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Peptídeos e proteínas
Prof. Dr. Gustavo R Sousa Jr grsousajunior@ufpi.edu.br
https://grsousajunior.github.io
http://lattes.cnpq.br/7676488032110533
https://orcid.org/0000-0002-9070-3775
Esta obra está sob uma licença Creative Commons Atribuição-NãoComercial-CompartilhaIgual 4.0 Internacional.
Estrutura das proteínas
• As proteínas são tão grandes que a palavra estrutura adquire vários significados
• A estrutura terciária descreve como a molécula inteira se enrola em uma forma tridimensional
• Por exemplo:
➢ Na análise de uma peptídeo, observou-se que ele continha os seguintes resíduos:
alanina (Ala, A), cisteína (Cys, C), isoleucina (×2; Ile, I), metionina (Met, M), glutamina (Glu, Q) e
selenocisteína (Sec, U).
Glu–Sec–Ile–Met–Ile–Cys–Ala ou Q–U–I–M–I–C–A
Estrutura secundária das proteínas
• A estrutura secundária descreve como os segmentos da espinha dorsal do peptídeo se
orientam em um padrão estruturais recorrentes
Representação da estrutura da
concanavalina A (PDB: 3CNA),
uma proteína com várias folhas
β-pregueadas, mostradas como
setas nessa representação.
Representação da estrutura da
mioglobina (PDB: 3RGK), uma proteína
com várias hélices-α, mostradas como
fitas enroladas nessa representação.
Estrutura secundária das proteínas: hélice-α
• A estrutura da hélice-α assume uma forma enrolada e é estabilizada por ligações de
hidrogênio entre os N–H de um grupo amida e C=O de outro grupo amida a quatro resíduos de
distância
Um segmento de proteína (PDB: 1TRZ) em um padrão helicoidal Um segmento de proteína (PDB: 1TRZ) mostrando somente a
(espiral) estabilizado por ligações de hidrogênio entre o grupo espinha dorsal em um padrão helicoidal (espiral) estabilizado
N–H de um resíduo e o grupo C=O afastado quatro resíduos. por ligações de hidrogênio.
Estrutura secundária das proteínas: hélice-α
• A estrutura da hélice-α assume uma forma enrolada e é estabilizada por ligações de
hidrogênio entre os N–H de um grupo amida e C=O de outro grupo amida a quatro resíduos de
distância
Um segmento de proteína (PDB: 1TRZ) mostrando a hélice-α, Detalhe do segmento de proteína (PDB: 1TRZ) mostrando
estabilizada por ligações de hidrogênio, e as cadeia laterais uma hélice-α voltada à direita.
dos aminoácidos.
Estrutura secundária das proteínas: folha-β pregueada
• A estrutura da folha-β pregueada assume um formato estendido e é estabilizada por ligações
de hidrogênio que ocorrem entre resíduos de cadeias adjacentes
Um segmento de proteína em um padrão de fitas (folhas) Um segmento de proteína mostrando somente a espinha dorsal
mostrando a folha-β pregueada estabilizada por ligações de em um padrão de fitas (folhas) estabilizado por ligações de
hidrogênio entre cadeia adjacentes (PDB: 3CNA). hidrogênios entre cadeia adjacentes (PDB: 3CNA).
Estrutura secundária das proteínas: folha-β pregueada
• A estrutura da folha-β pregueada assume um formato estendido e é estabilizada por ligações
de hidrogênio que ocorrem entre resíduos de cadeias adjacentes
Um segmento de proteína mostrando as cadeias laterais Uma folha-β pregueada de seis fitas (PDB: 3CNA)
dos aminoácidos e uma folha-β pregueada estabilizada por
ligações de hidrogênio entre cadeia adjacentes (PDB: 3CNA).
Estrutura secundária das proteínas: folha-β pregueada
• Na folha-β pregueada as cadeias adjacentes podem ser dispostas na mesma direção (paralela)
ou em direções opostas (antiparalela), mais comum e mais estável
Detalhe mostrando uma folha-β pregueada antiparalela Detalhe mostrando uma folha-β pregueada paralela de 8
de 7 fitas. O sentido N-terminal → C-terminal das cadeias, fitas. O sentido N-terminal → C-terminal das cadeias,
indicado pelas setas (PDB: 3CNA). indicado pelas setas (PDB 1QRE).
Estrutura terciária das proteínas
• A estrutura terciária descreve como a molécula inteira se enrola em uma forma tridimensional,
sendo uma união de estruturas secundárias
Representação da estrutura da concanavalina A (PDB: 3CBA) Representação da estrutura da anidrase carbônica (PDB: 1QRE)
mostrando as fitas antiparalelas das folhas-β pregueadas. mostrando as fitas paralelas das folhas-β pregueadas.
Estrutura terciária das proteínas
• Algumas proteínas contêm duas ou mais cadeias distintas, ou subunidades, que podem ser
idênticas ou não
Uma ligação dissulfeto
unindo duas partes da
mesma cadeia
• As ligações dissulfeto são importantes
componentes das estruturas secundária e
terciária das proteínas Uma ligação
dissulfeto unindo
duas cadeias
Representações da estrutura do monômero (esquerda), da estrutura trimérica da PCNA humana (PDB: 1AXC), colorizada para mostrar
a extremidade N-terminal (azul) e C-terminal (vermelho) (centro) e para mostrar os monômeros na estrutura quaternária da proteína
(à direita).
Estrutura quaternária das proteínas
Representação da estrutura da estrutura chaperonina (PDB: 1AON), uma proteína complexa gigante. A representação foi colorizada
para mostrar as subunidades da estrutura quaternária.