www.sbg.org.br ISSN 1980-3540 ELETROFORESE DE CIDOS NUCLICOS: UMA PRTICA PARA O ENSINO DE GENTICA Emanuel Ricardo Monteiro Martinez 1 , Luiz Ricardo de Souza Paiva 1 Autor para correspondncia: Emanuel Ricardo Monteiro Martinez, Departamento de Morfologia, Labora- trio de Biologia e Gentica de Peixes, Instituto de Biocincias, UNESP, Botucatu, SP, CEP 18618-000, Fone: 14-3811-6264, 1 Departamento de Morfologia, Laboratrio de Biologia e Gentica de Peixes, UNESP, IB, Botucatu, So Paulo, E-mail: emanuel@ibb.unesp.br Palavras-chave: Ensino, Eletroforese, Gentica Resumo No ensino de Gentica tornam-se necessrios pr- ticas auxiliares ao aprendizado de diversos subtemas como, por exemplo, DNA. Neste sentido, a eletroforese em gel de agarose possibilita a observao do DNA ex- trado de um organismo de maneira menos abstrata do que em um laboratrio de pesquisa. Mas, realizar esta prtica em sala de aula torna-se muito difcil devido ao seu alto custo. Refetindo sobre este problema, desenvol- vemos e adaptamos a eletroforese em gel de amido de uso culinrio, tornando o assunto DNA mais visvel, para o entendimento das teorias a respeito. Introduo O conceito de DNA (cido desoxirribonuclico) em metodologias de ensino-aprendizagem um desafo para professores e pesquisadores envolvidos com a edu- cao, devido, talvez, s difculdades de se abstrair a te- oria sobre DNA e demonstr-la de forma visual, atravs de atividades prticas. Loreto e Sepel (2003) desenvol- veram um trabalho que apresenta prticas que facilitam o aprendizado de temas sobre Biologia Molecular. Com base neste trabalho, tentamos reproduzir tcnicas que po- deriam ser aplicadas num curso de Biologia Molecular para professores e alunos de Ensino Mdio e Superior. Estas prticas podem facilitar o entendimento acerca do DNA devido s difculdades de se ensinar estes conceitos apenas em exposies orais. Porm, uma destas prticas no era vivel do ponto de vista econmico devido uti- lizao do gel de agarose, um material de custo elevado. Para tentar resolver o problema, modifcamos esta pr- tica substituindo o gel de agarose por amido de milho, tornando-o acessvel e mais observvel em sala de aula. As prticas reproduzidas de Loreto e Sepel (2003), que apresentam desde extrao do DNA eletroforese modi- fcada apresentada neste trabalho, foram ministradas em dois cursos com aulas terico-prticas no V Workshop da Ps-Graduao UNESP, IB, Botucatu, SP e VII Encon- tro Maringaense de Biologia XX Semana de Biologia UEM, Maring, PR, ambas no ano de 2005. O pbli- co-alvo foi composto por professores e alunos do ensino fundamental, mdio e superior. Inicialmente proposta por Arne Teselius (1937), a eletroforese era tcnica empregada para visualizao de protenas com suas diferenas de comprimento de frag- mentos de aminocidos e cargas eltricas. Atualmente, o uso desta tcnica comum tambm para estudos com cidos nuclicos (Brown 1998; Farah 2000). Na visuali- zao de material gentico (cido desoxirribonuclico e ribonuclico, DNA e RNA), utiliza-se comumente gel de agarose por apresentar porosidade irregular, funcionando assim como uma malha que separa o DNA, por diferena de tamanho, dos fragmentos menores que chegam mais rpido ao fnal da corrida eletrofortica. O DNA apresen- ta-se com carga negativa e, devido a esta caracterstica pode-se conduzi-lo de um plo com carga negativa para um plo com carga positiva. Porm, este material gen- tico tem de estar em contato com uma soluo salina que permita a conduo eltrica atravs de ons (Figura 1). Loreto e Sepel (2003) sugerem uma metodologia modif- cada para eletroforese em gel de agarose aplicada ao en- sino, mas de difcil acesso pelo alto custo da agarose. No presente trabalho modifcamos esta prtica com a substi- tuio de agarose por amido de milho. O amido de milho um produto barato, facilmente encontrado e vendido em mercados pois muito utilizado em culinria (mingaus e cremes). Para sua utilizao so necessrias algumas mo- difcaes para a conduo de ons na eletroforese. 44 Metodologia e Resultados 1. Cuba eletrofortica Na montagem da cuba eletrofortica, utiliza-se um recipiente de plstico (4 cm de altura, 20 cm de compri- mento e 12 cm de largura, podendo variar dependendo do tamanho da forma do gel tipo Tupperware). Nas bordas, coloca-se o fo de cobre, preso por resina epxi nas extremidades (cantos do recipiente), enrolam-se os fos de ao inox e prende-se com resina epxi nas ex- tremidades inferiores das bordas, que funcionaro como eletrodos positivos e negativos (Figura 2 a e b). Na ponta dos fos de cobre sero presas as presilhas do tipo jaca- r, uma presilha positiva e uma negativa, ligadas fonte de energia (dessas de brinquedos ou de impressoras); as fontes podero ser de 20 a 30 volts, com um tempo de, no mnimo, 3 horas de corrida (Figura 4 b). Uma voltagem maior poder diminuir o tempo de corrida, porm, pode- r tornar-se perigosa em sala de aula. 2. Preparao de gel e solues Deve-se colocar num recipiente para serem aque- cido, os seguintes materiais o tampo Brax 18 mM (Borato de Sdio, comum em farmcias de manipulao - 3,8 gramas de Borato de Sdio + 1000 ml de gua); o amido com concentrao fnal de 8% (100 ml de tBorax + 8 gramas de amido). Deve-se aquecer em microondas, fogo, bico de Bunsen ou lamparina. Pode ser utilizado, tambm, um Erlenmeyer ou Becker at o incio de fer- vura, fazendo-se movimentos circulares. Imediatamente aps o incio de fervura (gel viscoso), colocar em uma forma tipo mantegueira (2 cm de altura, 14 de compri- mento e 8 cm de largura), tomando o cuidado de no dei- xar formar bolhas, para dar forma ao gel e solidifcar. importante esperar cerca de 30 minutos, em temperatura ambiente, o resfriamento, devido evaporao (Figura 3). Antes de solidifcar, coloca-se em uma extremidade o pente plstico que moldar os poos para aplicao dos cidos nuclicos. O pente dever ser fxado em encaixes feitos, com uma faca aquecida, nas laterais da forma do gel (Figura 3 d). Aps este perodo, cobre-se o gel com saco plstico do tipo celofane e coloca-se na geladeira para ajudar a solidifcar temperatura de 4 0 C (durante 2 horas). Solidifcado, retira-se o pente com cuidado (o pente no pode alcanar o fundo da forma), para aplica- o do material gentico. (Figura 4 a). 3. Aplicao do Material Gentico No caso de uma extrao de cidos nuclicos (DNA + RNA) caseira, do tipo descrita por Loreto e Sepel (2003) e, tambm de acordo com sites na inter- net (como por exemplo: http://www.odnavaiaescola. com/atividades.html), pode-se extrair material gentico de frutas (banana, morango), insetos (abelha), fgado de boi; uma vez extrado o material coloc-lo em tubo (re- cipiente pequeno destes de remdio) com ajuda de uma seringa do tipo de insulina de 1 ml (material gentico hidratado em gua), cerca de 2 gotas (1 , aproximada- mente, 1 unidade de 1 ml ou uma gota); em seguida, a di- cionam-se 2 gotas de tampo de carregamento de amos- tra (0,5 ml de tBorax, 10 gotas de azul de bromotimol, encontrado em lojas de aqurio ou 2 gotas de corante de bolo, sendo necessrio acrescentar acar em ambos at saturar, cerca de 0,15 gramas). Para manter o material gentico nos poos, o acar liga-se ao DNA e evita a futuao, auxiliando ainda na visualizao do material gentico durante a corrida (colorao azulada). (Figura 4). Foram aplicadas em gel de amido diferentes amostras para avaliar a resoluo e qualidade. Foram aplicadas em seqncia, as seguintes amostras: A. DNA, B. corante de bolo, C. azul de bromofenol, D. DNA + azul de bromofenol, E. DNA + corante de bolo, F. DNA + Blue Dextran (utilizado em laborat- rios de molecular) (Figura 4 a e 5 b). No decorrer da corrida eletrofortica, a amostra a no foi visualizada devido falta de um tampo de carregamento. As demais amostras foram visualizadas durante a corrida. 4. Corrida eletrofortica Aps a aplicao, o gel foi colocado com sua for- ma na cuba eletrofortica, contendo tampo Brax. importante no deixar o gel entrar em contato direto com o tampo, diferente do gel de agarose de Loreto e Sepel (2003), pois o tampo poder dissolver o gel de amido. Nesta adaptao utilizou-se uma fanela de pano (tipo Perfex), cortada num tamanho que entrasse em contato com o tampo e com o gel nas extremidades positivas e negativas, por difuso h migrao dos cidos nuclicos (Figuras 4 b, 5 b). Com a cuba eletrofortica montada, prendem-se as presilhas nas extremidades dos fos de co- bre, colocando a cuba em um recipiente trmico esfriado (caixa de isopor, com gelo, para manter a temperatura e no deixar o gel dissolver), podendo, ento, comear a corrida eletrofortica. Discusso A prtica com estes materiais demonstrou ser mais vivel economicamente quando comparado com o traba- lho de Loreto e Sepel (2003). Em ambos os trabalhos, as amostras contendo apenas tampo de carregamento ou cido nuclico mais tampo de carregamento, foi poss- vel visualizar a sua corrida, pois estes apresentam car- gas negativas. Dessa forma importante que o professor apresente, da forma mais clara possvel aos alunos, os conceitos fsico-qumicos que possam auxiliar a compre- enso da prtica. Para o gel de amido no foi possvel corar com azul de metileno 0,5% proposto para gel de agarose (Loreto e Sepel, 2003) pois este se dissolve. Na prtica com o ami- do deve-se focar a corrida eletrofortica, que mostra, 45 didaticamente, como amostras com carga negativa mi- gram e, desta forma, simbolizam o material gentico. Aconselha-se que o professor deva realizar esta prtica em duas partes, devido demanda de tempo que ela exige. Na primeira parte, a montagem da cuba ele- trofortica, do gel, aplicao das amostras e incio de sua corrida um dia antes, para que esses resultados possam ser visualizados e apresentados aos alunos. No dia da aula, o professor dever mostrar estes resultados aps uma exposio terica dos conceitos e, juntamente com os alunos, elaborar e montar a prtica eletrofortica. Concluso A eletroforese em gel de amido torna-se uma pr- tica barata e de fcil demonstrao, comprovada em cur- sos ministrados por ns. Uma prtica que contribui para o entendimento do DNA e para a assimilao de conhe- cimentos multidisciplinares. Agradecimentos Ao Laboratrio de Biologia e Gentica de Peixes por ceder o espao fsico para o desenvolvimento deste trabalho. Referncias Brown, T. A. (1999) Gentica um enfoque molecular. 3 a Ed., Guanabara Koogan. Rio de Janeiro, R.J. Farah, S. B. (2000) DNA: Segredos e Mistrios. Savier. So Paulo. SP. Loreto, E. L. S. e Sepel, L. M. N. (2003) Atividades Experimentais e Didticas de Biologia Molecular e Celular. 2 a Ed., Sociedade Brasileira de Gentica. Ribeiro Preto. SP. Tiselius, A. (1937) A new apparatus for electrophoretic analysis of colloidal mixtures. Biochem. J. 31, 1464. http://educar.sc.usp.br/licenciatura/2003/siteprojeto/2003/6_enzima_ e_gel.pdf http://www.google.com.br 46
Figura 1. Eletroforese em gel de agarose. O material gentico com carga negativa migrando na malha do gel do plo negativo para o plo positivo. Fonte: www.google.com.br http://educar.sc.usp.br/licenciatura/2003/siteproje- to/2003/6_enzima_e_gel.p Figura 2. Materiais utilizados para Eletroforese: a. Cuba eletrofortica e acessrios; b. Viso interna da cuba ele- trofortica, seta vermelha indica o fo de cobre e a seta branca o fo de ao inox; c. Forma para o gel de amido e pente para formar os poos no gel de amido. 47 Figura 3. Montagem do gel de amido: a. Materiais necessrios para o preparo do gel; b. Aquecimento do amido de milho; c. Colocao do amido de milho fervido na forma; d. Forma com gel esfriando. Figura 4: a. Aplicao das amostras no gel; b. Corrida eletrofortica. 48 Figura 5: a. Corrida eletrofortica com viso da cuba e fonte; b. Migrao do material gentico e tampes de carregamento do plo negativo para o plo positivo (Poos: A. DNA; B. corante de bolo; C. azul de bromofenol; D. DNA + azul de bromofenol; E. DNA + corante de bolo; F. DNA + Blue Dextran (utilizado em laboratrios de molecular).