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Aminoácidos:

estrutura, função e propriedades


físico-químicas

Anderson Pinheiro
FundamentosBioquímica
químicos da Bioquímica
• A organização hierárquica das células;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas são as macromoléculas biológicas mais
abundantes;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas possuem tamanhos variados;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas são o produto final do metabolismo
informacional;

Transcrição

Tradução

Instrumentos moleculares
através dos quais a informação
genética é expressa!
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas apresentam diversas funções biológicas;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas apresentam diversas funções biológicas;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas apresentam diversas funções biológicas;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas apresentam diversas funções biológicas;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas apresentam diversas funções biológicas;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas apresentam diversas funções biológicas;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas apresentam diversas funções biológicas;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas apresentam diversas funções biológicas;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas apresentam diversas funções biológicas;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas apresentam diversas funções biológicas;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas apresentam diversas funções biológicas;
Bioquímica
Proteínas
• As proteínas apresentam diversas funções biológicas;
Proteínas

• As proteínas apresentam diversas funções biológicas;


Aminoácidos

• As proteínas são polímeros de aminoácidos;

• Os aminoácidos possuem um grupo carboxila e um grupo


amino ligados a um mesmo átomo de carbono (C);
grupo amino grupo carboxila
Aminoácidos

• Átomos da cadeia lateral nomeados a partir do C;


Aminoácidos
• As proteínas são constituídas por um grupo de 20 aas mais
comuns;
Aminoácidos
• As proteínas são constituídas por um grupo de 20 aas mais
comuns;
Aminoácidos

• Os aminoácidos diferem uns dos outros de acordo com o seu


grupamento R;
• Classificados de acordo com as propriedades do grupamento
R: polaridade;
Aminoácidos
• Classificados em 5 grupos: apolares alifáticos, aromáticos,
polares não-carregados, polares positivos e polares
negativos;
Apolares alifáticos
Aminoácidos
• Classificados em 5 grupos: apolares alifáticos, aromáticos,
polares não-carregados, polares positivos e polares
negativos;
Apolares alifáticos

- Hidrofóbicos
Aminoácidos
• Classificados em 5 grupos: apolares alifáticos, aromáticos,
polares não-carregados, polares positivos e polares
negativos;
Apolares alifáticos

- Menor aa

- Cadeia lateral H
Aminoácidos
• Classificados em 5 grupos: apolares alifáticos, aromáticos,
polares não-carregados, polares positivos e polares
negativos;
Apolares alifáticos

- Contém S

- Grupo tioéter
Aminoácidos
• Classificados em 5 grupos: apolares alifáticos, aromáticos,
polares não-carregados, polares positivos e polares
negativos;
Apolares alifáticos

- Cadeia lateral
cíclica

- Grupo imino
Aminoácidos

Aromáticos
Aminoácidos

Aromáticos

- Hidrofóbicos
Aminoácidos

Aromáticos

- Hidrofóbicos

- Phe mais hidrofóbica do


que Tyr e Trp

- Absorvem luz UV
Aminoácidos
• Lei de Lambert-Beer;

Espectrofotometria

𝑰𝟎
𝒍𝒐𝒈 𝑰 = cl
Aminoácidos

Polares não-carregados

• Contêm grupamentos funcionais que fazem ligações


hidrogênio com a água
Aminoácidos

Polares não-carregados

• Contêm grupamentos funcionais que fazem ligações


hidrogênio com a água

- Grupo hidroxila
Aminoácidos

Polares não-carregados

• Contêm grupamentos funcionais que fazem ligações


hidrogênio com a água
Dissulfeto - Grupo sulfidrila
Intermolecular

Dissulfeto
Intramolecular
Aminoácidos

Polares não-carregados

• Contêm grupamentos funcionais que fazem ligações


hidrogênio com a água

- Grupo amida
Aminoácidos

Polares positivos

• Grupamentos R carregados positivamente a pH 7,0;


Aminoácidos

Polares positivos

• Grupamentos R carregados positivamente a pH 7,0;

- Grupo amino
Aminoácidos

Polares positivos

• Grupamentos R carregados positivamente a pH 7,0;

- Grupo guanidino
Aminoácidos

Polares positivos

• Grupamentos R carregados positivamente a pH 7,0;

- Grupo imidazol
Aminoácidos

Polares negativos

• Grupamentos R carregados negativamente a pH 7,0;

• Grupos carboxílicos;
Aminoácidos

• Em todos os aminoácidos comuns, com exceção da Gly, o C


está ligado a 4 substituintes diferentes;
• O C constitui um centro quiral;
• Os aminoácidos possuem 2 estereoisômeros;
Aminoácidos

• Em todos os aminoácidos comuns, com exceção da Gly, o C


está ligado a 4 substituintes diferentes;
• O C constitui um centro quiral;
• Os aminoácidos possuem 2 estereoisômeros;

• Atividade ótica;
Aminoácidos

• Nomenclatura baseada na configuração absoluta do centro


quiral;
• Isômeros D e L baseados na configuração do gliceraldeído;

• ATENÇÃO:

Nem todos os
L-aas possuem
atividade
levógena!
Aminoácidos

• As proteínas são formadas exclusivamente por L-aas;

• D-aas são extremamente raros em proteínas!


Aminoácidos

• As proteínas apresentam outros aas além dos 20 mais


comuns;
• Aas formados a partir da modificação de resíduos já
incorporados na cadeia polipeptídica

Colágeno

Miosina

Pró-trombina
Aminoácidos

• As proteínas apresentam outros aas além dos 20 mais


comuns;
• Aas formados a partir da modificação de resíduos já
incorporados na cadeia polipeptídica;

Elastina
Aminoácidos

• As proteínas apresentam outros aas além dos 20 mais


comuns;
• Aas introduzidos durante a síntese protéica;

Glutationa Redutase
Aminoácidos

• Outros aas são encontrados nas céls porém não fazem parte
de proteínas;

Intermediários da
biossíntese de Arg e
do ciclo da uréia

Neurotransmissor

Taurina
Aminoácidos

• Derivados de aas com atividade biológica;

Neurotransmissor
Aminoácidos

• Derivados de aas com atividade biológica;

Neurotransmissor
Aminoácidos– características estruturais
Apolares alifáticos Aromáticos

Polares não-carregados Positivos Negativos


Aminoácidos– propriedades ácido-base

• Os aas existem em solução como um íon dipolar ou


zwitterion;
Aminoácidos– propriedades ácido-base

• Os aas podem agir como um ácido (doador de H+s) ou base


(aceptor de H+s);

ÁCIDO – DOA H+s PARA O MEIO

BASE– CAPTA H+s DO MEIO

• Substâncias anfóteras;
Aminoácidos– propriedades ácido-base

• -aas simples funcionam como ácidos dipróticos quando


completamente protonados;

Gly
Aminoácidos– curvas de titulação
Aminoácidos– curvas de titulação

• Gráfico com 2 estágios


referentes à desprotonação
de 2 grupos diferentes;

Ác. acético
Aminoácidos– curvas de titulação

• Gráfico com 2 estágios


referentes à desprotonação
de 2 grupos diferentes;

• pHs muito baixos:


Aminoácidos– curvas de titulação

• Gráfico com 2 estágios


referentes à desprotonação
de 2 grupos diferentes;

• pHs muito baixos;


• Ponto de inflexão do primeiro
estágio:

doadora aceptora
Aminoácidos– curvas de titulação

• Gráfico com 2 estágios


referentes à desprotonação
de 2 grupos diferentes;

• pHs muito baixos;


• Ponto de inflexão do primeiro
estágio;
• Ponto de inflexão: pH = pKa

Henderson-Hasselbach

pH = pKa + log [A-]/[HA]


Aminoácidos– curvas de titulação

• Gráfico com 2 estágios


referentes à desprotonação
de 2 grupos diferentes;

• pHs muito baixos;


• Ponto de inflexão do primeiro
estágio;
• Ponto de inflexão: pH = pKa
• Ponto médio (pH = 5,97):
Aminoácidos– curvas de titulação

• Gráfico com 2 estágios


referentes à desprotonação
de 2 grupos diferentes;

• pHs muito baixos;


• Ponto de inflexão do primeiro
estágio;
• Ponto de inflexão: pH = pKa
• Ponto médio (pH = 5,97):
• Segundo estágio: remoção
do H+ do grupo amino;
Aminoácidos– curvas de titulação

• Gráfico com 2 estágios


referentes à desprotonação
de 2 grupos diferentes;

• pHs muito baixos;


• Ponto de inflexão do primeiro
estágio;
• Ponto de inflexão: pH = pKa
• Ponto médio (pH = 5,97):
• Ponto de inflexão do
segundo estágio:
Aminoácidos– curvas de titulação

• Gráfico com 2 estágios


referentes à desprotonação
de 2 grupos diferentes;

• pHs muito baixos;


• Ponto de inflexão do primeiro
estágio;
• Ponto de inflexão: pH = pKa
• Ponto médio (pH = 5,97):
• Ponto de inflexão do
segundo estágio:
• Ponto de inflexão: pH = pKa
Aminoácidos– curvas de titulação

• Gráfico com 2 estágios


referentes à desprotonação
de 2 grupos diferentes;

• pHs muito baixos;


• Ponto de inflexão do primeiro
estágio;
• Ponto de inflexão: pH = pKa
• Ponto médio (pH = 5,97):
• Ponto de inflexão do
segundo estágio:
• Ponto de inflexão: pH = pKa
• pHs muito altos:
Aminoácidos– curvas de titulação

• Medida quantitativa do pKa


de cada grupo ionizante
Aminoácidos– curvas de titulação

• Medida quantitativa do pKa


de cada grupo ionizante

• Grupo carboxila da Gly é


100x mais ácido que do HAc
Aminoácidos– curvas de titulação
• Grupo carboxila da Gly é 100x mais ácido que do HAc;
• Repulsão eletrostática do H+ liberado pelo grupo amino;
Aminoácidos– curvas de titulação

• Medida quantitativa do pKa


de cada grupo ionizante

• Grupo carboxila da Gly é


100x mais ácido que do HAc

• Gly possui duas regiões


tamponantes
Aminoácidos– curvas de titulação

• Medida quantitativa do pKa


de cada grupo ionizante

• Grupo carboxila da Gly é


100x mais ácido que do HAc

• Gly possui duas regiões


tamponantes
• Relação entre pH e carga
elétrica;
• Ponto isoelétrico (pI): pH no
qual a carga elétrica do aa é
zero!
Aminoácidos– curvas de titulação

• Medida quantitativa do pKa


de cada grupo ionizante

• Grupo carboxila da Gly é


100x mais ácido que do HAc

• Gly possui duas regiões


tamponantes
• Relação entre pH e carga
elétrica;
• Ponto isoelétrico (pI): pH no
qual a carga elétrica líquida
do aa é zero!

• pI = ½ (pK1 + pK2)
Aminoácidos– curvas de titulação

• pI = ½ (pK1 + pK2)

• pH > pI → Gly negativa

pH < pI → Gly positiva


Aminoácidos– curvas de titulação

• pI = ½ (pK1 + pK2)

• pH > pI → Gly negativa

pH < pI → Gly positiva

• Todos os aas com 1 grupo


-amino, -carboxila, R não-
inonizável;
Aminoácidos– curvas de titulação

• pI = ½ (pK1 + pK2)

• pH > pI → Gly negativa

pH < pI → Gly positiva

• Todos os aas com 1 grupo


-amino, -carboxila, R não-
inonizável;
• Aas que possuem R
ionizável? → curva de
titulação com 3 estágios;
Aminoácidos ácidos

Polares negativos

• Grupamentos R carregados negativamente a pH 7,0;

• Grupos carboxílicos;
Aminoácidos básicos

Polares positivos

• Grupamentos R carregados positivamente a pH 7,0;


Aminoácidos básicos

Polares positivos

Amina 1a Guanidino Imidazol


Aas ácidos– curvas de titulação

• pI reflete a natureza
química do grupo R;
Aas ácidos– curvas de titulação

• pI reflete a natureza
química do grupo R;

• Glu pI = 3,22;

• Glu pI < Gly pI → dois


grupos carboxílicos

ponto isoelétrico
Aas ácidos– curvas de titulação

• pI reflete a natureza
química do grupo R;

• Glu pI = 3,22;

• Glu pI < Gly pI → dois


grupos caroxílicos

• pI = ½ (pK1 + pKR);

ponto isoelétrico
Aas básicos– curvas de titulação

• His pI = 7,59;

• pI = ½ (pKR + pK2);

ponto isoelétrico
Aas básicos– curvas de titulação

• His pI = 7,59;

• pI = ½ (pKR + pK2);

• Cálculo do pI →
média dos pKs
anterior e posterior
à forma isoelétrica
do aa;
Aas básicos– curvas de titulação

• His pI = 7,59;

• pI = ½ (pKR + pK2);

• Cálculo do pI →
média dos pKs
anterior e posterior
à forma isoelétrica
do aa;
• Único aa com pKa
próximo a 7,0;
Aas básicos– curvas de titulação

• His pI = 7,59;

• pI = ½ (pKR + pK2);

• Cálculo do pI →
média dos pKs
anterior e posterior
à forma isoelétrica
do aa;
• Único aa com pKa
próximo a 7,0;

• Tamponamento na
região de pH
fisiológico;
Proteínas– curvas de titulação

RNAseA

• Diversos grupamentos
ionizáveis;
• Estrutura 3D da
proteína;
• Função da
concentração de sal no
meio;
Proteínas– curvas de titulação
• Ponto isoelétrico é o pH no qual a carga elétrica líquida da
proteína é igual a zero!

• No pI, a proteína se torna insolúvel e sofre precipitação;

pH < pI pH = pI pH > pI

+ + +
+ + −
+ − −
+ + + −

− + +
− −
+ − + − + −
− −

Precipitação
isoelétrica
Proteínas– curvas de titulação

• Medida teórica do ponto isoelétrico


maqlgavvav assffcaslf savhkieegh igvyyrggal ltstsgpgfh lmlpfitsyk 61
svqttlqtde vknvpcgtsg gvmiyfdrie vvnflvpnav ydivknytad ydkalifnki 121
hhelnqfcsv htlqevyiel fdqidenlkl alqqdltsma pglviqavrv tkpnipeair 181
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kiseiedaaf larekakada ecytamkiae anklkltpey lqlmkykaia snskiyfgkd 301
ipnmfmdsag svskqfegla dklsfglede pletatken

• Medida experimental do pI: focalização isoelétrica;

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