de tal forma que a sua sequência aleatória é composta por 75%
de Guaninas e 25% de Uracilos.
6.1. Entre os aminoácidos das cadeias polipeptídicas resultantes da tradução in vitro, qual será
a frequência esperada dos seguintes aminoácidos: Trp, Val e Phe?6.1
7. Uma molécula de mRNA sintética consiste na repetição de uma sequência de bases 5’-
7.1. Quais as implicações deste resultado na forma como são traduzidas o mRNA?
5’- promotor – ATG GTT GAT AGT CGT TGC CGC GGG CTG TGA –3’
3’- promotor – TAC CAA CTA TCA GCA ACG GCG CCC GAC ACT –5’
8.1. Qual será a sequência de bases do mRNA transcrito a partir deste gene?
8.2. Se a cadeia dupla de DNA desse gene tiver 20% de citosina, qual será a percentagem de
adenina? (relembrar as regras de Chargaff)
8.3. Qual a será a sequência de aminoácidos do péptido traduzido?8.1 5’- AUG GUU GAU AGU
CGU UGC CGC GG CUG UGA-3’
3’- TAC CAC GTG GAC TGA GGA CTC CTC TTC AGA -5’
5’- ATG GTG CAC CTG ACT CCT GAG GAG AAG TCT -3’
9.1. Se o gene for transcrito, qual será a sequência de bases do mRNA dessa região
codificante?
9.2. Dada a sequência de mRNA da questão anterior, qual será a sequência de aminoácidos
desta
9.3. Se uma mutação ocorrer na sequência de DNA deste gene, na base indicada a negrito,
sendo a
base T substituída por uma A, qual será o resultado desta substituição na sequência de
aminoácidos
do péptido traduzido?
9.4. Esta mutação, no gene em questão, está na origem de uma doença genética que afeta a
hemoglobina humana. Faça uma pequena investigação sobre as consequências provocadas por
esta
9.1 5’-AUG GUG CAC CUG ACU CCU GAG GAG AAG UCU-3’
9.2 Met – Val – His – Leu – Thr – Pro – Glu – Lys - Ser
10. O conjunto de genes (gene cluster) da beta-globina humana estende-se por cerca de 50 Kb
(Figura 1). Aparentemente, este conjunto inclui apenas 5 genes que codificam produtos
Figura 1
10.1. Que percentagem do segmento total de DNA codifica os aminoácidos dos polipéptidos
em causa?
11.2
C - presença de consequência
B e D – sem consequência
12. São indicadas abaixo sequências parciais de 4 alelos do gene CFTR (descubra em
www.cff.org que doença é causada por mutações neste gene).
Alelo 1: GGG TTC TTT GTG GTG TTT TTA TCT GTG CTT CCC TAT GCA
Alelo 2: GGG TTC TTG TGG TGT TTT TAT CTG TGC TTC CCT ATG CAC
Alelo 3: GGG TTC TTT GTG GTG TTT GTA TCT GTG CTT CCC TAT GCA
Alelo 4: GGG TTC TTT GTG GTG TTT TAA TCT GTG CTT CCC TAT GCA
12.1. Abaixo de cada sequência indique a sequência do mRNA que se produziria aquando da
transcrição.
12.2. Assumindo que o Alelo 1 é de um indivíduo não afetado e que os outros alelos são de
indivíduos afetados, que tipo de mutação está presente em cada um dos alelos?12.1
Alelo 1: GGG TTC TTT GTG GTG TTT TTA TCT GTG CTT CCC TAT GCA = normal
mRNA 5’- GGG UUC UUU GUG GUG UUU UUA UCU GUG CUU CCC UAU GCA
Alelo 2: GGG TTC TTG TGG TGT TTT TAT CTG TGC TTC CCT ATG CAC = deleção no 3º tripleto
mRNA 5’- GGG UUC UUG UGG UGU UUU UAU CUG UGC UUC CCU AUG CA
Alelo 3: GGG TTC TTT GTG GTG TTT GTA TCT GTG CTT CCC TAT GCA = transversão
mRNA 5’- GGG UUC UUU GUG GUG UUU GUA UCU GUG CUU CCC UAU GCA
Alelo 4: GGG TTC TTT GTG GTG TTT TAA TCT GTG CTT CCC TAT GCA = transversão
mRNA 5’- GGG UUC UUU GUG GUG UUU UAA UCU GUG CUU CCC UAU GCA
12.2
13.1
Alteração Mutação
5 – Deleção Frameshift
6 – Inserção Frameshift
13.2
2 – sem consequência
III1 = X200Y
14.2 O individuo III1 apresenta o fenótipo do Sindrome do X frágil porque tem a mutação
completa, que herdou da mãe (II2) que tem a pré-mutação, herdada do avô (I 1).
15.3 proteína truncada, será mais ou menos grave conforme a atividade da proteína, se a
mutação está mais pero da extremidade 5’ ou 3’.
16. Relativamente aos mecanismos de reparação de DNA, apenas uma das alíneas completa
c) Remove bases nucleotídicas da molécula de DNA que foram alteradas por radiação.
d) Utiliza o DNA do cromossoma homólogo não danificado para reparar uma mutação.
16.1 c)
16.2 b)
2
28. Num casal, com uma criança com uma doença de hereditariedade
autossómica recessiva, o estudo dos polimorfismos de ligação relevantes mostrou
que o pai tem os polimorfismos 1 e 3, a mãe o 2 e o 4, e o doente o 1 e o 4. Numa
futura gravidez dentro deste casal:
a) um feto com os polimorfismos 3 e 4 é um homozigoto normal;
b) um feto com os polimorfismos 1 e 2 é um homozigoto normal;
c) um feto com os polimorfismos 1 e 2 é um heterozigoto normal;
d) um feto com os polimorfismos 1 e 4 é um heterozigoto normal;
e) um feto com os polimorfismos 2 e 3 é um homozigoto doente.
Grupo A
a) Um homem saudável, que teve uma irmã falecida em criança por retinoblastoma bilateral,
tem um filho de 1 ano com a mesma afeção da irmã.
d) A mutação na base da distrofia muscular de Duchenne pode ser uma deleção ou uma
mutação pontual no gene correspondente.
e) Numa família com história clínica de distrofia miotónica o pai apresenta calvície, fraqueza
muscular e arritmia cardíaca. A irmã deste tem cataratas de aparecimento precoce e o filho
apresenta anomalias no eletromiograma.
Grupo B
1) Heterogeneidade alélica
2) Penetrância incompleta
3) Heterogeneidade genética
4) Expressividade variável
5) Consanguinidade
A2
B3
C5
D1
E4
39.2. Justifique as respostas que assinalou como sendo falsas, apresentando a respetiva
fundamentação teórica.
43. António tem 26 anos de idade. Recentemente foi-lhe diagnosticada uma doença
oftalmológica
de hereditariedade mitocondrial, a Neuropatia Optica de Leber. Os pais, a irmã de 30 anos e o
irmão mais novo de 18 anos são assintomáticos. Não há outros casos familiares.
a) Faça o heredograma.
46. MP era uma mulher ativa, filha de pais saudáveis, que por volta dos 40 anos começou a ter
dificuldades em manter o seu ritmo normal de trabalho. Sentia um zumbido nos ouvidos e
desenvolveu dificuldades em falar e andar. Seguidamente a sua memória começou a
deteriorar. Desenvolveu depois diabetes, surdez e demência. Alguns anos após o início dos
sintomas MP foi diagnosticada como tendo MELAS (“mitochondrial myopathy encephalopaty
lactic acidosis syndrome”), vindo a falecer pouco tempo depois.
c) Admitindo que ambos os filhos venham a ser doentes, é possível fazer uma previsão do seu
quadro clínico, baseado nos sintomas da mãe? Justifique.
1) c
2) e
49. Qual dos seguintes factos fornece a evidência mais forte de que existe um envolvimento de
b) Concordância mais elevada entre gémeos do mesmo sexo do que entre gémeos de sexo
diferente
c) Para probandos adotados, uma incidência aumentada entre os familiares biológicos, mas
não os adotivos
d) A constatação de que as crianças tendem a parecer-se com os pais no que se refere a terem
ou não hábitos alimentares saudáveis.