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UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ

CAMPUS UNIVERSITÁRIO PROFESSORA CINOBELINA ELVAS – CPCE


Química Orgânica para Engenharia Agronômica | Medicina Veterinária | Zootecnia

Peptídeos e proteínas
Prof. Dr. Gustavo R Sousa Jr grsousajunior@ufpi.edu.br
https://grsousajunior.github.io
http://lattes.cnpq.br/7676488032110533
https://orcid.org/0000-0002-9070-3775

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Estrutura das proteínas
• As proteínas são tão grandes que a palavra estrutura adquire vários significados

• Existem quatro níveis de estrutura: primária, secundária, terciária e quaternária

• A estrutura primária é simplesmente a sequência de aminoácidos que formam a cadeia

• A estrutura secundária descreve como os segmentos da espinha dorsal do peptídeo se


orientam em um padrão regular

• A estrutura terciária descreve como a molécula inteira se enrola em uma forma tridimensional

• A estrutura quaternária descreve como diferentes proteínas se juntam para produzir


agregados proteicos
Estrutura primária das proteínas
• A estrutura primária é simplesmente a ordem ou sequência de aminoácidos que formam a
cadeia da proteína

• Por exemplo:
➢ Na análise de uma peptídeo, observou-se que ele continha os seguintes resíduos:
alanina (Ala, A), cisteína (Cys, C), isoleucina (×2; Ile, I), metionina (Met, M), glutamina (Glu, Q) e
selenocisteína (Sec, U).

➢ Após a análise de sequenciamento, o resultado encontrado para a estrutura primária da foi:

Glu–Sec–Ile–Met–Ile–Cys–Ala ou Q–U–I–M–I–C–A
Estrutura secundária das proteínas
• A estrutura secundária descreve como os segmentos da espinha dorsal do peptídeo se
orientam em um padrão estruturais recorrentes

• As estruturas secundárias mais comuns são a hélice-α e a folha-β pregueada

Representação da estrutura da
concanavalina A (PDB: 3CNA),
uma proteína com várias folhas
β-pregueadas, mostradas como
setas nessa representação.
Representação da estrutura da
mioglobina (PDB: 3RGK), uma proteína
com várias hélices-α, mostradas como
fitas enroladas nessa representação.
Estrutura secundária das proteínas: hélice-α
• A estrutura da hélice-α assume uma forma enrolada e é estabilizada por ligações de
hidrogênio entre os N–H de um grupo amida e C=O de outro grupo amida a quatro resíduos de
distância

Um segmento de proteína (PDB: 1TRZ) em um padrão helicoidal Um segmento de proteína (PDB: 1TRZ) mostrando somente a
(espiral) estabilizado por ligações de hidrogênio entre o grupo espinha dorsal em um padrão helicoidal (espiral) estabilizado
N–H de um resíduo e o grupo C=O afastado quatro resíduos. por ligações de hidrogênio.
Estrutura secundária das proteínas: hélice-α
• A estrutura da hélice-α assume uma forma enrolada e é estabilizada por ligações de
hidrogênio entre os N–H de um grupo amida e C=O de outro grupo amida a quatro resíduos de
distância

Um segmento de proteína (PDB: 1TRZ) mostrando a hélice-α, Detalhe do segmento de proteína (PDB: 1TRZ) mostrando
estabilizada por ligações de hidrogênio, e as cadeia laterais uma hélice-α voltada à direita.
dos aminoácidos.
Estrutura secundária das proteínas: folha-β pregueada
• A estrutura da folha-β pregueada assume um formato estendido e é estabilizada por ligações
de hidrogênio que ocorrem entre resíduos de cadeias adjacentes

Um segmento de proteína em um padrão de fitas (folhas) Um segmento de proteína mostrando somente a espinha dorsal
mostrando a folha-β pregueada estabilizada por ligações de em um padrão de fitas (folhas) estabilizado por ligações de
hidrogênio entre cadeia adjacentes (PDB: 3CNA). hidrogênios entre cadeia adjacentes (PDB: 3CNA).
Estrutura secundária das proteínas: folha-β pregueada
• A estrutura da folha-β pregueada assume um formato estendido e é estabilizada por ligações
de hidrogênio que ocorrem entre resíduos de cadeias adjacentes

Um segmento de proteína mostrando as cadeias laterais Uma folha-β pregueada de seis fitas (PDB: 3CNA)
dos aminoácidos e uma folha-β pregueada estabilizada por
ligações de hidrogênio entre cadeia adjacentes (PDB: 3CNA).
Estrutura secundária das proteínas: folha-β pregueada
• Na folha-β pregueada as cadeias adjacentes podem ser dispostas na mesma direção (paralela)
ou em direções opostas (antiparalela), mais comum e mais estável

Detalhe mostrando uma folha-β pregueada antiparalela Detalhe mostrando uma folha-β pregueada paralela de 8
de 7 fitas. O sentido N-terminal → C-terminal das cadeias, fitas. O sentido N-terminal → C-terminal das cadeias,
indicado pelas setas (PDB: 3CNA). indicado pelas setas (PDB 1QRE).
Estrutura terciária das proteínas
• A estrutura terciária descreve como a molécula inteira se enrola em uma forma tridimensional,
sendo uma união de estruturas secundárias

Representação da estrutura da concanavalina A (PDB: 3CBA) Representação da estrutura da anidrase carbônica (PDB: 1QRE)
mostrando as fitas antiparalelas das folhas-β pregueadas. mostrando as fitas paralelas das folhas-β pregueadas.
Estrutura terciária das proteínas
• Algumas proteínas contêm duas ou mais cadeias distintas, ou subunidades, que podem ser
idênticas ou não
Uma ligação dissulfeto
unindo duas partes da
mesma cadeia
• As ligações dissulfeto são importantes
componentes das estruturas secundária e
terciária das proteínas Uma ligação
dissulfeto unindo
duas cadeias

• Uma ligação dissulfeto entre resíduos de


cisteína na mesma cadeia peptídica liga
duas partes da cadeia, criando laços (loops)
Uma ligação
dissulfeto ligando
• Uma ligação dissulfeto entre resíduos de duas cadeias
cisteína em diferentes cadeias peptídicas
liga duas cadeias que estariam separadas Representação da estrutura da insulina humana (PDB: 1A7F)
mostrando os resíduos de cisteína unindo cadeia da proteína
através de ligações dissulfeto intra e intercadeias.
Estrutura quaternária das proteínas
• A estrutura quaternária descreve como diferentes proteínas se juntam para produzir
agregados proteicos, sendo uma união de estruturas terciárias

Representações da estrutura do monômero (esquerda), da estrutura trimérica da PCNA humana (PDB: 1AXC), colorizada para mostrar
a extremidade N-terminal (azul) e C-terminal (vermelho) (centro) e para mostrar os monômeros na estrutura quaternária da proteína
(à direita).
Estrutura quaternária das proteínas

Representação da estrutura da estrutura chaperonina (PDB: 1AON), uma proteína complexa gigante. A representação foi colorizada
para mostrar as subunidades da estrutura quaternária.

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