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Faculdade de Odontologia
Genética
Aula 1
O que é genética?
Estudo dos genes em todos os níveis, desde as moléculas até em populações.
Mendel
Monge, ervilhas. “Ensaio com plantas híbridas”
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DNA – Propriedades
Devem permitir uma replicação fiel.
Devem conter conteúdo informacional.
Estável, dê para se basear, mas trocar em raras ocasiões.
DUPLA HÉLICE
Nucleotídeos torcidos na forma de dupla hélice.
Juntos por PONTES DE HIDROGÊNIO.
Arcabouço formado por unidades alternadas de fosfato e desoxirribose conectados por LIGAÇÕES
FOSFODIÉSTER.
Cada pentose se liga pelo C 5’ ao carbono 3’ da pentose adjacente.
Base se liga ao carbono 1’ e se volta para dentro até a base do outro filamento por PONTES DE HIDROGÊNIO.
Sem H20 dentro.
Pareamento
DNA fino – pirimidina + pirimidina
DNA grosso – purina + purina
Espessura compativel – purina + Pirimidina
Tipos de DNA
Diferem:
Espessura
Número de pares de base por volta
Exposição das bases ao meio externo
Classes de RNA
RNAm codificante para síntese proteica
RNAr catálise na síntese proteica
RNAt catálise na síntese proteica
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QUESTÕES SLIDES
3) Fale sobre o experimento de Chargaff e cite a importância de seu trabalho no desvendamento da estrutura do
DNA.
NUCLEOTÍDEOS PIRIMÍDOS = PURÍNICOS – EXPERIMENTO DE CHARFATT
T+C=A+G
Sendo que T = A e C = G.
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QUESTÃO LISTA
1) Se o conteúdo de GC de uma molécula de DNA é 56%, quais são as percentagens das quatro bases (A, T, C e G)
nessa molécula?
G + C = 56
G = 28
C = 28
T + 28 = A + 28
100 – 56 = 44
T = A = 44/2 = 22
Genética
Aula 2
Replicação
DNA se auto-replica para formar uma nova cadeia.
Mitose
Multiplicação celular para desenvolver orgãos e tecidos
2n = 46 ----- 2n = 46
Meiose
Formação de gametas para reprodução.
2n = 46 ----- n = 23
Tipos de replicação
Semi-conservativa - a dupla helice de cada molécula filha de DNA tem um filamento da molécula original e um do recém
sintetizado.
Conservativa - molécula parental é conservada e uma única dupla hélice filha é produzida, daí são 2 filamentos novos.
Dispersiva - moléculas filhas tem filamentos com segmento de ambos, parentais e recém sintetizados.
Procariotos - Helicases e Topoisomerases
Helicases: enzimas que rompem as pontes de hidrogênio
Topoisomerases (DNA girase): retira as torções causadas pela deselicoidização.
Proteínas SSB: proteínas de ligação unifilamentar
Primase - síntese d um pequeno oligonucleico de RNA no filamento molde para síntese de DNA.
Outras enzimas
Forquilha de replicação
Local onde a dupla hélice é desenrolada para produzir os filamento
Filamento leading
A cadeia que cresce no mesmo sentido que o deslocamento da forquilha de replicação, a síntese ocorre continuamente.
Filamento Lagging
A cadeia cresce no sentido oposto ao deslocamento da forquilha de replicação e a síntese ocorre descontinuamente.
Gera fragmentos de okazaki.
Fragmentos de Okazaki:
Os curtos fragmentos de DNA produzidos por replicação descontínua são denominados fragmentos de Okazaki.
Replissomo
Complexo de enzimas e proteínas para a replicação.
Polimerasse, grampo beta, girase, helicase, primase e polimerase.
Replicação de Eucariotos
Semiconservativo
Síntese de leading e lagging.
Replissomo mais complexo - 27 componentes contra 12 de procariotos.
DNA na forma de cromatina - nucleossomos.
Replissomo Eucarioto
Fator 1 de montagem da cromatina
Antígeno nuclear de proliferação celular - grampo beta dos eucariotos.
Alongamento
BOLHA DE TRANSCRIÇÃO - RNA polimerase se move ao longo DNA, desenrola o DNA a frente dela e reenrola o que ja
foi transcrito. Filamento molde é exposto dentro dele.
Término
Vai acontecendo até que a RNA polimerase reconheça sequencias especiais de nucleotideos para dar sinal para o
término. Daí libera o RNA e a enzima do molde.
2 MECANISMOS:
Intrínsico - término direto. Termina em um trecho rico em GC que é seguido por um fileira de seis ou mais A.
GC formam pontes de hidrogenio - ALÇA EM GRAMPO (GC é mais estável que AT pois tem 3 pontes).
Dependente de rô - Rô é uma proteína que reco nhece os sinais de término, não tem a fileira de U em sua ponta, tem uma
sequencia de 40 a 60 nucleotídeos rica em C e pobre em G - sítio rut.
Logo posteriores às sequencias, posterior 5'. Após a ligação, rô facilita a liberação do RNA a RNA polimerase.
Os eucariontes requerem a montagem de muitas proteínas em um promotor antes que a RNA polimerase II possa começar
a sintetizar RNA. São os FATORES GERAIS DE TRANSCRIÇÃO - GTF - ligam-se antes que a RNA PII se ligue.
Início
A RNA polimerase II não reconhece as sequencias promotoras por si só, usa os GTF para se ligarem Às regiões do
promotor antes da ligação. O GTF e a RNA polimerase II constituem o complexo de pré iniciação - PIC. Os promotores
como nos procariontes, tão do lado 5' posterior do ponto de inicio. A sequencia TATA geralmente pode ser vista situada
cerca de 30 pares de base do ponto de inicio. TATA boxe é o sitio do primeiro evento da transcrição - ligação da
proteina de ligação à TATA. Atrai outros GTF e forma o complexo pre-iniciação.
Alongamento - Término
Ocorre dentro da bolha de transcrição, antes de ser produzido, o RNA tem que ter revvestimento na ponta 5',
recomposição para eliminar introns e adição de uma cauda 3' dos nucleotídeos adenina. CTD repetições de uma sequencia
de 7 aminoacidos, são sitios de ligação para enzimas que são necessarias para revestiro o rna e tal. Continua então o
alongamento até ter uma sequencia AAUAAA perto da ponta 3'. Dai coloca-se a cauda poli. Nucleotídeos adenina.
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QUESTÕES LISTA 1
Cite 4 enzimas que atuam no processo de replicação do DNA e explique as suas funções.
DNA RNA
Fita dupla Fita simples
Açucar: desoxiribose Açucar: ribose
Bases: A G C T Bases: A G C U
Origem: replicação Origem: transcrição
Função: informação genética Função: síntese de proteínas
QUESTÕES LISTA 2
Tradução
Síntese de cadeias polipeptídicas baseado na sequência do RNAm.
Ribossomos - complexos macromoleculares que unem AA para formar a proteína. São compostos de vários tipos de RNAr
de proteínas diferentes.
RNAt - adaptadores de códon de 3 nucleotídeos no RNAm ao AA correspondente. Uma molécula de RNAt pode levar um
AA ao ribossomo para traduzir qualquer RNAm.
RNAr - principais componentes dos ribossomos. ribossomos trazuem os RNAm de qualquer gene codificante de proteínas.
Código Genético - sequência de AA de uma proteína codificados pela sequencia de nucleotideos do RNAm.
Código superposto - AA consecutivos são especificados por códons que tem algumas bases consecutivas em comum, por
exemplo as 2 ultimas bases de um códon tbm podem ser as duas primeiras do códon seguinte.
Glutamina - GAG
Lisina - AAG
Glicina - CAG
Tirosina - UAC
Triptofano - UGG
Serina - UCG
Ribossomos
Síntese de proteínas - RNAt + moléculas de RNam se associam aos ribossomos.
Ribossomos tem uma subunidade pequena e uma grande, cada uma feita de RNA e proteínas.
É composta de 1 a 3 tipos de RNAr e até 50 proteínas.
Procariontes - 30S e 50S e se associam para formar 70S
Eucariontes - 40S e 60S, com 80S para o ribossomo completo.
As moléculas de RNAt e RNAm estão posicionadas no ribossomo de modo que o códon do RNAm possa interagir com o
anticódon do RNAt.
O sítio de ligação ao RNAm tá dentro da subunidade menor.
Existem 3 sítios de ligação para as moléculas de RNAt. Eele une as subunidades com sua ponta de anticódon na primeira e
sua ponta de aminoacil na última.
Sítio A - para aminoacil - liga um aminoacil que chega na subunidade 30S.
Sítio P - para peptidil - subunidade 30A, liga-se a cadeia crescente e entra num túnel de 50S.
Sítio E - de exit/saída - contem um RNAt que não leva mais um AA que está pronto para ser liberado do ribossomo.
Tradução
Iniciação em eucariontes - Na chegada no citoplasma o RNAm é geralmente coberto de preoteínas e regiões podem ter
dupla hélice devido a pareamento de base. Essas regiões de estrutura devem ser removidas, são então removidas pelos
fatores de iniciação - IF - assiciam-se ao cap (ponta 5') e à subunidade 40S e RNAt iniciador para formar um complexo.
Daí ele move-se no sentido 5'->3 e desenrola as regiões com pareamento de base, ao mesmo tempo fica procurando um
códon AUG para começar a tradução.Quando acha une-se a 60S e forma o ribossomo 80s.
Alongamento - RNAm é um mapa especificando a entrega de RNAt levando uma carga de aminoácido. Cada
aminoácido é adiciona a cadeia polipeptidica crescente e o RNAt desacilado é reciclado pela adição de outro AA.
Fatores que ajudam: TU e G.
Tu se junta com aminoacil-RNAt que contém o anticodon correto formando um complexo ternário - RNAt AA e Tu.
Daí um RNAt iniciador no sítio P com um sítio A para aceitar um cplexo ternário. Daí o G passa a se ajustar ao A, muda os
RNAt nos sítios A e P para P e E. O RNAm move-se pelo ribossomo.
Término - Até o códon no A ser um dos tres codons de fim: UGA, UAA ou UAG. Já que nenhum RNAt reconhece esse
códons. Mas proteínas chamadas fatores de liberação reconhecem.Daí tem-se dssociação das unidades maior e menor do
ribossomo e liberação da cadeia polipetídica.
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LISTA 3
3)Quais os principais domínios de um RNA transportador e qual sua função no processo de tradução?
Alongamento - RNAm é um mapa especificando a entrega de RNAt levando uma carga de aminoácido. Cada
aminoácido é adiciona a cadeia polipeptidica crescente e o RNAt desacilado é reciclado pela adição de outro AA.
Fatores que ajudam: TU e G.
Tu se junta com aminoacil-RNAt que contém o anticodon correto formando um complexo ternário - RNAt AA e Tu.
Daí um RNAt iniciador no sítio P com um sítio A para aceitar um cplexo ternário. Daí o G passa a se ajustar ao A, muda os
RNAt nos sítios A e P para P e E. O RNAm move-se pelo ribossomo.
Término - Até o códon no A ser um dos tres codons de fim: UGA, UAA ou UAG. Já que nenhum RNAt reconhece esse
códons. Mas proteínas chamadas fatores de liberação reconhecem.Daí tem-se dssociação das unidades maior e menor do
ribossomo e liberação da cadeia polipetídica.
Aula 4
Procariontes Eucariontes
DNA circular, poucos genes Cromossomos grandes compactados em cromatina
Controle feito principalmente por repressão gênica Usa muitas proteínas reguladoras
Ativo Inativo
Regulação deve: garantir que a expressão da maioria dos genes no genoma está desligada gerar milhares de padrões
de expressão.
Se o produto final é uma proteína, a regulação poderia ser obtida controlando a transcrição do DNA em RNA ou a
trdução.
A maioria é AO NÍVEL DE TRANSCRIÇÃO GÊNICA.
As proteínas podem ajudar a RNA polimerase na ligação ao seu sítio de início de transcrição, o promotor ou podem
reprimir a transcrição evitando a ligação da RNA polimerase.
Para modular a transcrição as proteínas reguladoras tem um ou mais dos seguintes domínios funcionais:
- um que reconhece a sequencia reguladora no DNa;
- um que interage com alguma proteína do aparelho de transcrição - tipo RNA polimerase
- um que interage com as proteínas ligadas a sequencias reguladoras vizinhas
- um que influencia a condensação da cromatina.
- um sensor das condições fisiológicas
Muitos estudos foram feitos para analisar como as proteínas reguladoras funcionam, daí tem dois tipos de sistemas
reguladores dos genes, o primeiro é relacionado ao uso de galactose e o segundo reprodutivo.
Ativadores - Trabalham indiretamente para recrutar a RNA polimerase II para genes promotores.
Interagem com subunidades dos complexos proteicos com papel no início da transcrição.
Recrutam proteínas que modificam a estrutura da cromatina, permitindo que a RNA polimerase II e outras proteínas
tenham acesso ao DNA.
Acentuadores - sítios de reconhecimento de proteínas ativadoras. Estimulam a transcrição pela interação física com a RNA
polimerase e outros fatores.
Histonas - Os cromossomos eucarioticos são embalados em cromatina que tem DNA e proteínas (histonas). A unidade
básica da cromatina é o nucleossomo, que tem cerca de 150pb de DNA envolvido em duas voltas ao redor de um
octâmero de histonas.
1 - rica em lisina, menos afinidade por DNA
2A
2B - tamanho inferior a H1, rica em lisina, menos conservadas entre as espécies.
3
4 - ricas em artinina, conservadas entre as espécies
A embalagem do DNA então significa que a grande parte do DNA não está prontamente acessível à proteínas
reguladoras. Daí modificar a cromatina é um metodo de modificar a transcrição.
Histona acetiltransferase
Histona responsável pelo grupo acetil. Se liga ao DNA nas regiões reguladoras de alguns genes e ativa a transcrição
acetilando as histonas vizinhas.
Histonas desacetilase
Repressão genica, altera a interação entre o octamero e o DNA e influencia a ligação de proteínas reguladoras ao DNA.
Imprinting genômico - certos genes são expressos apenas por um alelo, enquanto o outro é inativado.
DNA nas regiões reguladoras de genes imprintados é metilada de modo específico do sexo no desenvolvimento de
gametas. É uma adição de metil no carbono 5.
Dissomia parental - uma pessoa recebe duas copias de um cromossoma ou parte de um cromossoma de um dos pais e
nenhum cópia dos outros.
Síndrome de Prader-Willi
70% - 7 genes do cromossomo 15 estão faltando.
30% - gene materno imprindado, dissomia uniparental
Dá obesidade, pés pequenos e retardo mental.
Síndrome de Angelman
Deleções no gene do cromossomo materno e dissomina uniparental do paterno.
GENE PATERNO IMPRINTADO
Cromossomo X
Fêmeas - XX
Macho - XY
Hipótese de Lyon
Inativação é reversível nas células germinativas;
X é inativado;
X é ao acaso.
Aula 5
Mutações
Qualquer alteração causada no material genético
Cromossômicas
Deleções, inversões, inserções, translocações e quebras.
DNA
Troca de bases, inserções, deleções, regiões repetitivas.
Tipos de mutações
Quanto a localização:
Somática - qualquer células, são passadas a poutras células por mitose, criando um clone de células tendo o gene
mutando.
Germinativa - formação dos gametas. Meiose é repoduço sexual que permite que as mutações germinativas sejam
passadas aproximadamente metade dos membros da geração seguinte.
Qnt Localizacão:
Autossômicas - autossomos
Ligadas a X ou Y - cromossomos sexuais
Mutações de ponto
Alterações em um único par de bases ou peq nro de bases adj;
ubst de bases
Inserção
Deleção
Transições: substituição de uma base por uma outra base da mesma categoria
transversões: é a substituição de uma base por uma outra base de categoria diferente
Transcrição ou transversão
Mutação sinonima - códon alterado especifica o mesmo AA
De sentido trocado(conservativa) - codon especifica uma substancia similar a um AA
De sentido trocado (náo-conservativa) - especifica AA diferente
Sem sentido - codon alterado indica fim da cadeia
Quanto a origem:
Espontâneas - de ocorrência natural, tipo erros na replicação e lesões espontâneas
ERROS NA REPLICAÇÃO
Tautoméricas - forma das bases, parecidas que são capazes de parear com outras bases
Expansões trinucleotídeos - centenas ou milhares de cópias de CGG,
Indels - expansão, retração;
Doença de Huntigton - Repetição de CAG
LESÕES ESPONTÂNEAS
Depurinação: perda da base purina por lesões;
Desaminação: perda da cadeia amino por lesões hidrolíticas;
Danos oxidativos: reação do DNA com O2 reativos.
Sítios quentes - sitios que mutam muito mais que os outros, seja por desaminação ou pela existencia de sequencias
repetidas proximas.
Mutágenos