Química Medicinal Avançada

DOCKING MOLECULAR

Prof. Cristiane Lima

DOCKING MOLECULAR

• O docking molecular consiste em prever a melhor posição e orientação de um ligante

em comparação a outra molécula, formando um complexo estável.
 DOCKING MOLECULAR

• Geralmente é empregado para proteínas como receptores e enzimas, mas pode ser
utilizado para complexos com ácidos nucléicos ou carboidratos, por exemplo.
DOCKING MOLECULAR

• Ao conhecer a orientação
preferida pode se prever a
força da associação ou
afinidade de ligação entre
duas moléculas usando
funções de pontuação.
DOCKING MOLECULAR

• As abordagens atualmente permitem

a triagem virtual (ou virtual
screening) de milhões de compostos
em um tempo acessível, reduzindo
custos iniciais da identificação
de hits e aumentando as chances de
encontrar moléculas candidatas ao
uso terapêutico.
DOCKING MOLECULAR

• As metodologias computacionais de Docking proteína-ligante estão baseadas no modelo

chave-fechadura, proposto por Emil Fischer em 1894.

Ligante e proteína flexíveis,

podendo modificar a sua
conformação durante o processo de
formação do complexo receptor-
ligante.
 DOCKING MOLECULAR
 O reconhecimento molecular proteína-ligante está baseado na complementaridade de
características físico-químicas e estruturais das moléculas interagentes.

 As características físico-químicas definem o grau de afinidade e de especificidade do ligante pela

proteína, e estão relacionadas com as interações intermoleculares existentes no complexo.

Os principais tipos de interações intermoleculares envolvidas no

reconhecimento molecular proteína-ligante incluem:

1) ligações de hidrogênio;
2) interações de van der Waals;
3) interações iônicas;
4) interações hidrofóbicas;
5) interações envolvendo anéis aromáticos;
6) coordenação com íons metálicos.
DOCKING APLICAÇÕES – PLANEJAMENTO DE FÁRMACOS
DOCKING MOLECULAR
 DOCKING MOLECULAR

PROTEÍNA G
LORATADINA
 DOCKING MOLECULAR

ACESSAR: http://zinc.docking.org/
DOCKING MOLECULAR

LORATADINA
DOCKING MOLECULAR
DOCKING MOLECULAR

COPIAR!
 DOCKING MOLECULAR
ACESSAR: http://www.swissdock.ch/
DOCKING MOLECULAR
Ou então 537931
DOCKING MOLECULAR
 DOCKING MOLECULAR

ACESSAR: https://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/index.html
COPIAR! DOCKING MOLECULAR
DOCKING MOLECULAR
DOCKING MOLECULAR
DOCKING MOLECULAR
DOCKING MOLECULAR
DOCKING MOLECULAR
DOCKING MOLECULAR
DOCKING MOLECULAR
Realizar o procedimento com a molécula do Diclofenaco
e COX-1 para observar o docking
 DOCKING MOLECULAR

ACESSAR: http://zinc.docking.org/
DOCKING MOLECULAR
DOCKING MOLECULAR
 COPIAR!

OBRIGADA!
 DOCKING MOLECULAR
ACESSAR: http://www.swissdock.ch/
OBRIGADA!
OBRIGADA!
OBRIGADA!
OBRIGADA!
OBRIGADA!
OBRIGADA!
DOCKING MOLECULAR
DOCKING MOLECULAR