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21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Conceitos iniciais da biologia molecular


Prof. Eldio G. Santos

Descrição A construção histórica da biologia molecular e seu emprego no estudo das biomacromoléculas,
como o DNA, o RNA e as proteínas, que estão presentes nas células e são responsáveis pela
manutenção da vida.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Propósito A compreensão da descoberta do RNA e do DNA, a importância dessas moléculas para as células
procariontes e eucariontes e o fluxo de informação dado pelo dogma central da Biologia.

Objetivos

Módulo 1 Módulo 2

Histórico da biologia molecular e O DNA e o dogma central da Biologia


organização gênica
Descrever as funções do DNA e o dogma central da Biologia.

Descrever a história da biologia molecular, a origem da vida e


a organização gênica nos organismos.
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meeting_room Introdução
A biologia molecular é a área da Biologia que estuda as moléculas presentes nas
células responsáveis pela manutenção da vida. Vamos iniciar nosso aprendizado
sobre as moléculas possivelmente mais importantes para a existência da vida na
Terra. Estamos falando dos ácidos nucleicos: RNA e DNA.

Você sabia que até mesmo os vírus, microrganismos intracelulares obrigatórios,


apresentam ácidos nucleicos? Não existe sequer um ser vivo que não tenha
moléculas de RNA ou DNA.

Faremos um breve histórico sobre como começaram os estudos da biologia


molecular, passando pela provável origem da vida na Terra, conhecendo as
estruturas e composições dos ácidos nucleicos e observando como é dada a
organização desse material em diferentes seres vivos. Aprenderemos ainda como
o armazenamento e o fluxo de informação genética nos seres vivos ocorrem.
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1 - Histórico da biologia molecular e organização gênica


Ao final deste módulo, você será capaz de descrever a história da biologia molecular, a origem da vida e a
organização gênica nos organismos.
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Histórico da biologia molecular

Componentes do núcleo celular

Nosso histórico começa em 1869 com um bioquímico suíço chamado Johannes


Friedrich Miescher. Em seus estudos, ele buscava determinar quais componentes
químicos existiam dentro dos glóbulos brancos (leucócitos) presentes no pus de
feridas.

De modo geral, tais glóbulos possuem


um núcleo grande e bem definido. No
interior desse núcleo, Miescher observou
uma grande quantidade de um composto
ácido com átomos de nitrogênio e
fósforo, nomeando-o de nucleína por
estar localizado no núcleo. Mal ele sabia
Friedrich Miescher.
da importância dessa descoberta!
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Diversos outros cientistas continuaram investigando o tal composto – entre eles,


Albrecht Kossel, que, em 1880, demonstrou que nela havia diferentes bases
nitrogenadas. Richard Altmann, nove anos depois, conseguiu purificar a nucleína e
chamou o purificado de ácido nucleico.

Com o tempo, os ácidos nucleicos era cada vez mais estudados. Eles pareciam muito
importantes, já que praticamente todas as células possuíam esse material. Foram
descobertas quatro diferentes bases nitrogenadas:

Bases púricas Bases pirimídicas


Adenina (A) e guanina (G). Citosina (C) e timina (T).

Todas elas estão associadas com uma pentose (basicamente, um carboidrato


monossacarídeo formado por cinco átomos de carbono) do tipo ribose ou
desoxirribose (a desoxirribose perde a hidroxila do carbono 2) e um grupamento
fosfato.
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Nucleotídeo contendo a base nitrogenada, o fosfato e a pentose.

Essas bases estão ligadas entre si, sempre obedecendo a um padrão, em que a
adenina se associa à timina por duas ligações de hidrogênio e a guanina se associa à
citosina por três ligações, sendo a segunda interação a mais estável devido à maior
quantidade de ligações.
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Bases nitrogenadas e suas interações por ligação de hidrogênio. O grupamento R, nas


riboses, consiste em um OH e, nas desoxirriboses, em um H.

Entretanto, havia um fato curioso: a presença de uma base diferente, chamada de


uracila, em alguns desses materiais. Essa base apresentava uma ribose no lugar da
desoxirribose e se ligava à timina no lugar da adenina.

As moléculas com desoxirribose foram denominadas ácido desoxirribonucleico


(ADN). Seu nome, em inglês, é deoxyribonucleic acid: trata-se do famoso DNA.
As moléculas com ribose como pentose foram nomeadas ácido ribonucleico
(ARN), o qual, em inglês, é chamado de ribonucleic acid, conhecido como RNA.

Todas as bases nitrogenadas.

Vamos agora juntar todos os conceitos estabelecidos para entender como é a


estrutura do DNA e do RNA.
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Um nucleotídeo é um conjunto formado por uma base nitrogenada, que pode ser uma
purina ou pirimidina. Entre as purinas, há a adenina e a guanina; entre as pirimidinas, a
citosina e a timina, no caso de uma molécula de DNA, e o uracil(a), em uma molécula
de RNA.

Além das ligações de hidrogênio realizadas entre as bases nitrogenadas, também se


observou outro tipo de ligação que ocorria numa outra porção do nucleotídeo. Uma
ligação vertical entre as bases, formando uma longa cadeia chamada de fita, é
realizada entre a molécula de açúcar (pentose) de uma ribose para o RNA ou de uma
desoxirribose para o DNA e o grupamento fosfato da base adjacente, realizando uma
reação conhecida como ligação fosfodiéster.

Ligação fosfodiéster entre nucleotídeos da mesma fita


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de DNA.

O DNA é formado por diversos nucleotídeos, que possuem uma sequência (A, T, C, G)
específica. Mais à frente, veremos como essa sequência funciona e para que serve.

Saiba mais

A estrutura do DNA se encontra em uma fita dupla. A união entre as duas fitas se dá por ligações de
hidrogênio entre as bases nitrogenadas. O RNA pode estar em fita simples ou dupla a depender da sua
função.

Entretanto, considerando que os seres eucariotos, na maior parte do tempo, estão em


fita simples, não possuindo interações de hidrogênio entre as bases nitrogenadas, o
RNA, por conta disso, é consideravelmente mais suscetível à degradação mecânica ou
por calor que o DNA. Ele é muito mais frágil e tende a ter funções diferentes do DNA,
como veremos em outro momento.

Teorias sobre a estrutura do DNA

Vamos voltar para a história. Em 1953, uma dupla de cientistas, James Watson e
Francis Crick, publica um artigo na revista Nature denominado Molecular structure of
nucleic acids que apresenta uma nova proposta de estrutura do DNA. Eles eram
contrários às ideias existentes na época a respeito da estrutura.
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Entre os modelos antigos, o que mais se destacou foi o de Linus Pauling. Ele
acreditava que o DNA era interligado pelos grupamentos fosfatos, formando uma
coluna.

Já Watson e Crick, baseados em uma foto tirada por Rosalind Franklin, propuseram
uma nova estrutura para essa molécula. A estrutura era uma dupla hélice cujas bases
nitrogenadas purinas se ligavam às pirimidinas no centro da hélice espiralada, sendo
muito parecida com a que usamos até hoje.

Linus Pauling

Esta é a foto tirada utilizando difração de raio-X, técnica na qual um feixe de raios atravessa uma molécula
cristalizada e mancha um filme atrás, revelando, assim, uma imagem em que esses raios X foram difratados. É
semelhante ao nosso raio-X atuais de ossos, só que com pequenas moléculas.
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Raio-X, responsável pelas conclusões de Watson e Crick. A estrutura tridimensional montada por Watson e Crick.

Com a estrutura do DNA resolvida e o conhecimento sobre a química dessas


biomacromoléculas, faltava agora entender a atuação e a organização delas nas
células e por que eram tão importantes para justificar sua presença no núcleo de
basicamente todas as células.

Ao longo dos anos, o conhecimento sobre o DNA e o RNA vem


crescendo.

Hoje em dia, com técnicas de sequenciamento do DNA, podemos, por exemplo, ver
rapidamente se algum indivíduo possui propensão a determinado câncer analisando a
sua sequência de DNA. Começamos a ter mais segurança e menor custo na edição
genética.
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No futuro, possivelmente poderemos curar doenças que sequer se manifestaram.


Atualmente, inúmeras técnicas utilizando o DNA são amplamente usadas no dia a dia.
Eis alguns exemplos:

Quantificar o material genético que expressamos para diagnosticar doenças,


como a Covid-19.
Realizar perícias criminais.
Fazer testes de ancestralidade.
Modificar outros organismos para que produzem nossas proteínas.

Existem, portanto, inúmeras possibilidades decorrentes do desenvolvimento da


biologia molecular.

A origem da vida
A origem da vida sempre despertou curiosidade. Ao longo dos anos, houve diversas
teorias. Enquanto algumas se provaram erradas, outras se mantêm até hoje.

Você imagina como a vida começou? Vamos conhecer um pouco essas teorias?
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Teoria de Oparin e Haldane

Sabemos que os átomos podem fazer ligações de maneira espontânea desde que
estejam em um ambiente favorável e tenham afinidade um pelo outro, ou seja, após se
ligarem, encontram uma estabilidade maior do que a existente quando estavam
separados. Assim são construídas as moléculas.

Saiba mais
Das teorias existentes, uma delas, a de Oparin e Haldane, defendia justamente a ideia da formação
espontânea de pequenas moléculas orgânicas, as quais, com o tempo, passaram a se organizar de maneira
cada vez mais complexa até se replicarem e evoluírem, formando as células primitivas.

Em 1953, Stanley Miller tentou provar que, desde que o ambiente fosse favorável, era
possível existir a criação espontânea de moléculas orgânicas na Terra. Ele fez um
experimento no qual simulava a provável atmosfera primitiva do planeta há cerca de 4
bilhões de anos.

No seu experimento, havia moléculas, como gás hidrogênio, metano e vapor de água,
bastante comuns no ambiente primitivo. Na presença de uma descarga elétrica, como
um raio, esses gases se ligavam entre si, formando diversas moléculas orgânicas –
entre elas, os aminoácidos alanina, glicina e ácido aspártico.
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Experimento de Miller.

A teoria de Oparin e Haldane continuou ganhando relevância à medida que novos


estudos eram realizados, como os do geólogo Michael Russell. O pesquisador
demonstrou a existência de fontes de águas termais no fundo dos oceanos, as quais,
aquecidas pelo manto da Terra, jorram água alcalina.

Essas fontes são ricas em minérios de


ferro, níquel e enxofre dissolvidos. A
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reação de tais minérios com o gás


carbônico, hidrogênio reativo e moléculas
de água é capaz de produzir compostos
orgânicos, como hidrocarbonetos, e até
mesmo nucleotídeos!

Uma das descobertas mais incríveis


sobre essas fontes são as reações
químicas que lá ocorrem e como a
geração dessas moléculas orgânicas
acontece. As fontes termais são ricas em
minerais; sendo assim, possuem um
Fonte termal vulcânica, a possível origem da vida.
elemento que pode ser oxidado, como o
ferro.

O elétron oriundo da oxidação é carregado pelos núcleos metálicos desses minerais


até chegar ao aceptor final de elétrons. Tal aceptor pode ser o monóxido ou o dióxido
de carbono, que será reduzido, gerando a energia necessária para a confecção das
moléculas orgânicas.

Saiba mais

Você já ouviu falar de um mecanismo parecido com esse anteriormente? Em que um elétron percorre uma
cadeia até chegar ao seu aceptor, gerando energia? É de maneira muito semelhante a essa que diversos
seres vivos, como nós, produzem energia!
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Esse mecanismo ocorre durante a fosforilação oxidativa nas mitocôndrias, etapa


metabólica da nossa respiração celular. Isso mostra um elo entre todos os nossos
ancestrais, fortalecendo a hipótese de que a vida se originou dessas fontes de águas
termais há muitos anos. No entanto, vale mencionar que ainda existem diversas
perguntas para serem respondidas. Nos dias atuais, essa é a teoria com mais
aceitação para a origem da vida.

Teoria da panspermia
Outra teoria que vem ganhando notoriedade é a panspermia, segundo a qual a vida
não necessariamente surgiu na Terra. Ela, na verdade, veio do espaço e chegou aqui
através de corpos celestes.

Um fato que deu base para a teoria da


panspermia foi a observação de
compostos orgânicos presentes em
meteoritos.

Em 1997, com a análise do meteorito de


Muchinson, os pesquisadores
encontraram diversos aminoácidos
responsáveis por formar proteínas e
outros compostos orgânicos presentes
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que datavam de aproximadamente 7


bilhões de anos. Desse modo, eles eram
mais antigos que nosso próprio planeta,
que possui cerca de 4,5 bilhões de anos.

Fragmento de meteorito.

Nessas rochas extraterrestres incrivelmente antigas, cientistas encontraram minerais,


traços de aminoácidos e outros compostos orgânicos. A forma com que tais materiais
foram criados, como frisamos, os torna mais antigos que o próprio planeta. É possível
que os condritos carbonáceos sejam a fonte de compostos orgânicos responsável por
dar origem à vida na Terra.

Saiba mais
Em abril de 2022, uma descoberta movimentou a comunidade científica. Em um meteorito, foram
encontradas duas bases nitrogenadas, a citosina e a timina, que estão presentes no DNA, vindas do espaço!
Apesar de endossar a teoria da panspermia, essa descoberta não define como surgiu a vida na Terra. Mesmo
assim, ela nos abre para mais questionamentos e guiará futuras pesquisas.
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A panspermia não possui evidências científicas suficientes para explicar a origem da


vida no nosso planeta – diferentemente da teoria de Oparin e Haldane, que atualmente
é a mais aceita. Entretanto, é muito interessante imaginar que, em outros lugares do
universo, existam compostos orgânicos e – quem sabe? – até mesmo vida. Essas
amostras extraterrestres também evidenciam que é possível criar matéria orgânica,
incluindo as bases presentes no DNA e no RNA.

“Mundo RNA”
A teoria de Oparin e Haldane diz que, em um mundo no qual existiam alguns
nucleotídeos, aminoácidos e hidrocarbonetos, essas moléculas começariam a
interagir entre si, formando cadeias cada vez mais complexas. Dessa forma, as
ligações entre diferentes nucleotídeos formaram os primeiros RNAs; as ligações entre
diferentes aminoácidos, os oligopeptídeos.

A interação entre os oligopeptídeos e o RNA leva a benefícios mútuos. Ela gera, por
exemplo, estabilidade na estrutura de ambos, originando uma maior quantidade de
determinadas estruturas.

Imagine agora essas diversas interações por muitos milhares de


anos. É natural que, com o tempo, estruturas mais complexas se
formem e se mantenham.
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Já sabemos que tanto o RNA quanto os pequenos peptídeos conseguem realizar


reações químicas com diversas funções (neurotransmissores, hormônios, regulação
gênica etc.). Recentemente, foi descoberto que o RNA seria capaz até mesmo de se
autorreplicar, gerando outras moléculas de RNA também capazes de fazer essa
autorreplicação. Desse modo, a evolução poderia acontecer ainda mais rápido, dando
origem ao chamado “mundo RNA”.

Naquele mesmo ambiente, existiam


outros compostos orgânicos, como os
primeiros lipídeos oriundos dos
hidrocarbonetos formados.

Você já jogou um pouco de óleo na água?


Sabe que eles não se misturam, certo?
Isso se dá a partir da característica
anfipática de determinados lipídeos, que,
em um ambiente aquoso, tendem a
formar micelas, estruturas circulares
formadas naturalmente devido à forma
com que interagem com a água, expondo
Recipiente com água e óleo.
a parte hidrofílica (polar) e escondendo a
hidrofóbica (apolar) da água.
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Com isso, esses lipídeos formavam grandes micelas, originando “membranas”


celulares rudimentares com moléculas de RNA em seu interior. Surgiam, assim, as
primeiras células primitivas com material genético com capacidade replicativa.

Hoje em dia, grande parte dos seres vivos ainda possui seu material genético disperso
no citoplasma. Esses organismos são chamados de procariontes ou procariotos.

Ao longo de milhares de anos, o mundo


RNA foi evoluindo. Não se sabe
exatamente como essa evolução
ocorreu, mas a constante estabilidade
adquirida pelas moléculas presentes
naquela “sopa primordial” do mundo RNA
deu origem a uma fita dupla contendo
timina em vez de uracila.

A timina possui um grupamento metil no


carbono 5, inexistente na uracila. Assim
foram formadas as primeiras moléculas
de DNA. Consideravelmente mais estável
que o RNA, o DNA é formado por uma
Como poderiam ser as primeiras células vivas da Terra.
série de nucleotídeos, os quais, em
determinada sequência, armazenam uma
informação.
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Dessa maneira, o DNA possui uma maior confiabilidade para armazenamento de


dados e tem as informações responsáveis pela manutenção da vida. Ele passa por
uma série de processos nos quais haverá o fluxo desses dados armazenados até que
eles sejam expressos em forma de proteínas funcionais. Esse fluxo de informações
tem o seguinte nome: dogma central da biologia molecular.

A transcrição dá origem a um RNA mensageiro (RNAm) a partir do DNA. O RNAm é


traduzido em uma proteína, a unidade que vai realizar as funções de que a célula
precisa.

Exemplo

Catalisar reações, formar estruturas e participar de vias metabólicas.

O DNA também possui uma maquinaria para realizar cópias da fita original em um
processo chamado de replicação. Em breve, veremos com mais detalhes todos esses
processos do dogma central da biologia molecular.

Organização do material genético


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Estrutura e organização do DNA e do RNA


Nós já sabemos que o DNA e o RNA são formados por uma base nitrogenada, um
grupamento fosfato e uma pentose. Mas como funciona de fato a estrutura do DNA e
do RNA nos seres vivos? O que as diferentes bases nitrogenadas representam? Neste
tópico, responderemos a algumas dessas perguntas.

O DNA tem como função principal armazenar informação. Conforme a sequência de


bases nitrogenadas, a informação passada adiante vai servir para determinado
propósito. A porção do DNA que a transmite é chamada de gene, um segmento
codificante do DNA, isto é, um trecho que será lido e transcrito e formará uma proteína
com uma atividade de acordo com a sequência do DNA.

Saiba mais

O DNA não é apenas formado por genes. Na verdade, a maior parte dele é não codificante (DNA não
transcrito). Essas regiões têm sua importância no controle da expressão gênica e auxiliam em determinados
processos, como a replicação e a formação dos cromossomos.

O cromossomo é uma estrutura composta por uma molécula de DNA altamente


compactada e associada a proteínas auxiliadoras que ajudam a compactar e
descompactar o DNA para facilitar ou dificultar o acesso de outras proteínas a trechos
do DNA. Todo o conjunto de genes e regiões não codificantes recebe o nome de
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genoma, que contém toda a informação hereditária que será passada da célula-mãe
para as células-filhas.

À exceção de alguns vírus, todos os seres vivos utilizam a molécula de DNA para
armazenar e transferir suas características hereditárias. Esse material genético pode
estar:

Disperso no citoplasma Dentro de um núcleo


Nos procariotos. Nos eucariotos.

Os procariotos são os organismos mais antigos da Terra. Todos são unicelulares e


não possuem um núcleo organizado, isto é, o seu material genético não é separado
por uma membrana nuclear chamada de carioteca.

Essa “falta” de organização e a ausência de um núcleo definido fazem com que os


procariotos sejam parecidos com as primeiras células encontradas no nosso planeta.
Tais organismos são relativamente mais simples; além disso, a sua expressão gênica
é diferente da nossa. Nós, seres humanos, pertencemos ao grupo dos eucariontes e
temos o material genético separado do citoplasma pela carioteca.

Expressão gênica
É o processo em que uma informação contida no DNA é transcrita e traduzida para a formação de proteínas. A
proteína é a expressão da informação presente no DNA.
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Núcleo disperso nas células procariontes e núcleo compartimentado pela carioteca nas
células eucariontes.

Material genético dos procariotos

Cromossomo procarioto

Os procariotos possuem apenas um cromossomo linear ou circular que contém todo o


seu material genético. Seu nome é DNA cromossomal.

Além do cromossomo, eles também podem possuir elementos genéticos móveis


(EGMs). Os EGMs são responsáveis por transmitir algumas características genéticas a
outros indivíduos vizinhos para lhes conferir alguma vantagem ou desvantagem. Os
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EGMs são partes fundamentais do DNA dos procariotos, mesmo não pertencendo ao
cromossomo.

O cromossomo dos procariotos possui uma quantidade de DNA que pode variar entre
0,16 e 13Mpb (megapares de base).

Exemplo
O DNA da bactéria E. coli possui cerca de 4,6Mpb contido em uma célula de 2μm!

Esse volume só é possível devido ao alto grau de condensação do DNA. A


condensação é feita por meio da formação de grandes alças na molécula de DNA que
originam alças menores, possibilitando que o DNA ocupe um menor volume na célula.

As alças são formadas com o auxílio das proteínas DNA girase e topoisomerase l. A
região formada por este único cromossomo condensado é chamada de nucleoide.

Compactação do DNA procarionte.


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Elementos genéticos móveis


Os EGMs são partes fundamentais do DNA dos procariotos, mesmo não pertencendo
ao cromossomo. É importante saber que existem diferentes tipos de EGMs, vamos
estudar os três principais: plasmídeos, bacteriófagos e os transposons.

Tipos de elementos genéticos móveis (EGMs)

Os plasmídeos são moléculas circulares de DNA fita dupla, independentes do


cromossomo e possuem capacidade de replicação autônoma. Seu tamanho é de
cerca de 1 a 35 kpb (Quilo de pares de base). Cada célula pode conter diversos ou
nenhum plasmídeo, com uma ou várias cópias. Os plasmídeos são considerados
elementos de herança extracromossômica, já que possuem replicação autônoma,
independentemente do cromossomo. Eles também não são vitais e não causam
malefícios à célula hospedeira.

Geralmente, os plasmídeos possuem informações que serão aproveitadas para a


produção de toxinas, pilinas, adesinas e diversos outros tipos de proteínas capazes de
conferir algum tipo de vantagem para a célula hospedeira. Justamente por isso, eles
podem ser chamados também de elementos genéticos acessórios.
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Plasmídeo e DNA bacteriano.

Os plasmídeos não são normalmente sintetizados, e sim adquiridos por meio de um


fenômeno denominado conjugação bacteriana, em que uma bactéria transfere os
seus plasmídeos para outra e mantém uma cópia deles para si. Eles são de grande
importância no estudo da biologia molecular por sua facilidade de manuseio e
replicação.

Essas moléculas são utilizadas como vetores nos quais uma sequência de interesse é
inserida no plasmídeo, que, por sua vez, é difundido entre os indivíduos de
determinada colônia de bactérias. As bactérias, ao se replicarem, possibilitam originar
uma grande quantidade de cópias da sequência de interesse.

A partir disso, podemos purificar esse material e usá-lo para os mais diversos fins.

Exemplo
Uma das formas de obtenção e produção de insulina é utilizando os plasmídeos como vetores.
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Bacteriófagos

São vírus que infectam bactérias, injetando o seu material genético. Eles podem se
inserir no DNA cromossomal e se replicar junto com o organismo.

Após a inserção, os genes contidos no bacteriófago são expressos e se mostram


capazes de codificar proteínas, além de toxinas e fatores de virulência e toxinas. Eles
são perigosos, porque podem transformar uma bactéria não patogênica em uma
patogênica.

Alguns bacteriófagos podem até mesmo produzir capsídeo viral e se multiplicar


diversas vezes, iniciando um ciclo lítico que termina na eclosão da célula hospedeira.

Ciclo lítico
É a multiplicação do vírus dentro de uma célula, formando novos vírus e resultando no rompimento de dentro
para fora da membrana celular, o que libera uma grande carga viral.
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DNA do bacteriófago.

Transposons

São pequenas sequências de DNA que serão inseridas de forma aleatória no DNA do
organismo hospedeiro, formando novos trechos de genoma. Esse evento é chamado
de transposição e catalisado por enzimas denominadas transposases.

As transposases são capazes de cortar o DNA na região do transposon, liberando


essas sequências que se difundem pela célula. Os transposons são identificados a
partir de mudanças fenotípicas nas bactérias.
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Representação de um Transposon.

Como quase todo o DNA bacteriano é codificante, essas inserções podem causar
algumas alterações funcionais no procarioto, como, por exemplo, a perda de atividade
enzimática.

Existem três principais subgrupos de transposons:

Sequências de inserção (chamadas de IS ) expand_more

Os ISs (Insertion sequence) são os transposons mais simples, podendo se


inserir tanto no cromossomo quanto nos plasmídeos. Com cerca de 700 a
2.500pb, eles são nomeados pela sigla IS seguida de um número. É o exemplo
do IS3 ou IS37.
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Os ISs contêm os genes responsáveis pelo próprio mecanismo de


transposição que codificam as transposases e possuem sequências muito
parecidas em suas extremidades para que a sua respectiva transposase corte
essa região, liberando o IS para ser reinserido em um outro sítio. A
transposição acontece no momento de abertura – que antecede a replicação –
da dupla fita de DNA, em que o transposon é inserido na fita de DNA e
replicado junto com o DNA do procarioto.

Estrutura esquemática do ISs.

Transposons compostos (simbolizados pela sigla Tn) expand_more

Eles são chamados de transposons compostos por serem formados por duas
sequências de ISs em suas extremidades. Os Tn podem conferir vantagens a
bactérias. É o caso do Tn9, que gera resistência ao antibiótico cloranfenicol.
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Método de inserção de transposons.

Transposons complexos (ou elementos TnA) expand_more

Com cerca de 500pb, tais elementos, em vez de ISs em suas extremidades,


possuem pequenas sequências indicando o local de corte pela transposase.
Os TnA induzem a replicação do procarioto com objetivo de se multiplicarem.

É importante destacar que os EGMs possibilitam que as bactérias troquem


informação genética de maneira muito rápida. Desse modo, caso apareça
algum desses elementos, como, por exemplo, a capacidade de gerar
resistência a um antibiótico, todas as bactérias da colônia também ganham a
mesma resistência. Essas características foram fundamentais para a evolução
e a manutenção da vida dos organismos procariontes.
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Inserções transposon no genoma.

Material genético dos eucariotos

Membrana nuclear em eucariotos


Conforme já aprendemos, a maior diferença entre procariotos e eucariotos é a
presença da carioteca (uma membrana nuclear que engloba o material genético,
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isolando o citoplasma) no conjunto chamado de núcleo. O núcleo permite um maior


nível de organização celular e modifica a organização e a estrutura gênica.

Diferença entre uma célula eucariótica e procariótica.

Para começarmos a entender o nível de complexidade da organização do material


genético em eucariotos, faremos algumas contas básicas. Todo o genoma humano
possui cerca de 3.2Gpb (giga de pares de base). Já a espécie Polychaos dubium, um
pequeno parasita unicelular eucarionte, conta com 670Gpb, ou seja, uma quantidade
cerca de 200 vezes maior que o nossa.

Esse fenômeno é chamado de paradoxo do valor C, em que a complexidade do


organismo não está associada ao tamanho do seu material genético, uma vez que
nós, seres humanos, somos mais complexos que esse parasita. O paradoxo do valor C
pode ser explicado pela maneira com que o DNA é codificado e processado.
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Compactação do DNA dos eucariotos


Outro fator relevante é o nível de compactação do DNA. Vamos agora fazer um
comparativo entre duas células cujos valores de pares de base existentes nós já
conhecemos: a humana, com 3,2Gpb, e a E. coli, com 4,6Mpb.

Célula humana. Célula E. coli.

O DNA humano é contido em um diâmetro de cerca de 5 a 10μm, enquanto na E. coli


esse valor é de 2μm, ou seja, um DNA 700 vezes maior ocupa um espaço quase
semelhante ao da bactéria. Isso é possível graças a uma forma diferente de
estruturação e compactação do DNA.

O genoma dos eucariotos é compactado em cinco níveis diferentes.


21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

No primeiro, todo DNA, que possui 2nm, é


acoplado a proteínas chamadas de
histonas. Essa estrutura é conhecida
como nucleossomo.

O nucleossomo possui 11nm e se


compacta, formando uma estrutura
solenoide de 30nm. Essas histonas ficam
Nucleossomo. bem juntas, propiciando a formação de
uma estrutura ainda mais densa, como
se fossem fibras.

No terceiro e quarto nível de compactação, são formadas as alças dos solenoides


(parecidas com as alças dos procariotos) com 300 e 700nm, respectivamente. No
último grau de compactação, ocorre a formação de uma alça ainda maior, 1.400nm,
dando origem à estrutura chamada de cromátide cromossômica.

Duas cromátides unidas por uma


estrutura denominada centrômero
formam o cromossomo. O conjunto de
cromossomos, ou seja, o DNA e as
proteínas acessórias (principalmente, as
histonas), forma a cromatina.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

O cromossomo também possui em suas


extremidades os telômeros, que são
estruturas fundamentais para a
estabilidade do cromossomo e
indicadores da idade celular, já que um
pequeno trecho desse telômero é perdido
devido à forma com que o DNA replica.

Cromossomo.

O grau de compactação do DNA eucarionte pode variar de acordo com a fase do ciclo
celular que se encontra, pois a cromatina se organiza de diferentes formas,
obedecendo à necessidade de expressão gênica.

Com o DNA menos condensado (um estado mais aberto), ele pode ser exposto a toda
a maquinaria de transcrição e/ou replicação existente, e a cromatina se encontra em
um estado de eucromatina. Já no caso de um muito condensado, a célula não
consegue expressar ou replicar determinada região, e ele se encontra no estado de
heterocromatina. Há ainda a heterocromatina constitutiva, formada por trechos que
nunca serão transcritos.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Transcrição do DNA descompactado.

Normalmente, seu nome é estado de eucromatina/heterocromatina, já que não se


trata de algo fixo. Desse modo, o mesmo trecho pode ficar ora em estado de
eucromatina, ora em estado de heterocromatina. Contudo, não é errado chamá-lo
apenas de eucromatina ou heterocromatina.

Os eucariotos possuem também um DNA extracromossomal, que está presente nas


mitocôndrias e nos cloroplastos (nas células vegetais) e é completamente
independente do DNA cromossomal. Existem teorias de que essas organelas eram
outros organismos que acabaram sendo inseridos nas células eucariontes e lá
permaneceram, pois o ambiente era favorável. Em troca do ambiente seguro, eles
geravam energia para as células hospedeiras, formando, assim, uma relação de
simbiose.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Processo de compactação do DNA dos


video_library eucariotos
Neste vídeo, compreenderemos as etapas de compactação que o DNA eucarionte
sofre.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Falta pouco para atingir seus objetivos.

Vamos praticar alguns conceitos?

Questão 1
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Estudamos as teorias do surgimento da vida e as características estruturais das


moléculas que compõem o genoma. Sobre esses assuntos, leia as afirmativas
abaixo e responda.

I. A teoria de Oparin e Haldane era a mais aceita até a descoberta do meteoro de


Murchinson; a partir de então, a mais aceita foi a da panspermia.

II. A teoria mais aceita atualmente para a origem da vida na Terra é derivada da
teoria de Oparin e Haldane, segundo a qual a vida surgiu de forma espontânea a
partir de pequenas moléculas orgânicas.

III. O RNA e o DNA são moléculas capazes de armazenar informação genética;


entretanto, o DNA é mais estável e se consolidou nessa função.

IV. O mundo RNA dependia de organismos complexos.

Estão corretas as afirmativas:

A I e II.

B I e III.

C II e III.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

II, III e IV.


D

E I e IV.

Parabéns! A alternativa C está correta.

Vamos analisar caso a caso. Apesar de surpreendente, a teoria da panspermia (vida


advinda do espaço) não apresenta evidências suficientes. Já a de Operin e Haldane
se baseia na criação da vida por meio de moléculas orgânicas criadas de forma
espontânea em um ambiente favorável, propiciando, com o tempo, a formação de
moléculas cada vez mais complexas. Essa teoria vem ganhando cada vez mais
força com novas descobertas. Os eucariotos e os procariotos usam moléculas de
DNA para armazenar sua informação genética, e a dupla fita de DNA é mais estável
que o RNA. O “mundo-RNA” é uma teoria que surgiu com a possibilidade de
autorreplicação do RNA.

Questão 2

Vimos as principais diferenças na organização das células procariontes e


eucariontes. Sobre a organização nos eucariotos, como você espera que esteja
organizado o DNA de uma célula pronta para se replicar?
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

A DNA completamente enovelado em estado de eucromatina.

B DNA parcialmente desenovelado em estado de heterocromatina.

C DNA desenovelado em estado de heterocromatina.

D DNA desenovelado em estado de eucromatina.

E DNA completamente enovelado em estado de heterocromatina.

Parabéns! A alternativa D está correta.

Para a maquinaria de replicação ter acesso ao DNA, ele precisa estar exposto. No
caso da replicação, todo o material genético será copiado para dar origem a uma
nova célula-filha; portanto, todo o DNA precisa estar desenovelado no estado de
eucromatina. A heterocromatina seria com o DNA enovelado; dessa forma, o DNA
não teria como ser replicado.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

2 - O DNA e o dogma central da Biologia


Ao final deste módulo, você será capaz de descrever as funções do DNA e o dogma central da Biologia.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Dogma central da Biologia e etapa de


replicação

Conceito geral do dogma central da biologia molecular


No módulo anterior, nós verificamos que o material genético é responsável por
armazenar informações e que isso ocorre preferencialmente no DNA por ele ser mais
estável e por conta do fluxo de informações. As informações presentes no DNA são
transcritas para o RNA e então traduzidas para proteínas, um conceito conhecido
como o dogma central da Biologia.

Mas por que e de que forma essas etapas acontecem?

Imagine a célula humana como se fosse


um restaurante antigo que era o melhor
da cidade. Todas as receitas dele estão
armazenadas em um grande livro de
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

receitas que fica trancado dentro de um


armário.

Esse seria nosso DNA dentro do núcleo,


considerando as células de um ser
eucarioto. Quando surge a necessidade
de cozinhar algo, o armário precisa ser
destrancado. Da mesma forma que
estudamos antes, determinada região de
heterocromatina precisa ser exposta e se
torna eucromatina para que tenhamos
acesso com o objetivo de ler o material
Livro de receitas trancado, assim como o DNA dentro
do núcleo. alvo, seja ele o DNA ou o livro de receitas.

Tanto o livro quanto o DNA são extremamente preciosos: sem eles, não há vida ou
restaurante. Qualquer um dos dois, assim, não deve ser retirado do núcleo ou do
armário.

Para que isso aconteça, o ideal é realizar uma transcrição desse material em outro
menos valioso, seja ele um RNA ou uma folha de caderno, porque, mesmo que lhe
aconteça algum dano, isso não vai comprometer toda a célula ou todo o restaurante.
Depois de ser feita, a cópia deve ser levada até outro local para que a receita seja
executada ou traduzida em um objetivo final, como um prato do restaurante ou uma
proteína.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Outra etapa muito importante é a replicação: ainda dentro da nossa analogia, ela
equivaleria à necessidade de abrir um segundo restaurante. Também precisamos ter
esse livro de receitas no local; sendo assim, uma réplica dele tem de ser feita da forma
mais íntegra possível, contendo a menor quantidade de erros.

O mesmo acontece quando uma célula precisa criar uma cópia dela
própria: todo o DNA é replicado para que a célula-filha seja idêntica à
mãe.

Juntos, estudaremos cada etapa do dogma central da Biologia de forma isolada e


dentro de um contexto geral, começando pela replicação.

Uma última informação muito importante antes de começarmos: a replicação, a


transcrição e a tradução apresentarão diferenças se o organismo for procarionte ou
eucarionte. Apesar de o objetivo final ser o mesmo, o caminho varia. Isso acontece por
causa da maneira com que a célula se organiza devido a:

Presença ou ausência de uma carioteca.


Forma que o material genético é organizado.
Fatores associados a tais eventos.

Para fins didáticos, nosso estudo será voltado principalmente para os organismos
eucariontes, citando algumas diferenças que ocorrem nos procariontes.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Conceito geral de replicação


Todas as células do nosso organismo possuem determinado tempo de vida;
entretanto, algumas têm uma maior dificuldade e/ou necessidade de replicação, como
os neurônios, enquanto outras precisam se multiplicar rapidamente para repor um
tecido por exemplo, como as células epiteliais. Seja qual for o caso, a célula terá de se
dividir. E, para isso o DNA, precisa ser replicado.

Saiba mais
O DNA é formado por uma dupla hélice com duas orientações diferentes para que haja complementariedade
entre as fitas, como se fosse um zíper. Caso as duas fitas estivessem no mesmo sentido, não seria possível
formar uma dupla fita estável.

Uma das fitas possui uma hidroxila livre no carbono 3 da pentose; a outra fita, o
carbono 5 livre na pentose, como pode ser visto na figura a seguir. Dessa forma, uma
fita é chamada de 5’→3’ e a fita complementar, de 3’→5’.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

A cadeia de DNA possui uma ponta 5’ e uma ponta 3’..

Etapas da replicação
A replicação tem início com a abertura da dupla fita de DNA mediada pela enzima
helicase, capaz de separar as ligações de hidrogênio entre as bases nitrogenadas. A
região de abertura da dupla fita é chamada de bolha de replicação.

Ao longo do DNA, são formadas várias dessas bolhas para que o processo seja ainda
mais rápido. No entanto, existem alguns problemas relacionados a isso.

Já experimentou esticar um objeto


espiralado, como um prendedor de
cabelo ou uma mola?
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Se você fizer isso, perceberá que uma


tensão muito grande vai se formar na
ponta do objeto: justamente por esticar
algo que estava enrolado, a mola poderia
facilmente quebrar.

Mola sendo esticada.

Acontece algo parecido com o DNA: para continuar a replicação, a fita precisa estar
esticada, mas ela é uma dupla hélice. Com isso, entra em ação a enzima
topoisomerase ou DNA girase. Tal enzima tem como função desfazer essa tensão
próxima ao início da bolha de replicação, que é aberta pela helicase.

Na região aberta da dupla fita, há o acoplamento de algumas proteínas – entre elas,


destacam-se a primase e o complexo DNA polimerase (existem várias DNA
polimerases, mas vamos falar da I e da III), formado por várias subunidades com
diferentes funções.

Exemplo
Ler um nucleotídeo, adicionar o nucleotídeo complementar na fita molde e ligar os nucleotídeos que estão
sendo formados para a construção de uma nova fita.

A primase é fundamental para que a DNA polimerase III comece seu trabalho. Lembra
que falamos das extremidades 5’ e 3’? A síntese de uma nova fita sempre acontece no
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

sentido 5’→3’, pois a DNA polimerase só consegue atuar quando ela enxerga uma
ponta 3’. Vejamos as etapas do seu trabalho:

looks_one Primeiro passo

A primase vai construir uma pequena fita de RNA complementar à fita molde, com cerca
de 15 nucleotídeos, para possibilitar a chegada da DNA polimerase. Esse pequeno
trecho é chamado de primer.

looks_two Segundo passo

Agora sim chega a DNA polimerase III, que é capaz de englobar a fita original para ler
qual nucleotídeo está ali presente. Em seguida, ela seleciona um novo nucleotídeo de
acordo com a fita molde – sempre respeitando a paridade A-T, C-G – e realiza a ligação
desse nucleotídeo selecionado na fita molde.

looks_3 Terceiro passo

U f it li ã d l tíd fit ld DNA li III


21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular
Uma vez feita a ligação de um novo nucleotídeo na fita molde, a DNA polimerase III
caminha em direção ao próximo nucleotídeo e repete o processo de forma muito rápida
– e sempre no sentido 5’→3’.

Sabemos que o DNA é formado por uma dupla fita, em que uma delas está no sentido
5’→3’ e a outra, no sentido oposto: 3’→5’. Para essa segunda fita, é mais fácil
construir uma nova fita no sentido 5’→3’, uma vez que esse já é o sentido
complementar, correto?

Mas como acontece na fita 5’→3’, em que o sentido oposto é 3’→5’?

Resposta

Para resolver esse problema, a replicação da fita molde 5’→3’ ocorre de pedaço em pedaço. À medida que a
helicase vai abrindo a fita dupla, diferentes enzimas primases inserem vários primers ao longo da fita. Depois
disso, a DNA polimerase III se junta nessas regiões, contendo os primers e sintetizando um trecho da fita até
chegar próximo ao primer seguinte.

Quando a polimerase chega ao próximo primer, ela se desacopla da fita de DNA e uma
outra proteína assume a DNA ligase, que junta os diferentes fragmentos de DNA
construídos. Damos o nome desses trechos de DNA feitos ao longo da fita de
fragmentos de Okazaki.

A figura a seguir exemplifica esse processo e vai facilitar o entendimento. A fita feita
de forma contínua é chamada de fita líder. A outra, montada pela união dos
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

fragmentos de Okazaki, tem o nome de fita tardia.

Representação da bolha de replicação.

Os processos realizados pela DNA polimerase III e pela primase são muito rápidos e
podem ser suscetíveis a erros (a primase costuma errar mais que a DNA polimerase
III). Um exemplo de erro seria a adição de um nucleotídeo na posição errada ou algum
nucleotídeo que não foi inserido, o que pode acontecer em um lugar crucial para o
funcionamento celular.

Dessa forma, antes do final da replicação, a DNA polimerase I é responsável por


corrigir esses eventuais erros e remover todos os primers da nova fita, os substituindo
por DNA. Já as lacunas entre esses novos trechos construídos após a remoção dos
primers são fechadas pela enzima DNA ligase. Com isso, todo o DNA é replicado e
duas fitas duplas de DNA são formadas.

Entretanto, não se trata de duas novas fitas duplas: em cada fita dupla de DNA, uma
delas já existia antes da replicação. Por isso, a replicação é um processo chamado de
semiconservativo.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Curiosidade

Um ponto a ser considerado que difere a replicação entre eucariotos e procariotos é que, no segundo grupo,
ocorre a formação apenas de uma bolha de replicação durante todo o processo.

Agora que já vimos como o DNA é replicado nas células, podemos seguir para o fluxo
de informações, que começa com a transcrição do DNA.

Etapa de transcrição

Conceito geral de transcrição


A transcrição, em resumo, é o processo em que o DNA, responsável por manter todas
as informações para o funcionamento do organismo, expõe um trecho, chamado de
gene, para ser copiado. A cópia é feita utilizando moléculas de RNA.

Esse RNA tem como função principal chegar à maquinaria de tradução íntegro para
que a informação expressa no DNA seja perfeitamente lida e traduzida. A transcrição é
um processo que ocorre de forma diferente em eucariotos e procariotos por diversos
motivos, como, por exemplo a presença/ausência da carioteca, que separa o DNA
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

presente no núcleo do restante do citoplasma, e pelo fato de a complexidade e a


organização do DNA serem diferentes entre essas classes de organismos.

Complexidade e a organização do DNA


Como vimos, os eucariotos organizam seu DNA em cromossomos. já os procariotos fazem isso em plasmídeos
e outros elementos.

Transcrição do DNA.

Sobre a transcrição, veremos alguns dos mecanismos que acontecem nos seres
procariotos e eucariotos para termos uma noção geral de como se dá a tradução nos
diferentes organismos. Além disso, vamos apresentar as noções básicas de regulação
da expressão gênica para entender melhor os motivos que podem aumentar ou
diminuir a transcrição de um gene.

Todos os seres vivos estão em um ambiente sujeito a constantes alterações. Às


vezes, é possível faltar nutrientes ou a temperatura fica muito alta. Há inúmeras
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

possibilidades, e nossos genes precisam responder a essas variações.

Se faltar um nutriente, o indivíduo que


conseguir economizar melhor recursos
vai sobreviver. Por outro lado, a tendência
para aqueles que continuam utilizando-o,
em geral, é morrer. Existe, assim, uma
seleção natural daqueles que conseguem
se adaptar rapidamente ao novo meio em
Camelos preservam água e gordura para sobreviverem
detrimento dos que não têm essa
no deserto.
habilidade.

Poupar recursos depende do seguinte fator: que determinados genes que gastam
muita energia fiquem menos ativos, estando mais condensados (em estado de
heterocromatina) para serem menos expressos. Já os genes responsáveis pelo
armazenamento de recursos, como os que expressam as proteínas promotoras da
formação do glicogênio, ficam mais ativos, ou seja, descompactados (eucromatina),
para que a maquinaria de transcrição possa acessá-los.

É importante ressaltar que existem ainda os genes essenciais para a manutenção da


vida: são os chamados genes constitutivos. Não é possível simplesmente economizar
energia expressando uma menor quantidade deles; caso contrário, existe uma alta
possibilidade de isso levar à morte.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Transcrição em procariotos
Nos organismos procariontes, a transcrição ocorre a partir do acoplamento da RNA
polimerase em uma sequência de DNA denominada região promotora. A RNA
polimerase é responsável por ler a fita de DNA e construir uma molécula de RNA
complementar a esse DNA, conhecido como RNA mensageiro ou RNAm, que recebe
esse nome por levar a mensagem do DNA (gene) para a maquinaria de tradução.

Saiba mais
Todos os genes (sequências de DNA codificantes) possuem uma região promotora. Essa região pode
inclusive favorecer uma maior ou menor expressão gênica, fazendo um controle negativo ou positivo a
depender da ligação de determinadas proteínas conhecidas como fatores transcricionais, que inibem ou
ativam a expressão gênica.

Vamos ver agora um exemplo mais concreto desse conceito de regulação baseado em
fatores transcricionais repressores (controle negativo) ou efetores (controle positivo).
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Regulação da expressão gênica negativa. Regulação da expressão gênica positiva.

Uma regulação negativa pode acontecer de algumas formas. Um fator repressor se


liga à região promotora e impede que a RNA polimerase acople na fita de DNA,
inibindo a transcrição. Além disso, um fator do tipo pode se ligar a um efetor,
impedindo a sua atuação e diminuindo a expressão de determinado gene. O mesmo
conceito pode ser aplicado inversamente:

Um fator efetor se liga à região promotora, aumentando a


transcrição, ou é capaz de estabelecer uma ligação com um
repressor e impedir a inibição do gene.

Nos procariotos, a região codificante, cujo nome é operon, é composta por mais de um
gene – em geral, com função final relacionada (de uma mesma via metabólica). Todos
os genes de determinado operon, desse modo, vão formar proteínas com funções de
alguma forma vinculadas umas às outras, como veremos em breve.

O RNAm oriundo da transcrição de um operon é formado por mais de um gene, sendo


chamado de RNAm policistrônico. De modo diferente, nos eucariotos, todas as regiões
promotoras estão associadas a apenas um gene; sendo assim, o RNAm final possui
informações apenas desse gene, tendo o nome de RNAm monocistrônico. Apesar de o
RNAm dos eucariotos ser formado por apenas um gene, ele precisa ser processado
para continuar a sua jornada.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Diferenças no RNAm de eucariontes e procariontes. UTR é uma sigla do termo inglês untranslated region, que significa região não codificante.

Após a formação e o processamento do RNAm nos eucariotos, ele precisa sair do


núcleo para encontrar o ribossomo. Nos procariotos, por não possuir carioteca, o
RNAm encontra-se no citoplasma, e um RNAt (RNA transportador) é responsável por
levar o RNAm contendo as informações do DNA para o ribossomo, local onde ele vai
iniciar a tradução.

Agora que já possuímos uma noção sobre a transcrição nos procariotos, podemos ver
com mais detalhes esse processo nos organismos eucariontes.

Etapa de transcrição em eucariotos


21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Conceito geral de transcrição em eucariotos


Vamos considerar a estrutura e organização dos procariotos:

Seres unicelulares cujo material genético quase todo é codificante.


Proteínas interligadas de uma mesma via metabólica sendo expressas.
Regulação básicas de ativação ou repressão genética e promotores.

Observaremos que as células procariontes funcionam muito bem se pensarmos que


elas são unidades individuais, buscando a sobrevivência. De modo diferente, se
considerarmos os organismos multicelulares, veremos que eles possuem um maior
nível de complexidade e que, ao mesmo tempo, o percentual de gene codificante e não
codificante é muito menor.

Nos humanos, cerca de 2% do DNA é codificante. É um pouco contraintuitivo pensar


que um organismo mais complexo, como no caso dos seres eucariontes em que todas
as células, mesmo com funções variadas, possuem o mesmo DNA – temos, ainda por
cima, uma porcentagem proporcionalmente menor de genes codificantes. Vamos
conhecer um exemplo?

Exemplo
No quesito especialização celular, uma célula do seu intestino precisa absorver e transportar nutrientes com
muita eficiência. Já uma célula da sua pele tem de se multiplicar mais, conferir resistência e acumular
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

queratina. No entanto, os dois tipos celulares têm os mesmos genes, assim como praticamente todo o DNA
é igual!

O segredo desse paradoxo é a regulação gênica e o processamento do RNAm. Para


ser possível transcrever uma fita de DNA, primeiramente há o acoplamento da RNA
polimerase na fita dupla. Esse DNA precisa estar acessível à maquinaria de
transcrição, ou seja, em um estado descompactado.

Compactação e descompactação do DNA


A compactação e a descompactação do DNA em eucariotos são dadas pelas
proteínas histonas, sendo um tipo de regulação gênica. As histonas ditam a
compactação da cromatina e são moduladas por pequenas alterações químicas em
sua estrutura. Essas alterações são:
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Metilação Acetilação
A adição de grupamentos metila favorece A adição de grupamentos acetil favorece
a compactação do DNA pelas histonas, a descompactação do DNA,
impossibilitando a atuação da possibilitando a atuação da maquinaria
maquinaria transcricional. de transcrição. Esse mecanismo é
catalisado pelas proteínas histona acetil
transferase (HAT) e é reversível.

Importante ressaltar que por conta do HAT, uma das maneiras de regular o que vai ser
expresso é dependente do padrão de acetilação/metilação de histonas.

Acetilação de histonas mediada por histona acetil transferase (HAT).

Voltando ao exemplo dado anteriormente, as células do seu intestino certamente


possuem trechos do DNA menos compactados que as células da sua pele. Esses
trechos vão expressar proteínas responsáveis pela absorção dos nutrientes. Nas
células da pele, os mesmos trechos estarão com as suas respectivas histonas
metiladas, isto é, mais compactadas.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Determinados fatores transcricionais podem promover a acetilação e a metilação das


histonas de maneira direcionada, gerando especializações celulares. Em resumo, o
padrão de histonas do seu DNA é um dos fatores que faz com que diferentes células
tenham funções diferentes.

Metilação do DNA
Outro mecanismo de inibição da expressão gênica é dado pela metilação do próprio
DNA – mais especificamente, na posição 5 do anel de citosina, o que dificulta a
interação com a RNA polimerase, impedindo a transcrição.

Citosina metilada na posição 5 do anel pirimidina. A metilação é a


adição de um grupo metil (CH3) de forma covalente. Enzima

responsável: DNA metiltransferase (DNMT).

As citosinas metiladas formam as chamadas ilhas CpG ou ilhas CG (ilhas citosina-


guanina). Essa metilação não é reparada pela maquinaria de reparo celular, não sendo
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

transcrita e traduzida. Ela constitui, assim, partes não codificantes.

No entanto, tal metilação pode ser passada para as células-filhas no processo de


replicação durante a multiplicação celular, garantido a sua hereditariedade. Elas se
localizam principalmente perto do sítio de início da transcrição de genes constitutivos.

Saiba mais

Nos eucariotos, levando em consideração a regulação da transcrição, há ainda as sequências reguladoras,


que são bastante semelhantes aos operadores dos procariotos. Mas essas sequências podem, nos
eucariotos, estar localizadas a milhares de pares de base de distância do promotor.

Outros pontos de regulação da expressão


gênica
Até agora vimos alguns fatores de regulação associados à transcrição do DNA, mas a
expressão gênica dos eucariotos pode ser regulada em diversos outros pontos. Isso
se verifica, por exemplo, em:

Processamento pós-transcricional.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Degradação do RNAm.
Tradução.
Processamento pós-traducional.
Degradação e transporte da proteína gerada.

Como sabemos, os eucariotos são organismos bastante complexos, com milhares de


diferentes interações. A cada dia, os cientistas descobrem novos conceitos e novas
formas de regulação gênica.

Por isso, vamos nos concentrar em algumas das regulações mais relevantes, como o
splicing alternativo e a maturação do RNAm, no nível do processamento pós-
transcricional, assim como nos recém-descobertos miRNA (microRNA) e siRNA (small
interferenceRNA), para a degradação do RNAm.

Agora já sabemos por que todas as células, mesmo possuindo o mesmo DNA, têm
especializações diferentes. Entretanto, falta ainda entender a proporção de DNA
codificante e não codificante.

Temos apenas 2% de DNA codificante: será que isso é suficiente


para dar conta de toda complexidade de um organismo
multicelular?

A resposta é sim. Afinal, estamos vivos, não é?


21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

A chave para entender esse dilema está no splicing alternativo. Cada célula possui um
padrão de splicing (conjunto de informação de como esse processo será realizado)
conforme as suas funções, originando, assim, proteínas diferentes a partir do mesmo
gene.

Após a transcrição do gene, é formado um pré-RNAm. Ele é processado por um


complexo de RNA e proteínas denominado spliciossomo, em que, a depender do
padrão de splicing celular no momento da transcrição, alguns trechos do pré-RNAm
são considerados éxons e outros, íntrons.

Os trechos íntrons são removidos do pré-RNAm, enquanto os trechos éxons são


ligados pelo spliceossomo, gerando um pré-RNAm formado apenas com éxons
segundo o padrão de splicing. É o que demonstra a figura a seguir.

Splicing alternativo
O termo em inglês splicing significa emendar. Já “alternativo” se refere ao fato de eles serem íntrons e éxons;
logo, são ligados de forma alternada.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Diferentes isoformas do RNAm.

Um mesmo gene pode dar origem a uma enorme quantidade de diferentes RNAm e,
por consequência, proteínas distintas. Dessa maneira, com uma quantidade
relativamente baixa de genes codificantes, os eucariotos conseguem gerar um número
muito elevado de diferentes proteínas.

Junto ao splicing alternativo, o pré-RNAm também precisa passar por um


processamento que o torna capaz de sair do núcleo para chegar ao ribossomo onde
será traduzido. O pré-RNAm passa por duas etapas:
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

A primeira etapa

É a adição do cap 5’, dada pela ligação de um nucleotídeo alterado, e o GMP metilado
(guanosina monofosfato metilada), na ponta 5’ do RNAm, por uma ligação trifosfato. O
cap 5’ promove a ligação na organela, além de também ter ação protetora. Ele é
fundamental para:

O reconhecimento do RNAm maduro.


A exportação do RNAm para fora do núcleo.
O endereçamento do RNAm em direção ao ribossomo.

Cap 5’
A palavra cap significa boné e, nesse caso, pode ser traduzida para capacete 5’. Por isso, seu nome é cap 5’ ou
capacete 5’, uma vez que esse nucleotídeo alterado protege a perda de informação contida no RNAm oriunda da
degradação pela ação de ribonucleases e fosfatases.

A segunda etapa

Constitui uma adição de uma cauda chamada de “poli-A” na extremidade 3’ do RNA. A


cauda tem esse nome por ser formada por 80 a 250 resíduos de adenina.
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Ela também serve para proteger o RNAm de degradação enzimática durante todo o
processo de locomoção em direção ao ribossomo. A cauda poli-A é clivada por
endonucleases quando o RNAm encontra o ribossomo.

Com a adição do cap 5’ e da cauda poli-A, o RNAm se torna maduro e pode ser
traduzido pelo ribossomo no citoplasma. A regulação desse processo se dá pela
remoção de uma dessas adições. Caso a célula não precise mais de determinada
proteína, sinalizações regulatórias serão enviadas para o núcleo, onde elas são
removidas, e o RNAm agora “não maduro” será degradado.

Processamento do RNAm.

A última regulação genética que vamos estudar é a mediada por pequenos RNAs:
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miRNAs

Os miRNAs apresentam cerca de 19 a 28pb (pares de base). Eles são endógenos e


formados a partir do pareamento imperfeito de uma fita dupla de RNA (double
stranded RNA, conhecido como dsRNA).

Esse pareamento gera uma estrutura em forma de grampo de cabelo; conhecida como
hairpin, ela é clivada por uma endonuclease dicer (endonucleases são proteínas que
cortam a fita de RNA ou DNA de forma precisa), formando os miRNAs.

siRNAs

Já os siRNAs, com cerca de 22 a 23pb, são exógenos (oriundos do RNA viral) ou


endógenos (oriundos de retrotransposons), sendo formados a partir de um
pareamento perfeito de uma dsRNA. Eles também são clivados pela endonuclease
dicer, gerando esses fragmentos de siRNA.

A regulação é dada pela ligação entre o miRNA ou siRNA no RNAm, induzindo a


degradação do RNAm ou impedindo sua tradução.

Retrotransposons
Componentes genéticos com capacidade de autorreplicação, convertendo RNA em DNA. Estão presentes em
eucariotos, porém sua possível origem é viral. Os retrotransposons, ao longo da evolução se estabeleceram no
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genoma eucarionte.

Mecanismo de ação do miRNA e siRNA

Recentemente descobertos, os siRNA e miRNA têm um papel muito importante no


controle da expressão gênica em eucariotos. Ainda tentamos entender melhor como
eles funcionam, embora suas aplicações médicas pareçam ser muito promissoras.

Exemplo

Uma pessoa com o metabolismo alterado para produzir grandes quantidades de colesterol endógeno pode
ter diversos problemas de saúde oriundos do alto colesterol. No futuro, para o caso dela, talvez seja possível
construir siRNAs específicos para silenciar a expressão de HMG-CoA redutase, a principal enzima da síntese
de colesterol endógeno, o que possibilidades para uma nova terapia genética.
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Etapa de tradução

Conceito geral de tradução


O processo de tradução é bastante parecido nos organismos eucariontes e
procariontes. A maior diferença é que, nos procariontes, o RNAm não precisa sair do
núcleo. Desse modo, veremos esse processo de forma independente do tipo de
organismo.

Após o RNAm ser transcrito e processado no citoplasma, este pode levar a informação
para uma estrutura conhecida como ribossomo, organela responsável por sintetizar
proteínas.

O ribossomo é composto de duas subunidades:

Subunidade maior (chamada de 50S)

A subunidade maior é dividida em três partes:


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Sítio A Sítio P Sítio E


Os aminoácidos entram Em que é formada a Em que é formada a
no ribossomo. cadeia peptídica. cadeia peptídica.

O termo “cadeia peptídica” é dado a uma cadeia de aminoácidos ligados por ligações
peptídicas. Trata-se de interações entre um grupamento amina e um carboxila que
estão presentes nas extremidades dos aminoácidos. Por isso, aliás, eles recebem o
nome de aminoácido: amin(a) e ácido (carboxílico).

Subunidade menor (chamada de 30S)

A 30S é responsável pelo acoplamento e pela leitura do RNAm.


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Esquema do funcionamento do ribossomo durante a tradução.

Processo de tradução
O processo de tradução se inicia pela leitura do RNAm, sendo realizado de 3 em 3
nucleotídeos. Essa trinca é conhecida como códon.

É importante saber que a leitura se inicia por um códon específico chamado de start
códon e formado pelas bases AUG. Começa dessa maneira o processo de tradução:
sempre lendo de três em três nucleotídeos e adicionando um novo aminoácido à
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cadeia peptídica até determinado ponto, em que haverá um códon de parada chamado
de stop códon.

Dica
Sempre que o ribossomo lê um códon, ele adiciona um aminoácido específico, definido a partir da leitura do
códon, na cadeia peptídica.

Em resumo, o processo de tradução funciona dessa forma, mas ainda existem dúvidas
a serem respondidas.

Como o ribossomo sabe qual é o aminoácido correto que ele


precisa adicionar? Como esse aminoácido chega à subunidade
50S?

A resposta está em um outro tipo de RNA, o RNA transportador ou RNAt. Ele tem uma
estrutura bastante peculiar, parecendo um grampo de cabelo.

Em uma de suas extremidades, o RNAt possui um aminoácido acoplado e, na


extremidade oposta, uma sequência de três nucleotídeos que será complementar à do
códon de leitura presente no RNAm, sendo chamada de região anticódon. Cada
diferente sequência anticódon conta com um aminoácido específico que será
adicionado no ribossomo à cadeia peptídica, formando uma proteína funcional.
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Estrutura do RNAt.

Código genético universal e degenerado


Todos os seres vivos existentes compartilham o mesmo código de códons conhecido
como código genético universal e degenerado, estando associados aos mesmos
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aminoácidos! Trata-se de mais um indício que corrobora a confirmação da teoria da


evolução, segundo a qual todos nós viemos de um mesmo ancestral comum.

Código genético universal.

Vale notar que o código genético universal também é chamado de degenerado pelo
fato de a primeira e a segunda base se repetirem para os seus relativos aminoácidos.
A variação ocorre principalmente na terceira base. Esse é mais um mecanismo de
redundância e de minimização de erros, já que, caso aconteça alguma mutação, se ela
for na terceira base do códon, haverá uma grande chance de ser uma sem relevância,
porque ela vai expressar o mesmo aminoácido.
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Por fim, a cadeia peptídica expressa a partir do RNAm contendo vários aminoácidos
sofre uma ação do complexo enzimático denominado chaperona. A chaperona fica
responsável por otimizar a estrutura terciária dessa cadeia, auxiliando na construção
da proteína funcional e liberando, no fim da sua reação, a proteína em seu estado final.

Comentário
Assim concluímos o fluxo de informação conhecido como dogma central da Biologia. Existem ainda alguns
vírus com capacidade de burlar esse fluxo pela ação de enzimas específicas, como é o caso da transcriptase
reversa. Tais casos, porém, são especiais e precisam ser estudados de forma mais profunda.

video_library Dogma central da Biologia


Neste vídeo, apresentaremos de maneira geral o conceito do dogma central da
Biologia.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Falta pouco para atingir seus objetivos.

Vamos praticar alguns conceitos?

Questão 1

São exemplos de modificações pós-transcricionais em organismos eucariontes:

A Adição da cauda poli-A e adição do cap 5’.

B Adição do cap 5’ e abertura mediada por helicase.

C Adição de aminoácido e abertura por helicase.


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D Adição da cauda poli-A e retirada dos fragmentos de Okazaki.

E Abertura mediada por helicase e retirada dos fragmentos de Okazaki.

Parabéns! A alternativa A está correta.

A adição da cauda poli-A e do cap 5’ é uma estratégia que ajuda no endereçamento


do RNAm para fora do núcleo em direção ao ribossomo e confere mais resistência
ao RNAm.

Questão 2

Quais são as principais funções da DNA polimerase I e da III, respectivamente?

A Abrir a dupla fita de DNA e remover os primers de RNA formados.

B Remover os primers de RNA, adicionando DNA, e construir a fita líder.


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C Ligar os fragmentos de Okazaki e abrir a dupla fita de DNA.

Remover a tensão da dupla fita e adicionar pares de base na fita


D
simples de RNA.

Abrir a dupla fita de DNA e adicionar pares de base na fita simples de


E
RNA.

Parabéns! A alternativa B está correta.

A DNA polimerase I é responsável por remover os primers de RNA, que começam a


construir os fragmentos de Okazaki com o intuito de possibilitar a construção da fita
tardia e adicionar DNA no lugar do RNA, que é sintetizado pela primase. Já a
polimerase III constrói a fita complementar de DNA no sentido 5’-3’.
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Considerações finais
Vimos neste conteúdo como a biologia molecular foi estabelecida como ciência a
partir da descoberta do DNA e do RNA, explorando principalmente a sua estrutura e a
sua função. Além disso, conhecemos a teoria mais aceita atualmente para explicar
como a vida surgiu no nosso planeta.

Em seguida, aprendemos de que forma o material genético está organizado nos


eucariotos e procariotos, observando ainda alguns dos mecanismos de regulação da
expressão gênica.

Por fim, percorremos todo o dogma central da Biologia, que explica de que modo
funciona o fluxo de informações presente no nosso material genético. Entendemos o
seu sentido, indicando quais etapas ocorrem para que ele seja expresso e para que
sejam produzidas as proteínas funcionais, as quais, por sua vez, realizam todas as
etapas para o funcionamento de um ser vivo.

headset Podcast
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Neste podcast o especialista vai abordar exemplos práticos da aplicação clínica e


laboratorial da biologia molecular, como utilização de plasmídeo para produção de
insulina por meio da replicação, entre outros exemplos.

Explore +
Para conhecer um pouco mais sobre a história da biologia molecular, leia Os genes e o
gene, matéria de Rogerio Meneghini publicada na revista FAPESP.

Qual foi papel de Rosalind Franklin no modelo da dupla hélice do DNA de Watson e
Crick? Para saber mais, consulte no Scielo Brasil o artigo As controvérsias a respeito
da participação de Rosalind Franklin na construção do modelo da dupla hélice, de
Marcos Rodrigues da Silva, publicado em 2010.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

Michael Russell demonstrou que existem fontes de águas termais no fundo dos
oceanos que, aquecidas pelo manto da Terra, jorram água alcalina. Essas fontes são
ricas em minérios de ferro, níquel e enxofre dissolvidos. Para conhecer mais, leia o
livro Questão vital: Por que a vida é como é?, de Nick Lane e Talita Rodrigues, de 2017.

Referências
AL MUFTAH, W. A. et al. Epigenetic associations of type 2 diabetes and BMI in an arab
population. Clinical epigenetics. v. 8. n. 1. 2016.

ALBERTS, B. Molecular biology of the cell. 2018.

AMBROS, V. The functions of animal microRNAs. Nature. v. 431. n. 7006. 2004. p. 350-
355.

BETZ, F. Managing science: methodology and organization of research – innovation,


technology, and knowledge management. Springer, 2011.

BORGES-OSÓRIO, M. R.; ROBINSON, W. M. Genética humana. 3. ed. Porto Alegre:


Artmed, 2013.

COSTA, E. de B. O.; PACHECO, C. Epigenética: regulação da expressão gênica em nível


transcricional e suas implicações. Semina: Ciências Biológicas e da Saúde. v. 34. n. 2.
2013. p. 125-136.
21/09/2023, 11:44 Conceitos iniciais da biologia molecular

HICKMAN, A. B.; DYDA, F. Mechanisms of DNA transposition. Mobile DNA III. 2015. p.
529-553.

JOAQUIM, L. M.; EL-HANI, C. N. A genética em transformação: crise e revisão do


conceito de gene. Scientiae studia. v. 8. n. 1. 2010. p. 93-128.

KELLERMANN, N. PF. Epigenetic transmission of holocaust trauma: can nightmares be


inherited. Israel journal of psychiatry and related sciences. v. 50. n. 1. 2013. p. 33-39.

LEHMAN, N. Cold-hearted RNA heats up life. Nature chemistry. v. 5. n. 12. 2013. p.


987-989.

LESLIE, F. M. Multigenerational epigenetic effects of nicotine on lung function. BMC


medicine. v. 11. n. 1. 2013. p. 1-4.

NELSON, D. L.; LEHNINGER, A. L.; COX, M. M. Lehninger principles of biochemistry.


Macmillan, 2008.

PARFREY, L. W.; LAHR, D. JG; KATZ, L. A. The dynamic nature of eukaryotic genomes.
Molecular biology and evolution. v. 25. n. 4. 2008. p. 787-794.

VÁZQUEZ-SALAZAR, A.; LAZCANO, A. Early life: embracing the RNA world. Current
biology. v. 28. n. 5. 2018. p. R220-R222.

WATSON, J. D.; CRICK, F. H. C. Molecular structure of nucleic acids: a structure for


deoxyribose nucleic acid. Nature. v. 171. n. 4356. 1953. p. 737-738.
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