Aminoácidos, Peptídeos e

Proteínas
Tiago Veltri
Aminoácidos e Proteínas
-Subunidades monoméricas que se unem para a formação de proteínas

-Todas as proteínas são sintetizadas a partir de apenas 20 aminoácidos

diferentes

-Os aminoácidos também servem como precursores de biomoléculas

importantes, como histamina, catecolaminas, glutationa, serotonina, etc. ou
podem funcionar como neurotransmissor, como o glutamato.
 Estrutura dos aminoácidos
Todos os aminoácidos, com exceção da glicina, possuem um Carbono
assimétrico que se liga a um grupo amina (-NH2), uma carboxila (-COOH),
um átomo de Hidrogênio (-H) e uma cadeia lateral ou Radical (R). A cadeia
lateral diferencia os aminoácidos.

Forma ionizada em pH fisiológico

Os aminoácidos presentes em proteínas são L-aminoácidos
Os aminoácidos são classificados em cinco classes principais baseados nas
propriedades de suas cadeias laterais (R), principalmente a polaridade

1- Aminoácidos com cadeias laterais não-polares (hidrofóbicas)

2- Aminoácidos com cadeias laterais aromáticas

3- Aminoácidos com cadeias laterais polares não carregadas (mais hidrofílicas)

4- Aminoácidos com cadeias laterais carregadas positivamente (hidrofílicas)

5- Aminoácidos com cadeias laterais carregadas negativamente (hidrofílicas)

Aminoácidos com cadeias laterais não-polares (hidrofóbicas)

* * *

* Aminoácidos essenciais
Aminoácidos com cadeias laterais aromáticas

* *

* Aminoácidos essenciais
Aminoácidos com cadeias laterais polares não carregadas (mais hidrofílicas)

* Aminoácidos essenciais
Aminoácidos com cadeias laterais carregadas positivamente (hidrofílicas)

* * *

* Aminoácidos essenciais
Aminoácidos com cadeias laterais carregadas negativamente (hidrofílicas)
Os aminoácidos são unidos por ligações peptídicas
Pentapeptídeo Ser–Gly–Tyr–Ala–Leu: 5 aminoácidos, 4 ligações peptídicas
Oxitocina- 9 resíduos de aas
Bradicinina- 9 resíduos de aas
Insulina – 2 cadeias (30 e 21aas)
Glucagon – 29 resíduos de aas
 ATIVIDADE EM SALA

1- Os peptídeos Lys-Asp-Glu (peptídeo 1) e Leu-Ala-Phe

(peptídeo 2) foram adicionados a uma mistura de água e
óleo com posterior agitação. Os peptídeos 1 e 2 ficarão
distribuídos em duas fases, uma hidrofílica outra
hidrofóbica. Qual das fases ficará cada um deles?
Justifique a resposta.
2- Oxitocina e Vasopressina, são peptídeos com função
hormonal e estão representados a seguir:

S S

Oxitocina H3N+-Cys-Tyr-Ile-Gln-Asn-Cys –Pro-Leu-Gly-COO-

S S

Vasopressina H3N+-Cys-Tyr-Phe-Gln-Asn-Cys –Pro-Arg-Gly-COO-

A tabela a seguir mostra a atividade dos dois peptídeos quanto
á lactação e à antidiurese. Mostra também a atividade (relativa
às atividade de oxitocina e vasopressina) de peptídeos
sintéticos, que diferem da oxitocina por substituição da leucina
por outros aminoácidos.
Atividade de lactação e antidiurese (em porcentagem)

Oxitocina Vasopressin “Oxitocina” com troca de Leu por:

a
Ile Val Arg Lys

Lactação 100 - 80 70 46 40

Antidiurese - 100 - - 56 6

A partir das consequências das substituições de aminoácidos e

sabendo que o tratamento de oxitocina e vasopressina com
agentes redutores acarreta a sua inativação, discutir de que
depende a atividade biológica dos peptídeos.
Dados moleculares de algumas proteínas
 Proteínas
Biomoléculas mais abundante nos sistemas biológicos, desempenham as mais
diversas funções, como:

-Catálise enzimática

-Transporte (Hemoglobina, transferrina, lipoproteínas, transportadores de

membrana, etc.)

-Nutrição e estocagem (sementes, ferritina)

-Contração ou proteína motora (contração muscular, tubulina, dineína)

-Estrutural (colágeno, queratina)

-Defesa (anticorpos, fibrinogênio, trombina)

-Regulatória (hormônios, proteína G)

 Introdução a Estrutura de Proteínas

Níveis organizacionais
• Estrutura primaria
- sequência de aminoácidos
- ligação peptídica
• Estrutura Secundária
- alfa hélice, folhas beta e voltas
- supraestruturas secundárias
• Estrutura Terciária
- domínios protéicos
• Estrutura Quaternária
- oligômeros
• Enovelamento Protéico
*
Proteínas são polímeros lineares formados
por unidades chamadas de aminoácidos

Níveis Hierárquicos de Organização

Kai LinderstrØm-Lang cunhou os termos:
estrutura primária, secundária, terciária e
quaternária
Vídeo
 Estrutura Primária

• 1953 Frederick Sanger determinou a estrutura primária

da insulina. Esse estudo mostrou que as proteínas tem
uma sequência de aminoácidos definida.
• Estudos mostraram que a sequência de aa de uma
proteína é geneticamente determinada.

Por que conhecer a seqüência primária de uma proteína?

• Para elucidar seu mecanismo de ação, se for um enzima
• Para se conhecer a estrutura tridimensional
• Para se entender determinadas patologias, p.e., anemia falciforme,
fibrose cística, etc.
• Para se compreender a evolução das espécies em nosso planeta
Tipos de ligações presentes na estrutura de um Proteína
➢ As pontes de hidrogênio são forças extremamente
fracas, da ordem de 5 kcal · mol–1; em comparação, a
ligação iônica exibe energias da ordem de 100 kcal · mol–1
e a ligação covalente (a verdadeira ligação molecular)
apresenta 120 kcal · mol–1.

➢ Todavia, ainda que as pontes de hidrogênio isoladamente

sejam fracas, a grande quantidade dessas ligações em
proteínas colabora para a manutenção de sua estrutura
espacial.

➢ De fato, a ruptura das pontes de hidrogênio em uma

molécula proteica implica a desnaturação desta.
 Estrutura Secundária

• A a hélice foi prevista em 1951 por Linus Pauling e Corey . A

primeira hélice só foi vista 6 anos mais tarde quando se
determinou a estrutura da mioglobina.
• A a-hélice possui 3.6 resíduos por passo
• A hélice se monta graças a existência de pontes de H entre o C
= O do resíduo n e o NH do resíduo n + 4
• Hélices onde as pontes de H se estabelecem entre os resíduos n
e n + 5 são ditas hélices p. São fracamente empacotadas.
• hélices onde as pontes de H se estabelecem entre os resíduos n
e n + 3 são ditas hélices 310.São fortemente empacotadas.
Estrutura secundária - É dada pelo arranjo espacial de aminoácidos próximos entre si na
seqüência primária da proteína, estabilizada por pontes de hidrogênio.

a- Hélice - É a forma mais comum de estrutura secundária regular. Caracteriza-se por uma
hélice em espiral formada por 3,6 resíduos de aminoácidos por volta. As cadeias laterais dos
aminoácidos se distribuem para fora da hélice, evitando assim o impedimento estérico.
 C=O do A.a. n

N -H do A.a. n+ 4
*
* As folhas b:

• as folhas b combinam regiões distantes da proteína

• possuem, em geral, de 5 a 10 resíduos
• as pontes de H se formam entre os CO de uma
cadeia e o NH de outra
• podem ser paralelas ou antiparalelas

Bom formadores de fita b: valina, isoleucina, fenilalanina, tirosina,

triptofano, treonina
Maus formadores de fita b: prolina, ácido glutâmico, ácido
aspártico, cisteína, glutamina, lisina, etc
Folhas beta
*
Folhas beta paralelas e antiparalelas

PARALELA ANTIPARALELA
*
Loops ou Voltas

• conectam as a- hélices e as fitas b

• em geral, estão na superfícies das proteínas
• loops que conectam fitas b adjacentes são
ditos hairpin loops
• em geral, são flexíveis
• sítios de clivagem para proteases

Bom formadores de voltas: glicina, serina, aspártico,

prolina, asparagina
 Motifs ou motivos: Estrutura Suprasecundária
Existem certas combinações de elementos de estrutura
secundária que se repetem com grande freqüência nas proteínas.
Essas combinações são ditas de motivos estruturais ou
estruturas suprasecundárias.

Exemplos
• hélice-volta-hélice e a ligação de cálcio, Kretsinger, 1973, parvalbumina;
Herzberg and James, 1985, troponina C

• unidade b-b, sem função associada, inibidor de tripsina bovina, Robert

Huber; erabutoxina (veneno de cobra), Barbara Low

• chave grega: 4 fitas b antiparaelas; sem função associada, nuclease

• b-a-b: está presente em quase todas as proteínas que possuem folhas b
paralelas, como por exemplo, triose fosfato isomerase
EF
hand

Greek key
Nuclease de
estafilococus
*
Estrutura Terciária
Domínios: unidades da proteína que podem se enovelar
independentemente formando uma estrutura estável
A estrutura terciária das proteínas é mantida por interações fracas
do tipo pontes de H; interações iônicas e interação de van der
Waals
Essas interações são muito fracas! Como, então, as proteínas se
mantem na conformação nativa????
a- domain; b-domains and a - b domains - Chotia and Levitt.
*
Estrutura Quaternária

• Alguma proteínas possuem mais de uma subunidade. Neste caso,

são chamadas de oligômeros. Ex: hemoglobina, alcool
desidrogenase, lactato desidrogenase, etc, etc, etc.
• Os virus também são formados pela conjunto de diversas
proteínas
Vídeo
*

“A sequência primária de uma proteína determina

sua estrutura tridimensional”
 Experimento de Christhian Anfinsen
* década de 50
Ribonuclease: 124 aa com 4 pontes de S
*
“As proteínas são marginalmente estáveis” (10-20 kcal/mol)
Isso é importante pois garante turnover das proteínas e flexibilidade
Interações que mantém a estrutura nativa
• pontes de hidrogênio
• interações iônicas - entre resíduos carregados
• interações hidrofóbicas - entre resíduos apolares
• interações de van der Waals - entre átomos que se aproximam
• pontes de enxofre - entre cisteínas

Agentes desnaturantes:
• caótropos : uréia, cloreto de guanidina , perclorato de sódio, etc
• solventes
•pH
• altas e baixas temperaturas
• pressão hidrostática
*
*

O processo não é randômico...(Ainda bem!)

*
Classificação quanto à forma (Fibrosas e Globulares)

Proteínas fibrosas – O colágeno, a elastina e a queratina são exemplos de

proteínas fibrosas. Elas têm função estrutural. As proteínas fibrosas têm
estrutura relativamente simples, obtida da repetição de aas específicos,
formando estruturas secundárias regulares.
Proteínas globulares – Apresentam cadeia polipeptídica fortemente enrolada em
uma forma globular ou esférica. Sua forma resulta de uma interação complexa
de elementos estruturais secundários, terciários e algumas vezes quaternários.
 Estrutura e Função

Perda da estrutura tridimensional e da função por desnaturação

Exemplos de agentes desnaturantes; calor, pHs extremos, uréia,

detergentes, etc.

“A conformação da proteína, ou seja, o arranjo

tridimensional dos átomos na estrutura é o fator
determinante na função”
Doenças genéticas ( alteração no gene, mutações, etc.) X Doenças conformacionais

Proteína com
estrutura
nativa
(funcional)

Renaturação com o auxílio

de chaperones
Proteína
parcialmente
desnaturada
Proteína
proteolíticamente
degradada

•Amiloidose visceral familiar (lisozima)

•Polineuropatia amilóide familiar (transtirretina)
•Amiloidose renal hereditária (fibrinogênio)
•Doença de Alzheimer (peptídeo b-amilóide da APP)
•Doenças do prion – Scrapie (ovelhas e cabras), Encefalopatia espongiforme bovina
(gado), Kuru (tribo canibal de Nova guiné), Doença de Creutzfeldt-Jakob (doença rara
em humanos).
Estudo dirigido

1- Descreva a estrutura geral dos aminoácidos.

2- Qual o aminoácido que não apresenta Carbono assimétrico?
3- Classifique os aminoácidos de acordo com as cadeias laterais.
4-Conceitue aminoácidos essenciais e não-essenciais. Dê exemplos.
5-Como se formam as ligações peptídicas?
6- O que você entende por extremidade N-terminal e C-terminal?
7- Quais as funções das proteínas?
8- O que são proteínas conjugadas?
9-Explique os níveis de organização das proteínas.
10- O que é desnaturação e o que isso significa para função das proteínas?
11- Classifique as proteínas quanto à forma.