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O mesmo não acontece na metabolômica. Como vimos, essa ciência estuda uma
ampla gama de compostos diferentes com grande variedade de propriedades
físicas e químicas. O que torna evidente a não utilização de um procedimento
padrão em suas análises.
Técnicas usadas em metabolômica
Todo o método cromatográfico tem como objetivo separar compostos contidos em uma
amostra. Compostos de uma mistura são separados de acordo com a afinidade com as
fases (fase estacionária e a fase móvel).
Técnicas usadas em metabolômica
Cromatografia Gasosa
Também é usada para analisar compostos que possam produzir derivados voláteis
e compostos termicamente estáveis nas condições de trabalho.
Técnicas usadas em metabolômica
Cromatografia Líquida
Fonte: https://ceatox.ibb.unesp.br/padrao.php?id=15
Técnicas usadas em metabolômica
Cromatografia Líquida
Cromatografia Líquida
A fase estacionária é a parte fixa e o eluente é a parte móvel (fase móvel), sendo que a diferença
de polaridade dos componentes da amostra, proporcionarão a estes constituintes interações
diferentes com a fase estacionária e a fase móvel.
Na fase estacionária podem ser utilizados compostos sólidos ou líquidos. Os sólidos normalmente
são substâncias absorventes, tais como, sílica, carvão ativo, etc., que se encontram “empacotadas”
em uma coluna, a qual é atravessada pela fase móvel.
Técnicas usadas em metabolômica
Cromatografia Líquida
Cromatografia Líquida
Fonte: https://Freitag.com.br/blog/o-que-e-a-cromatografia-liquida-de-alta-eficiencia
Técnicas usadas em metabolômica
Cromatografia Líquida
As subtâncias com maior afinidade com a fase estacionária movem-se mais lentamente e
as substâncias com pouca afinidade com a fase estacionária movem-se mais rapidamente.
Cromatografia Líquida
Fonte: https://www.biomedicinapadrao.com.br/2015/04/hplc-cromatografia-liquida-de-alta.html
Técnicas usadas em metabolômica
Cromatografia Líquida
Material é colocado em uma placa com matriz e bombardeado com um laser que
o evapora, em seguida, um sistema ioniza e aspira o material volatilizado, o qual
chega à detectores que registram o tempo que a substância chega ate o detector
e a sua quantidade. Essa técnica baseada em conceitos proteômicos, capaz de
fornecer resultados altamente precisos em poucos minutos.
Referências:
CAO, YQ., et al. Digital PCR as an Emerging Tool Monitoring of Microbial Biodegradation. Molecules. 2020, Feb 25(3):706,
1-18.
CHEN, Q., GUO, W., FENG, L., YE, X., XIE, W., HUANG, X. and LIU, J. Transcriptome and proteome analysis of Eucalyptus
infected with Calonectria pseudoreteaudii. J. Proteomics 115, 117–131, 2015.
ESPÍNDULA, F.S.et al. Recursos de bioinformática aplicados às ciências ômicas como genômica, transcriptômica,
proteômica, interatômica e metabolômica. Bioscience Journal, Uberlândia, v. 26, n. 3, p. 463-477, Maio/Junho 2010.
GAUTHERET, D.; POIROT, O.; LOPEZ, F.; AUDIC, S.; CLARVERIE, J. M. Alternate polyadenylation in human mRNAs: a large-
scale analysis by EST clustering. Genome Research, Cold Spring Harbor, US, v. 8, p. 524-530, 1998.
HAN, Y., GUO, S., MUEGGE, K., ZHANG, W. and ZHOU, B. Advanced Applications of RNA Sequencing and Challenges.
Bioinform. Biol. Insights, 29, 2015.
Técnicas usadas em metabolômica
Referências:
KIM, K.H., KANG, Y.J., KIM, D.H., YOON, M.Y., MOON, J.-K., KIM, M.Y., VAN, K. and LEE, S.-H. RNA-Seq Analysis
of a Soybean Near-Isogenic Line Carrying Bacterial Leaf Pustule-Resistant and -Susceptible Alleles. DNA Res.
18, 483–497, 2011.
MARTIN, J.A. & WANG, Z. Next-generation transcriptome assembly. Nat. Rev. Genet. 12, 671–682, 2011.
MATTHEWS, B. F.; DEVINE, T. E.; WEISEMANN, J. M.; BEARD, H. S.; LEWERS, K. S.; MACDONALD, M. H.; PARK, Y.
B.; MAITI, R.; LIN, J.; KUO, J.; PEDRONI, J. J.; CREGAN, P. B.; SAUNDERS, J. A. Incorporation of sequence cDNA
and genomic markers into soybean genetic map. Crop Science, Madison, US, v. 41, p. 516-521, 2001.
MOREIRA, L.M; et al. Ciências Genômicas: Fundamentos e Aplicações. 1a Edição. Ribeirão Preto: Cubo, 2015.
MORETON, J., IZQUIERDO, A. AND EMES, R.D. Assembly, Assessment, and Availability of De novo Generated
Eukaryotic Transcriptomes. Front. Genet. 6, 2016.
Técnicas usadas em metabolômica
Referências:
PROSDOCIMI & SANTOS. Sobre bioinformática, genoma e ciência. Ciência Hoje, 2006, v. 35, n. 209, p. 54-57.
PROSDOCIMI, F. Introdução à bioinformática. Revista Biotecnologia Ciência & Desenvolvimento, 2007, p. 03-74.
SUGIMOTO, M., KAWAKAMI, M., ROBERT, M., SOGA, T., & TOMITA, M. Bioinformatics Tools for Mass Spectroscopy-
Based Metabolomic Data Processing and Analysis. Current bioinformatics, 2012, v.7, n.1, p.96–108.
VELCULESCU, V.E.; ZHANG, L.; VOGELSTEIN, B.; KINZLER, K.W. 1995. Serial Analysis of Gene Expression. Science. v. 270.
p. 484-487.
VERLI, H; et al. Bioinformática: Da Biologia à Flexibilidade Molecular. 1a Edição. São Paulo: SBBq, 2014.
WESTERMANN, A.J., GORSKI, S. a. and VOGEL, J. Dual RNA-seq of pathogen and host. Nat. Rev. Microbiol. 10, 618–630,
2012.
ZAHA, A.; FERREIRA, H.B.; PASSAGLIA, L.M.P. Biologia Molecular Básica. 5a Edição. Porto Alegre: Artmed, 2014.
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