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Enzimas

Profa. Marina Rodrigues e Silva

Belo Horizonte, 2022


Compreender as propriedades gerais das enzimas e sua nomenclatura

Elucidar a estrutura enzimática e suas características

Objetivos
Relacionar os conceitos de energia de ativação e velocidade da reação

Interpretar os mecanismos que alteram a cinética enzimática

Descrever os mecanismos de regulação enzimática


Histórico das Enzimas
• Eduard Buchner (1897)
– Extratos de levedo podiam fermentar o açúcar
até álcool;
– “Fermentos” funcionavam mesmo quando
removidas da célula viva. Eduard Buchner
•Frederick Kuhne (1860-1917)

- Nomeou tais moléculas de enzimas.


•James Sumner (1926)
– Isolou e cristalizou a Urease do feijão preto;
– Cristais eram de proteínas;
James Summer
– Postulou que “todas as enzimas são proteínas”. (1887-1955)
Histórico das Enzimas
• John Northrop e Moses Kunitz(década 30)
– Cristalizaram a pepsina e a tripsina bovinas;

• Década de 50 – séc. XX
– 75 enzimas - isoladas e cristalizadas;
– Ficou evidenciado caráter proteico. John Northrop
(1891-1987)

• Atualmente + 2000 enzimas são conhecidas.


Enzimas - Propriedades Gerais

Catalisadores de reações biológicas


• Presente em praticamente todas as reações metabólicas

• Propriedades:
1- Poder catalítico extraordinário (até 1000x + rápido)
2- Alto grau de especificidade
3- Funcionam em temperaturas e pH específicos
4- Não participam da reação como reagente ou produto
5- Presente em concentrações extremamente baixas
(acabam de fazer uma reação e podem ser usadas em outra)
Enzimas - Propriedades Gerais
Catalisadores de reações biológicas
• Presente em praticamente todas as reações metabólicas
• Propriedades:
1- Poder catalítico extraordinário (até 1000x + rápido)
2- Alto grau de especificidade
3- Funcionam em temperaturas e pH específicos
4- Não participam da reação como reagente ou produto
(não são consumidas durante a reação)
5- Presente em concentrações extremamente baixas
(acabam de fazer uma reação e podem ser usadas em outra)
Enzimas - Propriedades Gerais
Natureza

Proteínas Ribozimas

• Proteínas: Globulares
Possuem todas as características das proteínas
Estruturas terciária e quaternária
Podem ter sua atividade regulada
• Estão quase sempre compartimentalizadas
Enzimas - Nomenclatura

Século XIX- poucas enzimas identificadas


• Adição do sufixo “ASE” ao nome do substrato:

* gorduras (lipo - grego) – LIPASE


* amido (amylon - grego) – AMILASE

• Nomes arbitrários:

* Tripsina e pepsina – proteases

NOMES TRIVIAIS
Enzimas - Nomenclatura

No século XX...

• 1955 - Comissão de Enzimas (EC) da União Internacional de


Bioquímica (IUB) - nomear e classificar.

• Cada enzima - código com 4 dígitos que caracteriza o tipo de


reação catalisada:
- 1° dígito - classe
- 2° dígito - subclasse
- 3° dígito - sub-subclasse
- 4° dígito - indica o substrato
Enzimas – Nomenclatura
Sistema IUB de Nomenclatura
1. Oxido-redutases (reações de oxidação-redução ou transferência de elétrons)
1.1.atuando em CH-OH
1.2.atuando em C=O
1.3.atuando em C=O-
1.4.atuando em CH-NH2 Ex: desidrogenases e oxidases
1.5.atuando em CH-NH-
1.6.atuando em NADH, NADPH
2.Transferases (transferem grupos funcionais entre moléculas)
2.1.grupos com um carbono
2.2.grupos aldeído ou cetona
2.3.grupos acil Ex: quinases e
2.4.grupos glicosil transaminases
2.7.grupos fosfatos
2.8.grupos contendo enxofre
3.Hidrolases (reações de hidrólise em ligações covalentes)
3.1.ésteres
3.2.ligações glicosídicas
3.4.ligações peptídicas Ex: peptidases
3.5.outras ligações C-N
3.6.anidridos ácidos
Enzimas - Nomenclatura
ATP + D-Glicose ADP + D-Glicose-6-fosfato
IUB (união internacional) - ATP:glicose fosfotransferase

E.C. 2.7.1.1
2 - classe – Transferase (transferência do grupo fosfato)
7 - subclasse – Grupos fosfato
1 - sub-subclasse - Fosfotransferase que utiliza grupo hidroxila da
glicose como receptor
1 - indica ser a D-glicose o receptor do grupo fosfato

Nome trivial: Hexoquinase


Estrutura das Enzimas

Estrutura
Holoenzima (ativa)
Enzimática
Proteína Cofator
Ribozimas
Apoenzima ou
Pode ser:
Apoproteína • íon inorgânico
RNA (inativa) • molécula orgânica

Coenzima
Estrutura das Enzimas

Cofatores Enzimáticos

• Cofatores:
- são pequenas moléculas inorgânicas
- não estão ligados permanentemente
- na ausência deles, a enzima é inativa;

Metanol desidrogenase
(Íon cálcio)
Estrutura das Enzimas
Cofatores Enzimáticos
Co-fatores metálicos Enzimas
Zn2+ Anidrase carbônica, carboxipeptidase
Mg2+ Hexocinase
Ni2+ Urease
Mo Nitrato-redutase
Se Glutationa-peroxidase
Mn2+ Superóxido-dismutase
K+ Propionil-CoA-Carboxilase
Estrutura das Enzimas
Coenzimas
- são compostos orgânicos, quase sempre derivados de vitaminas,
- que atuam em conjunto com as enzimas.
• Classificam-se em:
1. transportadoras de hidrogênio
2. transportadoras de grupos químicos

1. Transportadoras de hidrogênio
Coenzima Abreviatura Reação Origem
catalisada
+
Nicotinamida adenina NAD Oxi-redução Niacina ou
dinucleotídio Vitamina B3
Nicotinamida adenina NADP+ Oxi-redução Niacina ou
dinucleotídio fosfato Vitamina B3
Flavina adenina FAD Oxi-redução Riboflavina ou
dinucleotídio Vitamina B2
Estrutura das Enzimas
Coenzimas
2. transportadoras de grupos químicos
Coenzima Abrev. Reação catalisada Origem
Coenzima A CoA-SH Transferência de Pantotenato ou
grupo acil Vitamina B5
Biotina Transferência de Biotina ou
CO2 Vitamina H
Piridoxal fosfato PyF Transferência de Piridoxina ou
grupo amino Vitamina B6
Metilcobalamina Transferência de Cobalamina ou
unidades de carbono Vitamina B12
Tetrahidrofolato THF Transferência de Ácido fólico
unidades de carbono
Tiamina TPP Transferência de Tiamina ou
pirofosfato grupo aldeído Vitamina B1
Especificidade das Enzimas
Sítio de Ligação
• As enzimas são muito específicas para os seus
substratos;

• Esta especificidade pode ser relativa a apenas um


substrato ou a vários substratos ao mesmo tempo;

• Especificidade se deve à existência, na superfície da


enzima de um local denominado SÍTIO DE
LIGAÇÃO DO SUBSTRATO (enzima- sítio ativo)

• Sítio de ligação é um arranjo tridimensional,


complementar ao substrato
Especificidade das Enzimas
Sítio Ativo ou Catalítico
• No interior do sítio de ligação - aminoácido auxiliares ou de
contato

• Local das reações

• Alguns modelos procuram explicar a especificidade entre o


substrato e a enzima
Especificidade das Enzimas
Modelos de Ligação

• Modelo Chave/Fechadura: Prevê um encaixe perfeito do substrato


no sítio de ligação, que seria rígido como uma fechadura.

•Modelo do Ajuste Induzido: Prevê um sítio de ligação não


totalmente pré-formado, mas sim moldável à molécula do substrato; a
enzima se ajustaria à molécula do substrato na sua presença.

•Evidências experimentais sugerem um Terceiro modelo que combina


o ajuste induzido a uma "torção" da molécula do substrato, que o
"ativaria" e o prepararia para a sua transformação em produto.
Especificidade das Enzimas
Modelos de Ligação
Especificidade das Enzimas
Modelos de Ligação

Sem enzima

Enzima complementar ao substrato

Enzima complementar ao estado de transição


Mecanismos de Ação das Enzimas
Taxa de Reação

• Como se pode aumentar a velocidade da reação?


- concentração do reagente
- temperatura
- energia de ativação
Mecanismos de Ação das Enzimas
Taxa de Reação
Energia de ativação é a energia que eu preciso para que meu

E + S ↔ ES ↔ EP ↔ E + P substrato atinja o estado de transição


e os catalisadores vão agir justamente nesse ponto, alterando
a energia de ativação.

Energia
de
Ativação

Ação dos
catalisadores
Mecanismos de Ação das Enzimas
Taxa de Reação

Energia
de
Ativação

ΔGo = variação de energia livre


Mecanismos de Ação das Enzimas
Velocidade de Reação
• Como as enzimas diminuem a Energia de ativação?

- Reações químicas entre substrato e enzima


(complexo ES)

Ligações covalentes e não covalentes


Energia de Ligação (ΔGB)

Otimizam o estado de transição


e contribuem para a
especifidade
Cinética Enzimática
Fatores que Alteram

➢ Fatores que alteram a velocidade de reações


enzimáticas:
• pH;
• temperatura;
• concentração das enzimas;
• concentração dos substratos;
• presença de inibidores.
Cinética Enzimática
Fatores que Alteram
Velocidade da Reação

• Dependente da [S]

Velocidade Inicial, Vo (µM/min.)


Cinética Enzimática
Fatores que Alteram
Influência do pH
• O efeito do pH sobre a enzima deve-se às variações no estado de ionização
dos componentes do sistema à medida que o pH varia.
• Enzimas - grupos ionizáveis, existem em ≠ estados de ionização.
Cinética Enzimática
Fatores que Alteram
Influência do pH
ENZIMA pH ÓTIMO

Pepsina 1,5

Tripsina 7,7

Catalase 7,6

Arginase 9,7

Fumarase 7,8
Cinética Enzimática
Fatores que Alteram

Influência da Temperatura
Δ Temperatura: dois efeitos ocorrem:
a) a velocidade de reação aumenta, como se observa na
maioria das reações químicas;
b) a estabilidade da proteína decresce devido a desativação
térmica.

Temperatura ótima - para que


atinja sua atividade máxima, é a
temperatura máxima na qual a
enzima possui uma atividade por
um período de tempo.
Inibição Enzimática

Enzimas estão sujeitas a inibição


Inibição Enzimática
Inibidores Enzimáticos
Qualquer substância que reduz a velocidade de uma reação
enzimática.

INIBIDORES

REVERSÍVEIS IRREVERSÍVEIS

COMPETITIVOS INCOMPETITIVOS INIBIÇAO MISTA


Inibição Enzimática
Inibidores Competitivos
• Concorre com o S pelo sitio ativo da E livre.
• I é análogo não metabolizável

I compostos com estrutura


molecular lembra S

ligação da enzima no substrato

[substrato] necessária para obter a


mesma [ES]
Inibição Enzimática
Inibidores Competitivos
Inibição Enzimática
Inibidores Incompetitivos
•I se liga a um sítio diferente do sítio ativo do substrato
• Liga-se apenas ao complexo ES
Inibição Enzimática
Inibidores Mista
• Inibidor não-competitivo se liga reversivelmente, aleatória e
independentemente em um sítio que lhe é próprio.

I não tem semelhança estrutural


com o S

[substrato] não diminui a inibição


Inibição Enzimática
Inibidores Irreversíveis
• I se combina com um grupo funcional, na molécula da E, que é
essencial para sua atividade.
• Podem promover a destruição do grupo funcional
• Forma-se uma ligação COVALENTE entre o I e a E
Inibição Enzimática
Regulação Enzimática

Enzimas alostéricas
Regulação Enzimática

Enzimas alostéricas
Regulação Enzimática

Enzimas alostéricas
Regulação Enzimática

Enzimas alostéricas

Inibição Ativação
Regulação Enzimática

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