cobas8 CMV
I
cobas * CMV
Utilizagao prevista
O cobas* CMV e um teste in vitro de amplificagao de acidos nudekos para a
qua „„,
^^*
« < .
00 «
* .
( CMV ) em plasma EDTA humano.
transplante de 6rgaos sohdos e em
O cobas* CMV destina -se a auxiliar no diagnostic e gestao de CM \ em pacientes
populates para availar a
pacientes de transplante de celulas estaminais hematopoieticas. O teste pode ser u
p0dem ser utilizadas
necessidade de iniciar um tratamento antiviral . Em pacientes que estao a reccbtr terap
medidas de ADN em serie para avaliar a resposta viral ao tratamento.
Os resultados do cobas* CMV devem ser interpretados no contexto de todas as conclusoes c
relevantes.
individuos com infegao latente poderao por vezes excretar o virus assintomaticamente pelos fluidos corporais ( per ex.,
urina, saliva ) e infectar terceiros. Individuos imuno-comprometidos, incluindo recem - nascidos,
recetores de transplantes
e pacientes com HIV correm um risco elevado de desenvolverem infegoes de CMV
primarias ou reativagoes de CM \ ’
,
Valida a reprodutibilidade da carga v ral de ADN do CMV
6 crucial para garantir a ' S " !T “ °
gestao de pacientes com doenga por CMV. As diretrizes consistencia de rc ul
altera oes nas medi oes de carga viral em serie devem ,
^ ^
atuais com base na precisao
ser no minimo, 3 vezes (0,5 log )
de testes PCR '• erem
8 que a:
* ^
biologicas importantes. Uma vez que a variabilidade e •.
ter de ser superiores a 5 vezes ( 0, 7 log10 ) quando
maior em concent
baixaslsd'u
rates igoes
A
Cob>iN ( MV /
Enquanto quo o limiteexato aindai tema de debate devido a variabilidadc do < vxsAio \w \ i\ <
critico « valido e tem side registado em estudos de historia natural que motlmm
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valcuvs de un R v • a ’
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tlevados estao relacionados com o aumento do risco de desenvolvimento iU doc ns as \ or C
desenvolvido com teste COBAS* AMPLICOR CMV MONITOR determinou um cuUdl paiapuvu
a < oi s - ;( )( ) ( ) c
Explica ao do teste
^
O teste cobas* CMV e um teste quantitative que e executado no cobas* 6800 System e no cobas* 8800 System. O cobas
CMV permite a dete ao e quantifica ao de ADN do CMV em plasma EDTA de pacientes intetados. A carga viral e
^ ^
quantificada em compara ao com um padrao de quantifica ao de ADN sem CMV ( DN A QS) , que c' introduzido em cada
^ ^
amostra durante o processamento de amostras. O DNA - QS funciona tambem para monitorizar toda a prepara ao de
^
amostras e o processo de amplifica ao por PCR. Adicionalmente, o teste utiliza tres controlos externos: um positivo de
^
titulo elevado, um positivo de titulo baixo e um controlo negativo.
Principios do procedimento
O cobas * CMV baseia - se na prepara ao de amostras totalmente automatica (extra ao e purifica<;ao dos dcidos nucleicos)
^ ^
seguida de amplifica ao e dete ao por PCR. Os cobas* 6800/ 8800 Systems sao constituidos pelo modulo de abastecimento
^ ^
de amostras, o modulo de transference, o modulo de processamento e o modulo analitico. A gestao automatica de dados e
executada pelo software cobas * 6800/ 8800, que atribui resultados a todos os testes. As diferentes possibilidades de
resultados sao alvo nao detetado, ADN do CMV detetado < LLoQ (limite inferior de quantifica ao), ADN do CMV
^
detetado > ULoQ (limite superior de quantifica ao) ou um valor no intervalo linear LLoQ < x < ULoQ. Os resultados
^
podem ser examinados diretamente no ecra do sistema ou impressos como um relatbrio.
O acido nucleico de amostras de pacientes moleculas lambda DNA -QS adicionadas sao extraidas em simultaneo. Em
resumo, os acidos nucleicos virais sao libertados ao adicionar proteinase e reagente de lise it amostra. Os acidos nucleicos
libertados ligam-se a superficie de silica das particulas de vidro magneticas adicionadas. As substancias nao ligadas e
impurezas, tais como proteinas desnaturadas, detritos celulares e potenciais inibidores da PCR, sao removidas com os
posteriores passos com reagente de lavagem e os acidos nucleicos purificados sao eluidos das particulas de vidro com
tampao de elui ao a alta temperatura.
^
07190620001- 01PT
Doc Rev. 1.0
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Reagentes e materia ls
eagentes e controlos do cobas^ CMV
d Tabda 4
rT.cf recofTKn<i3iio M Irbela
Todos os reagentes e controlos nao abertos deverr. ser a 7 cor;
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EUH2CE ore desencadear
Contem: Subti ® na 9014-01- T
r 'eerer aercca
Reagente Master Mix 2 Tampao de tncina. acetato re potass o. < 18% de su Udaooo re 5-
~
de CMV dfmetilo, g cere < 0 1% de ~ Aeer 23 EC A < 3 * 2% re
(CMV MMX -R2) dATP, dCTP, dGTP, dUTPs, < 3 01% de primers sense e ari-
senso do CMV pnmers < 3 3 ‘ % re r -ere sense e r:-
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oUgoneciedt do marcares ccr- ^ D'esrerre esoecrcas rc
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*
CMV e do padrao de quantjfica ao or GV < 0 31% er:i~~rc
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oligonucleotfajco, < 0,1% re poi -erase DO AC \ Z35D
-
< 0,10% de enz: 13 A^ pErase [ „~5c ~\ -z cos ese'
(de ongem microbiana^ < 0.1% de azra re srcc
07190620001- 01PT
Doc Rev 1.0
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Doc Rev
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* MV
^
de fuga , nao utilize esse material para testes.
, um produto quimico
po tencialme
' nte perigoso.
• O cobas omni Lysis Reagent contem tiocianato de guanidina COntacto, lave
Evite o contacto dos reagentes com a pele, os olhos ou com membranas mucosas
, m ^
imediatamente a zona afetada com agua abundante para evitar queimadur
as. azida sodica
cobas omni Specimen Diluen
MGP Reagent e o
• Os kits de teste cobas CMV o cobas
" , omni
^ C 2LSO de
1
contacto , lave imediatame nte a zona afetada com agua abundante para
.
destes reagentes, dilua com agua antes de passar com um pano para secar solu ao
, entre em contacto com ^
• Nao permita que cobas omni Lysis Reagent, que contem tiocianato de guanidina
toxico.
de hipoclorito de sodio ( lixivia ). Esta mistura pode produzir um gas altamente
e reagentes, de acordo com
• Elimine todos os materiais que tenham entrado em contacto com amostras
regulamenta oes nacionais, estaduais e locais.
^
Boas praticas de laboratorio
• Nao efetue pipetagem com a boca.
• Nao coma, nao beba nem fume nas areas de trabalho.
. Para
• Use luvas de laboratorio, bata de laboratorio e prote ao ocular quando manusear amostras e reagentes
^
evitar contamina ao, as luvas devem ser trocadas entre o manuseamento de amostras e o manuseame
nto de kits
^
cobas* CMV e reagentes cobas omni . Evite contaminar as luvas quando manusear amostras e controlos.
• Lave muito bem as maos depois de manusear amostras e reagentes do kit, e depois de retirar as luvas.
Limpe e desinfete cuidadosamente todas as superficies de trabalho do laboratorio com uma solu ao preparada de
• ^
fresco de hipoclorito de sodio a 0,5% em agua desionizada ou destilada ( diluir lixivia domestica a 1:10 ). Em
seguida , esfregue a superficie com um pano com etanol a 70 %.
• Se ocorrer um derrame no equipamento cobas 6800/8800, siga as instates do Manual do Operador dos cobasJ
®
07190620001 -01 PI
Doc Rev. 1.0
14
cob»*' CMV
Amostras
. . . molecuU HI '
—
dos de leste de diagnostic*
)
•
O sangue deve ser colhido em tubos de prepWO de P
.
Apos
^- o as amoslras
12 semanas a < 18 "C.
.
d plasm
.
pcdem * r
Sangue
total
O
co.
k
3
+*
CO
.
u
0)
Q
E
0)
Plasma
l 6
Dias
< - 18 Plasma congelado
( pode ser congelado/ descongelado ate 4 vezes)
0 Semanas 12
anticoagulante pode ser armazenado e/ ou transportado durante ate 36 horas entre 2 ° C e 25 °C antes da
preparagao do plasma mas, nesse caso, o plasma separado nao pode ser armazenado por mais tempo e
deve ser analisado diretamente.
0719062000 M)] PT
15
Doc Rev. 1.0
cobas " CMV
Resultados
de CM V das amostras c dos
8800 Systems determinam automaticamente a concentrate) de ADN
1Vs coba»* 6800 /
m ).
controlos. A conccntrato de ADN de CMV e indicada em Unidades Internacionais por mililitro Ul /
(
Alarmes de controlos
Tabela 9 Alarmes de controlos negativos e positivos
Se o batch for invalido, repita os testes de todo o batch, incluindo todas as amostras e controlos.
07190620001-01PT
Doc Rev. 1.0
cote*
a
cw
Resuftados Interpretapao
—
0 tftuto calculado esca abwo do ir in= i g
-- - -
nesuftadas some ’ 3V * par pr gap:
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”
Dr pjarnnnaiar f
— 3“ sac
’ r.
Reportar nesuftadDs cone C7 » oerraDr irnsnor = /riuc
. nr.J
Tftuto min. = 34.5 Ul/mt
o a ac tituc _ in.
mir . e infer or
0 tftuto catoutado essa denrr or mtenoto iresr D: ersac - saeserar ***
5
Titer
ou igual ao tftuto n3v
resuftados oomo ' [TftutaD De CVi
da srsaic.
0 tftuto cateulaoc esta acma do inc? s-cenx Dr p-aitrcsisc .^ LrCT
> Titer Max 3
Reportar resuftados cone ' CMl DTCSCBDC s-Orro = :t ic
*
‘
_
Tftuto max- = 1.0E+07 Ul ml
j - .
Um resultado de amostra "> Titer Max refcrc se is aaoostns poanw de CXTV
( ULoQ). Caso se prelend a um resuludo quantiutrvo. a ainosm orspnL ctmrz.
o teste deve ser repeudo. Multiplique o resuludo reponado pejo laior de dikacaa.
dibhir OT ptr
— -E0TA
» 0
^yye
Limita oes do procedimento
•
^ cobas
O * CMY foi avaliado apenas para utiiizacao em comnnacao con o cobas * <3fV Control Kit. o cobas
NHP Negative Control Kit, o cobas omni MGP Reagent, c cobas omni Evas Reagent, c cobas omni Specimen
Diluent e o cobas omni Wash Reagent para unlizack) nos cobas* 6$00 SS.'. Systems. >
07190620001 - 01 PT
Doc Rev. 1.0
18
cobaft " ( - MV
1 padi ao int
P*** APN de otomeiraJovirus humane para ensoios de tecmcas de amplificayao de audo nuckico
(
CMV . Foram testades pamus ^
.
da OMS jura HCMY) obtido a purtir de NIBSC era plasma EDTA humane negative para o
multiplas , dias .
de 01*0 mvets de concentntV'io e amda urn brance com ties letes de reagentes cobas CMV, corridas
*
operadores e equipamentos.
do c M \
^ radas do plasma EDTA sao exibidos na Tabeia l I , O estudo demonstra que o cobas CM \ detetou AON
r.urr.a concentracao de 23 UI ml ou superior com unia taxa de positividade de > 95%.
190620001-01 PT
z Rev. 1.0
19
I w1
°
resultados do estudo sao apresentados testado em 48 replicas em tres
+ / ml a
lotes de reagentcs de teste cobas* CM V
na Figura 3.
O cobas* CMV
demonstrou ser linear de 2.45E +01
Figura 3 Determinagao
do intervalo linear
Ul/ ml a I 34E+07 Ul/ml. .
em plasma EDTA
8
o
'S Observagoes
2 7 •• • No intervalo espedficado
c Reta de regressao
8
c 6 Limite superior de desvio i
l
o
(J Limite inferior de desvio
0)
O
co
5 I
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0 1 2 3 4 5 6 7
Trtulo de Log atribu /do [ 8
unidades de concentragao
]
07190620001-01PT
Doc Rev. 1.0
20
cohns * CMV
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taxa de
*s s, . ,
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*
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Xv <Vx 21
cobas * CMj
^
de detegSo
Tabela 13 VerificacSo do gendtipo do ADN do CMV do limite 51,75 Ul/ml
34,5 Ul / ml Taxa de
17,25 Ul / ml
Taxa de Numero positividade
Taxa de N .° de em %
N.° de Numero positividade de
N.° de Numero positividade em % replicas (95% 1C*)
replicas de em % replicas de
validas positivos
( 95% 1C*) 100,0
validas jositivos (95Q/0 1C*) validas ositivos 63
Gendti 63
63 63 100 ,0 Cl 00.0)
gB-2 63 61 96,8
(99, 6 %) noo. o) 100 , 0
53 63
63 100 ,0 (100.0)
flB - 3 63 57 90,5 63
(100 ,0)
(96, 40/o) 100 , 0
63 53
63 63 100, 0 (100,0)
gB - 4 63 55 87,3
(94, 40/Q) (100 ,0)
O intervalo linear do cobas* CMV foi verificado para todos os tres genotipos ( gB - 2, gB - 3 e gB - 4 ).
Verifica ao do limite de dete ao para amostras de CMV resistentes a farmacos ( resistentes a Ganciclovir,
^ ^
Valganciclovir, Cidofovir ou Foscarnet )
Verifica ao do intervalo linear para amostras de CMV resistentes a farmacos ( resistentes a Ganciclovir,
^
Valganciclovir, Cidofovir ou Foscarnet )
07190620001-01 PT
Doc Rev . 1.0
22
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M
cobas * CMV
O impacto da presen a de doen as autoimunes como lupus eritematoso sistemico (LES), artrite reumatoide ( AR) e
^ ^
anticorpos antinucleares tambem foi avaliado na presen a e ausencia de ADN do CMV. Alem disso, os farmacos listados
^
na Tabela 16 foram testados com o triplo da Cmax na presen a e ausencia de ADN de CMV.
^
Foi demonstrado que todas substancias potencialmente interferentes nao interferem com o desempenho do
teste
07190620001- 01PT
Doc Rev. 1.0
24
El
cobas* CMV
®
do CMV pelo cobas CMV
a quantificagao de ADN
Tabela 16 Farmacos testados relativamente a
potencial interference com
farmaco
Classe do farmaco Nome generico do
Sulfametoxazol
Cefotetano
Antimicrobiano Ticarcilina dissddica
Clavulanato de pot ssio
^ Trimetoprim
Fluconazol Vancomicina
Piperacilina
Tazobactam sddico
Cidofovir
Compostos para o tratamento do Ganciclovir
Foscamet
vfrus Herpes Valganciclovir
Prednisona
Azatioprina
Imunossupressores Sirolimus
Ciclosporina
Tacrolimus
Everolimus
Micofenolato de mofetil
Acido micofendlico
-
—
CMV
, AmpliPrep/COBAS TaqMan
Oesempenho comparado con o teste COBAS
vaHdas e a
^ *>
de Demi g.
realizada uma analise de regressao
de quantifica «;ao de ambos os testes. Foi
estao indicados na Figura 4.
Os resultados da regressao de Deming
ZD
*
071906200Q ] -0‘\ PT 25
Doc Rev. 1.0
cobas " CMV
Informagoes adicionais
Caracteristicas principals do teste
Plasma EDTA
Tipo de amostra
500 pL
Quantidade de amostra minima necessaria
350 pL
Volume de processamento de amostras
34,5 Ul /ml
—
Sensibilidade analitica
—
/ ml
34,5 Ul /ml a lE+07 Ul
Intervalo linear
-
100%
Especificidade
Genotipos detetados
Detetadas amostras do CMV resistentes a
farmacos
« »
” *T
Amostras do CMV resistentes
e Foscamet
.
a Ganc dc . •*- **«
D
21
0719062000 V£1PI
Doc Rev. 1-0
1 I
o
500pl: 20 cp /ml-l,0 E +07 cp /ml 500ul: 15 UI/ ml-l,0E +08 Ul/ ml 500ul: 10 UI / ml-l,0E+09 Ul / ml
ntervalo Linear
200pl: 50 cp 7 ml-l,0E +07 cp /ml 200ul: 40 UI/ ml-l,0E +08 Ul /ml 200ul: 25 UI / ml-l,0E+09 Ul/ ml
CMV
Tipo de amostra Plasma EDTA
34,5 Ul/ ml
Sensibilidade analitica