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Questionrio enzimas

1) O que so enzimas, como elas atuam a nvel de reao

Enzimas so grupos de substncias orgnicas de natureza normalmente


proteica (existem tambm enzimas constitudas de RNA, as ribozimas), com
atividade intra ou extracelular que tm funes catalisadoras, catalisando
reaes qumicas que, sem a sua presena, dificilmente aconteceriam.

Uma enzima uma protena, normalmente ela catalisa as reaes qumicas, ou


seja, faz com que aconteam. Elas atuam se ligando a molculas fazendo com
que ocorra troca de ons. As enzimas so bem especficas, normalmente s
tem um local de ao. Tambm so sensveis a variaes de pH e de
temperatura. Muitas delas ficam inativas fora da temperatura ideal.
Reaes dependem, para a sua realizao, da existncia de uma determinada
enzima. As enzimas so substncias do grupo das protenas e atuam como
catalisadores de reaes qumicas.

2) Explique sucintamente qual a diferena entre apoenzima e holoenzima.


.
Apoenzima (ou apoprotena) a parte proteca de uma holoenzima. Uma
enzima (biocatalizadora vital) constituda de duas partes: a apoenzima, que
a parte proteca e a coenzima, que a parte no-proteca. O conjunto completo
chama-se holoenzima.

Uma enzima (biocatalizadora vital) constituda de duas partes de grande


importncia: A apoenzima, que a parte proteca e a coenzima, que a parte
no-proteca. O conjunto completo chama-se holoenzima.

3) Descreva a diferena entre cofator e coenzima, exemplifique.

Cofatores so substncias orgnicas ou inorgnicas (metais) necessrias ao


funcionamento das enzimas. Quando o cofator uma molcula orgnica, ele
chamado de coenzima.

Cofatores inorgnicos so ons como cobre, zinco, magnsio, mangans e os


cofatores orgnicos (coenzimas) so derivados de vitaminas.

4) cite trs fatores que podem interferir na atividade de uma enzima,explicando


como cada um interfere.

Temperatura

A temperatura um fator importante na atividade das enzimas.


Dentro de certos limites, a velocidade de uma reao enzimtica
aumenta com o aumento da temperatura. Entretanto, a partir de uma
determinada temperatura, a velocidade da reao diminui
bruscamente.
O aumento de temperatura provoca maior agitao das molculas e,
portanto, maiores possibilidades de elas se chocarem para reagir.
Porm, se for ultrapassada certa temperatura, a agitao das
molculas se torna to intensa que as ligaes que estabilizam a
estrutura espacial da enzima se rompem e ela se desnatura.
Para cada tipo de enzima existe uma temperatura tima, na qual a
velocidade da reao mxima, permitindo o maior nmero possvel
de colises moleculares sem desnaturar a enzima. A maioria das
enzimas humanas, tm sua temperatura tima entre 35 e 40C, a
faixa de temperatura normal do nosso corpo. J bactria que vivem
em fontes de gua quente tm enzimas cuja temperatura tima fica
ao redor de 70C.

Grau de acidez (pH)


Outro fator que afeta a forma das protenas o grau de acidez do meio,
tambm conhecido como pH (potencial hidrogeninico). A escala de pH vai de
0 a 14 e mede a concentrao relativa de ons hidrognio (H+) em um
determinado meio. O valor 7 apresenta um meio neutro, nem cido nem bsico.
Valores prximos de 0 so os mais cidos e os prximos de 14 so os mais
bsicos (alcalinos).

Cada enzima tem um pH timo de atuao, no qual a sua atividade mxima.


O pH timo para a maioria das enzimas fica entre 6 e 8, mas h excees. A
pepsina, por exemplo, uma enzima digestiva estomacal, atua eficientemente no
pH fortemente cido de nosso estmago (em torno de 2), onde a maioria das
enzimas seria desnaturada. A tripsina, por sua vez, uma enzima digestiva que
atua no ambiente alcalino do intestino, tendo um pH timo situado em torno de
8.

Tempo:
A atividade enzimtica influenciada diretamente pela ao do tempo. Quanto mais
tempo a enzima estiver em contato com o substrato, mais produtos sero produzidos,
enquanto houver substrato.

A concentrao da enzima :
qualquer reao enzimtica, a quantidade de molculas de substrato
em causa , em comparao com o nmero de enzimas. Aumento da
concentrao de enzima da enzima pelo simples fato de que mais
enzimas envolvidas na reao aumenta. A velocidade da reao
diretamente proporcional quantidade de enzima disponvel para o
mesmo. No entanto, isto no significa que um aumento constante da
concentrao da enzima ir levar a um aumento constante da
velocidade de reao. Pelo contrrio, uma concentrao muito
elevada de enzima no qual todas as molculas do substrato e usado
at que no tem impacto sobre a taxa de reao. Em particular, uma
vez que a taxa de reao tenha atingido a estabilidade, aumentando a
quantidade de enzima no afeta a velocidade de reao mais.

Inibidores:
Como o nome sugere, os inibidores so substncias que tm uma
tendncia a evitar atividades enzimticas. Inibidores da enzima de
interferir com as funes da enzima em dois modos diferentes. Na
base deste, que so divididos em duas categorias: inibidores
competitivos e inibidores no competitivos. Um inibidor competitivo
tem uma estrutura que o mesmo que uma molcula de substrato, e,
em seguida, que une o centro da enzima ativada e restringe facilmente

a formao de ligao do complexo enzima-substrato. Um inibidor no


competitivo produzido pela alterao (s) sob a forma de enzimas
para a reao com o local ativo. Nesta condio, a molcula de
substrato no pode ligar-se enzima e, assim, bloquear as atividades
subsequentes.

Fatores allosteric :
H algumas enzimas tm um stio ativo e um ou mais locais de
regulao e so conhecidos como enzimas alostricos. Uma molcula
que se liga aos stios reguladores conhecidos como factor de
alostrico. Quando esta molcula no ambiente celular constitui um
local de regulao so fracos ligao covalente, a forma da enzima e
do seu centro de ativao alterado. Esta alterao reduz geralmente a
atividade enzimtica, pois inibe a formao de um novo complexo
enzima-substrato. No entanto, existem alguns ativadores alosticos que
promovem a afinidade entre enzima e substrato de enzima e influencia
positivamente o comportamento.

5) Considere as seguintes informaes, descritas abaixo, a respeito


da concentrao de 3 substncias em uma reao catalisada por uma
enzima.
Conc. A

Ci

10

0,01

Cf

10

0,01

Baseando-se nos dados descritos na tabela acima diga:


Qual substncia a enzima, qual representa o substrato e qual
representa o produto. Justifique cada afirmativa.

A substrato por que a concentrao inicial era 10 e a final e 0 isso


quer dizer que todo o substrato foi consumido na reao e o que
ocorre nas reaes.

B seria o produto inicialmente no temos concentrao inicial de


produto o produto e formado no final das reaes.

C a concentrao enzimtica sempre vai permanece a mesma

6) com base nos seus conhecimentos a respeito de Km e Kcat e tambm a


respeito da relao entre os dois. Diga como um inibidor competitivo e um
inibidor no competitivo podem interferir no valor da eficincia cataltica de uma
enzima.
Muitos inibidores competitivos so compostos que se assemelham ao substrato
e se combinam com a enzima para formar um complexo enzima-inibidor, mas
sem levar adianta a catlise. Combinaes desse tipo reduzem a eficincia da
enzima. Por levar em conta a geometria molecular dos inibidores que se
assemelham ao substrato, podem-se obter concluses sobre que partes do
substrato normal se ligam enzima. A inibio competitiva pode ser analisada
quantitativamente pela cintica de estado-fixo. Na presena de um inibidor
competitivo, a equao de Michaelis-Menten se torna:

A inibio enzimtica no-competitiva caracteriza-se pela possibilidade de ligao simultnea


do inibidor e do substrato enzima. Esta ligao est unicamente dependente da concentrao
do inibidor que se liga a um local que no o centro ativo do substrato:

Nestes casos o inibidor no tem semelhana estrutural com o substrato, eliminando a


competio. O inibidor liga-se ento a radicais que no pertencem ao stio ativo, alterando a
estrutura da enzima, e impedem a catlise enzimtica. O inibidor no altera o equilbrio do
complexo enzima-substrato, pois liga-se tanto com a enzima quanto com o complexo. Deste
modo, o inibidor no provoca variaes em Km, mas na presena de excesso de substrato a
velocidade mxima diminui.
Nesse caso a equao de Michaelis-Menten se altera para:

7) podemos dizer que a eficincia cataltica de uma enzima exclusivamente


dependente do seu Km? Explique a sua resposta.
Para determinar a eficincia cataltica de uma reao enzimtica, deve-se analisar
a constante especfica, definida como Kcat/Km.

8) Qual a diferena entre enzimas alostricas e enzimas michaelianas ?


Explique

Enzimas alostricas so enzimas que contm uma regioseparada


daquela em que se liga o substrato, na qual pequenasmolculas
regulatrias (efetores) podem ligar-se e modificar aatividade cataltica
destas enzimas.

Ao ligar-se enzima, o efetor alostrico pode aumentar (efetorpositivo)


ou diminuir (efetor negativo) a atividade cataltica,atravs de
modificaes no stio cataltico.
Muitas enzimas alostricas so oligomricas ( constitudas demltiplas
subunidades) ; geralmente esto localizadas em umponto de
ramificao, ou prximo a ele, em uma via metablica,influenciando no
direcionamento de substratos para uma ououtra via disponvel.
A atividade enzimtica pode ser alterada pelos efetores por
doiscaminhos: aumento ou diminuio da Vmx
ou aumento oudiminuio da Km. Muitas enzimas alostricas
respondem amltiplos efetores que interferem na Vmx e na Km
Enzimas michaelianas so aquelas em que oaumento da concentrao
do substratoaumenta a velocidade, at a saturao.
9) Explique qual a principal diferena entre uma inibio incompetitiva, inibio
competitiva e inibio mixta.

A inibio enzimtica a reduo da velocidadede uma reao enzimtica provocada


por umamolcula. As molculas que provocam essa aoinibitria so chamadas de
inibidores e podemser tanto constituintes da prpria clula comopodem ser
substncias estranhas a ela.
A molcula inibidora apresenta estrutura semelhante aosubstrato da enzima que se
liga para realizar a catlise. Ela liga-se ao stio ativo da enzima, que no pode realizar
o processocataltico, pois seu stio ativo est ocupado para poder ligar-seao substrato
correto. Portanto o inibidor compete comosubstrato pelo stio de ao.O inibidor forma
com a enzima o complexo enzima-inibidor EI,que anlogo ao complexo enzima
substrato ES.A molcula do inibidor no modificada pela enzima.O efeito da reao
modifica o Km, mas no altera a velocidade.Um exemplo de enzima que sofre esse
tipo de inibio aenzima succinato desidrogenase, que a responsvel
pelatransformao do succinato em fumarato, mas quando a ela seliga o malonato,
no ocorre reao, ou seja, o malonato oagente inibidor dessa enzima.
A inibio incompetitiva caracteriza-se pelo fato de oinibidor no se combinar com a
enzima livre, nem afetarsua reao com o substrato normal; contudo ele secombina
com o complexo ES para originar um complexoternrio inativo ESI, incapaz de sofrer
a etapa subsequenteda reao para produzir o produto.Essas interrelaes indicam
que o grau de inibio podeaumentar medida que se aumenta a concentrao
dosubstrato.Podem ser observada em reaes catalisadas por enzimasque possuem
mais de um substrato.Reduz igualmente a Vmax e Km

A inibio mista uma caracterstica importante na cintica A inibio mista


uma caracterstica importante na cintica de enzimas de enzimas
multissubstratos
! A inativao irreversvel assemelha A inativao irreversvel assemelha -se
inibio se inibio no competitiva. no competitiva. !
O inibidor ser um O inibidor ser um inativador !
Os inativadores inativadores reduzem o nvel efetivo da [E] reduzem o nvel
efetivo da [E] T e portanto e portanto Vmx para todos os valores de [S] para
todos os valores de [S] sem alterar K sem alterar KM

10) Com base no que foi previsto na questo anterior como seria o
comportamento do grfico de Leneweaver-Burk para cada uma das
inibies ?

Os resultados experimentais do estudo da influncia daconcentrao de


substrato na atividade enzmaticaadaptam-se bem equao de MichaelisMenten emmuitas enzimas (enzimas com cintica michaeliana).Nestes
casos os valores de Km e de Vmax descrevem demodo adequado o
resultado da experincia. Emboraatualmente existam mtodos estatsticos
sofisticados einclusive programas informticos para calcular a
partir dosdados experimentais os valores destes dois parmetroscontinuam
a ser usados mtodos de representao grficapara o seu clculo. A
representao grfica de Lineweaver-Burk ou de dupla inverso sem
dvida a mais popular emerece uma referncia neste texto
de notar que num grfico de Lineweaver-Burk os pontos mais prximos
dos eixo dasordenadas so os que representam asconcentraes de
substrato mais elevadas.Assim o ponto de abcissa zero representauma
concentrao infinita de substrato; defacto o Vmax um parmetro
e raramenteum resultado experimental que se obtenhadirectamente.

11) Defina dois fatores fsicos responsveis por afetar a atividade


enzimtica.

Temperatura e ph provoca maior agitao das molculas e, portanto, maio


responsabilidades de elas se chocarem para reagir. Porm, se for
ultrapassada certa temperatura, a agitao das molculas se torna to
intensa que as ligaes que estabilizam a estrutura espacial da enzima se
rompem e ela se desnatura.

12) Enzimas podem ser reguladas aps sua sntese por regulaes
covalentes ou por ao de molculas reguladoras. Defina cada caso.

Regulao por fosforilao


Atividade das enzimas tambm podem ser regulada por modificaes
covalentes, tais como a adio de grupos fosfato a resduos de serina,
treonina ou tirosina. A fosforilao um mecanismo muito comum na
regulao da atividade enzimtica, a adio de grupos fosfato estimula ou
inibe as atividades de muitas enzimas. Por exemplo, clulas musculares
respondem epinefrina (adrenalina) quebrando o glicognio em glicose,
fornecendo assim energia para a atividade muscular aumentada. A quebra
do glicognio catalisada pela enzima Glicognio Fosforilase, que
ativada por fosforilao em resposta ligao de epinefrina a um receptor
na superfcie da clula muscular. Fosforilao de protenas desempenha um
papel central no controle de muitas outras funes celulares, incluindo o
crescimento e diferenciao celular.

Regulao Alostrica
A inibio por Feedback um exemplo de regulao alostrica, no qual a
atividade da enzima controlada pela ligao de pequenas molculas
em stios regulatrios sobre a
enzima (Figura abaixo). O termo "regulaoalostrica" vem do fato de que a
molcula reguladora no se liga ao stio cataltico, mas em um outro
local sobre a protena (allo = "outro" estrico = "local"). A ligao da
molcula reguladora muda a conformao da protena, que por sua
vez altera a forma do stio ativo e sua atividade cataltica. No caso
da treonina deaminase , a ligao da
molcula reguladora (isoleucina) inibe a atividade enzimtica. Em outros
casos, molculas regulatrias podem servir como ativadores, estimulando,
em vez de inibir a enzima alvo.