Variabilidade

1 de DNA- Aula 4

O ambiente (fatores externos) também modula

- Quando se fala em variações genéticas, não se
refere só a doenças não. A variação é comum em
várias espécies.
os fenótipos. Então é possível que um fator
externo regule a expressão do gene.
Ex: Doença causada por um microrganismo. Ao
ser infectado por esse microrganismo, seu
organismo está recebendo um sinal externo e
com isso o organismo vai reagir com a ativação
de genes relacionados ao sistema imune. E essa
regulação é dinâmica, após o sistema imune
eliminar esse microrganismo do corpo, aqueles
genes são desativados.

Genomas não são entidades estáticas

Há variação fenotípica em cada umas dessas
espécies. É crucial a variação em todas as - Desde a origem da vida na Terra, a possibilidade
espécies. de mudança é o que move a evolução dos
organismos vivos de formas menos complexas a
- Variação fenotípica não é só no que formas mais complexas;
enxergamos. Existem variações no metabolismo
por exemplo e muitos outros. - Neste caminho a mutabilidade do material
genético é aspecto importante;
Principais fontes de variabilidade genética:
- Modificações no DNA podem ocorrer
- Mutação- Surge durante a replicação do DNA, espontaneamente ou induzidas por agentes
quando está sintetizando uma nova fita de DNA, externos;
a DNA polimerase pode cometer erros.
- Recombinação- ocorre durante uma etapa da
meiose. Tem cromossomos pareados e há uma
troca de material genético entre cromossomos
homólogos. Então faz com que casal tenha filhos
diferentes
- E tem outras variabilidades que podem surgir
devido a ambientes externos. Ex: radiação
Variação fenotípica normal e patológica
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2 de DNA- Aula 4
Variação genética em DNA
Mutação
De maneira geral o termo mutação é utilizado
como referência a alterações no DNA associadas
com efeitos patológicos;
Polimorfismo
De maneira geral o termo polimorfismo é
utilizado como referência a variações gerais no
genoma humano. Por convenção, uma variação é
polimórfica se a frequência de seu alelo menos
frequente é > 1%;
Mutação e polimorfismo- os 2 se referem a
alterações genéticas. O polimorfismo engloba
também a frequência dessa variação na
população.
Mutações/ Polimorfismos
- Somáticos
. Alterações no DNA de células não envolvidas
diretamente na formação dos gametas.
. Se um indivíduo adquirir uma mutação genética
em uma célula somática, essa alteração não vai
ser passada para a geração seguinte.
- Germinativos
. Alterações no DNA de células envolvidas
diretamente na formação dos gametas
. Geração seguinte apresenta alteração.
Mutações/ Polimorfimos
(Classificação de Thompson e Thompson)
- Mutações Genômicas
. Alterações no número de cromossomos
. Ex: Sindrome de Down, tem um cromossomo a
mais, o 23.
- Mutações Cromossômicas
. Rearranjos cromossômicos- Rearranjos dentro
de um cromossomo. Pode ter pedaços de um
cromossomo que é quebrado e esse pedaço ser
inserido em outro cromossomo;
Dentro das variações cromossômicas temos:
. Variações Estruturais (polimorfismos) -
cromossomo é quebrado e essa quebra não é
inserida em outra parte, é perdida;
. CNV (common number variation) - segmentos
dentro de cromossomos que são repetidos
- Mutações Gênicas
. Substituições de pares de base, pequenas
inserções e pequenas deleções.
. Dentro de um gene
. Deleção- perda de um pedaço do gene,
. Inserções- vai ser inserido um segmento de DNA
dentro de um gene.
. Pedaço de gene que é perdido e depois
reincorporado em outro sentido.
Mostrando como pode surgir uma alteração no
número de cromossomos dentro de uma célula:
- Primeiro exemplo- temos 2 cromossomos
homólogos duplicáveis no 1° círculo. Na primeira
divisão meiótica cada um deles deveria ir para
uma célula diferente. Mas ocorreu um erro de
separação durante essa 1° divisão meiótica em
que os 2 foram para a mesma célula e ela ficou
sem cromossomo. Esse erro é chamado de NÃO
DISJUNÇÃO MEIÓTICA. Então depois da 2°
divisão meiótica algumas células vão ter
cromossomos a mais e outras a menos. Caso ela
seja uma célula que vai ser fecundada por um
espermatozoide, isso vai dar origem a um feto
que apresenta um número anormal de
cromossomos. Ex: Sindrome de Down
- Segundo exemplo- erro de separação na 2°
divisão meiótica. Mesmo cromossomo sendo
 Variabilidade
3 de DNA- Aula 4
levado para uma única célula, resultando em
células com cromossomos a mais e células com
cromossomos a menos.

A) Trecho de DNA que vai ser replicado

- Síndrome de Klinefelter- cromossomo X mais.
- Quadro embaixo de Klinefelter- Síndrome de
Down, cromossomo 21 a mais.
B) Fitas de DNA sendo separadas. Houve a
incorporação de uma base nucleotídea
que não é complementar a base original.
Ao invés de um C, foi pareado um T ao G.
Como as posições vizinhas estão pareadas
corretamente, elas vão conseguir manter
as duas fitas ligadas.
C) Após a incorporação da base errada é
mantido ao longo das gerações e pode ter
algum impacto na função do gene
Processo de deaminação de proteínas

- Síndrome de Edwars- cromossomo 18 a mais.

Mutações Gênicas

. Espontâneas (Naturais)
- Erros de replicação do DNA- estimado em
1x10-10 (elevado a -10) - taxa de erro muito
baixa.
- A DNA polimerase que sintetiza as novas fitas
de DNA, não é 100% precisa, comete erros.
- Pode-se estimar menos de 1 erro por ciclo
celular
- Processos químicos espontâneos:
depurinação, desmetilação ou desaminação

. Induzidas por Mutágenos A) Processo químico em que o grupo amino,

- Químicos ou radiação ionizante
Ex: Desastre de Chernobil. Explosão de uma
usina nuclear e houve a liberação de
componentes radioativos. Muitas pessoas
apresentaram doenças sérias e muitas outras
morreram.
Mutações espontâneas- Erros de replicação
última citosina é removido e vai dar origem a
outra base nucleotidea, a uracila
B) 5-Methylcytosine da origem a Timina
Sistemas biológicos de reparo
. Prevenção dos erros antes que eles
aconteçam
- Enzimas superóxido dismutase e catalase-
catalizam a conversão de radicais superoxidos
em água
. Reparo durante a replicação
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4 de DNA- Aula 4
- Vias de reparo por excisão
. Reparo pós replicação
- Sistema de reparo de bases mal pareadas
(Mismatch repair system)

A importância dos erros

(Considerações simples sobre evolução)

•Sem variações no DNA, não há oportunidade

para a evolução Resume-se em substituição de um nucleotídeo.
•Erro e tentativa é o curso da evolução
* SNPs são a forma mais frequente de variações
•Grande parte dos erros são neutros
nos genomas
•Erros podem aumentar a vantagem reprodutiva
A estimativa para o genoma humano é de que em
– Seleção positiva. Maior probabilidade de
média dois genomas tenham uma diferença a
sobreviver mais tempo e consequentemente
cada 1250pb aproximadamente
maior probabilidade de se reproduzir e passar
Nesta figura representada pela letra R (significa
essa vantagem reprodutiva pra geração seguinte
que esta posição pode ser ocupada por um A ou
• Seleção Negativa- Erros podem diminuir a
por um G
vantagem reprodutiva
- Como nosso genoma tem bilhões de bases,
existem milhões de SNPs no nosso genoma.
• Seleção balanceada- Erros podem dar
vantagem e desvantagem Variações em sequência de DNA. Substituições
. Ex: Uma pessoa que tem anemia falciforme não
pega malária. •Substituições de uma única base acontecem ao
longo de todo o genoma
•O impacto de uma substituição está
- É uma balança. O surgimento de uma espécie relacionado com o papel funcional da região
depende do surgimento de variações, então que onde ela ocorre e com as consequências da
surgi a variação. E do outro lado da balança, não mudança de base
pode surgir muitas variações a ponto do genoma
do indivíduo ser afetado e adquirir doenças e não
sobreviver. Porque no final o objetivo é o
indivíduo sobreviver e passa seu genoma para as
gerações seguintes.
Ex: Alteração na região promotora pode
- Grande parte dessas variações são neutras, acontecer delas terem uma menor afinidade de
porque a maior parte do genoma não codifica ligação pelos fatores de transcrição. Os fatores de
nada, então se trocar pares de base nesses transcrição se ligam ao DNA por afinidade, é uma
lugares, não terá impacto nenhum. interação físico-química. Agora se tiver uma base
trocada essa afinidade vai ser menor. Ou seja, o
gene vai ter um nível de expressão mais baixo.
Mutações/Polimorfismos em DNA
- E pode também acontecer ao contrário. Pode
acontecer uma mutação que resulte nos fatores
•Variações em sequência
– Substituições de um nucleotídeo (designados de transcrição se ligarem com maior afinidade ao
pelo acrônimo SNPs, do inglês single nucleotide promotor. Nível de expressão será mais alto.
polymorphisms)
–É o tipo de variação mais comum
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5 de DNA- Aula 4
Mutações em sequencias regulatórias
Esses bloquinhos coloridos são as regiões
regulatórias dos promotores, as sequencias
conservadas ( Box tata, box cat). Esses picos
representam o impacto das mutações nos níveis
de transcrição.
- Então vemos que quando ocorre mutação
dentro dessas regiões conservadas os níveis de
transcrição são baixos.
Nível de transcrição associado a mutações na
região regulatória (promotor) do gene da Beta
Globina.
Variações em sequência de DNA
Substituições
*IMPORTANTE
•Substituições em sequências sem papel
funcional têm efeito neutro
•Substituições em sequências regulatórias podem
interferir na ligação de fatores de transcrição –
aumentando ou diminuindo a transcrição
•Substituições em bordas éxon/íntron podem
alterar o splicing
•Substituições em 5’e 3’UTR (regiões não
traduzidas) podem interferir na estabilidade do
mRNA.
Variações em sequência de DNA codificante
Substituições
•Substituições em regiões codificantes (éxons)
– Sinônima (ou silenciosa) - Caso não mude a
codificação do códon
– Não sinônima- Caso mude a codificação do
códon
•Sentido trocado (Missense) se gerar um outro
aminoácido.
 Conservativa se o novo aminoácido
codificado for de mesma natureza
química que o codificado pelo códon
antes da substituição; Ex: aminoácido
hidrofílico por um outro aminoácido
hidrofílico também.
 Não conservativa se a natureza química
do aminoácido codificado for diferente
•Sem sentido (nonsense) se gerar um códon de
parada.
-Dentro do éxons tem os códons que codificam
diferentes aminoácidos. Caso ocorra a
substituição de uma base dentro de um códon e
essa substituição não resulte na mudança do
aminoácido codificado é chamada de substituição
sinônima.
Ex: Temos os códons UCU e UCC que codifica a
serina. Se o 2° U do primeiro aminoácido for
trocado por um C, ele vai continuar codificando a
serina.
Exemplos:
-Substituição sinônima (silenciosa) – mesmo
aminoácido
AGG  CGG Arginina
- Mutação não sinônima sem sentido - geram
códons terminais (stop codon)
-Mutação não sinônima de sentido trocado -
mudança de aminoácido
Conservativa -aa diferentes mas
equivalentes
AAA  AGA
Lys Arg
Não conservativa -aa diferentes e não
equivalentes
AAA  GAA
Lys Glu
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6 de DNA- Aula 4

Deleções
• Deleções de uma única base acontecem ao
longo de todo o genoma

•O impacto de uma deleção está relacionado com

o papel funcional da região onde ela ocorre e
com as consequências da deleção

•Deleções em éxons
–De uma única base –mudança na janela de
leitura
–De duas bases –mudança na janela de leitura
–De três bases (um códon) –deleção de um
aminoácido.

- Quando salta uma ou duas bases na região

codificante, altera a janela de leitura.