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2 – Proteínas e ácidos
nucleicos
Conteúdo
Classificação
Função
Estrutura organizacional das proteínas
Desnaturação
Métodos de purificação e caracterização
Propriedades dos ácidos nucleicos e a expressão e regulação da
expressão gênica.
Sessão 2.2 – Proteínas e ácidos nucleicos
Independente da função
Independente do organismo
Simples
Cadeias peptídicas muito longas – 100 a milhares de aa
Conjugadas
aa + grupo prostéticos (outro elemento)
Lipoproteínas
Glicoproteínas
Metaloproteínas
Mineraloproteínas
Nucleoproteínas
Proteínas classificação
Proteínas - classificação
Simples fibrosas
Queratina/ Colágeno/ Fibroínas/ Elastinas
Força e estabilidade às estruturas
Insolúveis em água – aa hidrofóbicos
Proteínas - classificação
Simples globulares
Diversidade estrutural necessária para realização de funções biológicas
Enzimas/ Transportadoras/ Motoras/ Reguladoras/ Imunoglobulinas/ outras...
Proteínas
linear
Proteínas
Estrutura primária
Sequência linear de aa e as pontes de dissulfeto formadas por alguns aa
É determinada pelas ligações covalentes entre os aa
Proteínas
Estrutura secundária
Arranjo estrutural → ligações não-covalentes entre os
aminoácidos vizinhos na cadeia polipeptídica
Pontes de hidrogênio e Força de van der Waals
α- hélice (bastão)
folha β-pregueada (folha)
Proteínas
Estrutura terciária
Interação entre aa distantes – dobra sobre si mesma → estrutura globular
Regiões hidrofóbicas no interior, hidrofílicas na superfície
Proteínas
Estrutura quaternária
Interações entre as subunidades polipeptídicas de uma proteína complexa
Arquitetura e formas tridimensionais diversas
Fatores de desnaturação
Mudança de pH
Efeito nas forças de van der Walls e pontes de H
Alterações na temperatura
Efeito nas interações fracas (pontes de H)
Cromatografia
Objetivo:
Separar uma
determinada
proteína de
interesse.
Cromatografia
Como funciona:
A proteínas é colocada no topo de uma coluna feita com matriz
hidratada, constituída de diversos tipos de materiais (resinas).
Após a aplicação, a coluna é lavada com uma solução
apropriada para a separação da proteína de interesse.
Diferentes proteínas migram através da coluna com velocidades
diferentes, dependendo do grau de interação com a matriz.
Cromatografia de exclusão
Cromatografia de troca iônica
Cromatografia de afinidade
Enzimas
Conteúdo:
Mecanismos de ação e da especificidade das
enzimas,
Fatoresque afetam a atividade e a cinética
enzimática,
Inibidores e cofatores enzimáticos.
Enzimas
Exemplos:
Enzimas
Características
Nomenclatura: substrato ou atividade + sufixo “ase”
Ex.: Urease – catalisa a hidrólise da ureia
DNA polimerase – catalisa a polimerização de nucleotídeos para formar DNA
Alto poder catalítico; Alta especificidade
Atuam em soluções aquosas sob condições suaves de temperatura e pH
Funções
Aumento da velocidade das reações químicas em 105 a 1017
Atrai elementos do meio, transformar a reação sem ser consumida
Enzimas
Componentes
Grupo prostético – se a ligação for covalente
Cofator Coenzimas
1 ou + íons inorgânicos: Fe2+, Mg2+, Mn2+, Zn2+ Molécula orgânica complexa: vitaminas
Enzimas
Especificidade
Reação ocorre ambiente específico e energeticamente favorável
– sítio ativo
Mecanismo chave-fechadura
Sítio ativo
Enzimas
Cinética enzimática
Modificação da velocidade da reação em respostas à mudanças nos
parâmetros: [substrato], temperatura e pH
Enzimas
Inibidores
Moléculas que interferem diminuindo ou interrompendo as reações enzimáticas
Medicamentos
Reversíveis
Enzimas
Inibidores
Irreversíveis – inibidor suicida